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香蕉miR408b靶基因Chemocyanin的克隆及其在低温胁迫下的表达分析 被引量:3
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作者 刘彦英 倪珊珊 +3 位作者 项蕾蕾 孙雪丽 陈裕坤 赖钟雄 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期29-39,共11页
【目的】研究香蕉中miR408b及其靶基因Chemocyanin在低温胁迫下的表达模式和调控机制。【方法】以三明野生蕉和‘天宝蕉’叶片为材料,利用RT-PCR和RACE技术克隆获得三明野生蕉中的MiChemocyanin基因(MiCHY)和‘天宝蕉’中的MaChemocyani... 【目的】研究香蕉中miR408b及其靶基因Chemocyanin在低温胁迫下的表达模式和调控机制。【方法】以三明野生蕉和‘天宝蕉’叶片为材料,利用RT-PCR和RACE技术克隆获得三明野生蕉中的MiChemocyanin基因(MiCHY)和‘天宝蕉’中的MaChemocyanin基因(MaCHY),利用在线网站对MiCHY进行生物信息学分析。【结果】MiCHY基因的cDNA全长为587 bp,开放阅读框381 bp,编码126个氨基酸蛋白,具有Plantacyanin结构域,属于超铜氧化还原蛋白家族。在ORF区的4~24 bp处有一处高度匹配miR408b的结合区(GCTCAGGGAAGGGGCAGTGCG)。RLM-5’RACE分析表明,miR408b主要在靶序列的第7~8个碱基之间剪切靶基因MiCHY的mRNA。序列比对发现,MaCHY基因比MiCHY基因多了82 bp的序列,符合内含子的GT-AG剪切,推测发生了内含子驻留的可变剪接。保守结构域分析表明MaCHY没有Plantacyanin结构域,但也属于铜氧化还原蛋白家族。qRT-PCR结果表明,低温胁迫下,冷敏感的‘天宝蕉’miR408b的表达量上升,MaCHY的表达量降低;在抗寒的三明野生蕉中,miR408b的表达量下降,MiCHY表达量上升,miR408b与MiCHY表达量呈负相关。【结论】miR408b及其靶基因MiCHY可能在香蕉响应低温胁迫中发挥重要作用。 展开更多
关键词 香蕉 miR408b Chemocyanin基因 低温胁迫 表达分析
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Physiological Response of Oncidium hybridum‘Gower Ramsey’Infected by Erwinia carotovora 被引量:2
2
作者 Lin Zhengchun ni shanshan +1 位作者 Wu Qiuzhen Lai Zhongxiong 《Plant Diseases and Pests》 CAS 2020年第5期1-7,13,共8页
[Objective]The paper was to study the physiological mechanism of Oncidium hybridum‘Gower Ramsey’infected by Erwinia carotovora pv.carotovora.[Method]O.hybridum‘Gower Ramsey’was inoculated with E.carotovora by need... [Objective]The paper was to study the physiological mechanism of Oncidium hybridum‘Gower Ramsey’infected by Erwinia carotovora pv.carotovora.[Method]O.hybridum‘Gower Ramsey’was inoculated with E.carotovora by needle-punching method.The leaves inoculated with sterile water were used as control,and samples were collected at 12,24,36 and 48 h post inoculations to determine the physiological indexes,respectively.[Result]The contents of MDA,flavonoid,lignin,soluble protein and the activities of POD,SOD,CAT,PPO and PAL in O.hybridum leaves first increased then decreased.At 12 h post inoculation,the activities of SOD and CAT increased significantly by 40.49%and 37.77%(P<0.01,the same below),respectively;the contents of flavonoid increased significantly by 21.56%(P<0.05,the same below);and the activities of PAL,POD and PPO increased significantly by 42.29%,81.8%and 37.98%,respectively.The contents of MDA and lignin increased significantly by 57.98%and 58.72%at 24 h,respectively;the content of soluble protein increased by 87.71%at 24 h,and 61.28%at 36 h,while the content of Pro increased at 24 h(P>0.05,the same below),and increased significantly by 23.66%at 36 h;the content of soluble sugar content had no significant difference compared with the control.Additionally,the chlorophyll a and carotenoid contents tended to decrease dramatically,while chlorophyll b increased significantly by 95.33%at 24 h,then decreased.The initial fluorescence parameter of Fm/Fv and Y(II)decreased significantly by 47.14%and 54.61%,respectively,while the Y(NO)increased significantly by 33.61%,compared with the control.[Conclusion]The contents of Pro,MDA,lignin,soluble protein and the activities of POD,SOD,CAT,PPO and PAL in O.hybridum leaves are closely related to the infection of E.carotovora,which provide new clues for revealing the infection mechanism of E.carotovora in O.hybridum. 展开更多
关键词 Oncidium hybridum Soft rot INFECTION Defense enzymes Chlorophyll fluorescence properties
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液体状态机研究进展
3
作者 张永强 倪珊珊 +1 位作者 宋美霖 满梦华 《软件工程》 2023年第11期1-4,38,共5页
液体状态机(Liquid State Machine,LSM)具有实时计算和仿生的特点,在处理时间序列数据上具有巨大潜力。为了研究如何提高神经网络模型训练性能,降低计算复杂度,文章首先梳理和回顾了近几年相关研究文献,其次提出硬件实现和软件模型两个... 液体状态机(Liquid State Machine,LSM)具有实时计算和仿生的特点,在处理时间序列数据上具有巨大潜力。为了研究如何提高神经网络模型训练性能,降低计算复杂度,文章首先梳理和回顾了近几年相关研究文献,其次提出硬件实现和软件模型两个优化思路,并总结了不同优化方法的优势与不足,硬件和软件上的优化可以提高神经网络模型学习性能和训练速度,但依然存在可控性差、算法最优解未知等问题,最后针对以上问题对未来的研究方向进行了展望,可为时间序列数据处理和模式识别领域提供优化思路。 展开更多
关键词 脉冲神经网络 储备池层 液体状态机 遗传算法
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电子特气在低温干法刻蚀中的应用与发展
4
作者 陈润泽 花莹曦 +5 位作者 张建伟 倪珊珊 吝秀锋 李欣 孙加其 王佳佳 《低温与特气》 CAS 2023年第2期11-16,共6页
介绍了低温干法刻蚀技术的技术原理、应用和进展,探讨了不同刻蚀气体和工艺参数对低温干法刻蚀工艺的影响。
关键词 低温干法刻蚀 反应离子刻蚀 电子特气
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气相色谱法测定六氟丁二烯中的微量水分
5
作者 倪珊珊 郑秋艳 +3 位作者 陈润泽 李帅楠 井栋宇 解晓虎 《低温与特气》 CAS 2023年第3期44-45,共2页
提出了一种六氟丁二烯中微量水分的分析方法,采用配备水分转化器的氢火焰离子化检测器的气相色谱仪实现了水分的快速、准确测定。
关键词 六氟丁二烯 水分 气相色谱
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氪氖电子混合气体中杂质含量的测定
6
作者 李帅楠 倪珊珊 +1 位作者 殷越玲 李旭 《低温与特气》 CAS 2023年第1期37-39,共3页
建立了一种氪氖电子混合气体中微量H_(2)、O_(2)、N_(2)、CH_(4)、CF_(4)、CO、CO_(2)的分析方法。采用多阀切割和多色谱柱分离的氦离子化气相色谱仪一次进样实现了氪氖电子混合气体中杂质的分离检测。经过方法验证,证明该方法能够达到... 建立了一种氪氖电子混合气体中微量H_(2)、O_(2)、N_(2)、CH_(4)、CF_(4)、CO、CO_(2)的分析方法。采用多阀切割和多色谱柱分离的氦离子化气相色谱仪一次进样实现了氪氖电子混合气体中杂质的分离检测。经过方法验证,证明该方法能够达到较高的准确度和精密度。 展开更多
关键词 氪氖电子混合气体 脉冲氦离子检测器
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植物miR172家族成员进化与分子特性分析 被引量:7
7
作者 刘炜婳 林玉玲 +2 位作者 林争春 倪珊珊 赖钟雄 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2018年第3期525-533,共9页
为了解植物miR172家族成员的进化与分子特性,对mi Rbase数据库中37个物种的161个miR172前体序列和196个miR172成熟体序列进行进化规律分析,并对植物miR172家族的保守基序、二级结构和靶基因进行预测分析。结果表明:miR172家族成员分布... 为了解植物miR172家族成员的进化与分子特性,对mi Rbase数据库中37个物种的161个miR172前体序列和196个miR172成熟体序列进行进化规律分析,并对植物miR172家族的保守基序、二级结构和靶基因进行预测分析。结果表明:miR172家族成员分布的37个物种都是被子植物,被子植物很可能是miR172家族进化来源的祖先。进化分析表明,植物miR172家族成员序列相似性是其聚类的首要影响因素,其次才是物种差异的影响。植物miR172家族成员成熟体序列分析表明,5p臂上形成的成熟体序列特异性较大,3p臂上形成的成熟体序列保守性较高。二级结构分析发现,植物miR172家族成员具有典型的茎环二级结构,且茎序列的保守性较环序列高。植物miR172前体序列包含1个UNCG环。靶基因预测分析发现,同一物种不同miR172成员的靶基因可能不同;不同物种miR172的靶基因也可能不同,AP2或AP2-like出现频率最高,其次还有arginine decarboxylase 1、Pathogenesis-related、MYB84等靶基因,表明其靶基因功能的多样性。 展开更多
关键词 miR172家族 进化规律 分子特性 二级结构 靶基因
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非洲菊PR-1基因的克隆与表达分析 被引量:3
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作者 李乾玉 王秀美 +6 位作者 倪珊珊 王乐 张舒婷 夏朝水 叶炜 陈裕坤 赖钟雄 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2021年第7期1851-1859,共9页
以非洲菊‘G088’为材料,基于本研究所测序得到的非洲菊转录组数据(SRA:SRR9937065)的基础上,采用RT-PCR技术克隆获得2个病程相关蛋白1(PR-1)基因,分别命名为GjPR-1-like1和GjPR-1-like2(GenBank登录号:MW057342和MW057343),GjPR-1-like... 以非洲菊‘G088’为材料,基于本研究所测序得到的非洲菊转录组数据(SRA:SRR9937065)的基础上,采用RT-PCR技术克隆获得2个病程相关蛋白1(PR-1)基因,分别命名为GjPR-1-like1和GjPR-1-like2(GenBank登录号:MW057342和MW057343),GjPR-1-like1和GjPR-1-like2编码序列长度分别为534 bp和489 bp,可编码177和162个氨基酸。生物信息学分析表明,GjPR-1-like1属于碱性不稳定性蛋白,GjPR-1-like2属于弱酸性稳定蛋白;它们编码的蛋白质均含有CAP_PR-1和CAP superfamily保守结构域,属于富含半胱氨酸超家族蛋白,含有信号肽、跨膜结构和磷酸化位点;亚细胞定位表明均位于液泡中。PR-1基因在不同组织(叶、叶柄和根)、不同激素与逆境(SA、MeJA、ABA、NaCl)以及根腐病病原菌处理非洲菊的表达模式分析结果表明,GjPR-1-like1和GjPR-1-like2均在叶片中表达水平最高,在SA、MeJA、ABA和NaCl胁迫以及根腐病病原菌处理下,均显著影响GjPR-1-like1和GjPR-1-like2的表达水平。研究表明,GjPR-1-like1和GjPR-1-like2可能参与调控非洲菊生长发育过程,尤其是叶片的发育过程;且可能参与了非洲菊生物及非生物胁迫过程,尤其在响应非洲菊根腐病的抗病防御过程中发挥了一定的作用。 展开更多
关键词 非洲菊 病程相关蛋白1 基因克隆 激素 根腐病
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文心兰响应软腐病菌胁迫的生理生化分析 被引量:3
9
作者 吴秋桢 林争春 +1 位作者 倪珊珊 赖钟雄 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2020年第8期1610-1615,共6页
通过细菌性软腐病菌液针刺接种文心兰‘小樱桃’假鳞茎,分别在0、8、16、24、32 h时取假鳞茎上第一片叶,测定其叶绿素荧光特性[最大光合效率Fv/Fm、实际光合效率Y(Ⅱ)、调节性能量耗散的量子产额Y(NPQ)、非调节性能量耗散的量子产额Y(NO... 通过细菌性软腐病菌液针刺接种文心兰‘小樱桃’假鳞茎,分别在0、8、16、24、32 h时取假鳞茎上第一片叶,测定其叶绿素荧光特性[最大光合效率Fv/Fm、实际光合效率Y(Ⅱ)、调节性能量耗散的量子产额Y(NPQ)、非调节性能量耗散的量子产额Y(NO)],超氧化物歧化酶(SOD),过氧化物酶(POD),过氧化氢酶(CAT),多酚氧化酶(PPO)的酶活性,丙二醛(MDA),木质素及可溶性糖含量的变化。结果表明,随着侵染时间的延长,Fv/Fm、Y(Ⅱ)、Y(NPQ)逐渐下降,Y(NO)逐渐升高,光合系统受损;PPO活性及木质素含量逐渐下降;SOD、POD活性逐渐升高;CAT活性与可溶性糖含量先上升后下降;MDA含量在0~24 h逐渐下降,24 h后趋于平缓。探明文心兰感染软腐病后其抗性机制,建立抗性鉴定的生理方法。 展开更多
关键词 文心兰 软腐病 生理生化指标 叶绿素荧光特性 木质素
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香蕉MaSULTR3家族成员的全基因组鉴定与不同温度下表达模式分析 被引量:1
10
作者 倪珊珊 林争春 +6 位作者 刘彦英 陈裕坤 田栩瑞 王秀美 李小芳 张舒婷 赖钟雄 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2021年第3期637-648,共12页
利用生物信息学分析法对香蕉MaSULTR3基因家族成员进行全基因组鉴定、蛋白特性分析、分子进化树分析、启动子顺式作用元件分析以及低温胁迫下叶片转录组的FPKM值分析;其后,利用基因组数据结合RT-PCR方法克隆了‘天宝蕉’(Musa spp.,AAA ... 利用生物信息学分析法对香蕉MaSULTR3基因家族成员进行全基因组鉴定、蛋白特性分析、分子进化树分析、启动子顺式作用元件分析以及低温胁迫下叶片转录组的FPKM值分析;其后,利用基因组数据结合RT-PCR方法克隆了‘天宝蕉’(Musa spp.,AAA Group)组培苗MaSULTR3.1-2基因的ORF序列;最后,利用qPCR技术分析了该基因在低温胁迫下的表达模式。结果表明,香蕉MaSULTR3家族有12个成员;MaSULTR3启动子区域含有光响应、激素响应、低温、干旱等逆境胁迫相关的响应元件;分子进化树分析表明MaSULTR3家族成员可分为4类:ClassⅠ包含2个MaSULTR3成员(MaSULTR3.3-2、MaSULTR3.3-1),与单子叶植物香蕉和水稻的SULTR3.3聚在一起;ClassⅡ包含3个MaSULTR3成员(MaSULTR3.4-2、MaSULTR3.4-1的2个不同转录本),与大部分物种的SULTR3.4和拟南芥的SULTR3.3/4聚在一起;ClassⅢ包含4个MaSULTR3成员(MaSULTR3.1-6、MaSULTR3.1-2、MaSULTR3.5-1、MaSULTR3.5-2),与香蕉和水稻的SULTR3.5聚在一起;ClassⅣ包含4个MaSULTR3成员(MaSULTR3.1-4、MaSULTR3.1-3、MaSULTR3.1-5、MaSULTR3.1-1),拟南芥、水稻和香蕉的SULTR3.1/2聚在一起。不同温度下叶片转录组的FPKM值分析表明:MaSULTR3在低温下整体呈上调趋势,在13℃处理下表达量最高,且MaSULTR3不同成员在应对低温胁迫下有不同的分工。天宝蕉MaSULTR3.1-2基因的ORF序列包含1959 bp的完整开放阅读框,编码652个氨基酸残基,属于SULTR3基因家族,不含信号肽,具有双向跨膜,为疏水性蛋白,PI为8.55,含有55个蛋白磷酸化位点,三级结构中α-螺旋和无规则卷曲占比较大。亚细胞定位预测结果显示MaSULTR3.1-2可能定位于细胞质。qRT-PCR结果显示,‘天宝蕉’MaSULTR3.1-2基因在所有检测组织部位均有表达,其中在叶片的表达量最高,并且在叶片表达量为随温度下降,表达量先下降后上升,在28℃表达量最高。本研究结果表明MaSULTR3.1-2基因可能参与低温胁迫下香蕉的抗寒响应。 展开更多
关键词 香蕉 MaSULTR3家族 基因克隆 低温胁迫
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香蕉GDSL脂肪酶基因家族全基因组鉴定与表达分析 被引量:1
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作者 张城瑜 任纹慧 +7 位作者 耿小慧 李丹 吴昊 倪珊珊 王梦鸽 罗彬彬 徐涵 赖钟雄 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期1415-1429,共15页
【目的】揭示香蕉GDSL脂肪酶基因家族(MaGDSL)序列特征及其在香蕉生长发育过程中的潜在功能。【方法】利用生物信息学方法对MaGDSL进行全基因组鉴定,分析其染色体、启动子顺式作用元件和转录因子结合位点(TFBS)的分布情况以及编码蛋白... 【目的】揭示香蕉GDSL脂肪酶基因家族(MaGDSL)序列特征及其在香蕉生长发育过程中的潜在功能。【方法】利用生物信息学方法对MaGDSL进行全基因组鉴定,分析其染色体、启动子顺式作用元件和转录因子结合位点(TFBS)的分布情况以及编码蛋白的理化性质、基因结构、保守基序和系统进化关系,并基于转录组数据库分析MaGDSLs在高温(45℃)/低温(4℃)处理的叶片、枯萎病菌FocTR4侵染的根系以及自然成熟/乙烯催熟的不同成熟阶段的果实中的表达模式,同时利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析部分MaGDSL成员在花粉中的表达情况。【结果】香蕉A基因组中有76个MaGDSL成员,分布于11个染色体上,可分为9个亚家族,各成员编码区长度为1 014~2 193 bp,其中有5个成员含有不同数量的转录本;多数MaGDSL成员包含5个外显子和4个内含子,编码蛋白具有信号肽且主要定位在内外膜上;启动子区存在多种植物激素和逆境胁迫相关响应元件以及22种TFBSs;MaGDSLs中有3个串联重复基因簇位于4、8号染色体,6个串联重复基因对分别位于1、6、7、8、9和10号染色体上,22对片段重复基因分布在除11号染色体外的所有染色体上。MaGDSLs在香蕉叶片和根部的表达水平差异较大,且个别成员受高、低温胁迫以及枯萎病菌调控,其中5个成员(MaGDSL4-5、8-1、8-12、9-4、9-5)受高、低温胁迫抑制表达,而MaGDSL2-1和MaGDSL6-8受高、低温胁迫诱导表达,MaGDSL4-1和MaGDSL11-1受低温和FocTR4调控,MaGDSL5~8仅响应低温胁迫,其中MaGDSL2-2和MaGLP10-5对各种处理均有响应,而MaGDSL1-1在根系和花粉中均有高表达。【结论】MaGDSLs可能在香蕉生长发育过程中发挥重要作用,同时部分成员特异响应生物和非生物胁迫。 展开更多
关键词 香蕉 GDSL脂肪酶 基因组 逆境胁迫 表达分析
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基于转录组的非洲菊PLC基因家族鉴定与进化分析
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作者 王秀美 倪珊珊 +6 位作者 李乾玉 李小芳 林争春 陈裕坤 林玉玲 赖钟雄 杜迎刚 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2021年第5期1267-1273,共7页
磷脂酶C(phospholipase C,PLC)广泛参与植物的生命活动和代谢过程,在抵御真菌感染的过程中发挥重要作用。本研究基于非洲菊转录组测序数据,鉴定出13个非洲菊PLC基因家族成员,其中NPC有3个,PI-PLC有10个。非洲菊PLC的蛋白序列长度在98~59... 磷脂酶C(phospholipase C,PLC)广泛参与植物的生命活动和代谢过程,在抵御真菌感染的过程中发挥重要作用。本研究基于非洲菊转录组测序数据,鉴定出13个非洲菊PLC基因家族成员,其中NPC有3个,PI-PLC有10个。非洲菊PLC的蛋白序列长度在98~594 aa之间,蛋白理论分子量为11410.25~67998.85 kDa,等电点为4.74~9.59,均为不稳定亲水蛋白。亚细胞定位预测结果显示,13个成员分别定位于细胞壁、细胞膜、细胞质、叶绿体和细胞核中,表明不同成员功能上可能存在多样性。进化树分析表明,13个非洲菊PLC蛋白可分为2个亚组,进化关系较近的蛋白结构组成相似。非洲菊PLC家族成员在拟南芥中的同源蛋白PLC2、PLC4、AT2G40116可相互作用。非洲菊转录组的FPKM值分析表明,GjPLC2、GjPLC3、GjPLC8、GjPLC10在非洲菊中表达量高,感病植株中变化大,可能在抵御真菌感染过程中发挥重要作用。研究结果可为进一步研究非洲菊PLC基因的生物学功能提供依据。 展开更多
关键词 非洲菊 磷脂酶C 基因家族 进化分析
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天然气站场三通不等壁厚连接结构优化 被引量:3
13
作者 杨明 牛海仲 +2 位作者 尤泽广 倪姗姗 伍奕 《压力容器》 北大核心 2022年第9期32-41,共10页
针对当前工程应用最大三通规格P 12 MPa,DN1400 mm×1200 mm的X80钢级站场三通,提出扩大三通内径及传统三通采用新型孔锥型坡口两种与工艺管道等内径连接方案,采用弹塑性有限元分析方法,结合基于响应曲面的参数优化方法,确定三通等... 针对当前工程应用最大三通规格P 12 MPa,DN1400 mm×1200 mm的X80钢级站场三通,提出扩大三通内径及传统三通采用新型孔锥型坡口两种与工艺管道等内径连接方案,采用弹塑性有限元分析方法,结合基于响应曲面的参数优化方法,确定三通等内径连接设计的最优方案为壁厚59 mm,内切坡口深度35 mm,实现了连接区域内无应力集中点。运用水压试验爆破方法验证了此结构的安全性,解决了大口径、高压力、高钢级、大壁厚差三通与工艺管道不等壁厚连接问题。此研究结果可为我国今后大口径天然气三通设计制造提供参考依据。 展开更多
关键词 天然气站场三通 不等壁厚连接 极限承载 优化设计
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泛育麦17播期种植密度试验 被引量:5
14
作者 崔晓东 倪闪闪 罗家俊 《种业导刊》 2019年第11期14-17,共4页
以半冬性优质小麦新品种泛育麦17为研究对象,采用裂区试验设计,分析不同播期、不同种植密度对泛育麦17产量及产量要素的影响。结果表明,不同播期(10月5—30日)可影响小麦产量,其中10月5日播种的小麦产量最高,为9 635.4 kg/hm^2,不同种... 以半冬性优质小麦新品种泛育麦17为研究对象,采用裂区试验设计,分析不同播期、不同种植密度对泛育麦17产量及产量要素的影响。结果表明,不同播期(10月5—30日)可影响小麦产量,其中10月5日播种的小麦产量最高,为9 635.4 kg/hm^2,不同种植密度(150万~225万苗/hm^2)小麦产量不同,当种植密度为450万苗/hm^2时,小麦产量最高,为9 646.9 kg/hm^2。泛育麦17在河南省中部地区的最佳播期为10月5—15日,最佳种植密度为150万~225万苗/hm^2。 展开更多
关键词 小麦 泛育麦17 播期 密度
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FIGO Ⅰ期单纯型卵巢透明细胞癌患者的预后分析 被引量:1
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作者 高阳 倪姗姗 曲芃芃 《现代妇产科进展》 CSCD 北大核心 2022年第3期166-170,共5页
目的:分析FIGO Ⅰ期单纯型卵巢透明细胞癌患者的临床病理特点,探寻预后影响因素。方法:回顾分析2010年1月至2019年10月在天津市中心妇产科医院就诊并接受手术治疗的94例Ⅰ期单纯型卵巢透明细胞癌患者的病例资料。应用Kaplan-Meier单因... 目的:分析FIGO Ⅰ期单纯型卵巢透明细胞癌患者的临床病理特点,探寻预后影响因素。方法:回顾分析2010年1月至2019年10月在天津市中心妇产科医院就诊并接受手术治疗的94例Ⅰ期单纯型卵巢透明细胞癌患者的病例资料。应用Kaplan-Meier单因素分析筛选预后相关危险因素,并用Cox比例风险模型进行多因素分析发掘影响预后的独立因素,总结其临床预后特点。结果:94例患者平均发病年龄52岁,均行卵巢癌全面分期手术。中位随访时间58.3个月(13~119个月),8例复发,5例死亡。患者5年生存率93.2%,3年无进展生存率94.1%。腹腔镜分期术患者的5年生存率显著低于开腹分期术患者(75.2%vs 94.6%,P=0.008),p53阳性患者的5年生存率显著低于p53阴性患者(80.2%vs 93.4%,P=0.03)。由于总生存的终点事件较少,无法行Cox多因素分析。结论:Ⅰ期卵巢透明细胞癌肿物大,生长慢,预后好,手术途径及p53对Ⅰ期卵巢透明细胞癌的预后具有重要价值。对于Ⅰ期卵巢透明细胞癌,腹腔镜分期手术的肿瘤学安全性尚不确定,应综合评估患者情况及肿瘤破裂风险后谨慎使用。 展开更多
关键词 卵巢透明细胞癌 FIGOⅠ期 预后
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气相色谱法测定高纯溴化氢中的微量杂质 被引量:1
16
作者 倪珊珊 郑秋艳 +3 位作者 陈润泽 滕莹 范娜 路璐 《低温与特气》 CAS 2022年第5期46-48,51,共4页
提出了一种溴化氢中微量气体杂质的分析方法,采用配备反吹气路的氦离子化检测器的气相色谱仪实现了高纯溴化氢中微量H_(2)、O_(2)、N_(2)、CO、CH_(4)及CO_(2)的分离检测。
关键词 溴化氢 气相色谱 氦离子化检测器 反吹
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潮州古城区文化创意旅游SWOT分析及发展对策研究 被引量:3
17
作者 倪珊珊 沈淇 《顺德职业技术学院学报》 2019年第3期38-44,共7页
文化创意旅游是一种不同于传统旅游的可持续发展模式。为了充分发挥潮州丰富的文化旅游资源,潮州古城区需要大力发展潮州的文化创意旅游,激发潮州旅游业潜在的活力,强化潮州古城区的知名度,以实现潮州旅游业的可持续发展。在阐述文化创... 文化创意旅游是一种不同于传统旅游的可持续发展模式。为了充分发挥潮州丰富的文化旅游资源,潮州古城区需要大力发展潮州的文化创意旅游,激发潮州旅游业潜在的活力,强化潮州古城区的知名度,以实现潮州旅游业的可持续发展。在阐述文化创意旅游的含义、文化创意旅游的影响因素和发展模式的基础上,运用SWOT理论分析潮州古城区发展文化创意旅游存在的优势、劣势、机会和挑战,并提出发展潮州古城区文化创意旅游的对策。 展开更多
关键词 文化创意旅游 SWOT理论 潮州古城区 对策
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文心兰PLC基因家族鉴定及其应答软腐菌侵染转录模式
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作者 林争春 倪珊珊 +5 位作者 张春渝 吴秋桢 张舒婷 张梓浩 林玉玲 赖钟雄 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期614-622,共9页
磷酸肌醇信号途径广泛参与生物体内多种细胞信号转导过程,PLC是该信号途径中的关键酶,在植物先天性免疫反应中起核心作用.为鉴定文心兰PLC基因家族成员、了解成员特征及其在应答软腐病菌侵染过程中的表达模式,基于‘南茜’文心兰应答软... 磷酸肌醇信号途径广泛参与生物体内多种细胞信号转导过程,PLC是该信号途径中的关键酶,在植物先天性免疫反应中起核心作用.为鉴定文心兰PLC基因家族成员、了解成员特征及其在应答软腐病菌侵染过程中的表达模式,基于‘南茜’文心兰应答软腐病菌侵染的转录组数据,利用生物信息学方法对其蛋白理化性质、亚细胞定位、二级结构、系统进化特征、保守氨基酸序列、蛋白互作网络及在文心兰感病过程中的表达模式(RPKM值)进行分析.共鉴定得到9个文心兰PLC基因家族成员,其编码蛋白的长度在332-600 aa,分子量(Mr)约为36.92×10^(3)-68.44×10^(3),等电点介于5.42-8.50,均属于不稳定亲水蛋白.亚细胞定位预测结果表明,文心兰PLC蛋白在过氧化物酶体、细胞核、细胞质、叶绿体和线粒体中均有分布.根据进化树和保守基序分析,文心兰PLC蛋白可分为PI-PLC和NPC 2个亚族,包含18个保守基序.String构建蛋白互作网络发现,PLC家族成员可能与PTEN3、PIP5K、PIS1以及G蛋白存在互作关系.RNA-seq表达量分析表明,9个文心兰PLC家族基因在‘南茜’文心兰不同感病时期(12 h和36 h)有明显不同的表达规律.其中,OhNPC1、OhPLC3以及OhPLC5在病原菌侵染初期与后期均显著上调表达,OhPLC4和OhPLC6在病原菌侵染后期显著上调表达.本研究表明OhNPC1、OhPLC3、OhPLC4、OhPLC5和OhPLC6可能在文心兰抵御软腐菌侵染过程中发挥重要作用.(图8表5参50) 展开更多
关键词 文心兰 PLC 基因家族鉴定 软腐菌 表达分析
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香蕉漆酶基因家族鉴定及低温胁迫下的表达分析 被引量:9
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作者 刘彦英 倪珊珊 +2 位作者 项蕾蕾 陈裕坤 赖钟雄 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期837-852,共16页
为研究香蕉漆酶基因家族成员的功能,采用生物信息学方法鉴定香蕉漆酶基因成员,分析其低温胁迫下的表达情况,为香蕉抗寒研究提供理论依据。从香蕉A(Musa acuminata)基因组筛选了22条漆酶基因(MaLAC),从香蕉B(Musa balbisiana)基因组筛选... 为研究香蕉漆酶基因家族成员的功能,采用生物信息学方法鉴定香蕉漆酶基因成员,分析其低温胁迫下的表达情况,为香蕉抗寒研究提供理论依据。从香蕉A(Musa acuminata)基因组筛选了22条漆酶基因(MaLAC),从香蕉B(Musa balbisiana)基因组筛选了11条漆酶基因(MbLAC),通过生物信息分析发现MaLAC比MbLAC更保守。分子进化树分析结果表明MaLAC可分为5类,MbLAC可分为4类。启动子顺式作用元件分析结果表明,MaLAC启动子序列包含大量光响应、激素应答及非生物胁迫等应激响应元件,推测MaLAC基因家族在响应逆境胁迫的过程中发挥重要作用。利用qRT-PCR技术对MaLAC部分成员在响应不同低温胁迫的表达情况进行分析,MaLAC3-2、MaLAC4、MaLAC4-5、MaLAC17在低温(13、4、0℃)处理下表达量均极显著高于对照(28℃),推测可能在香蕉响应低温胁迫的过程中发挥重要作用。预测香蕉MaLAC家族有18个成员受miRNA调控,主要受miR397和miR408的调控;推测香蕉MaLAC可能参与miRNA调控途径。 展开更多
关键词 香蕉 漆酶家族 成员鉴定 生物信息分析 低温胁迫
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石斛PRMT基因家族的鉴定及其在不同光周期下的表达 被引量:1
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作者 赵桦 张舒婷 +7 位作者 刘蒲东 倪珊珊 付帅 叶炜 陈裕坤 林玉玲 徐涵 赖钟雄 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期413-422,共10页
蛋白质精氨酸甲基转移酶(protein arginine methyltransferases,PRMTs)是真核生物基因组中重要的表观遗传调控因子之一,在植物信号转导、蛋白亚细胞定位和转录调控中发挥着重要作用.基于铁皮石斛基因组数据库,采用生物信息学方法对石斛P... 蛋白质精氨酸甲基转移酶(protein arginine methyltransferases,PRMTs)是真核生物基因组中重要的表观遗传调控因子之一,在植物信号转导、蛋白亚细胞定位和转录调控中发挥着重要作用.基于铁皮石斛基因组数据库,采用生物信息学方法对石斛PRMT基因家族进行成员鉴定,并对其基因结构、蛋白质保守基序(motif)、蛋白质理化特性和启动子顺式作用元件等进行分析.通过qRT-PCR检测DoPRMT在不同组织部位中的表达模式及对不同光周期条件的响应.在铁皮石斛(Dendrobium officinale)基因组上共筛选鉴定到6个PRMT成员,基因结构分析发现,该家族各成员内含子外显子数量有所差异,其中相差数量最多的达到25个.系统进化树可将石斛PRMT家族划分为3种类型(I、II、III)甲基转移酶,石斛中存在I型PRMT有5个,1个II型PRMT,III型甲基转移酶在其中不存在同源序列.保守结构域分析结果显示,该家族成员含有特定的PRMT和PrmA保守结构域,多数成员仅含有PrmA结构域.保守基序分析发现,该家族包含motif数量较多,各成员包含共有的motif1和motif4.启动子作用元件分析发现,该家族成员包含众多光响应元件及激素应答、厌氧诱导、逆境响应等相关响应元件.qRT-PCR数据表明,该家族各成员在金钗石斛(Dendrobium nobile)叶片中表达较高,茎中的表达较低,少数成员在根中表达较高.此外,DoPRMT在不同光周期下呈现差异性表达模式,各成员在24 h(光照)/0 h(黑暗)下相对表达量较高,在12 h/12 h、8 h/16 h、4 h/20 h等光周期条件下表达相对较低.本研究表明石斛PRMT家族成员表达具有组织特异性,并且可能在石斛响应光周期的过程中发挥重要作用.(图7表4参58) 展开更多
关键词 铁皮石斛 金钗石斛 DoPRMT 表达模式 光周期
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