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强化实验室认证管理项目对结核病实验室质量管理的效果评价 被引量:2
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作者 郑扬 夏辉 +2 位作者 欧喜超 宋媛媛 赵雁林 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2023年第10期967-973,共7页
目的:评价强化实验室认证管理(strengthening laboratory management toward accreditation,SLMTA)项目干预措施对结核病实验室质量管理的效果。方法:根据选点要求和自愿申报原则选择保山市、南京市和成都市3家医疗机构的结核病实验室... 目的:评价强化实验室认证管理(strengthening laboratory management toward accreditation,SLMTA)项目干预措施对结核病实验室质量管理的效果。方法:根据选点要求和自愿申报原则选择保山市、南京市和成都市3家医疗机构的结核病实验室为项目实施单位(随机编号为1、2、3号),对项目实验室实施了包括培训、定期沟通、改进措施有效性验证等干预措施,然后在不同阶段(基线、中期和终末期)使用标准化清单对项目实验室进行实验室质量管理的12个质量体系要素的现场评估,并对评价结果进行差异性分析。结果:基线评估时,实验室1、2、3的平均得分率为(43.17±2.48)%,评级均为0星。中期评估时,3家项目实验室的平均得分率为(70.19±4.16)%,实验室1和3达到2星,实验室2达到3星。终末期评估时,3家项目实验室的平均得分率为(87.88±1.37)%,均达到4星级别,3家项目实验室在3个不同时间段的平均得分率差异有统计学意义(F=165.700,P<0.001)。比较12个质量体系要素在基线评估和终末评估时的得分率,发现文件和记录、组织机构和人员、设备、过程控制和内部/外部质量评估、信息管理、内部评审、问题/事件处理和流程改进、纠正措施等8项质量体系要素的平均得分率分别由基线的(46.43±0.00)%、(42.42±5.67)%、(43.31±8.07)%、(52.09±3.90)%、(71.35±5.42)%、(2.22±3.14)%、(25.00±13.61)%和(21.05±15.49)%升高至终末期评估的(83.33±1.68)%、(87.88±11.34)%、(93.66±0.40)%、(88.55±2.95)%、(89.81±0.48)%、(91.11±12.57)%、(88.89±10.39)%和(78.95±0.00)%,差异均有统计学意义(t=31.010,P=0.001;t=10.010,P=0.010;t=9.108,P=0.012;t=9.709,P=0.010;t=4.559,P=0.045;t=11.090,P=0.008;t=4.600,P=0.044;t=5.284,P=0.034)。结论:SLMTA项目的实施有助于提高结核病实验室质量管理,提示可以在全国更广泛地实施项目中的各项干预措施。 展开更多
关键词 结核 实验室 医院 管理质量小组 质量控制 评价研究
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双靶标实时荧光PCR检测技术用于牛结核病快速诊断的研究 被引量:1
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作者 欧喜超 赵冰 +8 位作者 滕冲 张思琦 许晔 邢睿达 裴少君 夏辉 王胜芬 范伟兴 赵雁林 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2023年第11期1052-1057,共6页
目的:针对结核分枝杆菌复合群(Mycobacterium tuberculosis complex,MTBC)IS6110和IS1081基因,开发双靶标实时荧光PCR检测技术并评价其在剖检奶牛病料中进行MTBC快速检测的可行性,为分子检测技术在牛结核病早期诊断领域的推广应用提供... 目的:针对结核分枝杆菌复合群(Mycobacterium tuberculosis complex,MTBC)IS6110和IS1081基因,开发双靶标实时荧光PCR检测技术并评价其在剖检奶牛病料中进行MTBC快速检测的可行性,为分子检测技术在牛结核病早期诊断领域的推广应用提供基础数据支持。方法:以IS6110和IS1081为特异靶基因建立MTBC实时荧光PCR检测体系;通过制备并检测含有不同浓度牛分枝杆菌菌悬液的牛肺组织,确定双靶标实时荧光PCR检测体系的检出限;使用21株常见非结核分枝杆菌标准株的DNA作为扩增模板,确定双靶标实时荧光PCR检测MTBC的特异度;对剖检奶牛组织病料进行MGIT 960液体培养、Xpert MTB/RIF(简称“Xpert”)、Xpert MTB/RIF Ultra(简称“Xpert Ultra”)和双靶标实时荧光PCR检测,以液体培养结果为参照标准,分析双靶标实时荧光PCR检测在剖检奶牛病料中检测MTBC的效能。结果:双靶标实时荧光PCR检测21株非结核分枝杆菌菌株的DNA,均未检测到扩增曲线,MTBC检测特异度为100.0%(21/21)。组织病料液体培养、Xpert、Xpert Ultra和双靶标荧光PCR检测阳性率分别为64.0%(32/50)、56.0%(28/50)、78.0%(39/50)和76.0%(38/50)。双靶标荧光PCR检测阳性率明显高于Xpert检测阳性率,差异有统计学意义(χ^(2)=4.456,P=0.035),双靶标荧光PCR检测阳性率与Xpert Ultra检测阳性率差异无统计学意义(χ^(2)=0.056,P=0.812)。以液体培养结果为参照标准,双靶标荧光PCR检测MTBC的敏感度和特异度分别为90.3%(28/31)和40.0%(6/15);Xpert Ultra检测MTBC的敏感度和特异度分别为96.8%(30/31)和40.0%(6/15)。结论:双靶标荧光PCR检测技术可用于牛结核病的早期快速诊断,有助于控制人畜共患结核病的流行和传播。 展开更多
关键词 结核 动物疾病 分子探针技术 诊断
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我国结核病耐药状况:2018年全国结核病耐药监测数据分析 被引量:23
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作者 王胜芬 周杨 +6 位作者 欧喜超 夏辉 赵冰 宋媛媛 郑扬 杜昕 赵雁林 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2022年第11期1141-1147,共7页
目的:分析我国2018年结核病耐药流行状况,为结核病治疗和防控政策的制定提供参考。方法:沿用2007—2008年全国结核病耐药性基线调查抽取的70个调查点作为监测点,以2018年新诊断的涂阳肺结核患者为研究对象,采用统一的信息表收集研究对... 目的:分析我国2018年结核病耐药流行状况,为结核病治疗和防控政策的制定提供参考。方法:沿用2007—2008年全国结核病耐药性基线调查抽取的70个调查点作为监测点,以2018年新诊断的涂阳肺结核患者为研究对象,采用统一的信息表收集研究对象的社会人口学特征、病史和治疗用药史等信息;同时,在监测点采集可疑肺结核患者的痰标本并进行涂片和培养,阳性分离菌株送至省、市级疾病预防控制中心或结核病防治机构进行菌种鉴定和药物敏感性试验(简称“药敏试验”)。考虑复杂抽样设计和抽样权重,采用SAS 9.4 survey procedures相关程序计算加权耐药率,以logistic回归评估耐药率的变化。结果:3820例新涂阳和643例复治涂阳患者纳入本研究。新涂阳患者、复治涂阳患者的利福平耐药率分别为5.08%(95%CI:4.39%~5.77%)和23.31%(95%CI:20.14%~26.48%);新涂阳患者、复治涂阳患者的耐多药率分别为3.52%(95%CI:2.94%~4.11%)和18.01%(95%CI:15.36%~20.67%)。与基线调查相比,新涂阳患者[OR(95%CI)值为0.71(0.58~0.87);P<0.001]和复治涂阳患者[OR(95%CI)值为0.53(0.41~0.68);P<0.001]的利福平耐药率较基线显著下降;新涂阳患者[OR(95%CI)值为0.53(0.42~0.67);P<0.001]和复治涂阳患者[OR(95%CI)值为0.47(0.36~0.61);P<0.001]的耐多药率较基线也显著下降。估计2018年登记的病原学阳性肺结核患者中,新涂阳患者、复治涂阳患者利福平耐药例数分别为12662例(95%CI:10942~14382)和8156例(95%CI:7047~9265)。结论:2018年新涂阳和复治涂阳肺结核患者利福平耐药率、耐多药率较基线调查时均显著降低。但由于人口众多,我国耐药结核病总体负担仍然较重。建议采取综合措施以减少耐药结核病的产生和传播,进而降低我国耐药结核病总体负担。 展开更多
关键词 结核 分枝杆菌 结核 抗药性
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2018-2022年内蒙古自治区兴安盟结核病流行特征及发病预测模型应用
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作者 孙博 滕冲 +5 位作者 冯丽平 朱含芳 欧喜超 李永慧 黄欣宇 彩花 《疾病监测》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期200-206,共7页
目的分析2018—2022年内蒙古自治区兴安盟地区结核病疫情流行变化特征,为兴安盟地区结核病防控提供科学依据。方法通过中国疾病预防控制信息管理系统导出2018—2022年兴安盟6个县(市、旗)报告结核病患者相关资料,分析该地区近5年结核病... 目的分析2018—2022年内蒙古自治区兴安盟地区结核病疫情流行变化特征,为兴安盟地区结核病防控提供科学依据。方法通过中国疾病预防控制信息管理系统导出2018—2022年兴安盟6个县(市、旗)报告结核病患者相关资料,分析该地区近5年结核病报告发病率的变化趋势,并建立季节性自回归移动平均模型(ARIMA)预测短期发病情况。结果2018—2022年,兴安盟地区累计报告结核病患者5909例,平均报告发病率77.26/10万,报告发病率呈明显下降趋势(趋势χ^(2)=222.977,P<0.001),各县(市、旗)报告发病率差异有统计学意义(χ^(2)=340.103,P<0.001)。病原学阳性患者平均报告发病率为31.93/10万,呈上升趋势(趋势χ^(2)=137.504,P<0.001);报告发病主要集中在3—5月和11月至次年1月;男女性别比为2.24∶1,50岁及以上人群发病率最高(120.18/10万);职业分布以农牧民群体占比最高(62.95%,3720/5909)。以2012—2021年结核病发病数建立的季节性ARIMA(0,1,1)(0,1,2)12模型具有较好的预测效果,总体相对误差为6.14%,6个月预测值95%置信区间均涵盖真实值。结论兴安盟地区结核病报告发病率总体呈逐年下降趋势,各县(市、旗)之间发病率有明显差异,男性、老年人、农牧民等是结核发病重点人群,应有针对性的加强重点人群的防控措施。建立的季节性ARIMA(0,1,1)(0,1,2)12模型可用于兴安盟地区结核病短期发病预测。 展开更多
关键词 结核病 流行特征 自回归积分移动平均模型 预测
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Evaluation of the Xpert MTB/RIF assay for diagnosis of tuberculosis and rifampin resistance in county-level laboratories in Hunan province, China 被引量:24
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作者 Hu Peilei Bai Liqiong +8 位作者 Liu Fengping ou xichao Zhang Zhiying Yi Songlin Chen Zhongnan Gong Daofang Liu Binbin Guo Jingwei Tan Yunhong 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 2014年第21期3744-3750,共7页
Background The Xpert MTB/RIF showed high sensitivity and specificity in previous studies carried out in different epidemiological and geographical settings and patient populations in high-burden tuberculosis (TB) co... Background The Xpert MTB/RIF showed high sensitivity and specificity in previous studies carried out in different epidemiological and geographical settings and patient populations in high-burden tuberculosis (TB) countries.However,there were little data obtained by validation or demonstration study of the assay in China.In this study,the performance of Xpert MTB/RIF was investigated in two county-level laboratories in Hunan Province,China.Methods Consecutive patients with suspected pulmonary tuberculosis (PTB) and suspicion for multidrug-resistant tuberculosis (MDR-TB) were enrolled.For each patient suspected to have PTB,three sputum specimens (one spot sputum,one night sputum,and one morning sputum) were collected and each sputum was tested with smear microscopy,L(o)wenstein-Jensen (LJ) culture,and Xpert MTB/RIF test.For comparison across subgroups and testing methods,95% confidence intervals were calculated.All analyses were done with SPSS 16.0,and P <0.05 was regarded as significant.Results For case detection,the sensitivity of Xpert MTB/RIF was 100% for smear-and culture-positive TB and 88.6% for smear-negative and culture-positive TB; the overall sensitivity was 94.5% for all culture-positive patients.The specificity was 99.8%.The sensitivity of Xpert MTB/RIF assay was 22.0% in clinical TB patients and the specificity reached 100.0% in the group of patients who are infected with nontuberculous mycobacteria.For the detection of rifampin resistance,the sensitivity of MTB/RIF RIF-resistance detection was 92.9%,and the specificity was 98.7%.Of the 26 Xpert MTB/RIF-positive and RIF-resistant patients confirmed by LJ proportion tests,20 (76.9%) patients were infected by MDR-TB.Conclusions The Xpert MTB/RIF assay is a highly sensitive and specific method for diagnosis of TB and RIF resistance,which will enable it to have the potential to be used in county-level laboratories and lead to the reduction of the infectious pool and improvements in TB control in China.Further evaluations in county-level laboratories for implementing the assay are still required. 展开更多
关键词 pulmonary tuberculosis Xpert MTB/RIF DIAGNOSIS rifampin resistance
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基于多重PCR-质谱微测序技术的结核分枝杆菌对一线治疗药物耐药性检测系统构建 被引量:1
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作者 徐晓娜 赵欣 +3 位作者 欧喜超 肖迪 宋衍燕 赵雁林 《疾病监测》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期586-593,共8页
目的构建一种基于多重聚合酶链式反应-质谱微测序技术的结核分枝杆菌耐药基因多位点检测方法和检测模块,实现结核分枝杆菌对一线抗结核药物的高通量快速检测,为结核病诊疗提供一种新型技术支撑。方法通过对5个单核苷酸多态性位点靶基因... 目的构建一种基于多重聚合酶链式反应-质谱微测序技术的结核分枝杆菌耐药基因多位点检测方法和检测模块,实现结核分枝杆菌对一线抗结核药物的高通量快速检测,为结核病诊疗提供一种新型技术支撑。方法通过对5个单核苷酸多态性位点靶基因进行多重PCR扩增、单碱质量探针延伸及分子质量测定,同时完成16个突变位点、26种突变型的检测,实现结核分枝杆菌对利福平、异烟肼、吡嗪酰胺和乙胺丁醇等一线治疗药物抗性的通量检测。采用40例结核分枝杆菌样本、50例呼吸道感染患者咽拭子样本进行检测体系准确性及特异性验证。结果本研究构建了基于5重PCR-质谱联用的结核分枝杆菌对一线治疗药物的泛耐药检测方法,并开发了质谱配套检测系统。采用该系统,结核分枝杆菌对利福平、异烟肼、吡嗪酰胺、乙胺丁醇抗性检测的准确率和特异性均为100.00%,且具有7 h内完成96个样本的检测通量。结论本研究构建的方法有操作简便、低成本、高通量特点,耐药位点检测全面且准确,并具扩展性,可根据需要增添新突变位点,在结核分枝杆菌耐药性检测中具有良好应用前景。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 一线治疗药物 耐药性 多重聚合酶链式反应-质谱微测序技术
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新疆地区牛分枝杆菌29个毒力基因的突变分析
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作者 董玉慧 罗力嘉 +5 位作者 李梦莹 欧喜超 刘春法 范伟兴 赵雁林 周向梅 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第9期110-117,共8页
为了解我国新疆地区牛分枝杆菌的毒力基因变异情况并初步评估其毒力变化,利用聚合酶链式反应(PCR)检测临床分离的66株牛分枝杆菌的29个毒力基因,经Sanger测序后与标准株AF2122/97和本实验室保存的两株牛分枝杆菌(M.bovis C68004和M.bovi... 为了解我国新疆地区牛分枝杆菌的毒力基因变异情况并初步评估其毒力变化,利用聚合酶链式反应(PCR)检测临床分离的66株牛分枝杆菌的29个毒力基因,经Sanger测序后与标准株AF2122/97和本实验室保存的两株牛分枝杆菌(M.bovis C68004和M.bovis N)进行序列比对,对基因突变情况进行统计,分析基因突变对其编码蛋白功能和结构的影响。结果表明:1)临床分离株与本实验室保存的高毒力菌株M.bovis N毒力基因突变位点具有很高的相似性,在检测的29个毒力基因中,50%以上临床分离株与M.bovis N共有25个基因序列一致,2)临床分离株广泛存在的Mb2958、Mb2982C和Mb1553C基因突变PROVEAN评分均低于-2.5,可能改变其编码的酶催化活性,进而影响细胞壁脂类合成,3)Mb0607、Mb0609、Mb0606、Mb2979C和Mb1214基因突变分别造成哺乳动物细胞入侵蛋白、甲基转移酶和酰基转移酶蛋白二级结构改变,或许对细菌的胞内生存产生影响。综上,本研究筛选出8个关键毒力基因,这些基因的突变可能在新疆地区牛分枝杆菌流行菌株的毒力变化中发挥重要作用,同时,本研究揭示了关键毒力基因的突变特征,为进一步研究牛分枝杆菌遗传多样性及进化规律奠定了基础。 展开更多
关键词 牛分枝杆菌 毒力基因 临床分离株 基因突变
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