应用IS 6110探针对泰国结核菌的限定性片段长度多态性研究

背景:泰国中部的三所指定医院。目的:检测由指定医院分离的结核菌的种群结构。设计:收到的来自泰国中部医院的211株细菌分离株与IS6110探针和其它探针经过Southern杂交进行研究。结果:观察到仅有一个IS6110拷贝的菌株43株。这些菌株能进一步被DR和PGRS特异性探针加以区分。具有相似杂交形式的菌株的两大组被分开。北京家族含80株是以前曾报道过广泛在中国、蒙古、泰国和韩国发现的菌株。Nonthaburi组29株菌株是本地菌株。患者的年龄、性别和HIV状态与被特定杂交形式的菌株感染的机会无明确的相关。尽管如此,仍发现被分簇的菌株在北京家族和Nonthaburi组的成员之间更为普遍。结论:IS6110的Southern杂交在泰国结核病的流行病学研究中被发现是有用的。北京家族的存在被证实。北京家族在几个亚州国家中的不寻常的广泛传播值得进一步调查。

应用扩增直接重复序列DNA片段对泰国结核分支杆菌菌株基因差异的研究

背景:发展并使用一种用于研究结核分支杆菌基因差异的聚合酶链反应(PCR)设计:结核分支杆菌H_(37)Rv的两个多态性DNA片段被鉴定和测序。然后引物被设计以用于对两个多态性片段同时进行扩增。该方法被用于研究179例临床结核菌分离株,这些菌株以前曾用IS6110的Southern杂交鉴定。结果:两个多态性片段均含有直接重复序列。其中一个片段的直接重复序列位于α-异丙基苹果酸酯合成酶基因的编码序列之间。179个菌株的两个片段经过扩增后,PCR产物的40个型能够被鉴定。该方法能够将38个IS6110单带菌株区分为23个型。属于北京家族的菌株中的大多数具有与H_(37)Rv相同的PCR产物。Nonthaburi组成员的PCR产物彼此间是相似的。结论:这些结果符合北京家族和Nonthaburi组成员起源于两个共同祖先的假说。该PCR方法可能有助于对含IS6110单拷贝的结核菌菌株进行区分。