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一种基于PCR的水稻SNP标记检测方法 被引量:1
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作者 王钰 许学 +6 位作者 秦瑞英 陆徐忠 李莉 杨剑波 倪金龙 马卉 汪秀峰 《中国农学通报》 2020年第9期82-93,共12页
旨在找到一种简便的SNP检测方法用于水稻种性鉴定及遗传多样性分析,本研究以245份长江中下游主推杂交水稻品种及亲本为研究材料,从1319个SNP位点中筛选出124对多态性高的位点,建立SNP的高效检测体系。选用其中的1个标记sf0141821553和SS... 旨在找到一种简便的SNP检测方法用于水稻种性鉴定及遗传多样性分析,本研究以245份长江中下游主推杂交水稻品种及亲本为研究材料,从1319个SNP位点中筛选出124对多态性高的位点,建立SNP的高效检测体系。选用其中的1个标记sf0141821553和SSR的标记RM7120来检测水稻的纯度,分别利用Caps-AccI标记和SNP-sf0601764762扩增亲本及杂交后代Wx的基因型,两者结果完全一致。用124对位点对245份杂交水稻进行遗传多样性分析,聚类分析显示,245个品种间的遗传相似系数在0.64~0.97之间。以遗传相似系数0.64为阈值,可以将245个水稻品种分为2个类群,这2个类群分别在遗传相似系数为0.712和0.667处又可以分为2个亚群。结果表明材料间存在明显的群体结构,能精确区分待测品种的基因型以及品种间的遗传差异。利用聚丙烯酰胺凝胶电泳来实现SNP标记的检测,方法简便且不需要大型仪器设备和昂贵的试剂,便于实验室开展水稻品种的鉴定工作。 展开更多
关键词 水稻 SNP 功能基因 标记筛选 多态性
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粤港澳大湾区背景下广州制造业空间优化途径探析 被引量:3
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作者 秦瑞英 白伟杉 《城市观察》 2022年第4期38-46,160,共10页
随着《粤港澳大湾区发展规划纲要》的实施和推进,广州作为大湾区的核心城市之一,坚持“制造业立市”,推动制造业发展水平不断提高,对粤港澳大湾区制造业高质量发展的引领作用日益增强。本文分析粤港澳大湾区制造业空间分布现状特点及广... 随着《粤港澳大湾区发展规划纲要》的实施和推进,广州作为大湾区的核心城市之一,坚持“制造业立市”,推动制造业发展水平不断提高,对粤港澳大湾区制造业高质量发展的引领作用日益增强。本文分析粤港澳大湾区制造业空间分布现状特点及广州制造业在全国和大湾区的地位,揭示广州制造业布局现状和存在问题,探索广州制造业空间布局创新调整途径,提出广州要以实施“优内联外”战略为核心,优化拓展制造业发展空间,携手共建大湾区具有国际竞争力的先进制造业基地。 展开更多
关键词 粤港澳大湾区 制造业 空间优化 广州
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液基薄层细胞学检查、人乳头状瘤病毒检测及阴道镜检查在宫颈癌前病变及宫颈癌筛查中的应用价值 被引量:87
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作者 罗晶 李婷婷 +5 位作者 王倩 付晓飞 秦海霞 侯瑞杰 秦瑞英 王世进 《新乡医学院学报》 CAS 2021年第5期427-430,435,共5页
目的探讨液基薄层细胞学检测(TCT)、人乳头状瘤病毒(HPV)检测、阴道镜检查在宫颈癌前病变及宫颈癌筛查中的应用价值。方法回顾性分析2019年5月至2020年4月于新乡医学院第一附属医院同时行TCT、HPV检测及阴道镜检查的459例疑似宫颈病变... 目的探讨液基薄层细胞学检测(TCT)、人乳头状瘤病毒(HPV)检测、阴道镜检查在宫颈癌前病变及宫颈癌筛查中的应用价值。方法回顾性分析2019年5月至2020年4月于新乡医学院第一附属医院同时行TCT、HPV检测及阴道镜检查的459例疑似宫颈病变患者的临床资料。以组织学结果为“金标准”,分析TCT、HPV检测、阴道镜检查在宫颈癌前病变及宫颈癌筛查中的价值。结果459例疑似宫颈病变患者经宫颈活体组织检查确诊为宫颈病变者157例,其中低级别鳞状上皮内病变59例、高级别鳞状上皮内病变80例、宫颈癌18例。459例疑似宫颈病变患者中,TCT筛查阳性292例(阳性率63.62%),HPV筛查阳性342例(阳性率74.51%),TCT和HPV联合筛查阳性456例(阳性率99.35%)。TCT在宫颈癌前病变及宫颈癌诊断中的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、假阳性率、假阴性率、准确度分别为63.69%(100/157)、36.42%(110/302)、34.25%(100/292)、65.87%(110/167)、63.58%(192/302)、36.31%(57/157)、47.93%(220/459);HPV检测在宫颈癌前病变及宫颈癌诊断中的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、假阳性率、假阴性率、准确度分别为89.17%(140/157)、33.11%(100/302)、40.94%(140/342)、85.47%(100/117)、66.89%(202/302)、10.83%(17/157)、52.29%(240/459);TCT和HPV联合检测在宫颈癌前病变及宫颈癌诊断中的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、假阳性率、假阴性率、准确度分别为98.73%(155/157)、0.33%(1/302)、33.99%(155/456)、33.33%(1/3)、99.67%(301/302)、1.27%(2/157)、33.99%(156/459)。HPV检测在宫颈癌前病变及宫颈癌诊断中的灵敏度、阴性预测值高于TCT检测,假阴性率低于TCT(P<0.05);TCT与HPV检测在宫颈癌前病变及宫颈癌诊断中的特异度、阳性预测值、假阳性率、准确度比较差异无统计学意义(P>0.05)。TCT和HPV联合检测在宫颈癌前病变及宫颈癌诊断中的灵敏度、假阳性率高于TCT,特异度、假阴性率、准确度低于TCT(P<0.05);TCT和HPV联合检测与单独TCT在宫颈癌前病变及宫颈癌诊断中的阳性预测值、阴性预测值比较差异无统计学意义(P>0.05)。TCT和HPV联合检测在宫颈癌前病变及宫颈癌诊断中灵敏度、假阳性率高于单独HPV检测,特异度、假阴性率、阳性预测值、阴性预测值、准确度低于单独HPV检测(P<0.05)。病理学检查确诊为宫颈病变的患者157例,TCT检出率为63.69%(100/157),HPV检出率为89.17%(140/157),阴道镜检出率为86.62%(136/157),TCT、HPV及阴道镜检查三者联合检出率为100.00%(157/157);HPV检测、阴道镜检查的检出率均高于TCT(P<0.05),HPV检测和阴道镜检查的检出率比较差异无统计学意义(P>0.05),TCT、HPV、阴道镜检查联合检测的检出率高于三者单独检测(P<0.05)。结论TCT、HPV和阴道镜检查联合检测在宫颈癌筛查中具有高检出率、低漏诊率、无创、经济等优点,对早期发现宫颈病变有重要意义。 展开更多
关键词 液基薄层细胞学检查 人乳头状瘤病毒 阴道镜检查 宫颈癌前病变 宫颈癌 筛查
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基因组编辑技术在作物育种中的应用及监管现状 被引量:3
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作者 秦瑞英 殷三 +4 位作者 李娟 李浩 杨亚春 杨剑波 魏鹏程 《中国农学通报》 2019年第6期96-100,共5页
随着基因组编辑技术的迅猛发展,CRISPR/Cas9系统已经成为农作物改良的最主要手段之一。为给中国未来可能出现的,商业化应用的基因编辑作物的监管工作提供参考,本文简要归纳了目前运用CRISPR/Cas9技术培育农作物的现状,总结了基因编辑技... 随着基因组编辑技术的迅猛发展,CRISPR/Cas9系统已经成为农作物改良的最主要手段之一。为给中国未来可能出现的,商业化应用的基因编辑作物的监管工作提供参考,本文简要归纳了目前运用CRISPR/Cas9技术培育农作物的现状,总结了基因编辑技术在作物改良中的典型成功事例,分析了各国政府对于基因编辑作物的监管态度,并指出中国科学家应在此次革命中迎头赶上。 展开更多
关键词 基因编辑 基因修饰作物 作物育种 监管 检测
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CRISPR/Cas9-Mediated Adenine Base Editing in Rice Genome 被引量:7
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作者 LI Hao qin ruiying +4 位作者 LIU Xiaoshuang LIAO Shengxiang XU Rongfang YANG Jianbo WEI Pengcheng 《Rice science》 SCIE CSCD 2019年第2期125-128,I0018-I0023,共5页
Precise base editing is highly desired in plant functional genomic research and crop molecular breeding. In this study, we constructed a rice-codon optimized adenine base editor(ABE)-nC as9 tool that induced targeted ... Precise base editing is highly desired in plant functional genomic research and crop molecular breeding. In this study, we constructed a rice-codon optimized adenine base editor(ABE)-nC as9 tool that induced targeted A·T to G·C point mutation of a key single nucleotide polymorphism site in an important agricultural gene. Combined with the modified single-guide RNA variant, our plant ABE tool can efficiently achieve adenine base editing in the rice genome. 展开更多
关键词 PRECISE optimized ADENINE AGRICULTURAL GENE
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基于地理位置解析的种子溯源双向动态交互模型及实现 被引量:2
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作者 方钰 朱静波 +3 位作者 许学 秦瑞英 郭书普 张立平 《农业工程学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第24期207-214,共8页
为更好解决农作物种子溯源问题,帮助生产企业统计分析经营状况,实现交互式营销,该文利用种子电子代码,通过分开录入售前阶段各级分销信息,分层写入地理代码集合,在用户验证最小包装单元时动态解析用户位置信息,逐层匹配地理代码集合,构... 为更好解决农作物种子溯源问题,帮助生产企业统计分析经营状况,实现交互式营销,该文利用种子电子代码,通过分开录入售前阶段各级分销信息,分层写入地理代码集合,在用户验证最小包装单元时动态解析用户位置信息,逐层匹配地理代码集合,构建了种子溯源双向动态交互模型。用户通过该模型获得溯源信息时可选择互动交流,企业可采集用户行为数据,推送营销信息,实现了溯源结果对企业、用户双向推送。通过对小麦品种华成3366销售和反馈2组数据进行相关性分析,其拟合优度为0.997 8,说明企业通过扫码次数的反馈能较好地促进销售,有效防止窜货发生。该模型分层独立的流通信息,保证了溯源的可靠性;双向交互性有效地帮助企业指导生产实际,也为监管部门提供了可靠的管理手段。 展开更多
关键词 种子 农作物 模型 种子溯源 位置解析 地理代码集合 种子电子代码
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SDF5 Encoding P450 Protein Is Required for Internode Elongation in Rice
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作者 Yang Yachun Li Juan +6 位作者 Li Hao Xu Zuntao qin ruiying Wu Wenge Wei Pengcheng Ding Yong YANG Jianbo 《Rice science》 SCIE CSCD 2021年第4期313-316,I0002-I0007,共10页
Plant height is a critical trait for yield in rice(Oryza sativa),and gibberellic acid(GA)is involved in modulating rice height.Here,we identified the semi-dwarf 5(sdf5)mutant by screening a rice T-DNA insertion mutant... Plant height is a critical trait for yield in rice(Oryza sativa),and gibberellic acid(GA)is involved in modulating rice height.Here,we identified the semi-dwarf 5(sdf5)mutant by screening a rice T-DNA insertion mutant library using genome-resequencing.sdf5 contains a T-DNA insertion that causes the ectopic expression of LOC_Os05g34325,which encodes a 14-α-demethylase cytochrome P450(CYP51)protein.Levels of the active GA species GA1 and GA4 were reduced in the sdf5 mutant,and the semi-dwarf phenotype of the sdf5 mutant was rescued by exogenous GA4.In addition to its semi-dwarf height,the sdf5 mutant exhibited compact plant architecture,dark green leaves and low 1000-grain weight.Together,these results suggest that SDF5 is involved in GA biosynthesis pathway and modulates rice height and plant development. 展开更多
关键词 SATIVA DWARF ORYZA
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水稻功能性插入缺失标记(InDel)的筛选与应用 被引量:6
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作者 王钰 马卉 +3 位作者 许学 秦瑞英 杨剑波 汪秀峰 《作物杂志》 CAS 北大核心 2019年第4期84-93,共10页
开展水稻品种纯度和真实性鉴定对水稻遗传育种和种子生产有着重要的意义。以245个长江中下游主推水稻品种为研究材料,从643个插入缺失(InDel)位点中筛选出124个功能性多态性位点,建立了InDel高效检测体系。进一步利用InDel标记vf0121641... 开展水稻品种纯度和真实性鉴定对水稻遗传育种和种子生产有着重要的意义。以245个长江中下游主推水稻品种为研究材料,从643个插入缺失(InDel)位点中筛选出124个功能性多态性位点,建立了InDel高效检测体系。进一步利用InDel标记vf0121641804和SSR标记RM7120分析水稻样品的纯度,同时选用覆盖12条染色体的24对InDel引物和48对SSR标准引物分析水稻品种真实性,结果表明,采用InDel标记检测水稻品种纯度和真实性的结果与采用SSR标记检测结果一致,说明水稻功能性InDel标记也可用于水稻品种纯度和品种真实性的鉴定。在此基础上,鉴定了245个水稻品种124个InDel标记的基因型遗传多样性并进行了聚类分析,结果表明,水稻材料间存在明显的群体结构,基本反映了不同品种间的亲缘关系。水稻功能性InDel标记的筛选与应用,不仅为品种纯度和真实性鉴定、遗传多样性分析提供了新方法;而且可用于分子辅助育种,提高强优势组合的预见性。 展开更多
关键词 水稻 INDEL 多态性位点 品种纯度 品种真实性 遗传多样性
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