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新型戊肝病毒ORF3和部分ORF1基因的序列分析
被引量:
2
1
作者
王佑春
张华远
+3 位作者
辜文杰
rogerling
李河民
TimJHarrison
《中国病毒学》
CSCD
2001年第1期28-33,共6页
用RT PCR方法对 2例感染新型HEV的样品进行了检测 ,并对PCR产物进行了克隆及测序。检测结果显示用常规PCR检测易造成ORF3中GC丰富区的缺失 ,但在常规PCR反应液中加入GCmelt溶液可成功地扩增GC丰富区。序列分析显示T1和T11属于同一基因...
用RT PCR方法对 2例感染新型HEV的样品进行了检测 ,并对PCR产物进行了克隆及测序。检测结果显示用常规PCR检测易造成ORF3中GC丰富区的缺失 ,但在常规PCR反应液中加入GCmelt溶液可成功地扩增GC丰富区。序列分析显示T1和T11属于同一基因型 ,但不同于已报道的HEVI型、II型和III型 ,为一新的基因型。T1和T11与I型在该区的核苷酸同源性为 79%~ 82 % ;与II型的同源性为 80 %~ 81% ;和III型的同源性为 83%~ 85 %
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关键词
戊型肝炎病毒
基因型
同源性
开放读码框架
序列分析
下载PDF
职称材料
广西慢性乙型肝炎患者HBV核心基因启动子突变的研究
2
作者
方钟燎
庄辉
+6 位作者
葛宪民
杨进业
王学燕
龚健
李荣成
rogerling
TimJHarrison
《中华肝脏病杂志》
CAS
CSCD
2003年第8期477-478,共2页
目的 了解HBV核心基因启动子突变与肝损害程度或HBeAg状态的关系。方法 用套式PCR扩增59例慢性乙型肝炎患者血清HBV核心基因启动子,阳性者用直接测序法检测。结果35例HBV DNA阳性,阳性率为59.3%。无正常序列标本,最常见的突变类型是nt1...
目的 了解HBV核心基因启动子突变与肝损害程度或HBeAg状态的关系。方法 用套式PCR扩增59例慢性乙型肝炎患者血清HBV核心基因启动子,阳性者用直接测序法检测。结果35例HBV DNA阳性,阳性率为59.3%。无正常序列标本,最常见的突变类型是nt1762、1764发生双突(A→T、G→A),占57.1%;其次为nt1799位点突变,由C→G,占54.4%,为无义突变;nt1752位点突变,由A→G,使该密码由异亮氨酸变为缬氨酸,占37.1%;nt1753T→C,占20.0%。T_(1762)A_(1764)突变株在HBeAg阳性、阴性患者组中的分布分别为31.3%、79.0%,两者差异有显著性,x^2 8.068 8,P<0.05。结论 HBV核心基因启动子突变在广两慢性乙型肝炎患者较常见,T_(1762)A_(1764)突变株与HBeAg阴性及慢性肝炎有关。
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关键词
广西
慢性乙型肝炎
HBV
核心基因启动子
突变
研究
原文传递
题名
新型戊肝病毒ORF3和部分ORF1基因的序列分析
被引量:
2
1
作者
王佑春
张华远
辜文杰
rogerling
李河民
TimJHarrison
机构
中国药品生物制品检定所
CenterforHepatologyRoyalFreeCampus
出处
《中国病毒学》
CSCD
2001年第1期28-33,共6页
基金
英国WellcomeTrust基金组织资助
文摘
用RT PCR方法对 2例感染新型HEV的样品进行了检测 ,并对PCR产物进行了克隆及测序。检测结果显示用常规PCR检测易造成ORF3中GC丰富区的缺失 ,但在常规PCR反应液中加入GCmelt溶液可成功地扩增GC丰富区。序列分析显示T1和T11属于同一基因型 ,但不同于已报道的HEVI型、II型和III型 ,为一新的基因型。T1和T11与I型在该区的核苷酸同源性为 79%~ 82 % ;与II型的同源性为 80 %~ 81% ;和III型的同源性为 83%~ 85 %
关键词
戊型肝炎病毒
基因型
同源性
开放读码框架
序列分析
Keywords
Hepatitis E virus
Genotype
Homology
Open Reading Frame
分类号
R373.2 [医药卫生—病原生物学]
下载PDF
职称材料
题名
广西慢性乙型肝炎患者HBV核心基因启动子突变的研究
2
作者
方钟燎
庄辉
葛宪民
杨进业
王学燕
龚健
李荣成
rogerling
TimJHarrison
机构
广西壮族自治区疾病预防与控制中心办公室
北京大学医学部微生物学系
广西职业病防治研究所办公室
广西壮族自治区疾病预防与控制中心信息科
广西壮族自治区疾病预防与控制中心病毒科
英国伦敦大学皇家免费医院肝炎中心
出处
《中华肝脏病杂志》
CAS
CSCD
2003年第8期477-478,共2页
基金
卫生部(98-1-351)和广西卫生厅(9836)资助项目
文摘
目的 了解HBV核心基因启动子突变与肝损害程度或HBeAg状态的关系。方法 用套式PCR扩增59例慢性乙型肝炎患者血清HBV核心基因启动子,阳性者用直接测序法检测。结果35例HBV DNA阳性,阳性率为59.3%。无正常序列标本,最常见的突变类型是nt1762、1764发生双突(A→T、G→A),占57.1%;其次为nt1799位点突变,由C→G,占54.4%,为无义突变;nt1752位点突变,由A→G,使该密码由异亮氨酸变为缬氨酸,占37.1%;nt1753T→C,占20.0%。T_(1762)A_(1764)突变株在HBeAg阳性、阴性患者组中的分布分别为31.3%、79.0%,两者差异有显著性,x^2 8.068 8,P<0.05。结论 HBV核心基因启动子突变在广两慢性乙型肝炎患者较常见,T_(1762)A_(1764)突变株与HBeAg阴性及慢性肝炎有关。
关键词
广西
慢性乙型肝炎
HBV
核心基因启动子
突变
研究
Keywords
Chronic hepatitis B
Hepatitis B virus
Core promoter
Mutation
分类号
R512.62 [医药卫生—内科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
新型戊肝病毒ORF3和部分ORF1基因的序列分析
王佑春
张华远
辜文杰
rogerling
李河民
TimJHarrison
《中国病毒学》
CSCD
2001
2
下载PDF
职称材料
2
广西慢性乙型肝炎患者HBV核心基因启动子突变的研究
方钟燎
庄辉
葛宪民
杨进业
王学燕
龚健
李荣成
rogerling
TimJHarrison
《中华肝脏病杂志》
CAS
CSCD
2003
0
原文传递
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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