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新型戊肝病毒ORF3和部分ORF1基因的序列分析 被引量:2
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作者 王佑春 张华远 +3 位作者 辜文杰 rogerling 李河民 TimJHarrison 《中国病毒学》 CSCD 2001年第1期28-33,共6页
用RT PCR方法对 2例感染新型HEV的样品进行了检测 ,并对PCR产物进行了克隆及测序。检测结果显示用常规PCR检测易造成ORF3中GC丰富区的缺失 ,但在常规PCR反应液中加入GCmelt溶液可成功地扩增GC丰富区。序列分析显示T1和T11属于同一基因... 用RT PCR方法对 2例感染新型HEV的样品进行了检测 ,并对PCR产物进行了克隆及测序。检测结果显示用常规PCR检测易造成ORF3中GC丰富区的缺失 ,但在常规PCR反应液中加入GCmelt溶液可成功地扩增GC丰富区。序列分析显示T1和T11属于同一基因型 ,但不同于已报道的HEVI型、II型和III型 ,为一新的基因型。T1和T11与I型在该区的核苷酸同源性为 79%~ 82 % ;与II型的同源性为 80 %~ 81% ;和III型的同源性为 83%~ 85 % 展开更多
关键词 戊型肝炎病毒 基因型 同源性 开放读码框架 序列分析
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广西慢性乙型肝炎患者HBV核心基因启动子突变的研究
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作者 方钟燎 庄辉 +6 位作者 葛宪民 杨进业 王学燕 龚健 李荣成 rogerling TimJHarrison 《中华肝脏病杂志》 CAS CSCD 2003年第8期477-478,共2页
目的 了解HBV核心基因启动子突变与肝损害程度或HBeAg状态的关系。方法 用套式PCR扩增59例慢性乙型肝炎患者血清HBV核心基因启动子,阳性者用直接测序法检测。结果35例HBV DNA阳性,阳性率为59.3%。无正常序列标本,最常见的突变类型是nt1... 目的 了解HBV核心基因启动子突变与肝损害程度或HBeAg状态的关系。方法 用套式PCR扩增59例慢性乙型肝炎患者血清HBV核心基因启动子,阳性者用直接测序法检测。结果35例HBV DNA阳性,阳性率为59.3%。无正常序列标本,最常见的突变类型是nt1762、1764发生双突(A→T、G→A),占57.1%;其次为nt1799位点突变,由C→G,占54.4%,为无义突变;nt1752位点突变,由A→G,使该密码由异亮氨酸变为缬氨酸,占37.1%;nt1753T→C,占20.0%。T_(1762)A_(1764)突变株在HBeAg阳性、阴性患者组中的分布分别为31.3%、79.0%,两者差异有显著性,x^2 8.068 8,P<0.05。结论 HBV核心基因启动子突变在广两慢性乙型肝炎患者较常见,T_(1762)A_(1764)突变株与HBeAg阴性及慢性肝炎有关。 展开更多
关键词 广西 慢性乙型肝炎 HBV 核心基因启动子 突变 研究
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