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钩藤UrLAMT基因及其启动子的克隆与分析
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作者 李永权 刘淼 +4 位作者 上官黎阳 王晓红 胡涛 唐柳 张明生 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2024年第2期145-154,共10页
【目的】克隆钩藤(Uncaria rhynchophylla)中马钱苷酸甲基转移酶(loganic acid methyltransferase,LAMT)基因及其启动子,对UrLAMT基因的组织表达及其对生物和非生物胁迫的响应进行分析,并对UrLAMT及其启动子的生物信息学进行分析,为进... 【目的】克隆钩藤(Uncaria rhynchophylla)中马钱苷酸甲基转移酶(loganic acid methyltransferase,LAMT)基因及其启动子,对UrLAMT基因的组织表达及其对生物和非生物胁迫的响应进行分析,并对UrLAMT及其启动子的生物信息学进行分析,为进一步研究UrLAMT转录调控奠定基础。【方法】基于钩藤的转录组数据设计引物,采用PCR从钩藤cDNA中克隆UrLAMT序列,并对其进行生物信息学分析;采用实时荧光定量PCR,分析UrLAMT在钩藤不同组织(根、茎、叶、花、果实、钩)中的表达,以及对外源茉莉酸甲酯(MeJA)、遮光/复光胁迫的响应;利用FPNI-PCR技术克隆UrLAMT上游启动子序列,并验证其活性,结合酵母单杂交试验,分析相应转录因子与UrLAMT启动子的调控关系。【结果】克隆得到钩藤UrLAMT序列,其长度为1137 bp,共编码378个氨基酸。UrLAMT蛋白质相对分子质量为42.64 ku,理论等电点为5.76,为亲水性蛋白,无信号肽,不含跨膜结构,定位在细胞质中;UrLAMT基因在钩藤叶中表达量最高,其次为根;UrLAMT均能响应MeJA和光;其与短小蛇根草和长春花的进化关系较近。UrLAMT启动子序列长度为1141 bp,除核心响应元件外还含有多个光响应元件,UrLAMT启动子在酵母中与光调控转录因子HY5存在相互作用。【结论】获得了UrLAMT基因及其启动子序列,其在钩藤叶中表达量最高,可能受光诱导。 展开更多
关键词 钩藤 马钱苷酸甲基转移酶 基因克隆 启动子克隆 酵母单杂交
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Physio-ecological adaptability and service function in karst rocky desertification control of Premna puberula
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作者 WU Hongli shangguan liyang +3 位作者 HUANG Haidong LIU Miao WANG Anlong ZHANG Mingsheng 《Journal of Mountain Science》 SCIE 2024年第12期4269-4281,共13页
Increased soil erosion as a consequence of karst rocky desertification(KRD)reduces soil quality and plant diversity.Premna puberula Pamp.is a perennial understory shrub that can adapt to the harsh environment of KRD a... Increased soil erosion as a consequence of karst rocky desertification(KRD)reduces soil quality and plant diversity.Premna puberula Pamp.is a perennial understory shrub that can adapt to the harsh environment of KRD and has potential value for KRD environmental restoration.We measure morphological and photosynthetic characteristics,nutrient accumulation,and soil physical and chemical properties of two-year-old P.puberula planted in KRD habitat and non-rocky desertification areas,and investigate how it adapts to this habitat.In KRD areas,P.puberula reduces aboveground water loss by decreasing leaf area,stomatal conductance,and transpiration rate,while increasing leaf thickness,root length and number,and increases belowground biomass to absorb more water and nutrients.In KRD areas,drought leads to decreased leaf water content,stomatal conductance,intercellular CO_(2) concentration,and chlorophyll content,and decreased photosynthetic rate.Soluble sugar and protein contents increase in KRD areas in response to water stress,but pectin and flavonoid contents decrease.Correlation analysis reveals that leaf area and thickness are important functional traits that affect leaf water content and photosynthesis.Totals of leaf carbon,nitrogen,and phosphorus,along with C:N,C:P,and N:P ratios,are coupled with leaf photosynthetic characteristics and root development.Redundancy analysis reveals that available K and P,and total P,K,and N in soil mainly influence the differences in plant functional traits,explaining 95.8%,95.5%,91.1%,85.8%,and 74%of variation,respectively.We hypothesize that P.puberula reduces aboveground productivity to maintain its water balance,and acquires more water and nutrients by increasing belowground biomass.It indicates that this species adapts to arid KRD environments. 展开更多
关键词 Premna puberula Karst Rocky desertification control Plant adaptability Photosynthetic properties
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钩藤光敏色素互作因子鉴定及其表达分析 被引量:1
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作者 王晓红 郑浩杰 +4 位作者 李雪 强玮 于晓松 上官黎阳 张明生 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第11期2104-2116,共13页
光敏色素互作因子(phytochrome-interacting factors,PIFs)是具有基本螺旋-环-螺旋(bHLH)结构域的转录因子,它们与光敏色素相互作用,在光信号转导过程发挥重要作用。基于转录组数据注释及蛋白同源比对,共筛选出28个钩藤PIF家族成员(UrPI... 光敏色素互作因子(phytochrome-interacting factors,PIFs)是具有基本螺旋-环-螺旋(bHLH)结构域的转录因子,它们与光敏色素相互作用,在光信号转导过程发挥重要作用。基于转录组数据注释及蛋白同源比对,共筛选出28个钩藤PIF家族成员(UrPIFs),编码蛋白的长度在420~741个氨基酸之间,理论分子量46.47~79.46 kDa;等电点5.97~9.15。亚细胞定位预测结果显示UrPIFs均位于细胞核。系统进化关系和保守基序分析表明,28个UrPIFs分为4组,都具有活性光敏色素B结合(active phytochrome B-binding,APB)结构域和bHLH结构域,而且每组成员之间具有相似的保守基序。组织表达谱显示多数UrPIFs在叶中表达量较高,其次是茎,最低的是根。在遮光条件下,除UrPIF05外,7个UrPIFs表达量呈上升趋势;转移至正常光照条件后,8个Ur PIFs的表达量均呈下降趋势。尤其是UrPIF15对光较为敏感,可能在光信号转导中发挥重要作用。UrPIFs的鉴定和分析可为进一步构建钩藤光调控网络提供参考。 展开更多
关键词 钩藤 光敏色素互作因子 遮光 系统进化分析 基因表达
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