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番茄黄化曲叶病毒侵染危害海南番茄及其分子特征 被引量:4
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作者 汤亚飞 周洋 +6 位作者 张丽 李正刚 佘小漫 于琳 蓝国兵 邓铭光 何自福 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第8期1970-1976,共7页
【目的】明确引起海南三亚、东方和陵水番茄黄化曲叶病的病毒分子特征,为防控该病害提供科学依据。【方法】以2019年2月从海南三亚、东方和陵水采集的15份疑似番茄黄化曲叶病样本为材料,采用菜豆金色花叶病毒属病毒的通用简并引物AV494/... 【目的】明确引起海南三亚、东方和陵水番茄黄化曲叶病的病毒分子特征,为防控该病害提供科学依据。【方法】以2019年2月从海南三亚、东方和陵水采集的15份疑似番茄黄化曲叶病样本为材料,采用菜豆金色花叶病毒属病毒的通用简并引物AV494/CoPR对15份样本进行PCR检测,并对PCR检测为阳性的样本进行滚环扩增(RCA)及基因克隆,获得侵染海南三亚、陵水和东方番茄的病毒基因组全序列,进而在GenBank数据库BLASTh程序进行相似性比对,利用SDT 1.2的MUSCLE alignment进行序列相似性比较分析,采用MEGA 6.0的邻接法(Neighbor-joining,NJ)构建系统发育进化树,明确所获得病毒分离物与已报道分离物的亲缘关系。【结果】获得侵染海南三亚、陵水和东方番茄的3个番茄黄化曲叶病毒(Tomato yellow leaf curl virus,TYLCV)分离物基因组全序列,其大小均为2781 nt,编码6个开放阅读框(ORF),其中病毒链上AV1和AV2基因,互补链上AC1、AC2、AC3和AC4基因。相似性比对分析结果表明,TYLCV海南分离物与墨西哥和美国分离物的相似性在99.0%以上,与来自我国不同省(市)的14个TYLCV分离物的相似性在98.0%以上。系统发育进化分析显示,海南三亚、陵水和东方3个分离物与墨西哥、美国及我国北京和江苏分离物聚集在一个小分支,进一步与来自我国其他12个省(市)、韩国、哥斯达黎加和澳大利亚的分离物形成一个分支。【结论】侵染海南番茄的TYLCV可能来自我国大陆的番茄等种苗和烟粉虱带毒传入,也有可能来自墨西哥和美国等其他国家。 展开更多
关键词 番茄黄化曲叶病毒 分子鉴定 序列分析 海南
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13个菜心品种对菜心炭疽病的抗性鉴定
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作者 蓝国兵 于琳 +3 位作者 何自福 佘小漫 汤亚飞 邓铭光 《亚热带植物科学》 2017年第4期386-390,共5页
为了解广东省推广种植的菜心Brassica parachinensis品种对菜心炭疽病的抗性水平,对广东省13个具代表性菜心品种进行菜心炭疽病的抗性鉴定。结果显示,供试13个菜心品种对菜心炭疽病的平均病情指数为44.61~74.19,其中80天油青菜心的平均... 为了解广东省推广种植的菜心Brassica parachinensis品种对菜心炭疽病的抗性水平,对广东省13个具代表性菜心品种进行菜心炭疽病的抗性鉴定。结果显示,供试13个菜心品种对菜心炭疽病的平均病情指数为44.61~74.19,其中80天油青菜心的平均病情指数最低,粗苔49油青甜菜心的平均病情指数最高。80天油青菜心等6个品种对菜心炭疽病表现为中抗水平,粗苔49油青甜菜心等7个品种对菜心炭疽病表现为感病水平。目前在广东省生产种植的菜心以菜心炭疽病感病和中抗品种为主,缺乏菜心炭疽病抗性或高抗品种。 展开更多
关键词 菜心 炭疽病 希金斯刺盘孢 抗性鉴定
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广东甘薯疮痂病病原菌鉴定 被引量:3
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作者 于琳 佘小漫 +4 位作者 蓝国兵 汤亚飞 李正刚 邓铭光 何自福 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期579-585,共7页
【目的】明确广东甘薯疮痂病的病原菌种类及生物学和系统发育学特征,为甘薯疮痂病防治及抗病育种提供参考。【方法】从广东省茂名和湛江等甘薯产区采集甘薯疮痂病植株,采用分生孢子悬液梯度稀释分离法分离病原菌,通过病原菌的形态特征... 【目的】明确广东甘薯疮痂病的病原菌种类及生物学和系统发育学特征,为甘薯疮痂病防治及抗病育种提供参考。【方法】从广东省茂名和湛江等甘薯产区采集甘薯疮痂病植株,采用分生孢子悬液梯度稀释分离法分离病原菌,通过病原菌的形态特征观察、致病力测定,结合核糖体内转录间隔区(ITS)、28S核糖体RNA(LSU)、RNA聚合酶II第二大亚基(rpb2)和翻译延伸因子1-α(TEF1)部分序列的多核苷酸序列系统学分析等方法对病原菌进行鉴定。【结果】共分离获得26株单分生孢子分离物,随机选取3株代表性菌株SPEb-1、SPEb-2和SPEb-3进行观察和测定。光学显微镜下观察发现,3株代表性菌株的产孢细胞透明,内生芽殖;分生孢子单细胞,透明,短棒形,两侧顶端钝圆,大小为6.1~9.0μm×2.2~3.0μm;分生孢子梗短棒状;致病性人工接种表明,3株代表性菌株均可侵染甘薯引起典型的疮痂病症状。3株代表菌株的ITS、LSU、rpb2和TEF1序列与痂囊腔菌属(Elsino?)的E.ampelina、E.bidentis、E.arachidis、E.mimosae、E.ricini和E.sesseae等多个种的对应序列一致性为95%~99%。系统发育进化树分析结果显示,3株代表性菌株与蓖麻痂囊腔菌(E.ricini)单独聚成一支。【结论】广东甘薯疮痂病的病原菌为甘薯痂囊腔菌(E.batatas)。 展开更多
关键词 甘薯 疮痂病 鉴定 Elsinoe batatas 系统发育分析 广东省
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Small RNA deep sequencing reveals the presence of multiple viral infections in cucurbit crops in Guangdong,China 被引量:3
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作者 LI Zheng-gang NONG Yuan +6 位作者 Tahir FAROOQ TANG Ya-fei she xiao-man YU Lin LAN Guo-bing ZHOU Xue-ping HE Zi-fu 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2022年第5期1389-1400,共12页
Viral diseases are among the most critical damaging factors that impose a global threat to the cucurbit industry.China is the world’s leading country for the production and consumption of cucurbits.Guangdong,a provin... Viral diseases are among the most critical damaging factors that impose a global threat to the cucurbit industry.China is the world’s leading country for the production and consumption of cucurbits.Guangdong,a province in southern China dominated by the tropical and subtropical climate,favors the survival of different plant viruses and their vectors.Five main cucurbit crops showing various disease symptoms were surveyed and collected to identify viruses infecting cucurbits in Guangdong during 2018–2020.In the field,the incidence ranged from 5-30%,or even 60-100% in the case of severely infected cucurbits.A total of 357 symptomatic samples were collected and subsequently screened for cucurbit viruses by small RNA deep sequencing and assembly(sRSA).Seventeen virus species belonging to 10 genera were identified in the five main cucurbit crops.The most common viruses were papaya ringspot virus(PRSV;Potyvirus),zucchini tigre mosaic virus(ZTMV;Potyvirus),zucchini yellow mosaic virus(ZYMV;Potyvirus),and watermelon silver mottle virus(WSMoV;Orthotospovirus),with infection rates of 24.4,19.0,17.1,and 14.3%,respectively.Notably,the most prevalent viruses were melon yellow spot orthotospovirus(MYSV)in cucumber,PRSV in squash,cucumber green mottle mosaic virus(CGMMV;Tobamovirus)in bottle gourd,WSMoV in white gourd,and ZYMV in luffa.Mixed infections were prevalent,and the types of mixed infections varied substantially in different cucurbit crops.Moreover,the full-length nucleotide sequences of watermelon green mottle mosaic virus(WGMMV),CGMMV,and watermelon virus A(WVA;Wamavirus)identified in bottle gourd were cloned and analyzed.This study is the first reporting WGMMV infecting bottle gourd in China mainland.In summary,the results demonstrate that in Guangdong,the most prevalent viruses belong to potyviruses,orthotospoviruses,and tobamoviruses groups.The findings will facilitate agricultural researchers and farmers to plan and implement effective disease control strategies aiming at timely detection and management of cucurbit-infecting viral pathogens. 展开更多
关键词 cucurbit viruses small RNA deep sequencing phylogenic analyses POTYVIRUSES orthotospoviruses tobamoviruses
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广东省冬枣叶枯病病原菌的分离与鉴定 被引量:4
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作者 佘小漫 于琳 +4 位作者 蓝国兵 汤亚飞 李正刚 邓铭光 何自福 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期317-324,共8页
2018年2月,广东省清远市冬枣种植区发生了一种叶枯病,发病率约为17%,严重影响植株生长。为明确引起广东省清远市冬枣叶枯病的病原,采用常规病组织分离法获得2株菌株,通过致病性、生理生化特征和分子生物学对2株菌株进行鉴定。致病性测... 2018年2月,广东省清远市冬枣种植区发生了一种叶枯病,发病率约为17%,严重影响植株生长。为明确引起广东省清远市冬枣叶枯病的病原,采用常规病组织分离法获得2株菌株,通过致病性、生理生化特征和分子生物学对2株菌株进行鉴定。致病性测定结果显示,该细菌可侵染引起冬枣叶片产生枯死症状,与田间病株的症状相同。生理生化测定结果显示,该病原菌为革兰氏阴性菌,在LB平板产生黄色菌落;除利用蜜二糖产酸结果不同,2株菌株与成团泛菌Pantoea agglomerans ATCC27155菌株的其他生理生化特征相同。系统进化分析结果表明,QYZ1和QYZ22株菌株的16S rDNA序列分别与P.agglomerans TH81(CP031649)菌株、P.agglomerans C410P1(CP016889)菌株、P.vagans FDAARGOS160(CP014129)菌株和P.vagans C9-1(CP002206)菌株的相似性在99%以上;多位点序列分析结果表明,QYZ1和QYZ2与P.agglomerans TH81菌株关系最近,聚在一个分支。生理生化特征及分子生物学鉴定结果表明,引起广东省冬枣叶枯病的病原为成团泛菌。本研究是成团泛菌引起广东省冬枣叶枯病在国内的首次报道。 展开更多
关键词 冬枣叶枯病 成团泛菌 病原鉴定
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广东枣疯病植原体的鉴定 被引量:5
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作者 李正刚 佘小漫 +4 位作者 汤亚飞 于琳 蓝国兵 邓铭光 何自福 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期281-282,共2页
植原体是一类重要的植物病原菌,属柔膜菌纲、植原体属,没有细胞壁,专性寄生在植物的韧皮部筛管细胞内[1]。枣疯病(Jujube witches’ broom,JWB)是枣树的重要病害之一,对枣树种植产业具有毁灭性的危害。枣疯病在我国分布广泛,从四川、重... 植原体是一类重要的植物病原菌,属柔膜菌纲、植原体属,没有细胞壁,专性寄生在植物的韧皮部筛管细胞内[1]。枣疯病(Jujube witches’ broom,JWB)是枣树的重要病害之一,对枣树种植产业具有毁灭性的危害。枣疯病在我国分布广泛,从四川、重庆到河北、山东、山西和北京都有分布,而在华南地区暂无报道。 展开更多
关键词 JUJUBE witches’ BROOM PHYTOPLASMA MOLECULAR detection PHYLOGENETIC analysis
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