目的探究糖尿病性心肌病(diabetic cardiomyopathy,DCM)防治的潜在新靶点。方法取正常组和糖尿病组小鼠心肌组织用于蛋白质组学研究。利用R语言对GEO数据库GSE161931数据集进行分析,以P<0.05及|log_(2)FC|≥1为标准对芯片数据进行筛...目的探究糖尿病性心肌病(diabetic cardiomyopathy,DCM)防治的潜在新靶点。方法取正常组和糖尿病组小鼠心肌组织用于蛋白质组学研究。利用R语言对GEO数据库GSE161931数据集进行分析,以P<0.05及|log_(2)FC|≥1为标准对芯片数据进行筛选,得到相关差异基因。进一步采用R语言对差异基因进行基因本体论(gene ontology,GO)功能富集分析及京都基因与基因组(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析。最后,构建糖尿病模型小鼠并评估其心功能,初步验证上述差异表达基因分析结果,并研究差异蛋白作为潜在DCM治疗靶标的可能性。结果结果显示,糖尿病模型小鼠表现出DCM症状,模型组较正常组显著升高的蛋白19个、降低的蛋白35个,这些差异蛋白主要富集于脂代谢信号通路及细胞因子和炎性细胞通路。基于以上结果,通过STRING分析蛋白-蛋白相互作用筛选出11个靶标蛋白,结合实验发现了ACOT2的潜在靶标作用。验证实验结果显示,抑制ACOT2可以减轻糖尿病模型小鼠的DCM症状。结论通过应用蛋白组学与DCM转录组分析,ACOT2可能是DCM防治的潜在新靶点。展开更多
文摘目的探究糖尿病性心肌病(diabetic cardiomyopathy,DCM)防治的潜在新靶点。方法取正常组和糖尿病组小鼠心肌组织用于蛋白质组学研究。利用R语言对GEO数据库GSE161931数据集进行分析,以P<0.05及|log_(2)FC|≥1为标准对芯片数据进行筛选,得到相关差异基因。进一步采用R语言对差异基因进行基因本体论(gene ontology,GO)功能富集分析及京都基因与基因组(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析。最后,构建糖尿病模型小鼠并评估其心功能,初步验证上述差异表达基因分析结果,并研究差异蛋白作为潜在DCM治疗靶标的可能性。结果结果显示,糖尿病模型小鼠表现出DCM症状,模型组较正常组显著升高的蛋白19个、降低的蛋白35个,这些差异蛋白主要富集于脂代谢信号通路及细胞因子和炎性细胞通路。基于以上结果,通过STRING分析蛋白-蛋白相互作用筛选出11个靶标蛋白,结合实验发现了ACOT2的潜在靶标作用。验证实验结果显示,抑制ACOT2可以减轻糖尿病模型小鼠的DCM症状。结论通过应用蛋白组学与DCM转录组分析,ACOT2可能是DCM防治的潜在新靶点。