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基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱自建库鉴定临床常见致病丝状真菌的研究
1
作者
张璐
赵蓉芬
+4 位作者
孙艳霞
sde hoog
Jos Houbraken
邓淑文
张虹
《广西医科大学学报》
CAS
2024年第4期500-507,共8页
目的:评估基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术鉴定临床常见致病丝状真菌的准确性。方法:采用AUTOF MS1000质谱系统,在原有商业参考库的基础上,增补构建自建数据库,采用125株临床分离菌株对自建库进行验证。结果:自建...
目的:评估基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术鉴定临床常见致病丝状真菌的准确性。方法:采用AUTOF MS1000质谱系统,在原有商业参考库的基础上,增补构建自建数据库,采用125株临床分离菌株对自建库进行验证。结果:自建库新增菌株包括:皮肤癣菌3个属15种菌种,共76株;曲霉属30个菌种,共75株。以已有商业数据库加自建数据库为比对标准,125株临床分离菌株属水平鉴定率100%,种水平鉴定率达80.8%;以分子鉴定结果为金标准,正确鉴定率94.1%。其中,69株皮肤癣菌的种水平鉴定率为79.7%,正确鉴定率92.7%;56株曲霉菌种水平鉴定率为82.1%,正确鉴定率95.6%;错误鉴定6株,集中在须癣毛癣菌复合体(T.mentagrophytes series)菌种趾间毛癣菌/须癣毛癣菌/昆可努发癣菌(T.interdigitale/T.mentagrophytes/T.quinckeanum)交叉识别及Sect.Nigri中黑曲霉(A.niger)与塔宾曲霉(A.tubingensis)交叉识别。结论:通过补充完善自建库可提高MALDI-TOF MS鉴定丝状真菌的准确率;同时,参考数据库及时扩展和更新,以确保MALDI-TOF MS准确鉴定真菌菌种的能力。
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关键词
基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱
自建库
皮肤癣菌
曲霉
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职称材料
题名
基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱自建库鉴定临床常见致病丝状真菌的研究
1
作者
张璐
赵蓉芬
孙艳霞
sde hoog
Jos Houbraken
邓淑文
张虹
机构
苏州高新区人民医院医学研究中心
苏州高新区人民医院检验科
Centre of Expertise in Mycology of Radboud University Medical Centre/Canisius Wilhelmina Hospital
Westerdijk Fungal Biodiversity Institute
出处
《广西医科大学学报》
CAS
2024年第4期500-507,共8页
基金
苏州市科技计划项目(No.SKY2022037)
苏州高新区人民医院科学创新基金项目(No.SGY2019B01,No.SGY2021C01,No.SGY2022A01)。
文摘
目的:评估基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术鉴定临床常见致病丝状真菌的准确性。方法:采用AUTOF MS1000质谱系统,在原有商业参考库的基础上,增补构建自建数据库,采用125株临床分离菌株对自建库进行验证。结果:自建库新增菌株包括:皮肤癣菌3个属15种菌种,共76株;曲霉属30个菌种,共75株。以已有商业数据库加自建数据库为比对标准,125株临床分离菌株属水平鉴定率100%,种水平鉴定率达80.8%;以分子鉴定结果为金标准,正确鉴定率94.1%。其中,69株皮肤癣菌的种水平鉴定率为79.7%,正确鉴定率92.7%;56株曲霉菌种水平鉴定率为82.1%,正确鉴定率95.6%;错误鉴定6株,集中在须癣毛癣菌复合体(T.mentagrophytes series)菌种趾间毛癣菌/须癣毛癣菌/昆可努发癣菌(T.interdigitale/T.mentagrophytes/T.quinckeanum)交叉识别及Sect.Nigri中黑曲霉(A.niger)与塔宾曲霉(A.tubingensis)交叉识别。结论:通过补充完善自建库可提高MALDI-TOF MS鉴定丝状真菌的准确率;同时,参考数据库及时扩展和更新,以确保MALDI-TOF MS准确鉴定真菌菌种的能力。
关键词
基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱
自建库
皮肤癣菌
曲霉
Keywords
matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry
self-built database
dermatophytes
Aspergillus
分类号
R519 [医药卫生—内科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱自建库鉴定临床常见致病丝状真菌的研究
张璐
赵蓉芬
孙艳霞
sde hoog
Jos Houbraken
邓淑文
张虹
《广西医科大学学报》
CAS
2024
0
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