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用于结直肠癌预后评估和精准免疫治疗的肿瘤免疫微环境转录组学分型
被引量:
1
1
作者
Yun-Qiang Tang
Tu-Feng Chen
+8 位作者
Yan Zhang
Xiao-Chen Zhao
Yu-Zi Zhang
Guo-Qiang Wang
Meng-Li Huang
shang-li cai
Jing Zhao
Bo Wei
Jun Huang
《Gastroenterology Report》
SCIE
EI
2020年第5期381-389,I0002,共10页
背景:基于免疫环境的生物学标志物或许可以指导预后评估。T细胞失活、T细胞排斥以及T细胞功能障碍均会损害肿瘤微环境进而影响免疫治疗的效果及预后。然而,截至目前尚未见利用免疫相关生物标记物来对结直肠癌患者进行分类的报道。因此,...
背景:基于免疫环境的生物学标志物或许可以指导预后评估。T细胞失活、T细胞排斥以及T细胞功能障碍均会损害肿瘤微环境进而影响免疫治疗的效果及预后。然而,截至目前尚未见利用免疫相关生物标记物来对结直肠癌患者进行分类的报道。因此,本研究旨在根据肿瘤微环境中的T细胞失活、T细胞排斥和T细胞功能障碍的程度来对结直肠癌患者进行分类。方法:通过肿瘤免疫功能障碍和排斥(TIDE)算法,对TCGA数据库中的618例结直肠癌患者的RNAseq数据和GEO数据库中的316例结直肠癌患者的基因芯片数据进行分析。采用无监督聚类法对患者进行分类。结果:基于骨髓来源抑制细胞、癌相关成纤维细胞、M2型肿瘤相关巨噬细胞、细胞毒性T细胞和PD-L1的表达,将患者聚类分为4型:1型为高度免疫功能障碍,2型为低度免疫激活,3型为强烈免疫排斥,4型为高度免疫激活、中度免疫功能障碍及中度免疫排斥。多因素Cox分析结果显示,与1型相比,2、3、4型患者总体生存的风险比(95%可信区间)分别为0.63(0.35-1.13)、0.55(0.29-1.03)和0.30(0.14-0.64)。利用GSE39582队列进行验证,也得到了相似的聚类分型和预后模式。亚组分析中,在I/II期、微卫星稳定和未接受辅助治疗的患者中,免疫聚类分型与总体生存显著相关。结论:本研究结果表明,免疫分型可作为结直肠癌患者一项可靠的预后指标,且有助于个体化免疫治疗的病例选择。
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关键词
colorectal
cancer
immune
dysfunction
immune
exclusion
PROGNOSIS
原文传递
题名
用于结直肠癌预后评估和精准免疫治疗的肿瘤免疫微环境转录组学分型
被引量:
1
1
作者
Yun-Qiang Tang
Tu-Feng Chen
Yan Zhang
Xiao-Chen Zhao
Yu-Zi Zhang
Guo-Qiang Wang
Meng-Li Huang
shang-li cai
Jing Zhao
Bo Wei
Jun Huang
机构
Department of Hepatic-biliary Surgery
Department of Gastrointestinal Surgery
Jiangsu Cancer Hospital&Jiangsu Institute of Cancer
The Medical Department
Department of Colorectal Surgery
Guangdong Provincial Key Laboratory of Colorectal and Pelvic Floor Diseases
Guangdong Institute of Gastroenterology
出处
《Gastroenterology Report》
SCIE
EI
2020年第5期381-389,I0002,共10页
文摘
背景:基于免疫环境的生物学标志物或许可以指导预后评估。T细胞失活、T细胞排斥以及T细胞功能障碍均会损害肿瘤微环境进而影响免疫治疗的效果及预后。然而,截至目前尚未见利用免疫相关生物标记物来对结直肠癌患者进行分类的报道。因此,本研究旨在根据肿瘤微环境中的T细胞失活、T细胞排斥和T细胞功能障碍的程度来对结直肠癌患者进行分类。方法:通过肿瘤免疫功能障碍和排斥(TIDE)算法,对TCGA数据库中的618例结直肠癌患者的RNAseq数据和GEO数据库中的316例结直肠癌患者的基因芯片数据进行分析。采用无监督聚类法对患者进行分类。结果:基于骨髓来源抑制细胞、癌相关成纤维细胞、M2型肿瘤相关巨噬细胞、细胞毒性T细胞和PD-L1的表达,将患者聚类分为4型:1型为高度免疫功能障碍,2型为低度免疫激活,3型为强烈免疫排斥,4型为高度免疫激活、中度免疫功能障碍及中度免疫排斥。多因素Cox分析结果显示,与1型相比,2、3、4型患者总体生存的风险比(95%可信区间)分别为0.63(0.35-1.13)、0.55(0.29-1.03)和0.30(0.14-0.64)。利用GSE39582队列进行验证,也得到了相似的聚类分型和预后模式。亚组分析中,在I/II期、微卫星稳定和未接受辅助治疗的患者中,免疫聚类分型与总体生存显著相关。结论:本研究结果表明,免疫分型可作为结直肠癌患者一项可靠的预后指标,且有助于个体化免疫治疗的病例选择。
关键词
colorectal
cancer
immune
dysfunction
immune
exclusion
PROGNOSIS
分类号
R735.3 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
用于结直肠癌预后评估和精准免疫治疗的肿瘤免疫微环境转录组学分型
Yun-Qiang Tang
Tu-Feng Chen
Yan Zhang
Xiao-Chen Zhao
Yu-Zi Zhang
Guo-Qiang Wang
Meng-Li Huang
shang-li cai
Jing Zhao
Bo Wei
Jun Huang
《Gastroenterology Report》
SCIE
EI
2020
1
原文传递
已选择
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参考文献
引证文献
统计分析
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