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Super-enhancer receives signals from the extracellular matrix to induce PD-L1-mediated immune evasion via integrin/ BRAF/TAK1/ERK/ETV4 signaling
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作者 Panpan Ma Xinxin Jin +10 位作者 Zhiwei Fan Zhou Wang Suhui Yue Changyue Wu Shiyin Chen Yuanyuan Wu Miaomiao Chen Donghua Gu siliang zhang Renfang Mao Yihui Fan 《Cancer Biology & Medicine》 SCIE CAS CSCD 2022年第5期669-684,共16页
Objective:PD-L1 and PD-L2 expression levels determine immune evasion and the therapeutic efficacy of immune checkpoint blockade.The factors that drive inducible PD-L1 expression have been extensively studied,but mecha... Objective:PD-L1 and PD-L2 expression levels determine immune evasion and the therapeutic efficacy of immune checkpoint blockade.The factors that drive inducible PD-L1 expression have been extensively studied,but mechanisms that result in constitutive PD-L1 expression in cancer cells are largely unknown.Methods:DNA elements were deleted in cells by CRISPR/Cas9-mediated knockout.Protein function was inhibited by chemical inhibitors.Protein levels were examined by Western blot,mRNA levels were examined by real-time RT-PCR,and surface protein expression was determined by cellular immunofluorescence and flow cytometry.Immune evasion was examined by in vitro T cell-mediated killing.Results:We determined the core regions(chr9:5,496,378–5,499,663)of a previously identified PD-L1L2-super-enhancer(SE).Through systematic analysis,we found that the E26 transformation-specific(ETS)variant transcription factor(ETV4)bound to this core DNA region but not to DNA surrounding PD-L1L2SE.Genetic knockout of ETV4 dramatically reduced the expressions of both PD-L1 and PD-L2.ETV4 transcription was dependent on ERK activation,and BRAF/TAK1-induced ERK activation was dependent on extracellular signaling fromαvβ3 integrin,which profoundly affected ETV4 transcription and PD-L1/L2 expression.Genetic silencing or pharmacological inhibition of components of the PD-L1L2-SE-associated pathway rendered cancer cells susceptible to T cell-mediated killing.Conclusions:We identified a pathway originating from the extracellular matrix that signaled via integrin/BRAF/TAK1/ERK/ETV4 to PD-L1L2-SE to induce PD-L1-mediated immune evasion.These results provided new insights into PD-L1L2-SE activation and pathways associated with immune checkpoint regulation in cancer. 展开更多
关键词 PD-L1 super-enhancer ETV4 ERK αvβ3 integrin BRAF TAK1
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工业生物过程智能控制原理和方法进展 被引量:4
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作者 田锡炜 王冠 +1 位作者 张嗣良 庄英萍 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期2014-2024,共11页
工业生物过程是一个复杂的系统过程,对活体细胞代谢过程的认识是实现高效工业生物制造的基础。文中首先综述了工业发酵过程多尺度优化控制原理和实践,包括多尺度理论与装备、细胞宏观代谢在线检测传感技术以及生理代谢参数相关分析。在... 工业生物过程是一个复杂的系统过程,对活体细胞代谢过程的认识是实现高效工业生物制造的基础。文中首先综述了工业发酵过程多尺度优化控制原理和实践,包括多尺度理论与装备、细胞宏观代谢在线检测传感技术以及生理代谢参数相关分析。在此基础上,对工业生物过程智能控制——感知细胞内生理代谢特性新型传感技术、大数据库建立和数据深度计算以及生物过程智能决策进行了综述和展望。 展开更多
关键词 工业生物过程 在线传感技术 生理代谢 过程大数据 智能控制
原文传递
大数据-模型混合驱动下生物过程优化与放大的新机遇与挑战 被引量:1
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作者 王冠 田锡炜 +3 位作者 夏建业 储炬 张嗣良 庄英萍 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期1004-1016,共13页
当前,生物制造技术和产业是世界关注的热点。然而,生物过程优化与放大过程中普遍面临以下几个难题,包括:过程检测手段缺乏,难以满足关键指标参数的监控;细胞代谢认知匮乏,无法理性实现过程最优化调控;反应器环境差异大,导致逐级放大效... 当前,生物制造技术和产业是世界关注的热点。然而,生物过程优化与放大过程中普遍面临以下几个难题,包括:过程检测手段缺乏,难以满足关键指标参数的监控;细胞代谢认知匮乏,无法理性实现过程最优化调控;反应器环境差异大,导致逐级放大效率低下。文中针对以上亟待解决的关键问题,通过案例分析介绍发酵过程实时检测-动态调控-理性放大全链条关键技术创新。在未来,生物过程设计将以集成细胞生理学(时空多尺度细胞代谢模型)和流体动力学(CFD模型)的全生命周期模型为指导,推进计算机辅助设计与开发,加速生物过程实现大规模智能化生产,开启绿色生物制造新时代。 展开更多
关键词 新型传感器 动态调控 智能生物制造 理性放大 代谢模型
原文传递
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