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基于公共数据库的胶质瘤预后相关基因筛选
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作者 张艺 高含 +3 位作者 郑展越 谭启涛 杨敏丽 孙艳 《癌变.畸变.突变》 CAS 2024年第3期195-201,共7页
目的:基于公共数据库筛选与胶质瘤临床预后相关的基因。方法:从高通量基因表达(GEO)数据库中获取编号为GSE31095的基因芯片数据,利用R包“limma”筛选差异表达基因,并对其进行基因本体论(GO)功能注释、京都基因和基因组百科全书(KEGG)... 目的:基于公共数据库筛选与胶质瘤临床预后相关的基因。方法:从高通量基因表达(GEO)数据库中获取编号为GSE31095的基因芯片数据,利用R包“limma”筛选差异表达基因,并对其进行基因本体论(GO)功能注释、京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析。通过String和Cytoscape构建蛋白质相互作用网络图,筛选出hub基因。采用癌症基因组图谱(TCGA)数据库和中国胶质瘤基因组图谱(CGGA)数据库验证hub基因,基于CGGA数据集mRNAseq_325的临床数据对hub基因进行随机数森林分析、Kaplan-Meier分析和Cox比例风险分析,以阐明这些hub基因的诊断和预后效果。结果:筛选出了214个差异表达基因,其中上调的205个,下调的9个。GO分析显示,胶质瘤与生物合成过程、翻译过程、核糖体高度相关;KEGG富集结果显示胶质瘤与免疫系统和抗原呈递关系密切。筛选出10个hub基因,与TCGA和CGGA队列验证的结果一致。基于随机森林算法、Cox回归分析、Kaplan-Meier分析和ggrisk分析结果取交集得到4个基因:RPL7、RPL8、RPL12、RPS7。构建的风险模型受试者工作特征(ROC)曲线下面积在1年时为0.691,3年为0.687,5年为0.685。结论:RPL7、RPL8、RPL12、RPS7的高表达是胶质瘤预后不良因素,可作为胶质瘤临床预后有效的生物标志物以及为新药研发提供新的方向。 展开更多
关键词 胶质瘤 生物信息学 关键基因 预后
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基于生物信息学分析宫颈鳞癌的关键基因与免疫细胞浸润
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作者 高含 张艺 +3 位作者 郑展越 谭启涛 杨敏丽 孙艳 《癌变.畸变.突变》 CAS 2024年第2期100-106,共7页
目的:利用数据库芯片信息探寻宫颈鳞癌致病的关键基因,并从免疫细胞浸润角度探讨其可能作用机制。方法:从高通量基因表达(GEO)数据库获取基因芯片GSE63514,运用R语言“limma”等相关拓展包筛选差异表达基因,利用R语言“cluster Profile... 目的:利用数据库芯片信息探寻宫颈鳞癌致病的关键基因,并从免疫细胞浸润角度探讨其可能作用机制。方法:从高通量基因表达(GEO)数据库获取基因芯片GSE63514,运用R语言“limma”等相关拓展包筛选差异表达基因,利用R语言“cluster Profiler”等拓展包进行基因本体(GO)功能富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,通过String和Cytoscape软件构建蛋白质相互作用网络图,并筛选出关键基因。采用癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取宫颈鳞癌基因表达谱验证hub基因。使用随机森林算法筛选疾病关键基因,然后基于CIBERSORT反卷积算法对免疫细胞浸润模式进行分析。结果:共筛选出569个差异表达基因,其中上调262个,下调307个。GO分析显示,宫颈鳞癌主要与细胞周期、有丝分裂高度相关;KEGG分析显示,宫颈鳞癌主要与细胞周期过程、驱动蛋白高度相关。基于hub基因的随机森林算法筛选出TTK、CDK1、KIF23、KIF2C、NUSAP1共5个关键基因。免疫浸润模式分析结果显示,幼稚CD4^(+)T细胞在宫颈鳞癌中表达显著上调。结论:TTK、CDK1、KIF23、KIF2C、NUSAP1基因与宫颈鳞癌发生发展密切相关,幼稚CD4^(+)T细胞等免疫细胞在宫颈鳞癌的发生发展中具有重要作用。 展开更多
关键词 宫颈鳞癌 生物信息学 关键基因 免疫浸润
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基于元胞自动机的跨地域科研协作知识交流模型及仿真分析 被引量:1
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作者 叶光辉 魏锦钰 +1 位作者 谭启韬 夏立新 《情报学报》 CSCD 北大核心 2023年第6期681-689,共9页
跨地域科研协作知识交流对推动科研创新、促进价值创造具有重要意义。现实中知识交流过程复杂,传统方法难以对其进行全面刻画。本文刻画了跨地域科研协作知识交流中的主体特征,借鉴元胞自动机理论构建跨地域科研协作知识交流仿真模型,... 跨地域科研协作知识交流对推动科研创新、促进价值创造具有重要意义。现实中知识交流过程复杂,传统方法难以对其进行全面刻画。本文刻画了跨地域科研协作知识交流中的主体特征,借鉴元胞自动机理论构建跨地域科研协作知识交流仿真模型,并根据知识交流特点将其分为知识共享、知识转移和知识创新三个阶段,并从平均知识水平、知识均衡度和知识转移速度三个维度对不同因素下的仿真结果进行评测分析。研究结果表明,地理距离对跨地域科研协作知识交流的阻碍作用随时间的演变逐渐减弱,知识交流能力是提高知识交流效率的关键,知识创新是促进科研协作知识交流持续进行的不竭动力。本文通过探究不同影响因素对跨地域科研协作知识交流的效果,探讨知识在主体间转移的过程及特性,揭示了知识交流的内在机制,对解决跨地域科研协作知识交流研究中主体空间差异大、交流周期长、交互规则复杂等难题具有重要意义。 展开更多
关键词 跨地域 科研协作 知识交流 仿真 知识创新
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Synthesis and Characterization of 9,9-diethyl-1-phenyl-1,9-dihydrofluoreno[2,3-d]imidazole-ended Fluorophores
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作者 LI Saijun WANG Tianqi +2 位作者 tan qitao LIN Haixia CUI Yongmei 《Journal of Wuhan University of Technology(Materials Science)》 SCIE EI CAS CSCD 2023年第6期1484-1488,共5页
A series ofπ-conjugated compounds ending with 9,9-diethyl-1-phenyl-1,9-dihydrofluoreno[2,3-d]imidazole were conveniently synthesized by condensation of the key intermediate9,9-diethyl-N^(2)-phenyl-9H-fluorene-2,3-dia... A series ofπ-conjugated compounds ending with 9,9-diethyl-1-phenyl-1,9-dihydrofluoreno[2,3-d]imidazole were conveniently synthesized by condensation of the key intermediate9,9-diethyl-N^(2)-phenyl-9H-fluorene-2,3-diamine with the corresponding symmetric aryl phthalaldehydes under very mild conditions.The structures of these compounds were confirmed by^(1)H NMR,^(13)C NMR,and HRMS.Their UV-Vis spectroscopy data,fluorescent spectroscopy data,and further details of the electronic properties from cyclic voltammetry measurements and theoretical calculations were studied.Most compounds possess good fluorescence-emitting ability with quantum yield of fluorescence values in the region of 0.36-0.92 and display emission within 449-513 nm depending on the molecular nature. 展开更多
关键词 FLUORENE IMIDAZOLE synthesis UV absorption fluorescence
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基于加速因子不变原则的失效机理一致性检验
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作者 锁斌 谭启涛 +1 位作者 胡天松 唐家银 《电光与控制》 CSCD 北大核心 2021年第1期10-14,70,共6页
针对加速试验中产品的失效机理是否发生改变的问题,基于加速因子不变原则,研究了工程上应用较为广泛的Weibull寿命分布失效机理一致性的检验方法。将Weibull分布转化为I型极值分布,进而研究极值分布尺度参数的统计检验方法,并采用尺度... 针对加速试验中产品的失效机理是否发生改变的问题,基于加速因子不变原则,研究了工程上应用较为广泛的Weibull寿命分布失效机理一致性的检验方法。将Weibull分布转化为I型极值分布,进而研究极值分布尺度参数的统计检验方法,并采用尺度参数的Ansari-Bradley方法进行检验。结合Arrhenius加速模型,基于最小二乘法估计、回归系数的性质构造t统计量,实现对加速因子与分布参数的统计检验,判别失效机理发生改变的应力。仿真模型验证了所提检验方法的有效性。 展开更多
关键词 失效机理一致性 加速因子 尺度参数 t统计量
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混合指数分布型加速试验失效机理一致性检验 被引量:3
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作者 谭启涛 唐家银 徐志昆 《统计与决策》 CSSCI 北大核心 2019年第20期35-40,共6页
针对加速试验中产品的失效机理是否保持一致的问题,文章基于加速系数不变原则,探讨了寿命分布为混合指数类型,其分布参数与失效机理一致的内涵,结合Arrhenius加速模型,基于最小二乘法估计、回归系数的性质构造t统计量,实现加速系数与分... 针对加速试验中产品的失效机理是否保持一致的问题,文章基于加速系数不变原则,探讨了寿命分布为混合指数类型,其分布参数与失效机理一致的内涵,结合Arrhenius加速模型,基于最小二乘法估计、回归系数的性质构造t统计量,实现加速系数与分布参数的统计检验,通过随机变量的线性变换,将混合比例的一致性检验转化为分布函数的一致性检验,并给出了极限应力的逼近算法,仿真模型验证方法的可行性。 展开更多
关键词 失效机理一致性 加速系数 逼近算法
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考虑失效相关性的n部件多型贮备系统可靠性评估优化计算模型 被引量:2
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作者 谭启涛 唐家银 邓川 《统计与决策》 CSSCI 北大核心 2018年第23期38-43,共6页
文章结合条件密度、组合归类的思想,引入Copula的相关性理论,考虑零部件失效之间的相关性,针对转换开关分布服从0-1分布和连续型分布的情况,建立了多类型n部件的冷贮备系统与温贮备系统可靠性评估优化计算模型;并给出了相关性拟合的Cop... 文章结合条件密度、组合归类的思想,引入Copula的相关性理论,考虑零部件失效之间的相关性,针对转换开关分布服从0-1分布和连续型分布的情况,建立了多类型n部件的冷贮备系统与温贮备系统可靠性评估优化计算模型;并给出了相关性拟合的Copula模型选择方法。 展开更多
关键词 COPULA 失效相关 转换开关 贮备系统 可靠性
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基于PLC的立体仓库模拟装置的设计及控制部分设计 被引量:2
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作者 谭啟韬 《工业控制计算机》 2020年第3期133-135,137,共4页
针对电气控制来进行设计的时候,基本上是用到了四大机构:第一个是当下备受欢迎的PLC,第二个是步进电机驱动器,第三个是步进电动机,最后一个则是直流电动机。首先围绕该论文的写作背景以及其实际意义来展开详细说明;然后探讨了其硬件要... 针对电气控制来进行设计的时候,基本上是用到了四大机构:第一个是当下备受欢迎的PLC,第二个是步进电机驱动器,第三个是步进电动机,最后一个则是直流电动机。首先围绕该论文的写作背景以及其实际意义来展开详细说明;然后探讨了其硬件要素、结构以及工作原理等内容,并依次叙述了该系统所涵盖了的每个器件;最后在完成相应的编写作业之后,概括了其中涉及到的全部知识。 展开更多
关键词 PLC 自动化立体仓库 设计
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Review of biomechanical deviations among nonpregnant,pregnant,and postpartum cohorts
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作者 Wei Linjuan Wang Yan +4 位作者 Peng Yinghu tan qitao Gu Yaodong Li Li Zhang Ming 《Medicine in Novel Technology and Devices》 2023年第2期24-35,共12页
During pregnancy,women experience substantial changes in physiology,morphology,and hormonal systems.These changes have profound effects on the biomechanics of the human body,particularly the musculoskeletal system,res... During pregnancy,women experience substantial changes in physiology,morphology,and hormonal systems.These changes have profound effects on the biomechanics of the human body,particularly the musculoskeletal system,resulting in discomfort,pain,and decreased body stability.Sufficient biomechanical knowledge is critical for understanding the etiology and precautions of musculoskeletal disorders.With awareness of health problems in the pregnant cohort,identification,intervention,and precaution of problems have garnered attention.Researchers have conducted studies to determine the biomechanics of pregnancy.There have been review studies on summarization.However,to the best of our knowledge,few studies have comprehensively described biomechanical changes throughout pre-,in-,and postpartum periods.This review analyzed available studies on biomechanical changes during these three periods in the electronic databases of PubMed,Scopus,and Cochrane from inception until June 2,2021.Synthesized the general information,age of the studied subjects,investigated periods,sample size,objectives,measurement tools,and outcomes of reviewed studies.And Using National Institutes of Health quality assessment tool for observational cohort and cross-sectional studies to assessment the quality of the reviewed articles.These studies revealed biomechanical deviations in body stability,motion patterns,and gait modes during these three periods.Regarding research content,there are insufficient studies on certain critical biomechanical aspects,such as the kinetic parameters of the inner body,which are the most direct factors related to musculoskeletal problems.According to the National Institutes of Health quality assessment tool for observational cohort and cross-sectional studies,a more comprehensive and explicit understanding of pregnancy biomechanics can be expected. 展开更多
关键词 Pregnancy The center of pressure(COP) Kinematic Kinetic Motion patterns Gait modes
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2015—2019年深圳市光明区动物致人群伤害监测流行病学分析
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作者 王锦帼 孙艳 +4 位作者 朱航宇 高含 张艺 谭启涛 杨敏丽 《医学动物防制》 2023年第4期375-378,共4页
目的了解2015—2019年深圳市光明区动物致伤病例的流行病学特征,为预防和控制动物致人群伤害提供研究依据。方法收集2015—2019年深圳市光明区动物致人群伤害监测哨点医院就诊的病例资料,对被致伤人群的三间分布和致伤动物情况等进行流... 目的了解2015—2019年深圳市光明区动物致伤病例的流行病学特征,为预防和控制动物致人群伤害提供研究依据。方法收集2015—2019年深圳市光明区动物致人群伤害监测哨点医院就诊的病例资料,对被致伤人群的三间分布和致伤动物情况等进行流行病学分析。结果2015—2019年深圳市光明区共报告动物致伤病例23922例,各年发生率为488/10万、894/10万、805/10万、931/10万、865/10万,不同年份差异有统计学意义(χ^(2)=1.77,P<0.001)。致伤动物以犬类为主,16395例,占68.54%;致伤人群以外省(户籍未在深圳)人口为主,17621例,占73.66%;文化程度初中10797例,占45.13%;高发职业为商业和服务业,5090例,占21.28%;致伤时的活动以休闲活动为主,16082例,占67.23%;致伤的性质以咬伤/开放伤为主,22984例,占96.08%;致伤的部位以上肢和下肢为主,分别为11691例、10956例,占48.87%、45.80%;致伤的结局以处理后离院为主,23707例,占99.10%。结论应针对深圳市光明区动物致伤预防的重点人群加强健康教育,以减少致伤事件的发生。 展开更多
关键词 动物 致伤 监测 流行病学特征 致伤特征 调查 分析 影响因素
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工作场所空气中甲基丙烯酸异丁酯测定的气相色谱法
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作者 张素华 谭启涛 王星 《中华劳动卫生职业病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第8期628-630,共3页
目的:建立工作场所空气中甲基丙烯酸异丁酯的气相色谱测定方法。方法:于2019年7至10月,对工作场所空气中的甲基丙烯酸异丁酯采用活性炭管采集,以二硫化碳解吸后毛细管柱气相色谱法测定。结果:该方法测定甲基丙烯酸异丁酯在0~800μg/ml... 目的:建立工作场所空气中甲基丙烯酸异丁酯的气相色谱测定方法。方法:于2019年7至10月,对工作场所空气中的甲基丙烯酸异丁酯采用活性炭管采集,以二硫化碳解吸后毛细管柱气相色谱法测定。结果:该方法测定甲基丙烯酸异丁酯在0~800μg/ml浓度范围呈线性关系,r=0.99993;检出限为0.35μg/ml,最低检出浓度为0.12 mg/m 3;批内精密度为2.06%~2.72%,批间精密度为3.03%~3.83%;平均解吸效率为96.7%;穿透容量大于14.46 mg,采样效率达100%;样品在室温下至少可保存7 d。结论:甲基丙烯酸异丁酯的气相色谱测定方法操作简便,灵敏度高,精密度好,能准确测定空气中的甲基丙烯酸异丁酯。 展开更多
关键词 工作场所 空气 甲基丙烯酸异丁酯 色谱法 气相
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工作场所空气中二苯胺测定的高效液相色谱法 被引量:1
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作者 于甜甜 谭启涛 王宇 《中华劳动卫生职业病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第7期546-549,共4页
目的建立工作场所空气中二苯胺的高效液相色谱测定方法。方法空气中二苯胺经酸化玻璃纤维滤膜采集,甲醇洗脱,高效液相色谱-紫外检测器测定。结果该方法在0~30.0μg/ml范围中呈线性关系,回归方程为y=8425.6x-150.7,相关系数r=0... 目的建立工作场所空气中二苯胺的高效液相色谱测定方法。方法空气中二苯胺经酸化玻璃纤维滤膜采集,甲醇洗脱,高效液相色谱-紫外检测器测定。结果该方法在0~30.0μg/ml范围中呈线性关系,回归方程为y=8425.6x-150.7,相关系数r=0.9999;检出限为0.045μg/ml,最低检出浓度为0.030mg/m。(采样体积以15L计);精密度批内为2.41%~3.02%,批间为3.11%~4.45%;平均洗脱效率为97.8%,采样效率为100%,样品在室温下至少可保存7d。结论该方法各项指标均符合GBZ/T210.4—2008《工作场所空气中化学物质测定方法》的要求,适用于工作场所空气中二苯胺的检测。 展开更多
关键词 二苯胺 空气 工作场所 高效液相色谱测定法
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