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中国古老月季‘月月粉’FT/TFL1基因的鉴定与表达分析 被引量:4
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作者 吴高琼 李淑斌 +3 位作者 王炜佳 张颢 唐开学 王其刚 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期1741-1749,共9页
该研究以中国古老月季品种‘月月粉’(Rosa chinensis‘Old Blush’)为试材,根据拟南芥和草莓FT/TFL1基因家族成员的保守结构域设计引物,对‘月月粉’基因组DNA进行克隆和测序,结合数据库序列和双单倍体基因组信息进行序列比对,结果共... 该研究以中国古老月季品种‘月月粉’(Rosa chinensis‘Old Blush’)为试材,根据拟南芥和草莓FT/TFL1基因家族成员的保守结构域设计引物,对‘月月粉’基因组DNA进行克隆和测序,结合数据库序列和双单倍体基因组信息进行序列比对,结果共获得了8条月季的FT/TFL1基因家族序列,且8条序列分别注释为2个FT基因(RcFT1和RcFT2)、1个BFT基因(RcBFT)、1个ATC基因(RcATC)、2个MFT基因(RcMFT1和RcMFT2)和2个PEBP基因(PEBP1和PEBP2);进化树分析结果将这8个基因分为3个亚组;结构分析显示8个基因的内含子为1~5个不等。qRT-PCR分析显示,RcFT1、RcPEBP、RcMFT1、RcMFT2和RcBFT在‘月月粉’的叶片中表达量最高,茎尖中次之;RcFT2在茎尖中的表达最高,叶片中次之;RcATC在茎尖中的表达量高于其他组织;除RcPEBP在根组织中有表达外,其他基因在根组织中几乎没有检测到。进一步表达分析显示,RcFT1和RcFT2在‘无刺光叶蔷薇’(R.wichuriana‘Basye’s Thornless’)生殖生长期的叶片、茎尖中的表达量显著高于营养生长期。研究推测,具有连续开花性状的中国古老月季‘月月粉’可能具有多个开花时间(FT)基因位点,FT有可能可以作为月季生殖转换的标记基因。 展开更多
关键词 中国古老月季 FT/TFL1基因 开花时间 基因表达
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蔷薇科植物MLO蛋白家族的生物信息学分析 被引量:13
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作者 向贵生 王开锦 +4 位作者 晏慧君 李淑斌 周宁宁 唐开学 邱显钦 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期2043-2059,共17页
MLO基因家族是一类重要的植物抗病基因,MLO蛋白的突变体对白粉病真菌表现出广谱抗性,且能特异性调控细胞死亡,利用自发的细胞死亡来应答发育或非生物刺激。为了分析蔷薇科植物MLO蛋白的结构特征、系统进化及潜在功能,本研究利用生物信... MLO基因家族是一类重要的植物抗病基因,MLO蛋白的突变体对白粉病真菌表现出广谱抗性,且能特异性调控细胞死亡,利用自发的细胞死亡来应答发育或非生物刺激。为了分析蔷薇科植物MLO蛋白的结构特征、系统进化及潜在功能,本研究利用生物信息学方法对在Gen Bank中已登录的来自于蔷薇科的7个物种共计82条具有完整ORF的MLO基因进行了分析。分析显示这82条蛋白的氨基酸数量、碱基数、分子量差异较小,平均亲水系数为-0.191~0.253,绝大多数具有内含子结构;亚细胞定位主要分布于质膜中,包含5~8个跨膜结构;共有15个保守基序,长度在15~50个氨基酸之间。其中,等电点小于7的仅有1条,6条蛋白具有信号肽。系统进化关系揭示了这些物种间具有较高的同源性和保守性;将其与其它物种中已鉴定的MLO基因进行聚类分析,筛选出32个可能与抗白粉病相关的候选基因;进一步序列比对分析,发现仅有17条基因具有MLO型白粉病基因所有的典型结构。因此,本研究表明,所选用的82条蔷薇科MLO基因中,仅有17条基因可能参与寄主-白粉病菌的互作过程。本研究为进一步研究蔷薇科及其他植物MLO基因的抗病遗传机制提供了一些参考依据。 展开更多
关键词 蔷薇科 MLO基因 抗白粉病 系统进化 生物信息学
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月季组学及其开花习性和花香性状研究进展 被引量:9
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作者 李淑斌 王炜佳 +4 位作者 吴高琼 余春霞 唐开学 王四清 戴思兰 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期995-1010,共16页
综述了蔷薇属植物核基因组、叶绿体基因组、转录组和表观组学等方面的重要研究进展,结合中国古老月季‘月月粉’全基因组测序的最新研究成果,重点对连续开花和花香2个性状的研究进行了概述,对蔷薇属植物中亟待阐明的几个关键科学问题进... 综述了蔷薇属植物核基因组、叶绿体基因组、转录组和表观组学等方面的重要研究进展,结合中国古老月季‘月月粉’全基因组测序的最新研究成果,重点对连续开花和花香2个性状的研究进行了概述,对蔷薇属植物中亟待阐明的几个关键科学问题进行论述,并对今后蔷薇属植物组学研究的发展方向提出了展望,以期对蔷薇属植物重要生物学问题的解答和新种质的创制提供理论参考。 展开更多
关键词 蔷薇属 月季 组学 连续开花 花香 驯化
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Inheritance of Perpetual Blooming in Rosa chinensis ‘Old Blush' 被引量:9
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作者 LI Shubin ZHOU Ningning +9 位作者 ZHOU Qing YAN Huijun JIAN Hongying WANG Qigang CHEN Min QIU Xianqin ZHANG Hao WANG Shufang LI Shufa tang kaixue 《Horticultural Plant Journal》 SCIE 2015年第2期108-112,共5页
Perpetual blooming is one of the most important biological and economical traits in modern rose, while the genetic basis underlining the control of this trait is poorly investigated. With an aim in dissecting the gene... Perpetual blooming is one of the most important biological and economical traits in modern rose, while the genetic basis underlining the control of this trait is poorly investigated. With an aim in dissecting the genetic determinism of perpetual blooming, we developed six rose populations(OB, W, F1, F2, BC1 OB and BC1W) derived from a WOB population [interspecific diploid hybridization between Rosa chinensis ‘Old Blush'(OB) and R. wichuriana ‘Basye's Thornless'(W)]. Perpetual blooming is absent both in a F1 population with 296 individuals and a BC1 W population(W as the backcross parent) with 150 individuals. However, the perpetual blooming trait showed a typical 3︰1 segregation in a backcross population BC1 OB with OB as the backcross parent. In this population with 300 individuals, 83 plants had the perpetual blooming phenotype while the other 217 featured non-perpetual blooming, indicating that the perpetual blooming trait is very likely controlled by two recessive genes in R. chinensis(rpb1 and rpb2). These genetic data suggest that the inheritance of rose perpetual blooming may be controlled by a complex mechanism. 展开更多
关键词 rose Rosa chinensis perpetual blooming segregating population recessive loci
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