肝胆肿瘤中肿瘤特异性CircRNA衍生抗原肽的鉴定

基于肿瘤抗原的免疫治疗的应用受到验证免疫原性肽稀缺性的阻碍。本研究旨在研究环状RNA(circRNA)在肝胆肿瘤类器官中作为肿瘤抗原肽新来源的潜力。使用RNA测序(RNA-seq)和基于算法的评分工具,预测3950个翻译的肿瘤特异性环状RNA在27个类器官中产生18971个抗原肽。从抗原格局来看,11个氨基酸长度(mer)肽和人白细胞抗原(HLA)-A结合肽具有最高的免疫原性相关评分。在分析的3/5类器官中,有13个预测抗原肽通过质谱(MS)免疫肽组学被直接确认为HLA-A、HLA-B和HLA-C(HLA-ABC)结合肽。在流式细胞术和酶联免疫吸附试验(ELISA)中,由HLA-ABC分子呈递的circRNA衍生的肿瘤特异性肽刺激CD8(CD8)T细胞,显示CD107a干扰素γ(IFNγ)共表达和IFNγ分泌增加。免疫原性环状RNA衍生肽诱导的靶向类器官的细胞毒性T细胞活性在杀伤实验中得到验证。值得注意的是,来自circTBC1D15的抗原肽YGFNEILKK不仅被认为是类器官的HLA-ABC呈递肽,而且还显著降低了肿瘤类器官的存活率。本研究的发现强调了产生肿瘤抗原的一个关键亚群,这对靶向肿瘤特异性circRNA具有重要意义。