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核桃铵态氮转运蛋白基因JrAMT2的功能分析
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作者 凡婷婷 张佳琦 +9 位作者 刘会君 王凤敏 马宇航 吴宇伟 胡恒康 黄有军 李岩 王克涛 黄坚钦 张启香 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期79-91,共13页
【目的】研究高效利用氮素基因铵态氮转运蛋白基因JrAMT2,对核桃Juglansregia的品种改良、快速生长及产量形成有重要意义。【方法】以核桃JrAMT2过表达幼苗为实验材料,对JrAMT2基因进行生物信息学分析。通过基因表达量和表型测定对核桃J... 【目的】研究高效利用氮素基因铵态氮转运蛋白基因JrAMT2,对核桃Juglansregia的品种改良、快速生长及产量形成有重要意义。【方法】以核桃JrAMT2过表达幼苗为实验材料,对JrAMT2基因进行生物信息学分析。通过基因表达量和表型测定对核桃JrAMT2过表达植株生长发育、氮素吸收、叶绿素质量分数、叶绿素荧光进行理化分析。【结果】JrAMT2基因在核桃JrAMT2过表达植株中稳定表达。与野生型相比,核桃JrAMT2过表达株系的株高、节间长、生物量等生长参数显著提高(P<0.05),核桃幼苗的株高、节间长增加,最高可增加68.2%和50.3%,植株地上部分、地下部分生物量显著增加,地上部分最高可增加56.26%(鲜质量)和56.26%(干质量),地下部分最高可增加344.38%(鲜质量)和354.33%(干质量);核桃JrAMT2过表达株系地下部分对铵态氮及硝态氮的吸收显著提高(P<0.05),最高可提高114.1%和70.3%,其中JrAMT2基因介导了铵态氮从地下部分到地上部分的运输,地上部分铵态氮质量分数显著增加(P<0.05),最高可增加59.1%;核桃JrAMT2过表达植株叶绿体表面积与单层细胞表面积比率、叶绿素质量分数显著增加(P<0.05),最高可增加22.94%和74.3%;对叶绿素荧光参数分析,核桃JrAMT2过表达植株叶片放氧复活体活性、量子产额、电子传递效率均显著提高(P<0.05)。【结论】核桃JrAMT2基因在核桃幼苗生长发育、氮素吸收和光合作用中均有积极显著调控的作用,为进一步研究核桃快速繁育提供一定的理论依据,且为筛选优良品种奠定一定基础。 展开更多
关键词 核桃 JrAMT2 铵态氮转运蛋白 过表达 光合作用
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基于YOLOv5s的园林球形绿篱检测方法
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作者 王克涛 陈世锋 +3 位作者 陈贵 韦锦 蒙丽雯 陈泉成 《中国农机化学报》 北大核心 2024年第8期262-269,共8页
在聚集遮挡等复杂园林环境下,现有的目标检测算法很难对球形绿篱进行准确检测。针对这一问题,提出一种基于YOLOv5s的算法YOLO-CBS,用于提高园林球形绿篱的检测精度。首先,将坐标注意力(CA)引入YOLOv5s的主干网络,CA不仅考虑通道间的关... 在聚集遮挡等复杂园林环境下,现有的目标检测算法很难对球形绿篱进行准确检测。针对这一问题,提出一种基于YOLOv5s的算法YOLO-CBS,用于提高园林球形绿篱的检测精度。首先,将坐标注意力(CA)引入YOLOv5s的主干网络,CA不仅考虑通道间的关系还考虑特征空间的位置信息,因而能够使模型更准确地识别和定位目标绿篱;其次,用双向特征金字塔网络(BiFPN)替换路径聚合网络(PANet),以提高特征融合的效率;最后,将输出端的非极大值抑制(NMS)改为Soft-NMS,以提高对遮挡绿篱、聚集绿篱等复杂场景下的目标绿篱检测精度。典型绿篱数据集试验结果表明,与YOLOv5s算法相比,YOLO-CBS算法平均精度提高3.4%。 展开更多
关键词 绿篱检测 YOLOv5s 注意力机制 特征金字塔网络 非极大值抑制
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山核桃寡核苷酸探针开发及其应用
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作者 苑轲 黄坚钦 +3 位作者 王克涛 夏国华 张启香 徐川梅 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第5期88-99,共12页
【目的】利用山核桃全基因组测序数据,为山核桃开发一些寡核苷酸类型的染色体物理标记,并建立起山核桃寡核苷酸探针开发方法,以期为其他山核桃品种相关研究提供参考。【方法】以山核桃、湖南山核桃、云南山核桃、大别山山核桃、贵州山... 【目的】利用山核桃全基因组测序数据,为山核桃开发一些寡核苷酸类型的染色体物理标记,并建立起山核桃寡核苷酸探针开发方法,以期为其他山核桃品种相关研究提供参考。【方法】以山核桃、湖南山核桃、云南山核桃、大别山山核桃、贵州山核桃、薄壳山核桃及喙核桃为材料,利用Tandem Repeat Finder软件分析山核桃基因组中的重复序列,按照Period size>4,Copy number>100,且Period size*Copy number>3000的筛选条件对重复序列进行筛选,根据筛选结果合成了约60条寡核苷酸探针,利用荧光原位杂交技术对这些探针进行筛选。【结果】1)sht-2、sht-3、sht-4、sht-5、sht-5S及sht-45S均可在山核桃染色体上产生相应的荧光信号,且sht-2、sht-3、sht-4及sht-5在山核桃染色体上的分布模式相同,有2对强弱不同的信号存在,sht-45S在山核桃染色体上有1对信号存在,sht-5S仅在山核桃单条染色体上有1个信号位点分布,这些探针均位于染色体的近着丝粒区域。2)sht-5的2对信号位点中,其中较强的1对位点与sht-45S的信号位点在山核桃染色体上分布位置完全重叠。3)45SrDNA与sht-45S在山核桃染色体上分布位置完全重叠,5SrDNA与sht-5S在山核桃染色体上的分布位置也完全重叠。4)sht-5在湖南山核桃、云南山核桃、大别山山核桃及贵州山核桃染色体上均有信号分布,且与山核桃分布模式相似,但sht-5在喙核桃及薄壳山核桃染色体上没有信号。5)sht-5S及sht-45S在湖南山核桃、云南山核桃、大别山山核桃、贵州山核桃及薄壳山核桃染色体上均有信号分布,但在喙核桃染色体上没有信号分布。6)sht-45S在湖南山核桃、大别山山核桃及贵州山核桃染色体上的分布模式相似,均只有1对位点存在,sht-45S在薄壳山核桃染色体上有2对位点存在,位于2对同源染色体的近着丝粒区域。7)sht-5S在云南山核桃、贵州山核桃、大别山山核桃及薄壳山核桃4个山核桃种染色体上的分布模式相似,均只有1对信号位点存在,位于1对同源染色体上的近着丝粒区域,在湖南山核桃染色体上有2种不同的分布模式,第一种分布模式具有1个单独的信号位点,第二种分布模式中,具有2个强弱不同的荧光信号,均位于染色体的近着丝粒区域。【结论】1)sht-2/3/4/5、sht-5S及sht-45S可作为分析山核桃、湖南山核桃、云南山核桃、大别山山核桃及贵州山核桃染色体的物理标记。2)sht-5S及sht-45S可代替质粒45SrDNA和5SrDNA,用来对山核桃、湖南山核桃、云南山核桃、大别山山核桃、薄壳山核桃及贵州山核桃染色体进行分析。 展开更多
关键词 山核桃 重复序列 寡核苷探针 染色体 寡核苷酸荧光原位杂交
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腹腔镜卵巢成熟畸胎瘤剥除术电凝或缝合止血对患者卵巢储备功能影响 被引量:11
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作者 林宁 管业秋 +2 位作者 陶冶 王克涛 魏岩 《中国计划生育学杂志》 2021年第10期2064-2067,共4页
目的:比较腹腔镜卵巢成熟畸胎瘤剥除术电凝止血与缝合止血对患者卵巢储备功能的影响。方法:选取2016年5月—2021年5月本院收治的80例因卵巢畸胎瘤行腹腔镜下卵巢畸胎瘤剔除术患者,随机数字法随机分为两组各40例,分别采用双极电凝止血方... 目的:比较腹腔镜卵巢成熟畸胎瘤剥除术电凝止血与缝合止血对患者卵巢储备功能的影响。方法:选取2016年5月—2021年5月本院收治的80例因卵巢畸胎瘤行腹腔镜下卵巢畸胎瘤剔除术患者,随机数字法随机分为两组各40例,分别采用双极电凝止血方法(电凝止血组)或缝合止血方法(缝合止血组),记录两组手术时间、术中出血量,检测术前末次月经的第3天、术后3天及术后1个月、6个月患者月经第3天时血清雌二醇(E_(2))、促卵泡激素(FSH)、黄体生成素(LH)及抗苗勒管激素(AMH),在术前及术后1、6个月取血当天行经阴道超声记录窦卵泡数(F0)、卵巢体积及患侧卵巢间质血流峰值(PSV)。结果:两组手术时间和术中出血量无差异(P>0.05)。术后3天、1个月、6个月的E_(2)及AMH水平两组均低于术前,但缝合止血组高于电凝止血组;FSH水平两组均高于术前,但缝合止血组低于电凝止血组(均P<0.05);LH水平两组均高于术前(P<0.05),但两组无差异(P>0.05)。两组术后1个月、6个月超声F0均低于术前,但缝合止血组高于电凝止血组(均P<0.05),卵巢体积及PSV缝合止血组较术前回升,电凝止血组下降,缝合止血组卵巢体积及PSV均高于电凝止血组(均P<0.05)。结论:腹腔镜成熟畸胎瘤剥除术中采用缝合止血方法比电凝止血法更有利于保护卵巢储备功能及术后恢复。 展开更多
关键词 成熟畸胎瘤剥除术 腹腔镜 电凝止血 缝合止血 卵巢储备功能
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新型冠状病毒肺炎疫情下口腔颌面外科专科医师管理探索与实践
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作者 宋晓彬 杨科 +2 位作者 王克涛 刘少华 俞水 《中国毕业后医学教育》 2020年第3期236-238,266,共4页
新型冠状病毒肺炎疫情的暴发波及全国,全球也有些国家发生疫情,截至2020年2月15日累计的确诊病例数超过7万。口腔颌面外科专科医师培训基地应在抗击新型冠状病毒肺炎战役中迅速做出反应,从口腔颌面外科专科医师的特点入手,梳理在防控疫... 新型冠状病毒肺炎疫情的暴发波及全国,全球也有些国家发生疫情,截至2020年2月15日累计的确诊病例数超过7万。口腔颌面外科专科医师培训基地应在抗击新型冠状病毒肺炎战役中迅速做出反应,从口腔颌面外科专科医师的特点入手,梳理在防控疫情中培训工作可能出现的问题,与医院职能部门密切协同,根据国家相关政策和工作实际,制订疫情期间专科医师培训的应对方案和管理、培训措施,确保口腔颌面外科专科医师培训工作顺利进行。 展开更多
关键词 新型冠状病毒肺炎 口腔颌面外科 专科医师 培训 管理
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山核桃实时荧光定量PCR分析中内参基因的筛选与验证 被引量:8
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作者 赵艺蕊 黄春颖 +6 位作者 王克涛 徐一帆 王建华 邢语琳 陶瞫宸 黄坚钦 李岩 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期10-21,共12页
【目的】筛选出山核桃中的最佳内参基因。【方法】以山核桃的根、茎、叶、柱头、果皮、胚、不同处理下的叶片及嫁接后的砧木和接穗为试验材料,利用geNorm、NormFinder、BestKeeper和RefFinder 4种软件对10个管家基因家族(ARF、ACT1、ACT... 【目的】筛选出山核桃中的最佳内参基因。【方法】以山核桃的根、茎、叶、柱头、果皮、胚、不同处理下的叶片及嫁接后的砧木和接穗为试验材料,利用geNorm、NormFinder、BestKeeper和RefFinder 4种软件对10个管家基因家族(ARF、ACT1、ACT7、MPS、UBC9、CYP、60SRP、EF-1α、GAPHD和HIS)中的19个候选内参基因表达的稳定性进行综合分析。【结果】通过比较不同组织内参基因表达的稳定性,排名前五的5个基因(ARF-1、60SRP、ACT7-1、ACT1-1和UBC9-5)被选出且ARF-1和60SRP的表达最稳定。geNorm分析显示:在盐、干旱及嫁接处理后,60SRP的表达最稳定;外源喷施不同激素到山核桃叶面后,UBC9-5的表达最为稳定;综合所有组织和处理发现UBC9-5为最稳定表达的基因。NormFinder和RefFinder综合分析的结果与geNorm分析结果基本一致,而与BestKeeper分析相差较大。【结论】在山核桃的不同组织及不同试验处理中,最适的内参基因有所不同,其也受分析方法的影响。 展开更多
关键词 山核桃 组织 内参基因 实时荧光定量PCR
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内镜辅助下单一隐蔽切口入路面颊中部良性肿瘤切除效果初探
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作者 季翀昊 王勇 +2 位作者 王克涛 赵明宇 石亮 《中华口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期1165-1171,共7页
目的总结内镜辅助下通过耳屏内或口内两种隐蔽切口入路行面颊中部良性肿瘤切除术的初步经验,探讨面颊中部良性肿瘤切除中内镜辅助技术的应用适应证及优缺点。方法前瞻性纳入2018年4月至2022年11月就诊于山东大学齐鲁医院口腔颌面外科的3... 目的总结内镜辅助下通过耳屏内或口内两种隐蔽切口入路行面颊中部良性肿瘤切除术的初步经验,探讨面颊中部良性肿瘤切除中内镜辅助技术的应用适应证及优缺点。方法前瞻性纳入2018年4月至2022年11月就诊于山东大学齐鲁医院口腔颌面外科的36例面颊中部良性肿瘤患者,其中男性11例,女性25例,年龄(37.2±15.9)岁(11~65岁)。采用随机数字表法将患者分为两组,分别采用耳屏内切口入路(耳屏内组19例)和口内切口入路(口内组17例)。统计比较两组患者的肿瘤最大径、切口长度、手术时间、术中出血量、术后引流量及时间、美学满意度、围手术期并发症和随访情况。结果两组患者的手术过程均按预期完成。耳屏内组患者肿瘤最大径[(2.2±0.9)cm]与口内组[(2.1±0.7)cm]差异无统计学意义(t=0.46,P=0.687)。两组患者的手术切口长度和手术时间差异均无统计学意义(t=1.57,P=0.100;t=0.44,P=0.736)。口内组术中出血量[(23.6±8.9)ml]显著少于耳屏内组[(30.8±8.7)ml](t=2.97,P=0.006),美观满意度显著高于耳屏内组(t=3.44,P=0.015)。耳屏内组出现2例耳垂麻木,1例暂时性面瘫;口内组有2例术后积液,未观察到神经损伤迹象。术后随访1~54个月,两组均未见肿瘤复发。结论采用单一耳屏内或口内隐蔽切口入路于内镜辅助下切除面颊中部良性肿瘤均可获得较好的美观及微创效果,围手术期并发症少,手术效果满意。 展开更多
关键词 面部肿瘤 面颊中部 内镜 耳屏内切口 口内切口
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关节镜下后踝三入路切除术治疗疼痛性跟距骨桥
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作者 曲峰 孙成宜 +3 位作者 王克涛 王智 李鹏飞 张明珠 《中华腔镜外科杂志(电子版)》 2023年第2期106-110,共5页
目的研究关节镜下后踝三入路法切除治疗成人疼痛性跟距骨桥的疗效,以期为临床该病患者的治疗提供方案。方法选择首都医科大学附属北京同仁医院从2021年2~12月收治的11例成人疼痛性跟距骨桥患者。所有受试者均开展经典后踝内外侧入路联... 目的研究关节镜下后踝三入路法切除治疗成人疼痛性跟距骨桥的疗效,以期为临床该病患者的治疗提供方案。方法选择首都医科大学附属北京同仁医院从2021年2~12月收治的11例成人疼痛性跟距骨桥患者。所有受试者均开展经典后踝内外侧入路联合外侧高位入路切除术治疗。术前及术后随访,均行患侧踝关节负重正侧位X线片,CT检查。采用疼痛视觉模拟评分(visual analogue scale,VAS)及美国足踝外科协会(American Orthopaedic Foot and Ankle Society Ankle-Hindfoot Scale,AOFAS)踝-后足评分评价疼痛及足部功能改善情况。结果11例患者术后全部获得随访,随访时间6~14个月,平均11个月。术后切口均Ⅰ期愈合,无伤口感染、血管神经肌腱损伤、下肢深静脉血栓形成等并发症发生。术后踝关节疼痛及足部功能显著改善。末次随访VAS中位数1.0分,与术前VAS中位数6.0分比较,差异有统计学意义(P<0.05);末次随访AOFAS踝-后足评分(93.7±4.6)分,与术前(62.4±9.7)分比较,差异有统计学意义(P<0.001)。结论关节镜下后踝三入路可更好显露跟距骨桥,视野更广阔,空间感更好,操作过程更灵活,切除时不易伤及血管神经,有利于获得更好疗效。 展开更多
关键词 疼痛性跟距骨桥 关节镜 后踝三入路 骨桥切除术 视觉模拟评分法 疗效
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隐蔽切口入路内镜辅助颈部肿物切除效果初探 被引量:10
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作者 石亮 宋晓彬 +3 位作者 王克涛 刘超 谈万业 王勇 《中华口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期115-118,共4页
目的探索评价颌面部隐蔽切口入路内镜辅助下颈部良性肿瘤切除的新术式。方法选取2018年1月至2019年8月于山东大学齐鲁医院口腔颌面外科就诊的颈部良性肿瘤患者17例(颏下区3例,下颌下区2例,腮腺后下极9例,胸锁乳突肌上区1例,胸锁乳突肌中... 目的探索评价颌面部隐蔽切口入路内镜辅助下颈部良性肿瘤切除的新术式。方法选取2018年1月至2019年8月于山东大学齐鲁医院口腔颌面外科就诊的颈部良性肿瘤患者17例(颏下区3例,下颌下区2例,腮腺后下极9例,胸锁乳突肌上区1例,胸锁乳突肌中区1例,胸锁乳突肌下区1例)。术前行CT检查,评价肿瘤大小、边界、形态、性质,根据肿瘤所在区域设计不同部位隐蔽切口,颏下区及下颌下区肿物选用口内前庭沟入路,腮腺后下极及胸锁乳突肌区肿物选用耳后隐蔽小切口入路。术中采用自制的"口腔手术用造腔装置"辅助牵拉完成颈部"造腔",内镜辅助下将肿物完整摘除,术后每3个月定期随访。结果所有手术均按预期完成,术后3个月复查时,视觉模拟量表平均为9.3分,患者对切口设计及手术整体效果均表示满意,术后1~15个月随访均未见复发。结论采用隐蔽切口入路内镜辅助颈部良性肿物切除是一种切口不明显、具有良好美容效果的手术方法。 展开更多
关键词 头颈部肿瘤 内窥镜 口腔前庭沟切口 耳后切口
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内镜辅助腮腺浅叶良性肿瘤切除效果初探 被引量:7
10
作者 石亮 宋晓彬 +1 位作者 王克涛 王勇 《中华口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第12期847-850,共4页
目的总结内镜辅助腮腺浅叶良性肿瘤切除手术的初步经验,探讨内镜手术在口腔颌面部应用的适应证及优缺点.方法回顾性分析2018年3月至2019年3月山东大学齐鲁医院口腔颌面外科应用内镜技术完成的18例腮腺浅叶良性肿瘤包膜外切除手术患者的... 目的总结内镜辅助腮腺浅叶良性肿瘤切除手术的初步经验,探讨内镜手术在口腔颌面部应用的适应证及优缺点.方法回顾性分析2018年3月至2019年3月山东大学齐鲁医院口腔颌面外科应用内镜技术完成的18例腮腺浅叶良性肿瘤包膜外切除手术患者的临床资料,介绍其手术方式.对适应证、肿瘤的长轴长度、切口设计、手术时间、术中出血量、术后引流量及引流时间、美观满意度、术后并发症及随访情况进行记录整理和分析.结果所有手术过程均按预期完成.肿物长轴长度为(2.3±0.6)cm,内镜辅助耳屏内绕耳垂切口短小隐蔽,切口长度(5.1±1.3)cm,手术时长(2.0±0.4)h,术中出血量(168.9±18.8)ml、术后引流量(29.5±11.7)ml、术后引流天数为(3.6±0.5)d,暂时性面瘫及耳垂麻木各2例,术后3个月患者对切口设计及美观效果视觉模拟量表评分为(9.6±0.1)分,患者均表示非常满意.结论内镜辅助耳屏内绕耳垂切口行腮腺浅叶良性肿瘤切除术可减少并发症,缩小手术切口并获得满意的美观效果. 展开更多
关键词 腮腺肿瘤 内窥镜检查 包膜外切除术
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鼻内镜下鼻口相关囊肿开放术 被引量:3
11
作者 张立强 李学忠 +5 位作者 蔡晓岚 叶萍 冯昕 王娟 王克涛 王勇 《中国医学文摘(耳鼻咽喉科学)》 2020年第3期154-157,共4页
目的探讨鼻口交界相关区域不同类型囊肿的治疗方法。方法回顾分析2008年到2018年我院治疗的41例鼻口交界相关区域的不同类型的囊肿的临床资料,其中含牙囊肿12例,鼻前庭囊肿19例,腭正中囊肿6例,切牙管囊肿4例。全部病例采用鼻内镜下囊肿... 目的探讨鼻口交界相关区域不同类型囊肿的治疗方法。方法回顾分析2008年到2018年我院治疗的41例鼻口交界相关区域的不同类型的囊肿的临床资料,其中含牙囊肿12例,鼻前庭囊肿19例,腭正中囊肿6例,切牙管囊肿4例。全部病例采用鼻内镜下囊肿开放术。结果所有病例均得到治愈,未出现复发。有2例鼻前庭囊肿和1例腭正中囊肿患者术后出现开窗口狭窄,患者无不适。1例患者术后2小时出现较严重的出血,重新给予鼻腔填塞成功止血。1例鼻前庭囊肿患者术后前鼻孔形态略有变化。所有病例经随访,均未出现长期鼻腔溢液,囊肿均上皮化,囊腔逐渐变浅,甚至消失。结论鼻口相关囊肿可通过鼻内镜下囊肿开放术获得较好的治疗效果,疗效长期稳定;内镜开放术手术创伤小,对鼻口功能损伤小,操作简单,适应证广,并发症少,是值得推广的一种治疗方法。 展开更多
关键词 鼻前庭囊肿 腭正中囊肿 切牙管囊肿 含牙囊肿 鼻内镜外科技术
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Identification and Characterization of microRNA during Bemisia tabaci Infestations in Solanum lycopersicum and Solanum habrochaites 被引量:7
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作者 wang ketao SU Xiaomei +3 位作者 CUI Xia DU Yongchen ZHANG Shuaibin GAO Jianchang 《Horticultural Plant Journal》 SCIE 2018年第2期62-72,共11页
MicroRNAs(miRNAs) are a class of small non-coding RNAs that can regulate target gene expression during many plant growth and development processes. In recent years, several studies identified the miRNAs involved in fr... MicroRNAs(miRNAs) are a class of small non-coding RNAs that can regulate target gene expression during many plant growth and development processes. In recent years, several studies identified the miRNAs involved in fruit development, leaf development, and abiotic responses in tomato. However, little is known about the miRNAs that respond to insect attack. Here, miRNAs were identified by high-throughput sequencing at different stages after infections by the whitefly Bemisia tabaci in Solanum lycopersicum and Solanum habrochaites, which are susceptible and resistant to whitefly, respectively. A total of 44 known miRNA families were identified, and 33 were shared between the two species. Among these, 13 miRNA families were newly reported in tomato. After strict filtering, some novel miRNAs were also discovered. The global expression patterns of the miRNAs exhibited were different between the two species, reflecting their different responses and resistance levels to whitefly attack. Some of the predicted target genes of differentially expressed miRNAs may be involved in responding to, and defending against, diseases and insects. Thus, plant miRNAs are important in the responses to, and resistance against, insects and provide a useful resource for further investigations into the mechanism of miRNA-mediated plant–insect interactions. 展开更多
关键词 Solanum lycopersicum Solanum habrochaites Bemisia tabaci MIRNAS whitefly infection high-throughput sequencing
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Landscape and Fruit Developmental Regulation of Alternative Splicing in Tomato by Genome-Wide Analysis 被引量:2
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作者 wang ketao JIAO Zhicheng +5 位作者 XU Meng wang Yongsheng LI Ren CUI Xia GU Lianfeng ZHANG Shuaibin 《Horticultural Plant Journal》 SCIE 2016年第6期338-350,共13页
In eukaryotes, alternative splicing(AS) is one of the posttranscriptional regulatory mechanisms that play important roles by generating transcriptome diversity. To obtain a global view of AS and its dynamics during to... In eukaryotes, alternative splicing(AS) is one of the posttranscriptional regulatory mechanisms that play important roles by generating transcriptome diversity. To obtain a global view of AS and its dynamics during tomato fruit development, we analyzed the AS events using a large amount of transcriptome datasets. Same with other plant species, about half of the expressed multiexonic genes were alternatively spliced in tomato. Besides that, our further analyzation of RNA-seq datasets of ovule and pericarp at early fruit developmental stages reveals that the dynamic alteration of AS events occurred in specific tissues and AS was regulated spatially and temporally during early fruit development in tomato. By investigating the sequence variations at splice sites causing differential AS events between tomato cultivar ‘Moneymaker' and wild species Solanum pimpinellifolium PI365967, we uncover that AS may play the regulatory roles during domestication of tomato. Taken together, our results provided the global AS pattern in tomato and highlighted the importance of AS during tomato fruit development and domestication. 展开更多
关键词 TOMATO alternative splicing(AS) fruit development DOMESTICATION
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