【目的】为获得类乌齐牦牛环指蛋白216抗体(ring finger protein 216,RNF216)基因的CDS区序列,并研究RNF216基因在类乌齐牦牛不同组织中的表达情况。【方法】试验以0.5岁龄类乌齐牦牛为试验材料,采用RT-PCR方法克隆牦牛RNF216基因CDS序...【目的】为获得类乌齐牦牛环指蛋白216抗体(ring finger protein 216,RNF216)基因的CDS区序列,并研究RNF216基因在类乌齐牦牛不同组织中的表达情况。【方法】试验以0.5岁龄类乌齐牦牛为试验材料,采用RT-PCR方法克隆牦牛RNF216基因CDS序列并进行生物信息学分析,利用荧光定量PCR(qPCR)方法检测RNF216基因在臀脂、臀肌、肝脏、肺脏、心脏和脾脏等组织器官中的表达情况。【结果】RNF216基因CDS区全长2610 bp,开放阅读框序列长2223 bp,共编码740个氨基酸。RNF216基因编码蛋白为不稳定亲水酸性蛋白,无信号肽和跨膜结构,主要分布在细胞核中。理化性质分析显示,牦牛RNF216蛋白存在24个丝氨酸、8个苏氨酸和9个酪氨酸磷酸化位点。一致性比较和进化树分析显示,牦牛与黄牛的遗传距离最近,与鼠类的遗传距离最远,且在进化过程中保守性强。组织表达分析显示,RNF216基因在类乌齐牦牛肺脏中的表达水平最高,其次是脾脏,然后是臀脂,在臀肌中的表达水平最低。【结论】本研究为进一步了解RNF216基因在调控牦牛肌肉生长发育方面提供参考数据。展开更多
CSRP3基因(Cysteine and glycine-rich protein 3,CSRP3)编码CRP3蛋白,是一个肌发生的正调节因子,可通过多种方式在肌肉发育和肌肉细胞结构维持中起重要作用。通过对牦牛CSRP3基因进行克隆及组织表达谱分析,为后续提高牦牛肉品质的研究...CSRP3基因(Cysteine and glycine-rich protein 3,CSRP3)编码CRP3蛋白,是一个肌发生的正调节因子,可通过多种方式在肌肉发育和肌肉细胞结构维持中起重要作用。通过对牦牛CSRP3基因进行克隆及组织表达谱分析,为后续提高牦牛肉品质的研究提供基础数据。采用RT-PCR方法克隆牦牛CSRP3基因CDS区;再对其进行序列分析及蛋白结构和功能预测等生物信息学分析;最后利用实时荧光定量PCR技术检测该基因在牦牛不同组织中的表达量。牦牛CSRP3基因CDS区长585 bp,编码194个氨基酸;CSRP3基因的系统进化树结果显示,牦牛与黄牛的亲缘性最近,其次是绵羊。牦牛CSRP3基因编码的蛋白为偏碱性不稳定亲水蛋白,无跨膜结构和信号肽,为非分泌蛋白,含有磷酸化位点22个,N-糖基化位点2个,O-糖基化位点7个;存在两个LIM结构域,属于LIM结构域蛋白质超家族成员,主要分布于细胞核中;二级结构以无规卷曲为主,三级结构的最佳模型为1b8t.1.A;实时荧光定量PCR结果显示,牦牛CSRP3基因在臀大肌中有较高表达量。生物信息学分析结果显示,CRP3蛋白含有两个LIM结构域,主要分布在细胞核中,实时荧光定量PCR结果显示牦牛CSRP3基因在臀大肌中具有较高表达量,为牦牛CSRP3基因在牦牛肉品质方面的调控机制研究提供了基础数据。展开更多
Reference genes, stably expressing in different tissues and cells, are commonly used as the references in expression analysis. Selecting the optimum reference gene is crucial to the success of experiments. In this stu...Reference genes, stably expressing in different tissues and cells, are commonly used as the references in expression analysis. Selecting the optimum reference gene is crucial to the success of experiments. In this study, the expression stabilities of nine common reference genes, including ACT2, 18 S r RNA, APRT, EF-1α, RNA POL II, TUBα, TUBβ, GAPDH and TLF of Agropyron mongolicum, were studied under drought condition. Among them, 18 S r RNA was found to be the most optimum reference gene under drought stress by the analyzing of ge Norm and Norm Finder software. Quantitative expression levels of P5 CS using 18 S r RNA as the reference gene, and proline contents under drought stress in A. mongolicum were further operated, and we found the expression level of P5 CS gene and proline content had a significantly positive relationship（R^2=0.7763, P〈0.05）. This study established and validated 18 S r RNA as the reference genes in A. mongolicum under drought stress, providing a powerful tool for the quantitative expression analysis of drought genes in A. mongolicum.展开更多
目的初步评价1.5 T MR体素内不相干运动成像参数在宫颈癌中的应用价值。方法搜集经术后或活检病理证实的24例宫颈癌患者,另招募30名健康女性作为对照组,均行IVIM成像(b=0~1000 s/mm^2),并分析参数(f、D~*、D、ADC)。两组间分别进行独立...目的初步评价1.5 T MR体素内不相干运动成像参数在宫颈癌中的应用价值。方法搜集经术后或活检病理证实的24例宫颈癌患者,另招募30名健康女性作为对照组,均行IVIM成像(b=0~1000 s/mm^2),并分析参数(f、D~*、D、ADC)。两组间分别进行独立样本t检验,采用受试者工作特征曲线下面积评估上述参数值鉴别宫颈癌的能力。结果宫颈癌组的参数f、D~*、D、ADC平均值分别为(25.83±6.12)%,(16.83±4.02)×10^(-3) mm^2/s,(0.95±0.15)×10^(-3) mm^2/s,(1.05±0.17)×10^(-3)mm^2/s。正常健康女性宫颈纤维间质的上述参数平均值分别为(40.87±9.84)%,(17.64±4.80)×10^(-3) mm^2/s,(1.00±0.28)×10^(-3)mm^2/s,(1.56±0.45)×10^(-3)mm^2/s;外侧肌层分别为(36.00±5.99)%,(17.69±4.37)×10^(-3) mm^2/s,(1.24±0.20)×10^(-3)mm^2/s,(1.83±0.54)×10^(-3)mm^2/s。除D~*值外,f、D、ADC值在纤维间质和外侧肌层间差异均有统计学意义(P<0.05)。除D~*、D值外,f、ADC值鉴别宫颈癌和纤维间质差异有统计学意义(P<0.01),其ROC曲线下面积分别为:0.923、0.912;除D~*值外,f、D、ADC值鉴别宫颈癌和外侧肌层差异均有统计学意义(P<0.01),其ROC曲线下面积分别为:0.881、0.887、0.974。结论1.5 T MR体素内不相干运动成像参数在宫颈癌诊断中具有应用价值,并能有效区分正常宫颈纤维间质和外侧肌层。展开更多
文摘CSRP3基因(Cysteine and glycine-rich protein 3,CSRP3)编码CRP3蛋白,是一个肌发生的正调节因子,可通过多种方式在肌肉发育和肌肉细胞结构维持中起重要作用。通过对牦牛CSRP3基因进行克隆及组织表达谱分析,为后续提高牦牛肉品质的研究提供基础数据。采用RT-PCR方法克隆牦牛CSRP3基因CDS区;再对其进行序列分析及蛋白结构和功能预测等生物信息学分析;最后利用实时荧光定量PCR技术检测该基因在牦牛不同组织中的表达量。牦牛CSRP3基因CDS区长585 bp,编码194个氨基酸;CSRP3基因的系统进化树结果显示,牦牛与黄牛的亲缘性最近,其次是绵羊。牦牛CSRP3基因编码的蛋白为偏碱性不稳定亲水蛋白,无跨膜结构和信号肽,为非分泌蛋白,含有磷酸化位点22个,N-糖基化位点2个,O-糖基化位点7个;存在两个LIM结构域,属于LIM结构域蛋白质超家族成员,主要分布于细胞核中;二级结构以无规卷曲为主,三级结构的最佳模型为1b8t.1.A;实时荧光定量PCR结果显示,牦牛CSRP3基因在臀大肌中有较高表达量。生物信息学分析结果显示,CRP3蛋白含有两个LIM结构域,主要分布在细胞核中,实时荧光定量PCR结果显示牦牛CSRP3基因在臀大肌中具有较高表达量,为牦牛CSRP3基因在牦牛肉品质方面的调控机制研究提供了基础数据。
基金supported by the Western Light Project of Chinese Academy of Sciencesthe National Natural Science Foundation of China(31060057)the National Natural Science Foundation of Inner Mongolia,China(2015MS0305)
文摘Reference genes, stably expressing in different tissues and cells, are commonly used as the references in expression analysis. Selecting the optimum reference gene is crucial to the success of experiments. In this study, the expression stabilities of nine common reference genes, including ACT2, 18 S r RNA, APRT, EF-1α, RNA POL II, TUBα, TUBβ, GAPDH and TLF of Agropyron mongolicum, were studied under drought condition. Among them, 18 S r RNA was found to be the most optimum reference gene under drought stress by the analyzing of ge Norm and Norm Finder software. Quantitative expression levels of P5 CS using 18 S r RNA as the reference gene, and proline contents under drought stress in A. mongolicum were further operated, and we found the expression level of P5 CS gene and proline content had a significantly positive relationship（R^2=0.7763, P〈0.05）. This study established and validated 18 S r RNA as the reference genes in A. mongolicum under drought stress, providing a powerful tool for the quantitative expression analysis of drought genes in A. mongolicum.
文摘目的初步评价1.5 T MR体素内不相干运动成像参数在宫颈癌中的应用价值。方法搜集经术后或活检病理证实的24例宫颈癌患者,另招募30名健康女性作为对照组,均行IVIM成像(b=0~1000 s/mm^2),并分析参数(f、D~*、D、ADC)。两组间分别进行独立样本t检验,采用受试者工作特征曲线下面积评估上述参数值鉴别宫颈癌的能力。结果宫颈癌组的参数f、D~*、D、ADC平均值分别为(25.83±6.12)%,(16.83±4.02)×10^(-3) mm^2/s,(0.95±0.15)×10^(-3) mm^2/s,(1.05±0.17)×10^(-3)mm^2/s。正常健康女性宫颈纤维间质的上述参数平均值分别为(40.87±9.84)%,(17.64±4.80)×10^(-3) mm^2/s,(1.00±0.28)×10^(-3)mm^2/s,(1.56±0.45)×10^(-3)mm^2/s;外侧肌层分别为(36.00±5.99)%,(17.69±4.37)×10^(-3) mm^2/s,(1.24±0.20)×10^(-3)mm^2/s,(1.83±0.54)×10^(-3)mm^2/s。除D~*值外,f、D、ADC值在纤维间质和外侧肌层间差异均有统计学意义(P<0.05)。除D~*、D值外,f、ADC值鉴别宫颈癌和纤维间质差异有统计学意义(P<0.01),其ROC曲线下面积分别为:0.923、0.912;除D~*值外,f、D、ADC值鉴别宫颈癌和外侧肌层差异均有统计学意义(P<0.01),其ROC曲线下面积分别为:0.881、0.887、0.974。结论1.5 T MR体素内不相干运动成像参数在宫颈癌诊断中具有应用价值,并能有效区分正常宫颈纤维间质和外侧肌层。
