期刊文献+
共找到2篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
基于GEO数据集筛选结肠癌相关枢纽基因及验证
1
作者 景磊 胡晨曦 +3 位作者 张思瑾 肖添源 肖晓雪 宋巍 《河南城建学院学报》 CAS 2023年第2期125-132,共8页
从GEO芯片数据集中挖掘与正常结肠组织具有表达差异且与肿瘤病理特征相关的结肠癌关键基因。在GEO数据库中获取并处理GSE41258和GSE39582芯片数据集,筛选差异表达基因,利用DAVID、STRING等数据分析工具对差异表达基因进行KEGG分析、GO... 从GEO芯片数据集中挖掘与正常结肠组织具有表达差异且与肿瘤病理特征相关的结肠癌关键基因。在GEO数据库中获取并处理GSE41258和GSE39582芯片数据集,筛选差异表达基因,利用DAVID、STRING等数据分析工具对差异表达基因进行KEGG分析、GO分析以及蛋白质相互作用(PPI)网络构建。利用Cytoscape 3.9.1软件与UALCAN数据库筛选枢纽(Hub)基因,并分析其与结肠癌临床病理的相关性。从两个GEO数据集中共筛选出108个差异表达基因,其中上调基因36个、下调基因72个。KEGG分析和GO分析显示差异表达基因主要富集于类固醇激素生物合成、视黄醇代谢、胆汁分泌、IL-17信号通路、PPAR信号通路并参与细胞葡萄糖醛酸化、类固醇代谢、胶原分解代谢、视黄醇代谢等生物过程。最终筛选出排名前五的Hub基因,分别是SPP1、COL1A1、CXCL8、MMP1和FABP1,其中SPP1和COL1A1表达与结肠癌肿瘤分期呈正相关,FABP1、MMP1和CXCL8在结肠癌早期就表现出显著差异性。通过生物信息学分析发现,在5个结肠癌关键基因中,SPP1和COL1A1与结肠癌进展相关,FABP1、MMP1和CXCL8可成为潜在的结肠癌早期生物标志物。 展开更多
关键词 结肠癌 GEO数据库 差异表达基因 生物信息学分析
下载PDF
Cooperated Bayesian algorithm for distributed scheduling problem
2
作者 QIANG Lei xiao tian-yuan 《Frontiers of Electrical and Electronic Engineering in China》 CSCD 2006年第3期251-254,共4页
This paper presents a new distributed Bayesian optimization algorithm(BOA)to overcome the efficiency problem when solving NP scheduling problems.The pro-posed approach integrates BOA into the co-evolutionary schema,wh... This paper presents a new distributed Bayesian optimization algorithm(BOA)to overcome the efficiency problem when solving NP scheduling problems.The pro-posed approach integrates BOA into the co-evolutionary schema,which builds up a concurrent computing environ-ment.A new search strategy is also introduced for local op-timization process.It integrates the reinforcement learning(RL)mechanism into the BOA search processes,and then uses the mixed probability information from BOA(post-probability)and RL(pre-probability)to enhance the cooperation between different local controllers,which im-proves the optimization ability of the algorithm.The ex-periment shows that the new algorithm does better in both optimization(2.2%)and convergence(11.7%),compared with classic BOA. 展开更多
关键词 statistic optimization distributed scheduling Bayesian networks data mining
原文传递
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部