目的采用网络药理学方法探究中药赤芍的主要活性成分及其治疗IgA肾病(IgA Nephropathy,IgAN)的作用机制。方法以口服生物利用度(Oralbioavailability,OB)≥30%和类药性(Drug like,DL)≥0.18为标准,从中药系统药理学数据库分析平台(Tradi...目的采用网络药理学方法探究中药赤芍的主要活性成分及其治疗IgA肾病(IgA Nephropathy,IgAN)的作用机制。方法以口服生物利用度(Oralbioavailability,OB)≥30%和类药性(Drug like,DL)≥0.18为标准,从中药系统药理学数据库分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)中筛选出赤芍的活性成分、作用靶点,采用Cytoscape 3.7.2软件构建活性成分-作用靶点网络图。在GeneCards、DrugBank、DisGeNET、GAD等数据库中寻找与IgAN有关的所有靶点,将赤芍作用靶点与IgAN相关靶点取交集,筛选出赤芍治疗IgAN的活性成分及作用靶点。借助Cytoscape3.7.2软件,构建赤芍治疗IgAN的活性成分-作用靶点网络,选出关键化合物。通过STRING数据库构建靶蛋白质-蛋白质相互作用(Protein-Protein Interaction,PPI)网络,并选出核心靶点。在基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库,下载基因矩阵与平台数据文件,运用Perl脚本和R语言分析验证关键靶点可行性。使用DAVID数据库分析平台,对靶点基因进行GO富集分析和KEGG信号通路富集分析。结果从赤芍中筛选获得13个有效活性成分,80个作用靶点,与IgAN有关的有效活性成分11个,核心靶点35个。利用GEO数据库中GSE93798芯片与平台数据,分析验证前10个关键靶点,其中FOS、JUN为赤芍治疗IgAN的显著性差异基因。KEGG信号通路主要涉及乙型肝炎(Hepatitis B)通路、IL-17信号通路、TNF信号通路等,这些通路可能是赤芍防治IgAN的作用途径。结论初步研究了赤芍治疗IgAN的药效物质基础及其可能的作用机制,赤芍可以通过多个靶点、多条通路来发挥治疗IgAN。展开更多
文摘目的探究糖尿病肾病(diabetic kidney disease,DKD)血瘀证大鼠肾损害与肾脏铁死亡的潜在机制。方法将50只SPF级雄性SD大鼠分为对照组、DKD组、DKD血瘀证组。采用腹腔注射链脲佐菌素的方法复制DKD大鼠模型,采用尾静脉注射右旋糖酐的方法复制DKD血瘀证模型。实验过程中观察大鼠血瘀证表现及检测24 h尿蛋白、血清肌酐、血尿素氮、血液流变学指标,采用苏木精-伊红染色、Masson染色、PAS染色观察肾脏的组织形态,采用透射电子显微镜观察铁死亡典型细胞的线粒体变化;采用免疫组织化学法、Western blot法检测肾组织铁死亡相关蛋白[长链酯酰辅酶A合成酶4(Acyl-CoA synthetase long chain family member 4,ACSL4)、谷胱甘肽过氧化物酶4(glutathione peroxidase 4,GPX4)]及肾脏纤维化指标[纤维连接蛋白(fibronectin,FN)、Ⅳ型胶原蛋白(typeⅣcollagen,Col-Ⅳ)]的表达水平。结果与对照组比较,DKD组大鼠肾脏病理变化加重,线粒体损伤明显,24 h尿蛋白含量,血清肌酐、血尿素氮水平及全血黏度、血浆黏度明显升高(P<0.05),肾脏ACSL4、FN和Col-Ⅳ及其mRNA表达水平明显升高(P<0.05),GPX4蛋白及其mRNA表达水平明显降低(P<0.05)。DKD血瘀证大鼠出现唇色黯淡、眼球黯红、耳廓紫红、舌下脉络紫黯等血瘀证表现,24 h尿蛋白和血清肌酐、血尿素氮水平明显高于DKD组,光学显微镜下可见肾脏出现明显的系膜基质增生、肾小球萎缩、肾间质胶原沉积和纤维化,电子显微镜下可见肾组织细胞线粒体损伤明显,嵴基本断裂,ACSL4、FN、Col-Ⅳ及其mRNA表达水平较DKD组明显上升(P<0.05),GPX4蛋白及其mRNA表达水平较DKD组明显下降(P<0.05)。结论DKD血瘀证大鼠肾脏损害更加严重,其机制可能与GPX4、ACSL4介导的铁死亡有关。
文摘目的采用网络药理学方法探究中药赤芍的主要活性成分及其治疗IgA肾病(IgA Nephropathy,IgAN)的作用机制。方法以口服生物利用度(Oralbioavailability,OB)≥30%和类药性(Drug like,DL)≥0.18为标准,从中药系统药理学数据库分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)中筛选出赤芍的活性成分、作用靶点,采用Cytoscape 3.7.2软件构建活性成分-作用靶点网络图。在GeneCards、DrugBank、DisGeNET、GAD等数据库中寻找与IgAN有关的所有靶点,将赤芍作用靶点与IgAN相关靶点取交集,筛选出赤芍治疗IgAN的活性成分及作用靶点。借助Cytoscape3.7.2软件,构建赤芍治疗IgAN的活性成分-作用靶点网络,选出关键化合物。通过STRING数据库构建靶蛋白质-蛋白质相互作用(Protein-Protein Interaction,PPI)网络,并选出核心靶点。在基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库,下载基因矩阵与平台数据文件,运用Perl脚本和R语言分析验证关键靶点可行性。使用DAVID数据库分析平台,对靶点基因进行GO富集分析和KEGG信号通路富集分析。结果从赤芍中筛选获得13个有效活性成分,80个作用靶点,与IgAN有关的有效活性成分11个,核心靶点35个。利用GEO数据库中GSE93798芯片与平台数据,分析验证前10个关键靶点,其中FOS、JUN为赤芍治疗IgAN的显著性差异基因。KEGG信号通路主要涉及乙型肝炎(Hepatitis B)通路、IL-17信号通路、TNF信号通路等,这些通路可能是赤芍防治IgAN的作用途径。结论初步研究了赤芍治疗IgAN的药效物质基础及其可能的作用机制,赤芍可以通过多个靶点、多条通路来发挥治疗IgAN。