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汉江水体和沉积物中噬菌体特征研究 被引量:1
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作者 孙立宇 尚韵依 +2 位作者 李治龙 薛泽环 刘唐 《北京大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第1期125-132,共8页
基于2014年3月和10月汉江中下游6个断面的水体和沉积物监测样品,获得384个高质量vOTUs(viral Operational Taxonomic Units)。研究表明,vOTUs中95%以上隶属Caudovirales(有尾噬菌体目),丰度居前3位的科分别为Myoviridae(肌尾噬菌体科)、... 基于2014年3月和10月汉江中下游6个断面的水体和沉积物监测样品,获得384个高质量vOTUs(viral Operational Taxonomic Units)。研究表明,vOTUs中95%以上隶属Caudovirales(有尾噬菌体目),丰度居前3位的科分别为Myoviridae(肌尾噬菌体科)、Siphoviridae(长尾噬菌体科)和Podoviridae(短尾噬菌体科)。主坐标分析和相似性分析结果表明,沉积物中病毒群落结构相对稳定,而水体中群落易随季节发生变化,同流域的水体和沉积物中群落可能具有连通性。宿主来自2域(界)19门,丰度最高的宿主是Proteobacteria门(变形菌门)。88%的vOTUs具有单一的门水平的宿主,有3个vOTUs跨越5个门。跨域(界)感染的vOTUs在感染古菌界Thermoproteota门的同时,最常见的是感染细菌界的Bacteroidota门(拟杆菌门)。与水体相比,沉积物中宿主的群落组成更加多样。Pearson相关分析表明,噬菌体与其宿主的组成在门水平上一致。 展开更多
关键词 汉江 噬菌体 宿主 水体 沉积物
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汉江潜在致病菌群落物种组成及其分布特征
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作者 李治龙 孙立宇 +3 位作者 尚韵依 赵妮 薛泽环 刘唐 《北京大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第2期301-308,共8页
为探究水体和沉积物潜在致病性细菌群落的物种组成及其分布特征,为汉江致病菌防控提供基础数据,于2014年春、秋两季,在汉江6个监测断面进行样品采集。基于16S rRNA Illumina Miseq高通量测序技术,利用FAPROTAX软件,对细菌群落进行致病... 为探究水体和沉积物潜在致病性细菌群落的物种组成及其分布特征,为汉江致病菌防控提供基础数据,于2014年春、秋两季,在汉江6个监测断面进行样品采集。基于16S rRNA Illumina Miseq高通量测序技术,利用FAPROTAX软件,对细菌群落进行致病性功能预测,共识别出6类致病菌,隶属6门9纲22目45科105属。研究结果显示,变形菌门是汉江致病菌群落的主要组成物种,占比高达96.56%,Methylopu-milus和Roseomonas是属水平的优势物种。多样性分析结果表明沉积物中致病菌比水体中更丰富,浮游群落随季节的变化更显著。环境因子相关性分析结果指示底栖群落对环境因子变化更敏感。零模型分析结果揭示随机过程主导水体和沉积物致病菌群落的构建。 展开更多
关键词 汉江 致病性细菌 群落组成 分布特征 构建机制
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汉江浮游细菌稀有群落的分布与构建机制
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作者 方尧 王冰雪 +2 位作者 薛泽环 李治龙 刘唐 《北京大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第2期309-316,共8页
基于Illumina高通量测序,调查汉江浮游细菌整体及稀有、丰富物种的组成、分布与构建机制,得到细菌22门55纲93目132科164属,Proteobacteria,Actinobacteria和Bacteroidetes等为优势菌门。将4035个ASV(80.2%)定义为稀有物种。汉江浮游细... 基于Illumina高通量测序,调查汉江浮游细菌整体及稀有、丰富物种的组成、分布与构建机制,得到细菌22门55纲93目132科164属,Proteobacteria,Actinobacteria和Bacteroidetes等为优势菌门。将4035个ASV(80.2%)定义为稀有物种。汉江浮游细菌群落α多样性季节差异显著,而稀有物种受季节的影响更显著。非度量多维尺度分析结果显示,汉江浮游细菌群落季节分布与沿程分布差异不显著。Mantel分析结果表明,溶解氧和氨氮为秋季群落的主要影响因素。方差分解分析结果表明,环境因子对群落的影响大于空间因子。确定性过程为群落总体的主导构建机制,而稀有及丰富物种主要受随机过程影响。与丰富物种相比,稀有物种受环境选择过程的影响更大。 展开更多
关键词 汉江 浮游细菌 稀有物种 构建机制
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Impacts of spatially inconsistent permafrost degradation on streamflow in the Lena River Basin
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作者 xue zehuan WANG YiChu +2 位作者 ZHAO Yi LI DongDeng BORTHWICK Alistair George Liam 《Science China(Technological Sciences)》 SCIE EI CAS CSCD 2024年第11期3559-3570,共12页
Although permafrost degradation contributes significantly to hydrological change in cold regions, gaps remain in our understanding of streamflow variation induced by degrading permafrost in different river basins. We ... Although permafrost degradation contributes significantly to hydrological change in cold regions, gaps remain in our understanding of streamflow variation induced by degrading permafrost in different river basins. We therefore used a deep learning model to simulate the long-term(≥ 30 years) monthly streamflow at 60 hydrological stations along the Lena River, the third longest circum-Arctic river. Analyzing the effects of precipitation, temperature, and thaw depth on streamflow variation throughout the Lena River Basin, we identified two feedback patterns relating streamflow to warming permafrost, observed in areas of continuous and discontinuous permafrost. In northern plain regions with continuous permafrost, 94% of stations presented an increasing trend in annual streamflow from the 1900s to the 2010s due to permafrost degradation. The enhanced streamflow was mainly due to increased meltwater in the flood season. In southern regions covered by both continuous and discontinuous permafrost, approximately 38% of stations exhibited a declining trend in annual streamflow in response to permafrost degradation, with a high proportion(61%) located in mountain regions(elevation ≥ 500 m). The decline is attributed to the enhanced infiltration capacity of thawing frozen layers within discontinuous permafrost regions. Our study provides new insights into the mechanisms behind permafrost degradation-induced streamflow variation and highlights the importance of formulating tailored strategies for sustainable river management in cold regions experiencing climate change. 展开更多
关键词 permafrost degradation streamflow variation deep learning model climate change large cold basin
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