目的:采用网络药理学的方法分析预测出地榆皂苷Ⅱ(ZiyuglycosideⅡ)治疗鼻咽癌(NPC)的相关作用靶点及通路,并通过实验进行验证。方法:通过Pubchem、Swiss Target Prediction、GeneCards等数据库查询获得地榆皂苷Ⅱ治疗鼻咽癌的相关作用...目的:采用网络药理学的方法分析预测出地榆皂苷Ⅱ(ZiyuglycosideⅡ)治疗鼻咽癌(NPC)的相关作用靶点及通路,并通过实验进行验证。方法:通过Pubchem、Swiss Target Prediction、GeneCards等数据库查询获得地榆皂苷Ⅱ治疗鼻咽癌的相关作用靶点,并运用David数据库对靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,最后构建出"药物—靶点—疾病—通路"关系网络模型图。通过CCK-8细胞毒性实验探究地榆皂苷Ⅱ对鼻咽癌5-8F细胞增殖的影响。通过蛋白质印迹法(Western blotting)对预测出的靶点及其涉及到的信号通路进行验证。结果:网络药理学结果预测显示,地榆皂苷Ⅱ治疗鼻咽癌的潜在靶点有38个,GO功能注释和KEGG通路富集显示其机制可能与调控癌症信号通路(pathway in cancer)、磷脂酰肌醇-3激酶(PI3K)/蛋白激酶B(AKT)信号通路、癌症蛋白聚糖通路(proteoglycans in cancer)、叉头转录因子O亚族(FOXO)信号通路等有关。实验结果显示,地榆皂苷Ⅱ对鼻咽癌5-8F细胞的增殖有明显的抑制作用,地榆皂苷Ⅱ可明显下调AKT蛋白和PI3K蛋白水平(P<0.05)。结论:地榆皂苷Ⅱ可有效抑制鼻咽癌5-8F细胞的增殖,其抗鼻咽癌机制可能与抑制PI3K/AKT信号通路活性有关。展开更多
文摘目的:采用网络药理学的方法分析预测出地榆皂苷Ⅱ(ZiyuglycosideⅡ)治疗鼻咽癌(NPC)的相关作用靶点及通路,并通过实验进行验证。方法:通过Pubchem、Swiss Target Prediction、GeneCards等数据库查询获得地榆皂苷Ⅱ治疗鼻咽癌的相关作用靶点,并运用David数据库对靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,最后构建出"药物—靶点—疾病—通路"关系网络模型图。通过CCK-8细胞毒性实验探究地榆皂苷Ⅱ对鼻咽癌5-8F细胞增殖的影响。通过蛋白质印迹法(Western blotting)对预测出的靶点及其涉及到的信号通路进行验证。结果:网络药理学结果预测显示,地榆皂苷Ⅱ治疗鼻咽癌的潜在靶点有38个,GO功能注释和KEGG通路富集显示其机制可能与调控癌症信号通路(pathway in cancer)、磷脂酰肌醇-3激酶(PI3K)/蛋白激酶B(AKT)信号通路、癌症蛋白聚糖通路(proteoglycans in cancer)、叉头转录因子O亚族(FOXO)信号通路等有关。实验结果显示,地榆皂苷Ⅱ对鼻咽癌5-8F细胞的增殖有明显的抑制作用,地榆皂苷Ⅱ可明显下调AKT蛋白和PI3K蛋白水平(P<0.05)。结论:地榆皂苷Ⅱ可有效抑制鼻咽癌5-8F细胞的增殖,其抗鼻咽癌机制可能与抑制PI3K/AKT信号通路活性有关。
文摘目的:运用网络药理学的方法预测甘草查尔酮A(LCA)抗鼻咽癌的潜在作用靶点及作用机制。方法:通过PubChem平台获得LCA的3D结构,并用Swiss Target Prediction数据库筛选出LCA靶点以及Uniprot数据库进行靶点蛋白和基因信息校正,得到相应的基因名称数据库。通过人类基因组注释数据库(genecards)搜集与鼻咽癌相关的靶基因,与LCA所对应的靶点作交集,获得共同的潜在靶点。运用STRING数据库构建蛋白质间的相互作用,并进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)功能富集分析,以鉴定分子生物学过程和信号通路。最后,构建“药物-靶点-疾病-通路”网络模型。结果:筛选出鼻咽癌与LCA的共同作用靶点共41个。GO功能富集分析显示生物学过程和功能主要集中在蛋白质磷酸化、凋亡过程的负反馈调节、细胞质以及蛋白质黏合等方面。KEGG功能富集表明富集较多的通路主要有癌症相关信号通路、酒精通路、MAPK信号通路以及癌症微小核糖核酸表达等。“药物-靶点-疾病-通路”网络图显示关键基因主要有MAPK14、MAPK10、MAPK1、RAF1等。结论:运用网络药理学方法,预测了LCA治疗鼻咽癌的潜在药物靶点,并初步阐明了其潜在药理机制,为后续研究提供一定的理论依据。