应用SNP精准鉴定大豆种质及构建可扫描身份证

为加强大豆种质资源管理及品种保护,本研究构建了一套基于单核苷酸多态性(SNP)标记的快速鉴定体系。选用分布于13个基因的23个SNP标记对599份大豆表型精准鉴定种质进行基因型分析。结果表明,SNP标记的遗传多样性指数范围0~0.722,其中3个SNP在供试材料中不存在碱基差异,2个SNP为特异等位变异。从具有多态性的20个SNP中选出14个(Gly SNP14)用于种质鉴定,其中12个为高多态性SNP,2个为特异性SNP。模拟结果表明,Gly SNP14的种质鉴别能力(750份种质)高于任意相同数目标记构成的SNP随机组合(最多361份种质)。Gly SNP14在599份种质中共形成了176个单倍型,其中100份种质具有独特的单倍型。结合这些种质的其他属性,构建了100份种质由38个数字组成的身份证,前10位数字为种质属性信息码,包括品种类别、来源地等;11~38位数字为品种分子指纹码,代表品种的特异分子信息,并最终以一维码和二维码的形式表示,为种质资源简易管理与保护利用提供了有效途径。