BUB1基因在胃癌组织中高表达:基于Oncomine数据库及生物信息学方法

目的探讨细胞周期有丝分裂纺锤体检测点丝/苏氨酸激酶(BUB1)基因在胃癌(STAD)中的表达及临床价值。方法分别运用Oncomine、GEPIA、BioGPS和Kaplan-Meier Plotter等数据库分析BUB1基因在胃癌组织和正常胃组织的表达差异,并且分析BUB1表达水平与胃癌患者生存预后之间的关系;利用癌症细胞系全科百科全书(CCLE)分析BUB1分别在胃癌组织T细胞和B细胞中的表达,利用String数据库绘制BUB1相关蛋白网络图及基因本体(GO)功能注释,并对京都基因和基因组百科全书(KEGG)相关通路进行分析。采用肿瘤免疫评估资源(TIMER)数据库分析BUB1在免疫浸润物中的表达及对胃癌患者生存预后的影响。为进一步验证Oncomine数据库基因芯片的结果,我们选择成都医学院第一附属医院2018年3月~2019年7月收治的胃癌患者30例,经外科手术获得胃腺癌组织30份,同时获取的癌旁正常组织30份作为对照组,通过PCR和免疫组化技术对Oncomine数据库中BUB1基因表达的数据进行验证。结果Oncomine、GEPIA、BioGPS分析显示:与正常胃组织相比,BUB1在胃癌组织中呈现高表达(P<0.05)。通过Kaplan-Meier生存分析发现,BUB1基因高表达的胃癌患者无进展生存期(HR=0.52,95%CI=0.41~0.67,P<0.05)、总生存期(HR=0.67,95%CI=0.55~0.82,P<0.05)均有所延长。通过string数据收集到与BUB1相关蛋白主要富集于13类细胞学组分、4类分子功能和12类生物学过程,并参与了4条信号通路。TIMER数据库分析显示在免疫微环境中高表达BUB1 mRNA的CD4+T细胞和巨噬细胞对胃癌患者5年生存预后较好。实时定量PCR结果提示胃癌组织样本BUB1的表达水平(4.345±0.421)明显高于配对的癌旁正常胃粘膜组织(1.583±0.122)(t=34.63,P<0.05);免疫组化结果提示胃癌组织BUB1染色成阳性。结论胃癌组织中BUB1基因呈现高表达,BUB1可能具有减少肿瘤免疫抑制作用可协助评估胃癌患者的预后情况。

不同地理大鲵子三代养殖群体肌肉营养成分比较

试验旨在对比评价重庆大宁河水系和陕西汉江水系的养殖子三代大鲵群体肌肉营养价值。采用常规生化分析方法对重庆大宁河种群(C组)和陕西汉水种群(S组)的养殖子三代大鲵肌肉营养成分进行测定分析,并进行品质评价。结果表明,C组大鲵肌肉中水分和粗脂肪含量均显著低于S组(P<0.05),粗灰分和粗蛋白质含量差异不显著(P>0.05)。两个种群大鲵肌肉中均检测到18种氨基酸,其中谷氨酸含量最高;第一限制氨基酸均为色氨酸,而必需氨基酸的构成比例符合联合国粮农组织/世界卫生组织的标准。C组大鲵的必需氨基酸指数为97.29%,高于S组(85.82%)。C组大鲵肌肉中氨基酸总量(TAA)和总必需氨基酸(TEAA)均显著高于S组(P<0.05),而鲜味氨基酸没有显著差异(P>0.05)。S组大鲵肌肉中检测出15种脂肪酸,比C组多了珠光脂酸(C17∶0)和顺-11-二十碳一烯酸(C20∶1) 2种脂肪酸;S组大鲵肌肉的单不饱和脂肪酸、多不饱和脂肪酸、二十碳五烯酸+二十二碳六烯酸均显著高于C组(P<0.05)。两个种群大鲵肌肉中8种矿物质含量均为常量元素K含量最高、微量元素Zn含量最高。研究表明,两个地理种群子三代大鲵营养价值较高,肉质鲜美,C组大鲵肌肉的蛋白质和微量矿物元素品质优于S组,S组大鲵肌肉的脂肪酸和常量矿物元素品质优于C组。

翼状胬肉相关致病因子的研究进展

翼状胬肉(ptergium)是在多种因素和因子的共同作用下形成的眼表疾病,主要的发病机制与紫外线照射及辐射后所引起的一系列改变有关,具体过程至今仍不明确。血管内皮生长因子(VEGF)升高、炎症反应加重、新生血管的产生、氧化应激反应、上皮-间质细胞转化(EMT)、抑癌基因失活等是目前公认的翼状胬肉发病的原因,但各个因素及因子的具体作用过程仍有待研究。探究其具体相关因素及其在翼状胬肉发病过程中的作用,有助于为临床诊治提供靶向治疗方案及有效预防措施。

茅苍术根腐病主要病原菌的分离鉴定及室内药剂筛选

目的:确定引起茅苍术根腐病的主要病原菌种类,筛选有效的防治药剂。方法:采用常规的组织分离法进行病原菌的分离与纯化,对分离所得病原菌进行致病性测定、形态学和分子生物学鉴定,同时测定了10种常用药剂对病原菌的抑制效果。结果:10份病株共分离到52个真菌分离物,镰刀菌属真菌占84.62%。其中,菌株6-1a和菌株7-1b致病性最强,形态学和分子生物学鉴定表明,这两个菌株分别为腐皮镰刀菌Fusarium solani和尖孢镰刀菌Fusarium oxysporum。室内药剂试验结果显示,有效浓度为1.44 mg/mL的霜脲·锰锌和0.45 mg/mL的咪鲜胺对2种病原菌的菌丝生长抑制率均为100%。结论:腐皮镰刀菌Fusarium solani和尖孢镰刀菌Fusarium oxysporum是引起重庆地区茅苍术根腐病的主要病原菌,72%霜脲·锰锌可湿性粉剂和450 g/L咪鲜胺乳油对2种病原菌的室内抑制效果显著,可作为田间防治的备选药剂。

医学骨科专业课程中挖掘思政教学要素方略

高校各类专业课程与课程思政建设同向而行、协调统一,落实立德树人根本任务。分析医学骨科专业课程中存在思政不足的原因,针对骨科专业存在的具体问题提出建设思政教学的思路,实例介绍思政教学要素结合骨科医学专业课程教学方法。探讨骨科专业课程思政教学中挖掘医学方面的思政要素方略,提升骨科专业课程思政教学能力。

CT引导下经引导鞘肺活检术对肺外周结节的诊断价值

目的评价CT引导下经引导鞘肺活检术对外周型肺孤立性小结节(SPN)的诊断价值。方法回顾性分析2017年1月1日至2019年3月2日于成都医学院第一附属医院呼吸与危重症医学科用不同方法的经支气管肺组织活检的104例外周型SPN(直径≤3cm)患者的临床资料,根据活检方法的不同分为CT引导下经引导鞘肺活检(CT-guides transbronchial lung biopsy with guide-sheath,CT-GS-TBLB)组、支气管超声引导下引导鞘肺活检(endobronchial ultrasound transbronchial lung biopsy with guide-sheath,EBUS-GS-TBLB)组,比较两种肺活检方法的标本大小、诊断率、操作时间及并发症,最后诊断结果通过外科手术切除病灶行病理检查或者随访2年至临床治愈确诊。结果 CT-GS-TBLB组、EBUS-GS-TBLB组的病灶平均直径分别为(21±8.0)和(22±8.0)mm,病灶大小比较,差异无统计学意义(t=0.460,P=0.642)。CT-GS-TBLB组及EBUS-GS-TBLB组标本大小分别为(2.8±1.2)和(2.9±1.3)mm2(t=0.560,P=0.45);CT-GS-TBLB组和EBUS-GS-TBLB组的诊断率分别为86.5%(45/52)和65.4%(34/52),CT-GS-TBLB组诊断率高于EBUS-GS-TBLB组(c2=6.372,P=0.012)。CT-GS-TBLB组与EBUS-GS-TBLB组的操作时间分别为(34.5±14.1)和(36.3±12.5)min,两组差异无统计学意义(t=7.58,P=0.524);并发症方面,两组均未发生严重大出血,轻到中度出血的病例CT-GSTBLB组为13.4%(7/52),EBUS-GS-TBLB组为17.3%(9/52),差异无统计学意义(c2=0.295,P=0.587);气胸的病例CT-GS-TBLB组为9.61%(5/52),EBUS-GS-TBLB组为11.3%(6/52),差异无统计学意义(c2=0.102,P=0.749)。结论 CT引导下经引导鞘肺活检与支气管超声引导下引导鞘肺活检相比,操作时间、并发症发生概率及获得标本大小无明显差异,但在提高外周型SPN的诊断率方面具有优势,成本较低,安全性良好。

达格列净联合二甲双胍治疗肥胖2型糖尿病合并OSAS疗效及安全性的Meta分析

目的系统评价达格列净联合二甲双胍治疗肥胖2型糖尿病合并阻塞性睡眠呼吸暂停综合征(OSAS)疗效及安全性。方法计算机检索PubMed、Cochrane Library、EMbase、Web of science、万方数据库、维普数据库、中国学术期刊全文数据库(CNKI),检索时限为2012年1月1日—2019年11月8日,搜索所有关于达格列净联合二甲双胍治疗肥胖2型糖尿病合并阻塞性睡眠呼吸暂停综合征的文献。由2位研究者按照纳入和排除标准对文献进行筛选,并加以资料提取及方法学质量评价,采用Revman5.2软件进行Meta分析。结果共纳入11篇随机对照试验文献,包括533例2型糖尿病合并OSAS患者。Meta分析结果显示,试验组BMI低于对照组(SMD=-1.49,95%CI-2.05^-0.93,P<0.01),试验组稳态模型评估胰岛素抵抗指数(HOMA-IR)也低于对照组(SMD=-2.42,95%CI-3.15^-1.68,P<0.01);试验组呼吸暂停低通气指数(AHI)和嗜睡量表评分(ESS)均低于对照组(SMD=-3.28,95%CI-4.58^-1.99,P<0.01;SMD=-1.02,95%CI-1.44^-0.59,P<0.01),试验组睡眠最低血氧饱和度高于对照组(SMD=0.75,95%CI 0.28~1.21,P=0.002);2组不良反应发生率比较差异无统计学意义(OR=1.17,95%CI 0.60~2.28,P=0.660)。结论达格列净联合二甲双胍能有效降低肥胖2型糖尿病合并阻塞性睡眠呼吸暂停综合征的BMI、HOMA-IR,改善睡眠质量,不良反应少。

日本医蛭生境水质及生物学特性初探

目的:研究日本医蛭的野外生境水域和生物学习性。方法:采用野外调查与室内养殖观察相结合的方法。结果:日本医蛭野外生存水域水质恶劣,达不到水产养殖常用Ⅲ类水标准,其主要污染源为氮(N)、磷(P)、化学需氧量(COD);休眠结束期在野外捕获的日本医蛭体重较轻,平均体重为0.114 g,体重范围多分布在0.05~0.15 g之间;其性成熟率随体重增加而增加,体重大于0.25 g时性成熟率为100%。日本医蛭生活史包括了休眠、产茧、孵化、生长等阶段,由于养殖地不同,各阶段在时间上存在较大差异。温度对日本医蛭的行为影响较大,16℃以下逐渐进入休眠,最佳的生长温度为28~32℃。结论:日本医蛭野外生境水质污染严重;其体重较轻;温度是影响日本医蛭生理状态的主要因素。

发挥河长制优势 做好小流域水电站防汛度汛

详细分析龙潭电站泄洪闸因故不能提起从而造成大坝翻水事故的教训,提出可通过发挥河长制优势,采取相对应的措施,做好小流域水电站的防汛度汛。图2幅。

60种中草药对舒伯特气单胞菌的体外抑菌作用

【目的】选取60种中草药,研究其对杂交鳢源舒伯特气单胞菌的体外抑菌作用,为防治杂交鳢源舒伯特气单胞菌诱发的疾病提供科学依据。【方法】通过水提法获得60种中草药提取液,采用琼脂扩散法对杂交鳢源舒伯特气单胞菌进行体外抑菌试验,采用二倍稀释法测定筛选出的抑菌作用较好的中草药水提物对杂交鳢源舒伯特气单胞菌的最小抑菌浓度(MIC)和最小杀菌浓度(MBC)。【结果】五倍子、大黄、黄柏、黄连、地榆、丁香、木瓜、诃子、五味子、儿茶、乌梅对舒伯特气单胞菌极度敏感,有较好的抑菌效果,其中乌梅的体外抑菌效果最佳,抑菌圈直径为(28.62±0.66)mm。【结论】抑菌杀菌效果最好的是五倍子,其最小抑菌质量浓度和最小杀菌质量浓度均为1.95 mg/mL,其次是诃子、乌梅、地榆、黄连、儿茶和丁香,再次是木瓜和五味子;大黄和黄柏较差。

干眼的免疫机制研究进展

干眼是一种由多因素所致,发病机制众多的常见眼表疾病。随着我国干眼发病率逐年升高,干眼逐渐引起人们的重视。干眼的发病机制较为复杂,其中炎症、角结膜上皮细胞改变、泪膜成分改变、角膜神经改变、睑板腺功能异常改变等均为重要因素。泪膜高渗导致眼表上皮细胞高渗,刺激炎症发生级联反应,眼表炎症反应为干眼发病机制中最为关键的环节。该过程中有多种炎症介质和免疫细胞参与,越来越多的人认为干眼是一种抗原特异性自身免疫性炎症疾病且二者存在联系。临床治疗中,各类抗炎药物及促进泪液分泌药物在一定程度上标志着干眼药物治疗的快速发展,但干眼治疗并非仅仅为了改善症状,而要根据具体病因展开治疗。近年关于干眼免疫机制的研究日益增多,据此本文就干眼的免疫机制研究进展进行综述,希望系统性了解免疫在干眼发生发展过程中的作用及临床意义。

不同体质量规格的日本医蛭适宜越冬密度与繁殖性能研究

为了探究不同体质量规格的日本医蛭越冬的适宜密度以及对卵茧、幼苗的影响,选用不同体质量规格(A组为1 g,B组为2 g,C组为3 g,D组为4 g,E组为混合规格体质量组)的日本医蛭于面积为0.5 m^2的自制越冬池中越冬繁殖,记录越冬后日本医蛭存活数、产茧数量及卵茧孵化情况.结果显示,A-D组最佳越冬密度分别为3.174 kg/m^2,3.188 kg/m^2,2.904 kg/m^2和3.168 kg/m^2.A-D组平均产茧率为1.15,1.21,1.20,1.20.卵茧质量、幼苗平均质量随日本医蛭越冬规格增加而增加,出苗数也相应增多.结果表明,生产中为了获得较大规格的幼苗,应选择相对较大的亲本进行越冬繁殖,且单位面积总投放量控制在3.0~3.5 kg时,存活率最高,平均产茧率最大.

低温条件下日本医蛭各组织基因表达转录组测序及qPCR验证

为解析日本医蛭(Hirudo nippnica Whitman)繁殖的分子机理,研究不同温度下饲养的日本医蛭各组织基因表达差异情况。利用转录组学测序检测不同温度饲养条件下日本医蛭肌肉、环带和头部组织的基因表达情况,筛选出11个差异表达基因,并对其进行qPCR验证。qPCR结果显示一种具有去饱和酶功能的膜蛋白编码基因G6,在日本医蛭环带中的表达随温度的升高而降低,与转录测序结果一致,暗示G6基因可能为日本医蛭繁殖相关的关键基因。进一步对G6蛋白进行功能域预测,结果显示其属于一种跨膜蛋白。其他10个差异表达基因的转录组测序结果和qPCR结果基本保持一致,通过蛋白功能域预测结果显示预测出假定蛋白均含有的功能结构域;通过miRNA亲和预测,非编码RNA(G13)具有高亲和miRNAs特性。研究发现了10个潜在的功能基因和一个非编码RNA基因。

基于高通量测序的日本医蛭转录组及SSR序列分析

【目的】分析日本医蛭在不同温度处理下,其转录组和简单重复序列标记(simple seauence repeats,SSR)信息。【方法】应用高通量测序技术,对不同温度下日本医蛭不同组织分别进行转录组测序,采用MISA软件对unigene进行SSR分析。【结果】共获得125.08 G有效数据,平均错误率为0.03%。经Trinity软件混合拼接后共得到202 570条transcripts和52 206条unigene,平均长度分别为1 826 bp和1 390 bp,最大长度均为30 853 bp。将unigene与公共数据库进行比对,得到注释的unigene为29 352条,占总数的56.22%。对unigene进行SSR检测,共检测到29 926个SSR位点,发生频率是57.32%。SSR的核苷酸基元重复数都在5次以上,主要集中在5~10次(86.27%)之间,以三核苷酸和单核苷酸重复SSR为主,所占比例分别为74.07%和15.10%,核苷酸重复基元中,以A/T (4 255,14.22%)为主,在三核苷酸重复基元中,ATC/ATG (9 496,31.73%)所占比例最高。不同温度下日本医蛭转录组基因表达量差异比较数据显示,样本间表达差异基因共1 603个。【结论】不同温度处理后日本医蛭的SSR发生频率较高,可为日本医蛭筛选分子遗传标记提供大量基础数据。

药用水蛭研究进展

梳理了关于药用水蛭的相关报道,对药用水蛭资源、抗凝血物质、人工养殖研究等进行了详细的综述,剖析了当前水蛭养殖存在的主要问题,以期为药用水蛭的规范化养殖与推广提供基础资料与理论依据。

LOX基因多态性与亚洲人群恶性肿瘤易感性Meta分析

目的 探讨赖氨酰氧化酶(LOX)基因G473A多态性与亚洲人群恶性肿瘤易感性的关系。方法 通过计算机检索PubMed、CNKI、万方全文数据库等数据库,查找建库至2017年3月关于LOX基因与恶性肿瘤易感性关系的研究文献。筛选文献并提取数据进行分析。结果 LOX基因G473A多态性与亚洲人群恶性肿瘤易感性之间的相关性在各基因模型中均有统计学意义。假阳性报告率检验结果显示各基因模型的检验值均低于预先设定的临界值0.2,有统计学意义。结论 该Meta分析表明,LOX基因G473A多态性与亚洲人群恶性肿瘤发病风险之间可能存在相关性。

紫色土池塘养殖底泥理化性质变化及营养沉积过程

为探讨紫色土池塘养殖进程中底泥理化性质变化及营养沉积过程,以重庆市铜梁区(N29.5130°,E106.4010°)采集的紫色土作为基础,覆水模拟紫色土池塘半年的养殖过程,定期测定底泥温度、pH值、氧化还原电位等理化指标和有机质、氮、磷、钾、镁、硫等营养成分含量。结果表明,石灰性紫色土pH值达8.5,碱性明显,营养总体偏低。建成池塘后底泥迅速向中性转化,养殖组pH值(7.1)明显低于对照组(7.3);养殖组底泥表现为还原性,氧化还原电位降至约-210.0 mV,明显低于对照组(180.0 mV)。养殖组底泥主要营养成分有机质、总氮、总磷、速效磷和速效钾等含量逐步升高,均高于对照组,试验结束时沉积量分别达5.10 g/kg、0.13 g/kg、0.45 g/kg、78.88 mg/kg和88.50 mg/kg;其他营养成分也有不同量沉积,仅镁含量降低。养殖组底泥有机质不断累积并发生厌氧反应,但底泥p H值中后期较为稳定且仍处在宜渔区间,表现出石灰性紫色土作为池塘底泥的较强缓冲性。按照底泥有机质5.1 g/(kg·a)沉积和碳氮比升高的速度,养殖3 a后其将变为低渔产力池塘,故建议新建石灰性紫色土池塘养殖清淤年限不应超过3 a。

基于COI基因序列的日本医蛭疑似种鉴定

采用线粒体COI(细胞色素氧化酶Ⅰ亚基,tochrome oxidasesubunit Ⅰ)基因序列鉴别日本医蛭及其常见疑似种,并分析其遗传多样性和亲缘关系.以日本医蛭及其疑似种为材料,提取线粒体DNA,扩增其COI基因后进行测序,并计算遗传距离和聚类分析.结果显示,日本医蛭COI序列长度为680 bp,碱基A,T,C,G质量分数分别为35.1%,28.7%,16.2%和20.0%,碱基AT质量分数为63.8%;疑似种YS1~YS10的碱基A,T,C,G平均质量分数分别为39.8%,29.4%,15.2%和14.9%,碱基AT质量分数为69.2%. 11种蛭类COI序列中有569个一致位点,84个变异位点,其中,40个位点发生了碱基转换,44个位点发生了碱基颠换,转换与颠换的比值为0.90.日本医蛭与疑似种的遗传距离在0.159~0.166之间.基于COI序列的DNA条形码技术可以很好地鉴定正品日本医蛭与其疑似种,本试验鉴定的疑似种均不是日本医蛭.

基于生物信息学方法分析雌激素受体相关基因在女性结核病患者中的表达及意义

目的探索女性结核病患者雌激素受体相关联的基因并进行实验验证。方法下载GSE114911、GSE54992、GSE834563个数据集的基因表达谱。使用R软件探索来自女性的结核组织样本与正常组织样本之间的差异基因。在线数据库DAVID用于差异基因的富集分析。使用相互作用基因/蛋白质检索的搜索工具和Cytoscape软件对雌激素受体基因和差异基因进行网络构建。取我院女性肺结核患者肺结核组织和正常肺组织标本,运用实时定量PCR、Western blot检测关键基因在肺结核组织和正常肺组织中的表达水平。结果3个数据集的交集显示了24个差异基因。使用GO功能注释将24个差异基因分为生物学过程、分子功能和细胞组分3个类别。随后进行了KEGG分析,总共有10个差异基因和雌激素受体密切相关。其中,CCL20、CXCR3与雌激素受体关联最为密切的基因。运用实时定量PCR发现,肺结核组织样本中的CCL20mRNA表达水平为2.56±0.34,低于配对的正常肺组织的7.88±0.51(t=-2.375,P=0.003),CXCR3 mRNA表达水平为8.35±1.76,高于配对的正常肺组织的1.24±0.34(t=1.384,P=0.008);Western blot验证结果与实时定量PCR结果趋势一致。结论本研究通过多个数据库对CCL20、CXCR3进行生物信息学分析,发现雌激素受体相关基因可能在女性结核病中发挥作用,为结核病的分子机制提供新的见解。

POLE2在肺腺癌组织中表达及其生物信息学分析

目的利用肿瘤相关数据库探讨DNA聚合酶εB亚基(POLE2)基因在肺腺癌中的表达及其对生存预后的影响。方法使用GEPIA数据库和Oncomine数据库分析不同肺腺癌数据集中POLE2 mRNA的表达情况,利用Kaplan-Meier Plotter进行POLE2表达水平与肺腺癌病人总生存期的相关性分析。利用cBioPortal数据库和LinkedOmics数据库分析肺腺癌组织中的POLE2表达相关基因。利用Enrichr数据库和STRING数据库对POLE2表达相关基因进行富集分析,利用TIMER数据库了解POLE2与免疫细胞的关系。结果与正常肺组织比较,肺腺癌组织中POLE2 mRNA水平呈高表达(|log_(2)FC|=0.5,P<0.01)。高表达POLE2的肺腺癌病人总生存期更短(χ^(2)=9.134,P<0.01)。与POLE2表达相关基因共37个。GO分析显示,POLE2表达相关基因主要富集在DNA聚合酶的激活、DNA的复制、DNA的修复等生物学过程。KEGG通路分析显示,POLE2表达相关基因主要参与了碱基切除修复、DNA复制、核苷酸切除修复等信号通路。蛋白相互作用分析显示,PRIM2、POLA1、POLA2、CDC45等基因与POLE2有潜在的或密切的相互作用。POLE2基因在肺腺癌免疫微环境中与B细胞、CD4^(+)T细胞、CD8^(+)T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞、树突状细胞均无明显相关性。结论POLE2在肺腺癌组织中呈高表达,且其表达水平与肿瘤预后具有相关性,POLE2在肺腺癌中的高表达预示病人预后不良。