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2012—2022年长沙市学校突发公共卫生事件流行特征分析 被引量:1
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作者 赵锦 胡伟红 +6 位作者 张斯钰 罗飘异 匡文韬 倪涵 查文婷 易尚辉 吕媛 《热带病与寄生虫学》 CAS 2023年第3期164-168,共5页
目的分析长沙市学校突发公共卫生事件的发生规律和特点,为学校突发公共卫生事件应急处置提供科学依据。方法收集通过中国疾病预防控制信息系统突发公共卫生事件报告管理信息系统上报的2012—2022年长沙市学校突发公共卫生事件信息,对长... 目的分析长沙市学校突发公共卫生事件的发生规律和特点,为学校突发公共卫生事件应急处置提供科学依据。方法收集通过中国疾病预防控制信息系统突发公共卫生事件报告管理信息系统上报的2012—2022年长沙市学校突发公共卫生事件信息,对长沙市学校突发公共卫生事件的起数、级别、类型、发病人数、时间、场所等进行描述性研究。结果2012—2022年长沙市共报告293起学校突发公共卫生事件,报告发病14416例,无死亡病例。其中一般事件(Ⅳ级)179起,未分级事件114起,无重大(Ⅲ级)及以上事件。293起事件中传染病类事件288起,报告发病14320例。中毒事件1起,其他公共卫生事件4起。学校传染病事件中,事件数居前三位的分别为水痘(35.07%,101/288)、流行性腮腺炎(28.13%,81/288)、流行性感冒(21.53%,62/288),发病数居前三位的分别为流行性感冒(38.16%,5464/14320)、流行性腮腺炎(27.14%,3886/14320)、水痘(22.47%,3217/14320)。突发事件有4—5月、11—12月两个高峰。小学报告事件数最多,其次为幼儿园和初中,分别占学校事件总数的72.01%(211/293)、10.92%(32/293)、9.22%(27/293)。浏阳市的报告事件数和发病数均最高,分别占总数的43.00%(126/293)、37.37%(5387/14416);报告事件数和发病数最少的为芙蓉区,分别占总数的2.05%(6/293)、0.90%(130/14416)。结论呼吸道传染病是长沙市学校突发公共卫生事件的主要原因,小学为重点场所。应针对性地开展防控工作,提升疫苗接种率,减少学校突发公共卫生事件的发生。 展开更多
关键词 学校 突发公共卫生事件 传染病 流行特征 长沙市
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孕前体质量指数与后代先天性心脏病关联剂量反应关系的Meta分析 被引量:4
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作者 谢果红 郑赞 +2 位作者 吕媛 查文婷 刘桃成 《护理学报》 2018年第15期30-36,共7页
目的系统评估孕前体质量指数与后代先天性心脏病的关联。方法系统检索PubMed、EMbase、Web of Scicence、万方、维普和中国知网,检索时间为建库至2017年12月,按纳入和排除标准筛选文献。采用NOS量表评估文献质量。结果共16篇研究纳入本M... 目的系统评估孕前体质量指数与后代先天性心脏病的关联。方法系统检索PubMed、EMbase、Web of Scicence、万方、维普和中国知网,检索时间为建库至2017年12月,按纳入和排除标准筛选文献。采用NOS量表评估文献质量。结果共16篇研究纳入本Meta分析,其中病例对照研究13篇,队列研究3篇。低体质量(OR:1.03,95%CI:0.97~1.10)和超重(OR:1.05,95%CI:0.98~1.14)与后代先天性心脏病的发生风险无关,肥胖(OR:1.37,95%CI:1.17~1.61)可增加后代先天性心脏病的发生风险。剂量反应的Meta分析提示两者间存在非线性剂量反应关系,即随着孕前体质量指数的增加,后代发生先天性心脏病的风险也随之增加。结论肥胖影响后代先天性心脏病的发生风险,孕前体质量指数越大,后代发生先天性心脏病的风险越高。 展开更多
关键词 孕妇 体质量指数 BMI 先天性心脏病 META分析
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基于CNN的区域风功率预测方法 被引量:5
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作者 查雯婷 杨帆 +1 位作者 陈波 李亚龙 《计算机仿真》 北大核心 2021年第5期318-323,共6页
针对目前国内外风功率预测精度普遍不高,预测效果难以为电力系统调度提供可靠保障的现象,提出了一种基于CNN的区域风功率预测方法。采用k阶最小二乘法曲线拟合和BN归一化对历史数据进行预处理,将总数据集划分为训练集、验证集和测试集,... 针对目前国内外风功率预测精度普遍不高,预测效果难以为电力系统调度提供可靠保障的现象,提出了一种基于CNN的区域风功率预测方法。采用k阶最小二乘法曲线拟合和BN归一化对历史数据进行预处理,将总数据集划分为训练集、验证集和测试集,数据矩阵化作为网络的输入,训练结束后保存最优模型,通过滚动预测的方法得出最终预测结果。算例结果表明,上述方法适合对未来超短期风功率曲线进行准确预测,预测精度较传统方法和现有水平均有不同程度的提高。 展开更多
关键词 风功率预测 卷积神经网络 超短期预测 季节性分析 误差分析
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非理想条件下DC-DC Buck开关变换器的自适应控制 被引量:3
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作者 查雯婷 栗疆堡 +2 位作者 于志超 王朋辉 程红 《控制工程》 CSCD 北大核心 2020年第S01期19-24,共6页
针对非理想DC-DC Buck变换器,研究了系统中部分参数未知情况下的自适应控制问题。首先,综合考虑电路中元件的寄生电阻等非理想因素,基于状态空间平均法建立了非理想Buck开关变换器的小信号模型。然后,基于Lyapunov稳定性定理,将反步法... 针对非理想DC-DC Buck变换器,研究了系统中部分参数未知情况下的自适应控制问题。首先,综合考虑电路中元件的寄生电阻等非理想因素,基于状态空间平均法建立了非理想Buck开关变换器的小信号模型。然后,基于Lyapunov稳定性定理,将反步法与自适应控制技术相结合,迭代地设计了一个状态反馈控制器。通过构造自适应参数更新律来消除未知参数对系统的影响,可以证明闭环系统所有信号是有界的,同时电容电压和电感电流均达到稳定值。最后,利用MATLAB仿真和实验对相应控制策略的有效性进行了验证。 展开更多
关键词 BUCK变换器 非理想模型 自适应控制 反步法
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含模型不确定性的上三角非线性系统的全局镇定
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作者 查雯婷 翟军勇 梁营玉 《控制理论与应用》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第8期1790-1798,共9页
本文针对一类具有模型不确定性的上三角非线性系统,利用嵌套饱和函数方法研究其全局镇定问题.首先,对系统中存在的未知幂指数、未知控制参数和不确定性非线性函数施加适当假设,并基于Lyapunov稳定性定理利用已知的参数设计局部镇定控制... 本文针对一类具有模型不确定性的上三角非线性系统,利用嵌套饱和函数方法研究其全局镇定问题.首先,对系统中存在的未知幂指数、未知控制参数和不确定性非线性函数施加适当假设,并基于Lyapunov稳定性定理利用已知的参数设计局部镇定控制器.然后,将设计的控制器与饱和函数结合得到饱和控制器.通过适当选取饱和度,可以证明只要不确定参数在限定的范围内,该控制器都能够使得闭环系统全局渐近稳定.最后,选取不同的系统幂指数搭建数值仿真算例.在相同的控制器作用下,系统状态和控制轨迹渐近收敛至原点,从而验证了所提控制算法的有效性和鲁棒性. 展开更多
关键词 非线性系统 模型不确定性 嵌套饱和方法 鲁棒性 全局镇定
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2005-2016年某市淋病流行特征及时空变化规律研究 被引量:9
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作者 查文婷 邹享玉 +4 位作者 易尚辉 黄竹林 何麒灿 刘颖 吕媛 《中华疾病控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期1134-1137,1159,共5页
目的了解2005-2016年某市淋病流行特征和时空变化规律,为实施卫生资源优化配置、提高淋病的防控效果提供科学依据。方法疾病数据来源于传染病网络直报信息系统,采用动态数列和年估计百分化变化(estimating average percent change,EAPC... 目的了解2005-2016年某市淋病流行特征和时空变化规律,为实施卫生资源优化配置、提高淋病的防控效果提供科学依据。方法疾病数据来源于传染病网络直报信息系统,采用动态数列和年估计百分化变化(estimating average percent change,EAPC)研究其时间变化规律,采用地理信息系统(geographic information system,GIS)研究其空间变化规律。结果 2005-2016年某市报告淋病发病数为10 842例,平均发病率为13. 80/10万。男女性别比为2. 12∶1; 20~39岁为高发人群(63. 17%),主要职业为农民(31. 51%)、家政(13. 00%)和商业服务业(12. 04%)。2005-2016年淋病平均发展速度为97. 86%,平均增长速度为-2. 14%,年EAPC为-5. 16%,变化稳定。所辖区发病率较高的是岳麓区(22. 65/10万)、雨花区(20. 31/10万)和芙蓉区(18. 24/10万),构成比较高的是宁乡市(24. 33%)、浏阳市(15. 57%)、雨花区(14. 57%)和岳麓区(12. 99%),宁乡县和浏阳市一直表现出淋病的高发聚集性。结论 2005-2016年某市淋病发病率稍高于全国平均水平,但呈稳定的负向增长,应加强重点区域、重点人群的防控,共同营造预防性病的社会环境。 展开更多
关键词 淋病 流行特征 动态数列 年估计百分化变化 地理信息系统
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湖南省流行性感冒与气象因素关系及预测 被引量:10
7
作者 查文婷 李渭通 +5 位作者 何嘉慧 何嘉琪 吕媛 刘颖 邹享玉 易尚辉 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期537-541,共5页
目的分析湖南省气象因素与流行性感冒(流感)发病的关系,建立时间序列模型,并对预测效果进行评价,为今后制定更科学有效的流感防控策略提供参考依据。方法利用SPSS 20.0软件建立数据库,采用Spearman秩相关对气象因素和流感发病数进行相... 目的分析湖南省气象因素与流行性感冒(流感)发病的关系,建立时间序列模型,并对预测效果进行评价,为今后制定更科学有效的流感防控策略提供参考依据。方法利用SPSS 20.0软件建立数据库,采用Spearman秩相关对气象因素和流感发病数进行相关性分析,以2008—2016年湖南省流感发病数为基础构建时间序列模型,对2017年1—12月流感发病数进行预测并评价预测效果。结果 (1)2008—2017年全年均有流感病例报告,高发季节为冬春季;(2)流感发病数与月平均气温(r=–0.195,P <0.05)、平均日照时数(r=–0.483,P <0.05)、平均日降水量(r=–0.116,P <0.05)呈负相关,与月平均气压(r=0.195,P <0.05)、平均相对湿度(r=0.260,P <0.05)、平均最大风速(r=0.279,P <0.05)呈正相关;(3)ARIMA(1,0,0)(0,1,1)_(12)模型和引入气象因素后的ARIMAX模型对2017年1—6月流感发病数预测的平均相对误差分别为43.90%和31.48%,对2017年7—12月流感发病数预测的平均相对误差为70.65%和67.17%。结论引入气象参数后的ARIMAX模型较ARIMA模型预测效果更好,但两个模型对2017年7—12月预测效果均不佳,今后将纳入更多的因素完善ARIMAX模型。 展开更多
关键词 流行性感冒 气象因素 时间序列模型 预测
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基于时空大数据的甲型肝炎发病率分布特征分析及预测模型 被引量:18
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作者 朱佳佳 胡登利 +2 位作者 洪秀琴 查文婷 吕媛 《中华疾病控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期1144-1147,共4页
目的了解我国甲型病毒性肝炎(以下简称甲肝)发病率在时间和空间上的分布特征,探讨乘积季节模型在甲肝发病率预测中的可行性。方法收集我国2006-2017年甲肝发病数据和人口学资料,利用MapInfo11. 0绘制甲肝发病率时空分布柱状图;并采用SPS... 目的了解我国甲型病毒性肝炎(以下简称甲肝)发病率在时间和空间上的分布特征,探讨乘积季节模型在甲肝发病率预测中的可行性。方法收集我国2006-2017年甲肝发病数据和人口学资料,利用MapInfo11. 0绘制甲肝发病率时空分布柱状图;并采用SPSS 23. 0对2006-2016年数据建立自回归移动平均模型(autoregressive integrated moving average model,ARIMA),选取2017年数据评价模型的预测效果。结果 2006-2016年,全国共报告甲肝病例430 962例,发病率逐年递减,且西部地区明显高于东部地区。经数据平稳化处理、定阶、参数估计与模型检验后建立了最优模型ARIMA(0,2,2)(0,1,1)12。且对2017年1~12月的预测值和实际发病率基本吻合,相对误差在2. 0%~39. 7%之间。结论我国甲肝发病率逐年递减且东西部地区甲肝发病率表现出明显差异。ARIMA乘积季节模型对我国甲肝发病率具有很好的短期预测能力。 展开更多
关键词 甲肝 发病率 时空分布特征 ARIMA乘积季节模型
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基于结构方程对Ⅱ型糖尿病病人生活质量及影响因素的分析 被引量:5
9
作者 周楠 杨贶 +3 位作者 刘颖 易尚辉 查文婷 吕媛 《实用预防医学》 CAS 2020年第10期1158-1162,共5页
目的分析Ⅱ型糖尿病病人生活质量的影响因素,为综合制定合理措施改善患者生存质量提供科学依据。方法采用多阶段随机整群抽样,从长沙市9个区、县(市)中随机抽取3个,再从每个区中随机抽取1个镇(街道),对抽中的3个镇(街道)辖区内管理的Ⅱ... 目的分析Ⅱ型糖尿病病人生活质量的影响因素,为综合制定合理措施改善患者生存质量提供科学依据。方法采用多阶段随机整群抽样,从长沙市9个区、县(市)中随机抽取3个,再从每个区中随机抽取1个镇(街道),对抽中的3个镇(街道)辖区内管理的Ⅱ型糖尿病患者进行问卷调查与健康体检。根据变量数量对原始数据进行降维,构建结构方程模型,采用SPSS中的AMOS 22.0程序包进行模型拟合及检验。结果本次共调查糖尿病患者3338例,其中男性1643(49.22%)例,女性1695(50.78%)例;年龄以60~70岁为主,占42.12%(1406/3338)。并发高血压所占比例最大,占68.5%,其次为肾脏疾病(19.3%)、脑血管疾病(11.6%)等。χ2检验显示,年龄、患者病程、治疗情况、腰臀比和社会经济地位(如文化程度低、农村农民占多数)在糖尿病患者中有无慢性并发症差异有统计学意义(P<0.05),而性别、婚姻状况、吸烟、饮酒、体力活动、BMI分布情况等差异无统计学意义(P>0.05)。通过结构方程因子降维结果选取部分指标进行结构方程模型的拟合,拟合结果显示GFI=0.995,AGFI=0.989,TLI=0.9440,RMSEA=0.042,CFI=0.966,NFI=0.961。模型拟合较好,文化程度、生活质量、吸烟、饮酒以及体力活动以及家族遗传之间存在相互关系,其中体力活动对Ⅱ型糖尿病患者的生活质量存在较大影响,其次为文化程度。结论通过加强体力活动以及减少吸烟饮酒能够有效提升Ⅱ型糖尿病病人的生活质量。 展开更多
关键词 Ⅱ型糖尿病 结构方程 生存质量 影响因素
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中国急性出血性结膜炎时空分布和社会环境影响因素分析 被引量:4
10
作者 任香 陈梦想 +5 位作者 周楠 戴皓云 李国群 洪秀琴 查文婷 吕媛 《中华疾病控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期953-960,共8页
目的通过分析急性出血性结膜炎(acute hemorrhagic conjunctivitis,AHC)时空分布特征以及研究影响其发病的社会环境影响因素,为该疾病防控策略提供科学依据。方法本研究以中国2011―2017年31个省(自治区、直辖市)的AHC发病数据为基础,... 目的通过分析急性出血性结膜炎(acute hemorrhagic conjunctivitis,AHC)时空分布特征以及研究影响其发病的社会环境影响因素,为该疾病防控策略提供科学依据。方法本研究以中国2011―2017年31个省(自治区、直辖市)的AHC发病数据为基础,运用空间自相关分析方法探求疾病时空分布特征,并且使用地理探测器分析各环境因子对疾病的影响。结果2011―2017年AHC年发病率波动较小,发病主要集中在夏秋季;空间上集中于中南地区以及华东地区;AHC发病率存在空间正相关,湖南省从高高聚集到低高聚集,防控力度要继续保持,贵州省从低高聚集到高高聚集,要注意周围省份疾病传播;气象、社会发展、经济文化等因素均不同程度影响AHC的发病,且因子的两两交互作用增强了发病风险,其中年均气温与其他因子的相互作用增加效应较强。结论AHC发病时空分布不均匀,并且受各种社会环境因素的影响,空间自相关分析以及地理探测器模型的运用能有效地探索其时空特征以及影响因素,为AHC进行有重点的、有针对性的预防与控制发挥了重要的作用。 展开更多
关键词 急性出血性结膜炎 空间自相关 时空分布 社会环境因素 地理探测器
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基于生物信息学分析筛选舌鳞状细胞癌核心基因及其预后价值 被引量:2
11
作者 黄成 易尚辉 +1 位作者 查文婷 吕媛 《医学信息》 2020年第3期6-12,共7页
目的通过对GEO数据库提供的基因芯片数据进行挖掘,结合生物信息学分析基因表达谱,获取舌鳞状细胞癌(TSCC)核心基因,利用生存分析初步验证核心基因对舌鳞状细胞癌的预测效果。方法从GEO数据库下载舌鳞状细胞癌相关芯片数据(GSE9844),获得... 目的通过对GEO数据库提供的基因芯片数据进行挖掘,结合生物信息学分析基因表达谱,获取舌鳞状细胞癌(TSCC)核心基因,利用生存分析初步验证核心基因对舌鳞状细胞癌的预测效果。方法从GEO数据库下载舌鳞状细胞癌相关芯片数据(GSE9844),获得了26例TSCC组织样本和12例癌旁组织样本的全基因组转录组谱,采用SAM算法筛选出TSCC与癌旁组织间的差异表达基因,并借助GEO的gene信息库对基因功能进行描述,筛选出TSCC与癌旁组织间的差异细胞信号通路,构建决定TSCC的基因共表达网络,通过GEPIA数据库来初步验证共表达网络中的核心基因是否与TSCC患者的生存预后存在相关性。结果筛选出2074个差异表达基因,包括1119个上调基因和955个下调基因。以2074个差异表达基因作为共表达网络的构建基础,共纳入230个差异表达基因,筛选出5个TSCC核心的基因(ADCY4、PLA2G12A、MAOB、PDE2A、CYP2C9),通过GEPIA数据库对核心基因进行生存分析,初步验证共表达网络中高表达的ADCY4基因与TSCC总体生存率呈正相关(P=0.014),高表达PLA2G12A基因与TSCC总体生存率呈负相关(P=0.0029),MAOB、PDE2A及CYP2C9基因患者生存率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论通过生物信息学方法分析影响TSCC的核心基因,最终筛选出2个差异表达非常显著且对患者预后影响明显的基因,对TSCC的诊断和预后治疗提供了新思路,提高TSCC机制的研究效率。 展开更多
关键词 舌鳞状细胞癌 生物信息学 核心基因 共表达网络
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铁路系统职工胆囊结石患病情况及其危险因素分析
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作者 向红铭 易尚辉 +2 位作者 吕媛 查文婷 王凯旋 《医学信息》 2020年第5期126-129,共4页
目的了解铁路系统职工胆囊结石患病情况及其危险因素,为开展特定职业人群胆囊结石防治提供理论依据。方法选取2016年5月~2018年6月铁路系统中8个铁路段接受体检的13724名职工的体检资料,均进行常规体格检查,临床指标检测,B超影像学等检... 目的了解铁路系统职工胆囊结石患病情况及其危险因素,为开展特定职业人群胆囊结石防治提供理论依据。方法选取2016年5月~2018年6月铁路系统中8个铁路段接受体检的13724名职工的体检资料,均进行常规体格检查,临床指标检测,B超影像学等检查,根据胆囊结石诊断标准分为正常组和异常组,比较两组体检资料,并采用多因素Logistic回归分析胆囊结石的影响因素。结果13724名铁路系统在职职工,其中异常组925例,正常组12799人。两组性别、尿胆红素、血肌酐、尿素氮、隐血、谷丙转氨酶、谷草转氨酶、总胆红素、总胆固醇、LDL-C、促甲状腺、甲胎蛋白、癌胚抗原、EB病毒抗体比较,差异无统计学意义(P>0.05);两组年龄、BMI、高血压、血糖、脂肪肝、尿葡萄糖、尿蛋白质、甘油三酯、HDL-C比较,差异有统计学意义(P<0.05)。多因素非条件Logistic回归分析显示,高龄、超重肥胖、高血压、高血糖、脂肪肝、低HDL-C是铁路系统职工胆囊结石患病的危险因素。结论铁路系统职工胆囊结石患病率较高,高龄、超重肥胖、血糖偏高、高血压、脂肪肝、低HDL-C水平为铁路系统职工胆囊结石患病的危险因素。因此,加强对职工血压、血糖检测,调节膳食结构,减少饱和脂肪摄入,控制体重,积极预防脂肪肝和脂类代谢疾病等可有效预防胆囊结石患病的风险。 展开更多
关键词 铁路系统 胆囊结石 危险因素
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Genomic Characteristics of SARS-CoV,MERS-CoV and 2019-nCoV 被引量:1
13
作者 LI Tong YU Xing +2 位作者 CHEN Meng-xiang LV Yuan zha wen-ting 《Chinese Journal of Biomedical Engineering(English Edition)》 CAS 2021年第1期30-39,共10页
In December 2019, Wuhan, the capital of Hubei Province in China,reported a series of unexplained cases of pneumonia, which has been confirmed to be an acute infectious respiratory disease caused by Novel Corona Virus ... In December 2019, Wuhan, the capital of Hubei Province in China,reported a series of unexplained cases of pneumonia, which has been confirmed to be an acute infectious respiratory disease caused by Novel Corona Virus 2019(2019-nCoV)infection. The World Health Organization(WHO) named this pneumonia Corona Virus Disease 2019(COVID-19). The 21 st century had witnessed the spread of two previously unrecognized coronaviruses around the world with high pathogenicity before, namely severe acute respiratory syndrome coronavirus(SARS-CoV) and Middle East respiratory syndrome coronavirus(MERS-CoV) respectively. At present, 2019-nCoV ’s genome has been sequenced by researchers all over the world represented by China. Based on the systematic review and analysis of the genomic sequence characteristics of three highly pathogenic coronaviruses, this paper expounds the basic characteristics of the genomes of SARS-CoV, MERS-CoV and 2019-nCoV,which all belong to β-coronaviruses, the functionally important ORFs, ORF1 a, ORF1 b and major structural proteins including the spike(S), membrane(M) and envelop(E) and nucleiccapsid(N) proteins have no significant difference with each other. However, as the majority of genetic variations being seen at the N-terminal part of S protein, 2019-nCoV aligned best with the bat SARS-like virus bat-SL-CoVZX45. And Structure analysis of the spike(S) protein of2019-nCoV showed that it’s S protein only binds weakly to the Angiotensin Converting Enzyme2(ACE2) receptor on human cells whereas the human SARS-Cov exhibits high affinity to the ACE receptor and MERS-Cov does not need ACE2 to infect human cells,its receptor on human cells is DPP4. In the future, we hope to provide new ideas for the prevention and treatment of coronavirus by strengthening the research of coronavirus S protein and ACE2 receptor, and continuous surveillance and genomic characterization of coronaviruses from bats are necessary due to potential risks of human infection induced by a genetic mutation. 展开更多
关键词 2019-nCoV SARS-COV MERS-CoV COVID-19 genomic characteristic
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The Analysis of SNP within GPR26 Gene and Tumor-Associated Latent Loci
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作者 WU Bin QU Fang +4 位作者 CAO Peng-rong HU Jing YI Yin-sha zha wen-ting LV Yuan 《Chinese Journal of Biomedical Engineering(English Edition)》 2017年第2期57-63,共7页
This study aims to investigate the association of SNPs with tumor-associated latent loci. By analyzing the effect of gene mutations on the structure and function of proteins with the database, to speculate the destruc... This study aims to investigate the association of SNPs with tumor-associated latent loci. By analyzing the effect of gene mutations on the structure and function of proteins with the database, to speculate the destructive mutants. It was found that individuals with the genotype of the five key SNP loci were more susceptible to tumors; these specific markers can be used as a molecular marker to determine the susceptibility of a tumor to the individual, and to diagnose the population with high risk of tumor; and rs201154887 can be used as a new disease molecular marker. 展开更多
关键词 GPR26 GENE SNP tumor non-synonymous mutation
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The Relationship Between Gene Mutation and Pathological Type of Lung Cancer
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作者 PANG Feng-rui QU Fang +2 位作者 WU Bin zha wen-ting LV Yuan 《Chinese Journal of Biomedical Engineering(English Edition)》 2018年第2期47-56,共10页
Objective: To investigate the relationship between gene mutation and pathological type of lung cancer, inspect and verify the consistency between homologous genes mutation in various pathologic type. Methods: Combined... Objective: To investigate the relationship between gene mutation and pathological type of lung cancer, inspect and verify the consistency between homologous genes mutation in various pathologic type. Methods: Combined with the COSMIC and Uni Prot database, we obtained the reported overall big-sample mutation data of lung cancer and the protein sequences of the top 20 mutated genes,respectively. Analyze the data and cluster the protein sequences and then deduce the homologous gene. Ultimately, analyze the mutations of different pathological types of homologous genes. Results: TP53(32.32%) has the highest mutation rate in lung cancer, followed by EGFR(29.12%). The copy number variability(CNV) of genes:KRAS, LRP1 B, CDKN2 A, KMT2 C, FAT1, PIK3 CA, RB1, ERBB4, GRIN2 A and KDR between each pathological type is statically significant(P<0.05). The gene differential expression rate between adenocarcinoma and squamous carcinoma of gene TP53, KRAS, LRP1 B, CDKN2 A, STK11, FAT4, KMT2 D, NFE2 L2, KEAP1,PIK3 CA, RB1, ERBB4, SMARCA4 and KDR are statistically significant(P<0.05).The similarity of the protein sequence of EGFR and ERBB4 can reach 93%, and FAT4 and FAT1 are 81%. For small cell carcinoma, there's no difference in CNV between the two groups of homologous genes, and no difference between FAT4 and FAT1 in adenocarcinoma. Conclusion: The CNV and gene expression of lung cancer-associated genes are relevant to pathologic types. GFR and ERBB4 are homologous, FAT4 and FAT1 are also among the top 20 mutation genes.Additionally, there's no difference in CNV between the two groups of small cell carcinoma, which is the same between FAT4 and FAT1 in adenocarcinoma. 展开更多
关键词 lung cancer pathologic typing gene mutation
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