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2017—2022年湖南省登革热流行特征分析 被引量:5
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作者 刘子言 戴志辉 +9 位作者 湛志飞 杨浩 孙倩莱 王娟 卜哲妮 何方玲 陈生宝 刘荣娇 林慧君 罗垲炜 《热带病与寄生虫学》 CAS 2023年第5期245-249,共5页
目的分析湖南省登革热流行特征,为湖南省登革热防控提供科学依据。方法通过中国疾病预防控制信息系统收集2017—2022年湖南省登革热病例监测资料,使用描述流行病学方法对湖南省登革热疫情的时间、人群和地区分布特征以及输入病例和本地... 目的分析湖南省登革热流行特征,为湖南省登革热防控提供科学依据。方法通过中国疾病预防控制信息系统收集2017—2022年湖南省登革热病例监测资料,使用描述流行病学方法对湖南省登革热疫情的时间、人群和地区分布特征以及输入病例和本地病例特征差异进行分析。结果2017—2022年湖南省累计报告登革热病例943例,其中输入病例514例(占54.51%),本地病例429例(占45.49%),死亡1例;发病高峰集中在8—11月(746例,占79.11%);病例涉及14个市(州)108个县(市、区)。输入病例的男女性别比为2.70:1,高于本地病例的男女性别比(1.01:1)。输入病例年龄中位数为39(30,50)岁,主要集中在20~49岁(341例,占66.34%),职业以农民、商业服务、工人为主(365例,占71.01%);本地病例年龄中位数为46(33,55)岁,主要集中在30~69岁(309例,占72.03%),职业以农民、离退人员、学生、家务及待业为主(307例,占71.56%)。输入病例从发病到诊断的时间中位数为5(2,7)d,长于本地病例的4(2,6)d,差异有统计学意义(Z=-8.776,P<0.05)。境外输入病例主要来自柬埔寨、缅甸和泰国等东南亚国家,境内输入病例主要来自广东、云南和广西等省份。结论湖南省登革热疫情具有明显的输入性和季节性特征,各级疾控机构在流行季节应及时开展传播风险评估,采取切实有效措施降低蚊媒密度,避免发生流行与暴发。 展开更多
关键词 登革热 流行特征 输入病例 本地病例 湖南省
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2017—2019年湖南省食源性疾病沙门氏菌菌型分布及药敏分析 被引量:1
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作者 袁青 湛志飞 +3 位作者 陈帅 张林青 刘方 王岚 《实用预防医学》 CAS 2024年第4期495-497,共3页
目的通过对2017—2019年沙门氏菌菌型分布和耐药情况进行分析,为我省食源性沙门氏菌感染的防控提供参考依据。方法按照《国家食源性疾病监测工作手册》对2017—2019年湖南省食源性腹泻病监测点的样本进行沙门氏菌分离、鉴定、血清学分型... 目的通过对2017—2019年沙门氏菌菌型分布和耐药情况进行分析,为我省食源性沙门氏菌感染的防控提供参考依据。方法按照《国家食源性疾病监测工作手册》对2017—2019年湖南省食源性腹泻病监测点的样本进行沙门氏菌分离、鉴定、血清学分型,对沙门氏菌采用微量肉汤稀释法进行药敏试验。结果2017—2019年共收集7549份样本,检出沙门氏菌533株,检出率为7.06%;533株沙门氏菌中经血清分型,鼠伤寒沙门氏菌最多(占63.8%),为优势血清型;药敏结果显示沙门氏菌对四环素(84.99%)和氨苄西林(80.61%)的耐药率最高,对亚胺培南(0.56%)最敏感;几种常见血清型在14种抗生素中的耐药,鼠伤寒沙门氏菌、德尔卑沙门氏菌、伦敦沙门氏菌、黄金海岸沙门氏菌均对四环素的耐药率最高,肠炎沙门氏菌对萘啶酸的耐药率最高,鼠伤寒沙门氏菌多重耐药情况严重。结论2017—2019年湖南省食源性沙门氏菌感染主要发生在夏秋季,血清型以鼠伤寒沙门氏菌为优势型别,存在多重耐药,其中鼠伤寒沙门氏菌多重耐药严重,应加强持续性多重耐药监测。 展开更多
关键词 沙门氏菌 血清型 药敏分析
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2014—2022年湖南省病人来源猪链球菌2型鉴定及毒力基因分析
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作者 贺子翔 湛志飞 +4 位作者 杨浩 夏昕 陈生宝 刘然 覃迪 《实用预防医学》 CAS 2024年第4期385-389,共5页
目的了解2014—2022年湖南省人感染猪链球菌病病人分离株型别分布与毒力基因携带情况,为人感染猪链球菌病的防控提供依据。方法收集2014—2022年湖南省人感染猪链球菌病临床分离株,通过传统生化反应和聚合酶链反应(polymerase chain rea... 目的了解2014—2022年湖南省人感染猪链球菌病病人分离株型别分布与毒力基因携带情况,为人感染猪链球菌病的防控提供依据。方法收集2014—2022年湖南省人感染猪链球菌病临床分离株,通过传统生化反应和聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)检测猪链球菌种特异性基因16S rRNA,同时用PCR对2型血清型鉴定基因(兼荚膜多糖毒力基因)cps2J和7种毒力基因进行扩增,用毛细管电泳检测扩增产物,分析病人来源猪链球菌的型别与毒力基因携带情况。结果2014—2022年湖南省38株人感染猪链球菌病临床分离株中,1株为羊链球菌,32株为猪链球菌2型,5株生化鉴定为2型的菌株经分子分型鉴定为猪链球菌其他型别。32株猪链球菌2型菌株中,46.88%的菌株携带全部8种毒力基因,40.63%的菌株携带除mrp外的7种毒力基因。携带cps2J、fbps、ef、gdh、orf2、gapdh 6种毒力基因与携带cps2J、sly、gdh、orf2、gapdh 5种毒力基因的菌株均占3.13%,6.25%的菌株携带cps2J、gdh、orf2、gapdh 4种毒力基因。mrp毒力基因阴性菌株中58.82%(10/17)引起脑膜炎和中毒性休克综合征。结论2014—2022年湖南地区猪链球菌病人来源分离株以多毒力基因2型菌株为主,其毒力机制复杂,对人危害大,需引起持续关注。16S rRNA检测与分子分型能弥补猪链球菌生化鉴定的不足。 展开更多
关键词 猪链球菌 聚合酶链反应 毒力基因 人感染猪链球菌病 分子分型
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1例流行性脑脊髓膜炎死亡病例的流行病学及病原学特征分析
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作者 刘然 楼萍 +5 位作者 贺子翔 方明礼 彭水姣 向婧 湛志飞 周奇文 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期899-905,共7页
目的分析2024年湖南省衡阳市1例流行性脑脊髓膜炎(流脑)死亡病例的流行病学及病原学特征分析。方法对死亡病例开展流行病学调查,采集病例及其密切接触者相关标本,进行脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis,Nm)分离培养鉴定、药敏检测、... 目的分析2024年湖南省衡阳市1例流行性脑脊髓膜炎(流脑)死亡病例的流行病学及病原学特征分析。方法对死亡病例开展流行病学调查,采集病例及其密切接触者相关标本,进行脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis,Nm)分离培养鉴定、药敏检测、脉冲场凝胶电泳(PFGE)和基因测序,分析死亡病例的流行病学和病原学特征。基于核心基因组多位点序列分型(cgMLST)进行系统进化分析。结果病例为16岁高中寄宿学生,患暴发型流脑,伴休克症状,发病24 h内死亡。从病例及其室友中分离到6株Nm,分别来自不同的2个分支。死亡病例分离株144569与密切接触者分离株144572高度同源,属于高致病CC4821 L44.1子系,其抗原式为C:P1.7-2,14:F5-101:ST4821(CC4821)。耐药基因分析显示这2株菌存在gyrA-71和penA-552,提示喹诺酮类药物、β-内酰胺酶类药物不敏感,与耐药表型相符。其他4株密切接触者分离株在同一分支,抗原式为B:P1.18-25,9-18:ST5829(UA)。结论该起死亡病例由来自高致病性CC4821 L44.1子系的C群Nm引起。该型菌株的扩散传播存在引起流脑暴发的潜在风险,应加强Nm分子流行病学的监测。青少年间多种型别Nm的传播以致其暴露风险增大,需要引起关注。 展开更多
关键词 流行性脑脊髓膜炎 脑膜炎奈瑟菌 核心基因组多位点序列分型 CC4821
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2018—2022年湖南省儿童腹泻多病原监测及肠道腺病毒基因特征分析 被引量:1
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作者 周帅锋 汪新雨 +11 位作者 黄威 张帆 陆玉颖 姚正才 邵飞 黄超洋 向星宇 戴志辉 赵善露 胡世雄 湛志飞 李世康 《实用预防医学》 CAS 2023年第10期1184-1189,共6页
目的了解湖南省腹泻儿童人腺病毒(human adenovirus,HAdV)与多病原感染的分布,分析2018—2022年湖南省HAdV的病原学及分子流行病学特征。方法收集2018—2022年湖南省哨点医院儿童腹泻标本,用实时荧光定量PCR法检测HAdV及其他腹泻病原,... 目的了解湖南省腹泻儿童人腺病毒(human adenovirus,HAdV)与多病原感染的分布,分析2018—2022年湖南省HAdV的病原学及分子流行病学特征。方法收集2018—2022年湖南省哨点医院儿童腹泻标本,用实时荧光定量PCR法检测HAdV及其他腹泻病原,用一步法单管套式定量实时荧光PCR法和微滴式数字PCR检测腹泻标本中新型冠状病毒。选取HAdV阳性标本进行测序,分析其遗传进化关系。结果2018—2022年共检测1526份样本,有433例样本中检测到病原体,其中55例样本检测到HAdV,包括HAdV单独感染占52.73%(29/55),轮状病毒(rotavirus,Rv)与HAdV双重感染占23.64%(13/55),人类杯状病毒(human calicivirus,HuCV)与HAdV感染占14.55%(8/55),Rv、HuCV与HAdV多重感染占7.27%(4/55)。疫情期间941份标本未发现腹泻病原与SARS-CoV-2共感染病例。HAdV阳性率在不同性别和年龄上差异无统计学意义,新冠感染疫情前和疫情期间HAdV阳性率差异有统计学意义(χ^(2)=11.328,P<0.001),疫情前阳性率较高且型别多样化,不同季节差异有统计学意义,秋季发病最低。经测序分析,HAdV-41是湖南地区最主要的流行支,其次为HAdV-12和HAdV-B型,未发现其余型别。结论HAdV-41是湖南省肠道腺病毒的优势基因型,其多病原感染以HAdV与Rv为主。建议加强SARS-CoV-2及HAdV多病原监测,为HAdV所致儿童腹泻和急性肝炎暴发提前预警,实现精准防控。 展开更多
关键词 人腺病毒 新冠冠状病毒 轮状病毒 感染性腹泻 分子流行病学
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湖南省815株沙门菌血清型和耐药性分析 被引量:1
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作者 刘方 王岚 +3 位作者 湛志飞 张林青 袁青 陈帅 《预防医学》 2023年第2期134-136,140,共4页
目的 了解湖南省815株沙门菌的血清型和耐药性,为沙门菌感染防控提供参考。方法 对从2020—2021年湖南省食源性疾病腹泻患者粪便标本和食品标本分离出的沙门菌进行血清分型,采用微量肉汤稀释法进行药敏试验。结果815株沙门菌分离出10个... 目的 了解湖南省815株沙门菌的血清型和耐药性,为沙门菌感染防控提供参考。方法 对从2020—2021年湖南省食源性疾病腹泻患者粪便标本和食品标本分离出的沙门菌进行血清分型,采用微量肉汤稀释法进行药敏试验。结果815株沙门菌分离出10个血清群39种血清型,646株人源性菌株中B群388株,占60.06%;血清型以鼠伤寒及变种沙门菌为主,364株占56.35%;169株食源性菌株中B群61株,占36.09%;血清型以伦敦沙门菌为主,26株占15.38%。人源性耐药株597株,耐药率为92.41%,对氨苄西林耐药率较高,为81.58%;食源性耐药株140株,耐药率为82.84%,对四环素耐药率较高,为72.78%。两种来源的沙门菌对亚胺培南均敏感。多重耐药株577株,其中人源性多重耐药株490株,食源性多重耐药株87株。结论 2020—2021年湖南省815株从食源性疾病腹泻患者粪便标本和食品标本分离出的沙门菌血清型以鼠伤寒及变种沙门菌和伦敦沙门菌为主,多重耐药情况严重。 展开更多
关键词 沙门菌 血清型 耐药性 多重耐药
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湖南省2例钩端螺旋体病死亡患者流行病学调查报告
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作者 刘方 肖明霞 +1 位作者 曾舸 湛志飞 《实用预防医学》 CAS 2023年第8期975-978,共4页
目的对湖南省2020年报告的2例钩端螺旋体病死亡患者进行流行病学调查。方法采用荧光定量PCR检测其核酸。采用显微凝集试验法对患者的血清进行血清群型的鉴定。采取夹夜法,于2020年10月10日—14日对2例患者田间劳作点附近的周边稻田、土... 目的对湖南省2020年报告的2例钩端螺旋体病死亡患者进行流行病学调查。方法采用荧光定量PCR检测其核酸。采用显微凝集试验法对患者的血清进行血清群型的鉴定。采取夹夜法,于2020年10月10日—14日对2例患者田间劳作点附近的周边稻田、土地等环境进行鼠类宿主动物鼠密度的监测,并进行培养。结果荧光定量PCR结果显示,2例患者钩端螺旋体核酸均为阳性。在患者房屋周边环境中,共布放鼠夹624夹,捕获野鼠16只,平均鼠密度2.56%,鼠肾、水和土壤培养均为阴性。结论2020年报告的2例死亡患者来自湖南省凤凰县,结合流行病学调查、临床症状和实验室结果,认为2例病例为钩体病确诊病例(肺出血型)。应针对性采取防控措施加强疫情监测、对重点人群开展健康教育、加强各级医疗卫生机构开展钩体病防治培训、接种钩端螺旋体疫苗,防止钩体病传播蔓延。 展开更多
关键词 钩端螺旋体 流行病学调查 死亡病例 防制
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湖南省2018年登革热本地暴发流行病学和病毒分子特征分析 被引量:8
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作者 蔡亮 张恒娇 +12 位作者 何方玲 奉雅乐 胡世雄 王娟 刘富强 蒋永林 谭夏林 潘海明 唐宾彬 杨浩 龙浩宇 湛志飞 高立冬 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第12期2119-2124,共6页
目的对湖南省2018年登革热本地暴发疫情进行流行病学及病原学特征研究。方法对报告的8例疑似登革热病例进行实验室诊断,对病例密切接触者搜索出的186例疑似登革热病例和发热病例开展病原学监测,应用C6/36细胞对病例急性期血清开展病毒分... 目的对湖南省2018年登革热本地暴发疫情进行流行病学及病原学特征研究。方法对报告的8例疑似登革热病例进行实验室诊断,对病例密切接触者搜索出的186例疑似登革热病例和发热病例开展病原学监测,应用C6/36细胞对病例急性期血清开展病毒分离,对15株登革病毒株E基因测序,分析病毒的血清型别和基因亚型,构建系统发生树,分析可能的传播来源。在疫点开展蚊媒密度应急监测和健康人群回顾性血清流行病学调查。结果8例疑似病例血清标本,6例登革病毒核酸阳性,4例登革病毒NS1抗原阳性。186例疑似登革热病例,96例病原学检测结果阳性,分离到登革病毒株64株,经鉴定全部为登革病毒2型全球型,来源于广东和浙江省的可能性较大。应急蚊媒密度监测,疫点布雷图指数最高达65,具有极高的登革热传播风险。回顾性调查377名健康人群进行登革热抗体水平监测,IgG抗体阳性率为0.53%(2/377)。结论现场流行病学调查和分子遗传分析提示,湖南省2018年本地暴发疫情由输入性病例引起,由单一的登革病毒2型全球型引起。 展开更多
关键词 登革热 暴发流行 病原学 分子特征
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湖南省人间布鲁氏菌病流行特征及布鲁氏菌溯源调查 被引量:15
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作者 刘志国 王妙 +2 位作者 湛志飞 崔步云 李振军 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期1150-1154,共5页
目的分析2010-2018年湖南省人间布鲁氏菌病(布病)的流行特征,并追溯该地区布病的感染来源,为该地区人间布病防控提供参考。方法采用Excel 2016和ArcGIS 10.5等软件对湖南省2010-2018年人间布病监测数据进行流行病学分析,采用例数、构成... 目的分析2010-2018年湖南省人间布鲁氏菌病(布病)的流行特征,并追溯该地区布病的感染来源,为该地区人间布病防控提供参考。方法采用Excel 2016和ArcGIS 10.5等软件对湖南省2010-2018年人间布病监测数据进行流行病学分析,采用例数、构成比和率描述疫情特征。采用常规分型方法对临床分离的2株布鲁氏菌的种型进行鉴定,采用UTS-PCR复核种型鉴定结果,并对菌株的6个毒力基因进行检测。采用多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)方法对临床分离布鲁氏菌进行聚类分析。结果2010-2018年湖南省共报告人间布病728例,年均发病率为0.12/10万,郴州市和永州市发病率居前,发病率分别为2.50/10万和1.90/10万。发病县(市、区)从2010年的5个增加到2018年的69个。45~54岁年龄组病例最多(279例),占38.32%(279/728),农民占59.07%(430/728),男女性别比为2.75∶1。5-7月报告病例最多,占45.33%(330/728),发病呈明显的夏秋季高发特征,发病高峰在5月。常规鉴定表明临床分离的2株布鲁氏菌是羊种1型布鲁氏菌,UTS-PCR鉴定显示菌株为羊种布鲁氏菌。6个毒力基因均被检出,菌株为强毒株。MLVA分析表明2株菌与来自内蒙古自治区从绵羊和骆驼分离的菌株具有完全相同的基因型。结论湖南省人间布病趋于严峻,疫情向非疫区和普通人群蔓延。湖南省分离的2株羊种布鲁氏菌起源于内蒙古地区。应加强动物转运的检疫检测,防止布病暴发流行。 展开更多
关键词 布病 流行病学 溯源调查
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2009-2018年湖南省甲型H1N1亚型流感病毒监测结果及其全基因组进化分析 被引量:7
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作者 黄一伟 张斯钰 +6 位作者 湛志飞 曾舸 黄超洋 胡世雄 李文超 张红 高立冬 《疾病监测》 CAS 2019年第10期885-890,共6页
目的分析2009-2018年湖南省流感哨点医院甲型H1N1亚型流感监测结果,对分离病毒全基因组进化情况和分子特征进行分析。方法在全省14个市州的23家哨点医院开展流感监测工作,每周每家哨点医院门诊采集5~20份流感样病例的咽拭子标本进行核... 目的分析2009-2018年湖南省流感哨点医院甲型H1N1亚型流感监测结果,对分离病毒全基因组进化情况和分子特征进行分析。方法在全省14个市州的23家哨点医院开展流感监测工作,每周每家哨点医院门诊采集5~20份流感样病例的咽拭子标本进行核酸检测和/或病毒分离。对分离的毒株全基因测序,使用BEAST软件贝叶斯方法构建基因进化树,序列与疫苗株进行比较。结果2009-2018年湖南省流感监测哨点医院共采集流感样病例标本190289份,其中甲型H1N1流感阳性8014份,阳性率为4.21%。时间分布共有7个较明显的流行高峰,峰值以2009年最高。1~5岁(占25.13%)和5~15岁(占32.83%)年龄组所占比重较多,人群男女性别比为1.23∶1。对分离的60株甲型H1N1亚型流感病毒进行同源性分析,与疫苗株相比全基因组序列的同源性在97.2%~99.9%之间。贝叶斯基因进化树呈现阶梯状生长。推断最早的公共祖先出现在2009.177年,平均进化速率为2.695×10-3个替换·位点-1·年-1。贝叶斯天际线模型分析甲型H1N1流感的种群动态2009-2018年间基本维持稳定。表面蛋白选择压力分析dN/dS值为0.201与0.219。表面蛋白血凝素分子的主要变异位点为L8M、S91R、S160G、S181T、A214T、I312V。2株病毒神经氨酸酶分子出现H275Y耐药位点的突变。结论2009-2018年湖南省每年甲型H1N1流感阳性率和甲型H1N1流感所占流感比例各不相同,流行高峰出现在冬季,病例以儿童和少年为主,病毒基因持续变异,种群动态稳定。 展开更多
关键词 流感 甲型H1N1亚型 基因进化 种系发生树
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湖南省首起输入性基孔肯雅热疫情的发现与病原学诊断 被引量:3
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作者 何方玲 张恒娇 +8 位作者 王娟 何舰 龙绪湘 刘蓓 杨锐 胡世雄 湛志飞 蔡亮 高立冬 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2020年第2期175-179,共5页
目的确认湖南省首起输入性基孔肯雅热(Chikungunya fever,CHIK)疫情。方法采集病例和同行人员的血清标本,采用实时荧光定量PCR方法进行登革病毒(Dengue virus,DENV)、黄热病毒(Yellow fever virus,YFV)、基孔肯雅病毒(Chikungunya virus... 目的确认湖南省首起输入性基孔肯雅热(Chikungunya fever,CHIK)疫情。方法采集病例和同行人员的血清标本,采用实时荧光定量PCR方法进行登革病毒(Dengue virus,DENV)、黄热病毒(Yellow fever virus,YFV)、基孔肯雅病毒(Chikungunya virus,CHIKV)核酸检测,对核酸检测阳性病毒标本进行基因序列测定,对测序结果进行生物信息学分析,构建系统进化树。结果病例血清标本CHIKV核酸阳性,5名同行人员中有1人血清标本CHIKV核酸阳性。基因序列Blast比对显示与CHIKV序列同源性>99%。系统进化树显示感染CHIKV属于ECSA基因型。结论通过流行病学调查和病原学检测,确定了湖南省首起输入性CHIK疫情。 展开更多
关键词 基孔肯雅热 基孔肯雅病毒 系统进化树 基因型
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一起疑似炭疽疫苗菌株毒力恢复事件中炭疽芽孢杆菌的毒力鉴定与分析 被引量:4
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作者 张恩民 湛志飞 +6 位作者 魏强 张锡兴 胡艳红 夏昕 万康林 魏建春 高立冬 《疾病监测》 CAS 2019年第1期76-79,共4页
目的对某校疑似炭疽疫苗菌株毒力恢复事件(事件)中,教学实验使用的炭疽芽孢杆菌毒力及其环境污染情况进行鉴定和调查,为合理处理该事件提供参考依据。方法调查事件发生的情况、采集实验用培养物、冻存菌株和实验室环境样本。对实验用培... 目的对某校疑似炭疽疫苗菌株毒力恢复事件(事件)中,教学实验使用的炭疽芽孢杆菌毒力及其环境污染情况进行鉴定和调查,为合理处理该事件提供参考依据。方法调查事件发生的情况、采集实验用培养物、冻存菌株和实验室环境样本。对实验用培养物进行噬菌体裂解和青霉素敏感试验鉴定;选取炭疽芽孢杆菌的rpoB基因和毒力相关的pagA和capC基因,应用TaqMan荧光探针法对采集样本进行检测。结果实验用培养物的噬菌体裂解试验显示有明显的噬菌斑,青霉素敏感试验显示在青霉素纸片周围有明显的抑菌环,并且培养物和冻存菌株rpoB和pagA基因检测为阳性,capC基因检测为阴性;教学场所的环境样本rpoB、pagA和capC基因检测均为阴性。结论该事件中实验用培养物和冻存菌株均为缺少capC基因的减毒炭疽芽孢杆菌,未发现毒力恢复情况;教学场所中无炭疽芽孢杆菌的污染。 展开更多
关键词 炭疽芽孢杆菌 疫苗 毒力恢复 生物安全
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一起一犬伤7人事件的狂犬病病原学诊断及中和抗体检测分析 被引量:1
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作者 蔡亮 于鹏程 +10 位作者 李四海 何方玲 杨浩 陶晓燕 李广兵 刘佳惠 张红 胡世雄 湛志飞 王力华 高立冬 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2018年第3期242-246,共5页
目的对一起一犬伤7人狂犬病突发事件进行病原学诊断,监测暴露后预防处置(post-exposure prophylaxis, PEP)后狂犬病病毒中和抗体(rabies virus neutralizing antibody, RVNA)的保护作用。方法采集伤人犬犬脑组织,应用直接免疫荧... 目的对一起一犬伤7人狂犬病突发事件进行病原学诊断,监测暴露后预防处置(post-exposure prophylaxis, PEP)后狂犬病病毒中和抗体(rabies virus neutralizing antibody, RVNA)的保护作用。方法采集伤人犬犬脑组织,应用直接免疫荧光法(direct immunofluorescence assay, DFA)、巢式PCR法进行病原学诊断,阳性标本进行N基因序列测序,构建系统进化树,生物信息学方法分析N基因特征,与疫苗株进行同源性比较。采集暴露病例第0天、14天、40天血清,快速荧光灶抑制试验(rapid fluorescent focus inhibition test, RFFIT)检测RVNA滴度。结果DFA法、巢式PCR法检测犬脑组织大脑、小脑、海马回均为阳性,病毒属于狂犬病病毒G1型,与疫苗株核苷酸及氨基酸的同源性均在86%以上。血清RVNA均能在0~14 d内呈显著性的增高,效价最低的5.78 IU/ml、最高的26.15 IU/ml,第40天时,效价最高的达51.96 IU/ml。经过1年的随访,7例犬伤者都没有患狂犬病。结论狂犬病暴露后及时进行规范的PEP,能有效地预防狂犬病的发生。 展开更多
关键词 狂犬病 狂犬病病毒 暴露后预防处置 病原学 中和抗体
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不同病原体导致感染性腹泻的症状特征与差异研究 被引量:14
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作者 贺兆锴 汪静 +18 位作者 孙昊 苏佳 刘翔 古文鹏 于德山 罗隆泽 王鸣柳 胡彬 胡万富 童晶 杨梦 王少玲 汪春翔 王艳玲 湛志飞 段然 秦帅 景怀琦 王鑫 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第8期1328-1334,共7页
目的了解不同病原体导致感染性腹泻相关症状的特征与区别。方法基于2010-2016年我国20个省份的腹泻症候群感染性腹泻病原学监测,收集因急性腹泻就诊的门急诊病例,调查病例基本信息、采集粪便标本,进行共22种常见致泻病原体的病原学检测... 目的了解不同病原体导致感染性腹泻相关症状的特征与区别。方法基于2010-2016年我国20个省份的腹泻症候群感染性腹泻病原学监测,收集因急性腹泻就诊的门急诊病例,调查病例基本信息、采集粪便标本,进行共22种常见致泻病原体的病原学检测,分析不同病原体导致患者腹泻的临床症状模式特征。结果共收集腹泻就诊病例38950例。分别对5种致泻病毒核酸检测,轮状病毒阳性率最高(18.29%),其次为诺如病毒(13.06%);对17种致泻细菌分离培养,致泻性大肠埃希菌分离率最高(6.25%)。细菌性与病毒性腹泻的临床特征差异主要体现在粪便性状与便常规检验结果,但致病性弧菌感染与病毒性腹泻较为相似。结论不同病原体导致感染性腹泻的症状存在不同的特征,可为临床诊断提供依据。 展开更多
关键词 感染性腹泻 细菌 病毒 症状
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3型腺病毒免提取核酸重组酶介导的等温扩增实时荧光检测方法的建立及应用 被引量:5
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作者 王瑞欢 张益 +10 位作者 向星宇 湛志飞 李鑫娜 申辛欣 朱贞 张瑞卿 白雪丁 段青霞 凡国豪 张红 马学军 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2019年第6期653-657,共5页
目的 建立3型腺病毒(human adenovirus 3,HAdV-3)免提取核酸的重组酶介导的等温扩增(recmbinase acid amplification,RAA)实时荧光检测方法。方法 根据HAdV-3基因保守序列分别设计1对引物和1条探针,通过对免提核酸的条件摸索和优化,建立... 目的 建立3型腺病毒(human adenovirus 3,HAdV-3)免提取核酸的重组酶介导的等温扩增(recmbinase acid amplification,RAA)实时荧光检测方法。方法 根据HAdV-3基因保守序列分别设计1对引物和1条探针,通过对免提核酸的条件摸索和优化,建立1种免提取核酸,重组酶介导的等温扩增实时荧光检测方法;通过对培养的毒株进行系列稀释,免提取核酸分析该方法的灵敏度;通过检测其他呼吸道病毒的原始样本,评价该方法的特异性;并检测HAdV-3临床样本,与传统的提核酸实时荧光定量PCR方法进行比较。结果 本研究建立的免提取核酸实时荧光RAA方法对10倍系列稀释的HAdV-3毒株进行检测,和实时荧光定量PCR方法相比,灵敏度相当,对应的最低浓度稀释样本的Ct值为36.87,对常见其他型别的呼吸道病毒检测无交叉反应。两种方法对56例HAdV-3阳性临床样本同时检测,结果完全一致。结论 本文首次报道了免提取核酸的实时荧光RAA检测HAdV-3的方法,该方法具有较高的灵敏度和特异性,适合应用于临床实验室及基层单位快速检测HAdV-3。 展开更多
关键词 腺病毒3型 免提取核酸 重组酶介导的等温扩增 检测
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一起家庭聚集性发热伴血小板减少综合征疫情的流行病学及病原学分析 被引量:3
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作者 王娟 蔡亮 +5 位作者 杨浩 何方玲 胡兴平 胡世雄 湛志飞 高立冬 《疾病监测》 CAS CSCD 北大核心 2021年第7期729-733,共5页
目的对一起家庭聚集性发热伴血小板减少综合征(SFTS)疫情的流行病学和病原学进行分析,为疾病防控及监测方案的制定提供参考。方法对2例SFTS病例开展流行病学调查,对其居家周围的人群及宿主动物进行监测,通过酶联免疫吸附试验(ELISA)和... 目的对一起家庭聚集性发热伴血小板减少综合征(SFTS)疫情的流行病学和病原学进行分析,为疾病防控及监测方案的制定提供参考。方法对2例SFTS病例开展流行病学调查,对其居家周围的人群及宿主动物进行监测,通过酶联免疫吸附试验(ELISA)和实时荧光定量PCR方法对病例、动物血清及蜱进行血清学和病原学检测,对病例和蜱进行疾病关联分析,对核酸阳性标本进行SFTS病毒的S、M、L基因测序,构建系统进化树。结果2例病例SFTS病毒IgM及总抗体均为阳性,其中1例核酸检测阴性。45份健康人群血清标本中,3份SFTS病毒抗体阳性,6只犬(含病例家养犬)和4只羊血清SFTS病毒总抗体均为阳性,4头猪血清总抗体阴性。10只蜱中,仅在病例家养犬寄生的蜱标本中检测到SFTS病毒核酸,基因序列测定显示SFTS病例株与蜱株均包含S、M、L片段,两者高度同源,核苷酸同源性为99.9%~100.0%。结论本起家庭聚集性SFTS疫情的发生与病例家养犬及其寄生蜱高度关联。 展开更多
关键词 发热伴血小板减少综合征 流行病学 病原学 系统进化
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湖南省食源性环丙沙星-头孢噻肟-阿奇霉素共耐药汤卜逊沙门菌分子特征研究 被引量:1
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作者 陆咪 翟卫帅 +5 位作者 杜鹏程 汪洋 湛志飞 陈帅 贾华云 白莉 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期1745-1750,共6页
目的分析湖南省人源和水产动物源环丙沙星-头孢噻肟-阿奇霉素共耐药汤卜逊沙门菌的分子流行特征。方法对湖南省食源性疾病散发病例粪便样本和水产品样本中分离的汤卜逊沙门菌进行环丙沙星-头孢噻肟-阿奇霉素共耐药菌株的筛选与鉴定,使... 目的分析湖南省人源和水产动物源环丙沙星-头孢噻肟-阿奇霉素共耐药汤卜逊沙门菌的分子流行特征。方法对湖南省食源性疾病散发病例粪便样本和水产品样本中分离的汤卜逊沙门菌进行环丙沙星-头孢噻肟-阿奇霉素共耐药菌株的筛选与鉴定,使用肉汤稀释法对11种抗菌药进行体外药敏试验,并利用全基因组测序技术分析菌株的耐药机制以及进化关系。结果从粪便样本和水产品样本中共分离到19株汤卜逊沙门菌,其中9株菌对环丙沙星-头孢噻肟-阿奇霉素共耐药。进一步分析发现8株菌检出IncC质粒,携带质粒介导的喹诺酮类药物耐药基因qepA-qnrS1、β-内酰胺酶耐药基因bla_(CMY-2)和大环内酯类耐药基因mph(A);1株检出IncR质粒,携带qnrB4-aac(6′)-Ib-cr、bla_(OXA-10)和mph(A)耐药基因。遗传环境分析发现qnrS1、qepA、mph(A)和bla_(CMY-2)基因可能分别通过插入序列ISKra4、IS91、IS6100和ISEcp1整合到耐药菌的基因组上。基于核心基因组生成的系统发生树表明,人源和水产动物源环丙沙星-头孢噻肟-阿奇霉素共耐药汤卜逊沙门菌属于同一进化分支,具有较近的遗传进化关系。结论湖南省人源和水产动物源样本中检出对环丙沙星-头孢噻肟-阿奇霉素共耐药汤卜逊沙门菌,提示此类多重耐药菌已在人和水产动物之间传播。 展开更多
关键词 汤卜逊沙门菌 食源性疾病 耐药性 分子流行特征
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An improved Landsat Image Mosaic of Antarctica 被引量:5
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作者 HUI FengMing CHENG Xiao +11 位作者 LIU Yan zhanG YanMei YE YuFang WANG XianWei LI zhan WANG Kun zhan zhifei GUO JianHong HUANG HuaBing LI XiuHong GUO ZiQi GONG Peng 《Science China Earth Sciences》 SCIE EI CAS 2013年第1期1-12,共12页
A revised Landsat Image Mosaic of Antarctica (LIMA) is presented, using the 1073 multi-band scenes of the original Land- sat-7 ETM+ LIMA image collection available at the United States Geological Survey (USGS: h... A revised Landsat Image Mosaic of Antarctica (LIMA) is presented, using the 1073 multi-band scenes of the original Land- sat-7 ETM+ LIMA image collection available at the United States Geological Survey (USGS: http://lima.usgs.gov/). Three improvements have been applied during the data processing: (1) DN saturation is adjusted by adopting a linear regression, which has a lower root mean square error than the ratio regression used by LIMA; (2) solar elevation angle is calculated using pixel-level latitude/longitude and the acquisition time and date of the central pixel of the scene, improving slightly upon the bi- linear interpolation of the solar elevation angles of scene comers applied in LIMA; and (3) two additional image bands, Band 5 and Band 7, are sharpened using the panchromatic band (Band 8) and a Gram-Schmidt Spectral Sharpening algorithm to more easily distinguish snow, cloud and exposed rocks. The final planetary reflectance product is stored in 16-bit bands to preserve the full radiometric content of the scenes. A comparative statistical analysis among 12 sample regions indicates that the new mosaic has enhanced visual qualities, information entropy, and information content for land cover classification relative to LIMA. 展开更多
关键词 LANDSAT ANTARCTICA ice sheet MOSAIC remote sensing
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2019-2020年湖南省鼠类携带汉坦病毒情况调查及其基因特征研究
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作者 熊亚茹 何方玲 +6 位作者 王娟 刘荣娇 湛志飞 贾华云 孙倩莱 陈生宝 蔡亮 《热带医学杂志》 CAS 2024年第10期1367-1371,1383,I0001,共7页
目的探究湖南省5个省级肾综合征出血热(HFRS)监测点鼠类携带汉坦病毒情况及病毒的遗传进化特征,为HFRS的科学防控提供参考依据。方法2019-2020年采用夹夜法分别在湖南省5个省级HFRS监测点(宁乡市、浏阳市、炎陵县、邵东市、双峰县)捕鼠... 目的探究湖南省5个省级肾综合征出血热(HFRS)监测点鼠类携带汉坦病毒情况及病毒的遗传进化特征,为HFRS的科学防控提供参考依据。方法2019-2020年采用夹夜法分别在湖南省5个省级HFRS监测点(宁乡市、浏阳市、炎陵县、邵东市、双峰县)捕鼠并分离鼠肺样品,采用Real-time PCR技术开展病原检测,据此对毒株进行分型和基因测序,通过序列分析和构建系统发生树等方式解析汉坦病毒的遗传进化特征。结果不同监测点均仅检出了一种汉坦病毒毒株,阳性率分别为双峰县(15.24%)>宁乡市(5.13%)>浏阳市(4.17%)>邵东市(3.09%)>炎陵县(2.00%);汉滩型病毒(HTNV)和汉城型病毒(SEOV)的宿主分别为褐家鼠和黑线姬鼠,且前者(6.83%)的检出率远高于后者(1.86%);不同监测点HTNV的大(L)、中(M)、小(S)基因片段和编码区长度一致,各分离株之间M基因的序列一致性为96%~100%,与参比株M基因的序列一致性为88%~98%;不同SEOV的各基因片段长度及编码氨基酸数量也无差异,各分离株之间及其与参比株M基因的序列一致性分别为93%~100%和83%~97%。结论湖南省鼠类主要携带HTNV和SEOV两种型别汉坦病毒毒株,虽然已发生一定程度遗传变异,但当前未监测到“宿主转换”现象,推测鼠类宿主中汉坦病毒大规模流行的风险较低。 展开更多
关键词 汉坦病毒 基因测序 遗传变异
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