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Maize 6H-60K芯片在玉米实质性派生品种鉴定中的应用分析 被引量:1
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作者 田红丽 张如养 +6 位作者 范亚明 杨扬 张云龙 易红梅 邢锦丰 王凤格 赵久然 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期2876-2885,共10页
玉米实质性派生品种鉴定已成为当前种业知识产权保护的热点之一。为加快其精准高效分子鉴定技术的建立,本文利用多种类型派生品种为研究材料:京2416与京2416C(两者为遗传背景高度相近的两个自交系),京724与京72464(两者为遗传背景相近... 玉米实质性派生品种鉴定已成为当前种业知识产权保护的热点之一。为加快其精准高效分子鉴定技术的建立,本文利用多种类型派生品种为研究材料:京2416与京2416C(两者为遗传背景高度相近的两个自交系),京724与京72464(两者为遗传背景相近的两个自交系),以及由京724与京72464两者构建的893个DH系遗传群体等。研究分析了Maize 6H-60K芯片(包含61,214个SNP位点集合)应用于玉米派生品种鉴定的潜力。结果显示:(1)京2416与京2416C间存在829个SNP位点差异,GS值(遗传相似度)为98.7%,56.7%的差异位点集中分布在5号染色体长度约39 Mb区域内。(2)京724与京72464之间差异位点数目为4912个,GS值为90.1%,44.8%的差异位点集中分布在3号染色体上。(3)893个DH系与2个亲本京724及京72464之间的GS值分布均呈现连续性,其中与京724之间的GS值范围88.0%-97.0%,平均值为92.6%;与京72464之间的GS值范围88.3%-98.6%,平均值为94.5%。(4)893个DH系进行两两成对比较,共比较398,278‬对,所有DH系之间均有明确的SNP位点差异;GS值最小为87.5%,最大为99.9%,平均值为94.3%。结果表明Maize 6H-60K包含的SNP位点集能够精准评估派生、近似或极近似自交系及DH系的遗传背景,将所有材料一一鉴别明确区分开来,并具有进一步锁定与派生性状连锁标记的潜力。建议亟需基于Maize 6H-60K SNP位点集合,利用高效芯片、靶向测序等平台建立玉米实质性派生品种分子鉴定技术规程,为玉米品种知识产权保护、品种创新等提供技术支撑。 展开更多
关键词 玉米 实质性派生品种 分子鉴定 Maize 6H-60K芯片 高密度SNP位点集合
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玉米矮秆基因与矮秆育种研究 被引量:1
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作者 王天依 王荣焕 +7 位作者 王夏青 张如养 徐瑞斌 焦炎炎 孙轩 王继东 宋伟 赵久然 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期43-51,共9页
株高是影响玉米株型和种植密度的重要农艺性状,培育耐密植的矮秆/半矮秆新品种可为增产做贡献。但目前多数矮秆突变体单株产量损失较大,难以在育种中应用。因此,探究玉米株高的调控机制、挖掘株高基因的优良等位变异,从而改善玉米株型... 株高是影响玉米株型和种植密度的重要农艺性状,培育耐密植的矮秆/半矮秆新品种可为增产做贡献。但目前多数矮秆突变体单株产量损失较大,难以在育种中应用。因此,探究玉米株高的调控机制、挖掘株高基因的优良等位变异,从而改善玉米株型结构、提高群体光能利用率、增强群体对水肥的耐性,对提高玉米产量尤为重要。本文综述了目前挖掘到的株高数量性状位点,阐述了株高相关基因主要受植物激素、微管结合蛋白以及成花因子调节;概述了Brachytic2(Br2)基因在玉米矮秆育种研究中的应用及其局限性;最后展望了矮秆有利等位基因及其分子标记和现代生物技术在矮秆种质资源创制中的重要价值。本文将为玉米株高的遗传机制解析以及矮秆玉米分子育种奠定基础。 展开更多
关键词 玉米 矮秆 分子机制 育种
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StEFR1正调控马铃薯对晚疫病的抗性
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作者 张卫娜 余慧芳 +7 位作者 安珍 柳文凯 康益晨 石铭福 杨昕宇 张茹艳 王勇 秦舒浩 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期996-1005,共10页
马铃薯晚疫病是毁灭性卵菌病害,对我国乃至全球的农业生产造成巨大的经济损失。本试验结合生物信息学分析、表达模式和功能验证,分析了LRR-RLK家族成员StEFR1调控晚疫病抗性的作用和潜在的调控机制。进化分析表明,StEFR1与拟南芥中功能... 马铃薯晚疫病是毁灭性卵菌病害,对我国乃至全球的农业生产造成巨大的经济损失。本试验结合生物信息学分析、表达模式和功能验证,分析了LRR-RLK家族成员StEFR1调控晚疫病抗性的作用和潜在的调控机制。进化分析表明,StEFR1与拟南芥中功能已知的AtEFR序列相似度为53.9%。接种晚疫病菌3 d和elf18处理3 h,‘大西洋’离体叶片中StEFR1的表达分别上调至对照的1.87倍和2.31倍。瞬时过表达StEFR1的叶片受到晚疫病菌侵染时抗性增强,表现在叶片病斑面积较对照减小,而叶片细胞活性较对照增强。此外,与野生型相比,过表达StEFR1的叶片中3个PTI标记基因、SA和JA信号通路相关基因差异表达,且呈不同程度的显著上调,而ET信号通路相关基因的表达量无明显变化。综上所述,StEFR1参与晚疫病菌诱导的PTI抗性,且调控SA和JA激素信号相关基因的表达,对晚疫病起正调控作用。本文为深入研究StEFR1调控晚疫病免疫反应的分子机制奠定了基础,并为晚疫病分子育种研究提供重要参考。 展开更多
关键词 马铃薯晚疫病 LRR-RLK家族 激素信号 标记基因 差异表达
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玉米骨干自交系京2416的选育与应用 被引量:13
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作者 赵久然 王元东 +3 位作者 宋伟 张如养 李春辉 刘新香 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期1051-1057,共7页
京2416是北京市农林科学院玉米研究中心以京24和5237两个优良黄改系构建(京24×5237)×京24基础材料,利用同群优系聚合和"高大严"自交系选育方法,创制选育出的优良黄改群自交系。具有熟期早、脱水快、耐干旱、抗高温... 京2416是北京市农林科学院玉米研究中心以京24和5237两个优良黄改系构建(京24×5237)×京24基础材料,利用同群优系聚合和"高大严"自交系选育方法,创制选育出的优良黄改群自交系。具有熟期早、脱水快、耐干旱、抗高温、株型紧凑、叶色浓绿、适宜性广、散粉性好、自身产量及配合力高等多方面优点。利用该自交系育成并通过审定的玉米杂交种已有21个,种植面积100万亩以上的杂交种有京农科728、NK718、MC121、MC812等,其中京农科728为我国首批通过籽粒机收审定的玉米品种,并作为我国黄淮海区玉米籽粒机收组区域试验对照品种。京2416已经成为国家玉米良种重大攻关、国家玉米产业技术体系、七大农作物育种等多个重点项目及育种平台研究应用的骨干自交系。 展开更多
关键词 玉米 自交系 京2416 品种选育
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玉米抗禾谷镰孢菌穗粒腐病种质资源鉴定 被引量:5
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作者 苏爱国 王帅帅 +5 位作者 段赛茹 张如养 邢锦丰 杨扬 宋伟 赵久然 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期971-978,共8页
穗粒腐病是玉米主产区普遍发生的穗部真菌性病害,发掘优异的抗性种质资源和选育优良抗病品种,是防治玉米穗粒腐病最为经济有效的措施。本研究采用针刺果穗注射接种法,在北京通州和小汤山两个试验点,对国内外324份玉米自交系种质资源进... 穗粒腐病是玉米主产区普遍发生的穗部真菌性病害,发掘优异的抗性种质资源和选育优良抗病品种,是防治玉米穗粒腐病最为经济有效的措施。本研究采用针刺果穗注射接种法,在北京通州和小汤山两个试验点,对国内外324份玉米自交系种质资源进行禾谷镰孢菌抗性鉴定。综合2个试验点的抗性评价结果,鉴定到了9份禾谷镰孢菌穗粒腐病表现高抗的自交系,分别为OQ603、百黄混、PI 539921、Mo17、PI 406119、F321、X178、B09和PHG39。有48份自交系对禾谷镰孢菌的穗粒腐病抗性,在2个试验点均为抗级以上(包括高抗和抗)。从不同种质类群自交系的抗性分布情况来看,P群种质整体上表现出较强的抗性,Iodent群和X群次之,而在其他类群中抗性分布趋势并不明显。这些自交系的鉴定,丰富了我国玉米穗粒腐病抗性种质资源,也为抗病育种和理论研究奠定了基础。 展开更多
关键词 玉米 穗粒腐 禾谷镰孢菌 抗性鉴定 类群
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玉米骨干自交系黄早四的来源探究 被引量:4
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作者 赵久然 李春辉 +5 位作者 张如养 刘新香 李志勇 石子 王帅帅 宋伟 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期1-6,共6页
玉米骨干自交系黄早四育成于20世纪70年代,具有适应性强、配合力高、株型紧凑、生育期短、灌浆速度快等优点。以其为基础材料选育衍生出数以百计的黄改系,形成我国特有的黄改群(或称塘四平头群)核心种质群。利用黄早四及其衍生系组配的... 玉米骨干自交系黄早四育成于20世纪70年代,具有适应性强、配合力高、株型紧凑、生育期短、灌浆速度快等优点。以其为基础材料选育衍生出数以百计的黄改系,形成我国特有的黄改群(或称塘四平头群)核心种质群。利用黄早四及其衍生系组配的杂交种已累计推广应用数十亿亩,包括目前的主导大品种郑单958、京科968等。该系在我国玉米育种史中发挥了极其重要作用,但黄早四的系谱尚未明确、来源尚不清晰。本文根据历史上所描述的黄早四选育过程,推断黄早四是由白粒的塘四平头自交系与另一个熟期更早、籽粒颜色为黄色的玉米材料"串粉"杂交,又在塘四平头自交系繁殖田中得到回交,再经人工自交选育而成。利用40对SSR核心引物对黄早四、塘四平头及1970年代初种植的9份黄粒农家种或自交系进行DNA分子指纹比对,发现黄早四与塘四平头自交系有28个位点指纹完全相同,而在剩余的12个位点中仅黄四平头与黄早四具有完全的共同带型。全基因组IBD遗传结构分析结果进一步表明,塘四平头是黄早四的主要供体,黄四平头是其另一个亲本来源。经表型形态性状契合比对,证明黄早四的表型特征和农艺性状表现符合塘四平头与黄四平头两者杂交选系的结果。破解了黄早四自交系的来源之谜。 展开更多
关键词 玉米 自交系 黄早四 系谱来源
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不同杂种优势群玉米自交系籽粒灌浆和脱水速率评价 被引量:4
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作者 徐田军 张勇 +9 位作者 赵久然 王荣焕 吕天放 刘宏伟 刘月娥 蔡万涛 张如养 宋伟 邢锦丰 王元东 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期1595-1605,共11页
以京2416等7个不同杂种优势群共43份玉米骨干自交系为试验材料,研究并明确其籽粒灌浆和脱水速率差异,旨在为选育灌浆脱水快的玉米品种提供参考和指导。结果表明:(1)不同杂种优势群玉米自交系产量平均为4504.29 kg/hm^(2),其中京724产量... 以京2416等7个不同杂种优势群共43份玉米骨干自交系为试验材料,研究并明确其籽粒灌浆和脱水速率差异,旨在为选育灌浆脱水快的玉米品种提供参考和指导。结果表明:(1)不同杂种优势群玉米自交系产量平均为4504.29 kg/hm^(2),其中京724产量最高;不同杂种优势群间表现为X群>改良Ried群>黄改群>Reid群>Iodent群>P群>旅大红骨群。(2)灌浆速率平均为0.68 g/100-grain/d,其中京2416最高,较郑58和PH6WC分别高0.28 g/100-grain/d和0.19 g/100-grain/d,增幅为46.67%和27.54%;不同杂种优势间表现为X群>Reid群>Iodent群>黄改群>改良Reid群>旅大红骨群>P群。(3)收获期籽粒含水率平均为22.44%,其中京2416为18.91%,较郑58和PH6WC低6.34个百分点和3.18个百分点;生理成熟后籽粒脱水速率平均为0.65%/d,其中京2416最高,较郑58和PH6WC高78.26%和17.14%;不同杂种优势间表现为X群>Iodent群和Reid群>黄改群>旅大红骨群>改良Ried群>P群。(4)对参试玉米骨干自交系的籽粒灌浆速率和脱水速率进行系统聚类分析发现,京2416、京B547、京MC01、京72464灌浆速率和脱水速率均较高。(5)相关分析表明,玉米自交系产量与籽粒灌浆速率、干物质转运率呈极显著正相关,收获时籽粒含水率与生理成熟后籽粒脱水速率呈极显著负相关,生理成熟后籽粒脱水速率与灌浆速率呈极显著正相关。由此可见,X群自交系的籽粒灌浆和脱水速率均高于其他杂种优势群;黄改群骨干自交系京2416熟期最早,且灌浆和脱水速率均为最高,对培育早熟宜粒收玉米新品种具有重要的育种价值。 展开更多
关键词 杂种优势群 玉米自交系 籽粒灌浆和脱水速率 评价
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生物统计学本科生SAS软件高级编程教学的探索与实践 被引量:4
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作者 张汝阳 魏永越 +2 位作者 赵杨 于浩 陈峰 《教育教学论坛》 2017年第52期114-116,共3页
生物统计学专业旨在培养高素质的复合型统计应用人才。SAS软件高级编程是优秀生物统计学人才的必备技能。因此,SAS软件高级编程教学对专业人才培养至关重要。目前,国内开设生物统计学专业的医学院校屈指可数,且SAS软件高级编程教学经验... 生物统计学专业旨在培养高素质的复合型统计应用人才。SAS软件高级编程是优秀生物统计学人才的必备技能。因此,SAS软件高级编程教学对专业人才培养至关重要。目前,国内开设生物统计学专业的医学院校屈指可数,且SAS软件高级编程教学经验相对缺乏。本文以我校生物统计学本科生的课程教学实践为例,对课程设置、教学内容、授课方式、考核形式、参考教材、软硬件设施和教学效果进行了总结和思考,以期进一步提高教学质量、保障生物统计学本科生的职业竞争力。 展开更多
关键词 生物统计学 本科生 SAS软件高级编程
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增加hCG扳机剂量在卵巢低反应患者中的应用
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作者 宋昀杰 张园 +8 位作者 夏心如 夏梦 吴畏 黄洁 刁飞扬 冒韵东 刘嘉茵 张汝阳 马翔 《国际生殖健康/计划生育杂志》 CAS 2021年第6期441-445,共5页
目的:探讨增加人绒毛膜促性腺激素(human chorionic gonadotrophin,hCG)扳机剂量对体外受精/卵细胞质内单精子注射-胚胎移植(in vitro fertilization/intracytoplasmic sperm injection-embryo transfer,IVF/ICSI-ET)周期中低反应患者... 目的:探讨增加人绒毛膜促性腺激素(human chorionic gonadotrophin,hCG)扳机剂量对体外受精/卵细胞质内单精子注射-胚胎移植(in vitro fertilization/intracytoplasmic sperm injection-embryo transfer,IVF/ICSI-ET)周期中低反应患者促性腺激素释放激素激动剂(gonadotropin releasing hormone agonist,GnRHa)长方案鲜胚移植周期临床结局的影响。方法:回顾性分析2018年1月—2021年3月在我院生殖医学科拟行IVF/ICSI使用GnRHa长方案助孕周期中409例卵巢低反应患者的临床资料。根据hCG日扳机剂量分为2组,常规剂量组(n=337)采用常规艾泽6500 U扳机,增加剂量组(n=72)采用hCG10000 U或hCG 2000 U联合艾泽6500U扳机。比较2组患者的获卵数、获卵率,MⅡ率、2PN率、可移植胚胎数、优质胚胎数、临床妊娠率、胚胎植入率、流产率和卵巢过度刺激综合征(OHSS)发生率。结果:2组获卵数、获卵率、MⅡ率、2PN率、可移植胚胎数、优质胚胎数和流产率比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。增加剂量组的临床妊娠率(55.56%vs.42.73%,P=0.047)和胚胎植入率(50.51%vs.37.88%,P=0.021)高于常规剂量组。2组均未发生OHSS。结论:增加hCG扳机剂量可提高卵巢低反应患者GnRHa长方案新鲜周期移植的胚胎植入率和临床妊娠率,相对安全可行,是一种值得推荐的扳机方案。 展开更多
关键词 促性腺素释放激素 绒毛膜促性腺激素 体外受精 胚胎移植 卵巢
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Exploring differentially expressed genes associated with fertility instability of S-type cytoplasmic male-sterility in maize by RNA-seq 被引量:5
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作者 SU Ai-guo SONG Wei +7 位作者 SHI Zi ZHAO Yan-xin XING Jin-feng zhang ru-yang LI Chun-hui LUO Mei-jie WANG Ji-dong ZHAO Jiu-ran 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2017年第8期1689-1699,共11页
The germplasm resources for the S-type male sterility is rich in maize and it is resistant to Bipolaris maydis race T and CI, but the commercial application of S-type cytoplasmic male sterility (CMS-S) in maize hybr... The germplasm resources for the S-type male sterility is rich in maize and it is resistant to Bipolaris maydis race T and CI, but the commercial application of S-type cytoplasmic male sterility (CMS-S) in maize hybrid industry is greatly compromised because of its common fertility instability. Currently, the existence of multiple minor effect loci in specific nuclear genetic backgrounds was considered as the molecular mechanism for this phenomenon. In the present study, we evaluated the fertility segregation of the different populations with the fertility instable material FIL-H in two environments of Beijing and Hainan, China. Our results indicated that the fertility instability of FIL-H was regulated by multiple genes, and the expression of these genes was sensitive to environmental factors. Using RNA sequencing (RNA-seq) technology, transcriptomes of the sterile plants and partially fertile plants resulted from the backcross of FIL-HxJing 724 in Hainan were analyzed and 2 108 genes with different expression were identified, including 1 951 up-regulated and 157 down-regulated genes. The cluster analysis indicated that these differentially expressed genes (DEGs) might play roles in many biological processes, such as the energy production and conversion, carbohydrate metabolism and signal transduction. In addition, the path- way of the starch and sucrose metabolism was emphatically investigated to reveal the DEGs during the process of starch biosynthesis between sterile and partially fertile plants, which were related to the key catalytic enzymes, such as ADP-G pyrophosphorylase, starch synthase and starch branching enzyme. The up-regulation of these genes in the partially fertile plant may promote the starch accumulation in its pollen. Our data provide the important theoretical basis for the further exploration of the molecular mechanism for the fertility instability in CMS-S maize. 展开更多
关键词 CMS-S fertility instability RNA-SEQ DEGs
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玉米自交系京724和郑58的产量配合力及杂种优势研究 被引量:9
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作者 张如养 宋伟 +3 位作者 赵久然 王继东 孙轩 吉玉龙 《玉米科学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期1-6,13,共7页
以优良玉米自交系京724和郑58为试材,采用NCII遗传交配设计,以京92、京2416、昌7-2、黄早四、京24、Lx9801等14个黄改群自交系为测验种,杂交组配所得28个杂交组合,调查测定杂交组合和自交系的子粒产量,分析京724和郑58与黄改群自交系的... 以优良玉米自交系京724和郑58为试材,采用NCII遗传交配设计,以京92、京2416、昌7-2、黄早四、京24、Lx9801等14个黄改群自交系为测验种,杂交组配所得28个杂交组合,调查测定杂交组合和自交系的子粒产量,分析京724和郑58与黄改群自交系的产量配合力及杂交种的杂种优势特性。结果表明,自交系京724子粒产量的一般配合力效应值为7.03,极显著高于郑58;杂交组合京724/京92(京科968)子粒产量的特殊配合力相对效应值在全部组合中最高,达23.71。京724与系列黄改系组配组合的子粒产量均值显著高于郑58所配组合;京724与系列黄改系所配组合的超标优势均值显著高于郑58所配组合;京科968的杂种优势指数与郑单958相当。 展开更多
关键词 玉米 京724 郑58 配合力 杂种优势
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玉米自交系京2416×京92改良后代收获时子粒含水量配合力分析 被引量:3
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作者 孙轩 吉玉龙 +4 位作者 张如养 王继东 王夏青 宋伟 赵久然 《玉米科学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期1-7,16,共8页
利用玉米黄改群自交系京2416和京92及其213个改良后代为基础材料,以京464、京724、京MC01为测验种,采用NCII杂交设计方法,杂交组配得到645个组合,调查杂交组合收获时子粒含水量,分析213个改良后代收获时子粒含水量的配合力及遗传特性。... 利用玉米黄改群自交系京2416和京92及其213个改良后代为基础材料,以京464、京724、京MC01为测验种,采用NCII杂交设计方法,杂交组配得到645个组合,调查杂交组合收获时子粒含水量,分析213个改良后代收获时子粒含水量的配合力及遗传特性。结果表明,收获时子粒含水量一般配合力优于原始高值亲本的自交系有京2416J92-049等68个,特殊配合力优于原始高值亲本的杂交组合有京2416J92-192×京464、京2416J92-210×京724、京2416J92-009×京MC01等177个。结合一般配合力和特殊配合力筛选出京2416J92-192×京464、京2416J92-210×京724、京2416J92-200×京MC01等57个优良杂交组合。通过遗传参数分析表明,收获时子粒含水量的广义遗传率为73.70%,狭义遗传率为65.82%,可以进行早代选择。 展开更多
关键词 玉米 改良自交系 收获时子粒含水量 配合力
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多组学数据整合分析的统计方法研究进展 被引量:5
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作者 沈思鹏 张汝阳 +1 位作者 魏永越 陈峰 《中华疾病控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第8期763-765,771,共4页
复杂疾病往往是由环境因素、遗传因素(多个组学层面)共同作用所致。全面分析不同分子水平的信息对认识疾病的发生发展至关重要。多组学数据整合分析能够提高特征筛选检验效能、改善疾病预测精度。本文从统计学角度出发,对多组学数据整... 复杂疾病往往是由环境因素、遗传因素(多个组学层面)共同作用所致。全面分析不同分子水平的信息对认识疾病的发生发展至关重要。多组学数据整合分析能够提高特征筛选检验效能、改善疾病预测精度。本文从统计学角度出发,对多组学数据整合分析的统计理论方法研究进展做一述评。 展开更多
关键词 多组学数据 整合分析 统计方法
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