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电针对血管性认知障碍大鼠脑功能局部一致性的效果 被引量:7
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作者 丁妍怡 张胜行 +5 位作者 刘雨露 余燕 杨敏光 梁胜祥 柳维林 陶静 《中国康复理论与实践》 CSCD 北大核心 2022年第1期55-61,共7页
目的观察电针百会、神庭对血管性认知障碍(VCI)大鼠脑区功能活动和工作记忆的影响。方法18只Sprague-Dawley大鼠,其中12只结扎双侧颈总动脉造模,假手术组6只不结扎。造模大鼠随机分为模型组(n=6)和电针组(n=6),电针组电针百会和神庭,共... 目的观察电针百会、神庭对血管性认知障碍(VCI)大鼠脑区功能活动和工作记忆的影响。方法18只Sprague-Dawley大鼠,其中12只结扎双侧颈总动脉造模,假手术组6只不结扎。造模大鼠随机分为模型组(n=6)和电针组(n=6),电针组电针百会和神庭,共4周。干预前后采用Y迷宫、Morris水迷宫进行评定;干预后行静息态功能磁共振成像扫描,计算局部一致性(ReHo)。结果干预前,与假手术组相比,模型组和电针组Y迷宫交替率显著降低(P<0.001),Morris水迷宫逃避潜伏期升高(P<0.05);干预后,电针组Y迷宫交替率较模型组增高(P<0.05),Morris水迷宫工作记忆逃避潜伏期降低(P<0.05)。与假手术组相比,模型组双侧海马、嗅觉皮质、感觉皮质、听觉皮质,左侧纹状体ReHo降低;与模型组相比,电针组双侧前额叶、海马、嗅觉皮质,左侧杏仁核ReHo升高。结论电针百会、神庭可改善VCI大鼠工作记忆,可能与调节前额叶、海马、杏仁核等脑区功能活动有关。 展开更多
关键词 血管性认知障碍 电针 工作记忆 局部一致性
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堤坝水下渗漏通道应急封堵方法试验研究 被引量:4
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作者 张盛行 汤雷 +1 位作者 贾宇 罗明锴 《人民长江》 北大核心 2019年第12期169-176,共8页
渗漏是堤坝的高发病害,也是汛期溃堤、溃坝的先兆险情,快速封堵水下渗漏通道对堤坝应急抢险具有重要的工程意义。当前处理渗漏病害的方法多种多样,但针对汛期快速堵漏仍存在各种不足,尤其是对堤坝水下渗漏通道的应急封堵存在不适用性。... 渗漏是堤坝的高发病害,也是汛期溃堤、溃坝的先兆险情,快速封堵水下渗漏通道对堤坝应急抢险具有重要的工程意义。当前处理渗漏病害的方法多种多样,但针对汛期快速堵漏仍存在各种不足,尤其是对堤坝水下渗漏通道的应急封堵存在不适用性。为解决上述问题,提出了一种水下熔化相变材料应急封堵渗漏通道的新方法,研发出相应的水下加热设备并对相变封堵材料进行了测试。通过多次室内水下封堵试验,得出了相变封堵材料水下加热后的熔化规律,总结了相变封堵材料水下熔化后的扩散规律和对渗漏通道封堵机制,验证了该方法用于应急封堵堤坝水下混凝土界面渗漏的可行性。在此基础上开展混凝土面板上渗漏通道封堵的现场试验,结果表明该方法可实现对水下混凝土界面渗漏通道的高效封堵。相关经验可供类似工程运行管理单位及人员借鉴。 展开更多
关键词 堤坝渗漏 水下渗漏封堵 相变材料 熔化过程 加热设备
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复合相变材料性能调配及在应急堵漏中的应用 被引量:2
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作者 张盛行 汤雷 +1 位作者 贾宇 王玉磊 《建筑材料学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第6期1496-1503,共8页
基于“水下熔化相变材料应急封堵渗漏通道”的方法,对不同配比的石蜡松香复合相变材料和硬脂酸松香复合相变材料进行流动性试验和单轴压缩试验,得到相应的材料特性,并选择性能较佳的复合相变材料在土槽模型中进行堵漏试验,分析了其堵漏... 基于“水下熔化相变材料应急封堵渗漏通道”的方法,对不同配比的石蜡松香复合相变材料和硬脂酸松香复合相变材料进行流动性试验和单轴压缩试验,得到相应的材料特性,并选择性能较佳的复合相变材料在土槽模型中进行堵漏试验,分析了其堵漏效果.结果表明:在熔融状态下,随着松香掺量的增加,石蜡-松香复合相变材料的运动黏度呈指数函数的增长趋势,硬脂酸松香复合相变材料的运动黏度呈三次函数的增长趋势;松香的掺入使石蜡和硬脂酸由脆性转变为塑性,且随着松香掺量的增加,复合相变材料屈服应力逐渐增大,材料特性由应变软化转为应变硬化;与纯石蜡相比,松香掺量为20%的石蜡松香复合相变材料封堵用时更短,同周围土体结合更为密实,止水效果更好. 展开更多
关键词 堤坝渗漏 相变材料 流动性 单轴压缩 水下封堵
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相变材料水下自吸式堵漏状态试验研究 被引量:1
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作者 张盛行 汤雷 +1 位作者 贾宇 王玉磊 《水利水运工程学报》 CSCD 北大核心 2019年第5期54-61,共8页
在汛期等极端条件下,渗漏是溃堤、垮坝的先兆险情,及时有效地应急处理渗漏病害是切断堤坝溃决灾害链的关键举措。基于一种水下熔化相变材料应急封堵渗漏通道的新方法,开展了石蜡材料水下熔融、渗漏通道自吸入式封堵的试验研究,分析了其... 在汛期等极端条件下,渗漏是溃堤、垮坝的先兆险情,及时有效地应急处理渗漏病害是切断堤坝溃决灾害链的关键举措。基于一种水下熔化相变材料应急封堵渗漏通道的新方法,开展了石蜡材料水下熔融、渗漏通道自吸入式封堵的试验研究,分析了其封堵效果并总结了相关规律。通过分段量测渗漏通道中的石蜡,经卷积平滑处理出封堵材料沿封堵长度的质量分布曲线,定性描述了石蜡封堵材料在渗漏通道中凝固后的分布情况,并分析了封堵完成后的残余材料。结果表明:封堵过程中,熔融的石蜡材料与周围水体结合良好,易涌入渗漏通道,可实现稳定封堵;封堵长度和有效封堵材料量与初始渗漏流速正相关,封堵线密度随着初始渗漏流速的增加而减小;针对石蜡封堵状态的特征,可将封堵长度划分为碎裂密实段、松散破碎段和断裂密实段。封堵完成后,设备中的残余材料剖面呈楔形状,且残余质量波动幅度较小。 展开更多
关键词 堤坝渗漏 应急封堵 新技术 相变材料 封堵状态
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超声横波成像检测隧洞衬砌质量的响应分析与实践 被引量:1
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作者 杨建喜 张盛行 +2 位作者 汤雷 李军 潘文明 《水利与建筑工程学报》 2022年第6期195-200,共6页
隧洞衬砌内部缺陷精准定量检出一直是工程难点问题,超声横波成像是当前国内外无损检测混凝土缺陷的前沿技术。通过模型试验分析了不同频率下超声横波成像的响应特征,提出隧洞衬砌内部缺陷定量辨识方法。在超声成像图谱中,钢筋、混凝土... 隧洞衬砌内部缺陷精准定量检出一直是工程难点问题,超声横波成像是当前国内外无损检测混凝土缺陷的前沿技术。通过模型试验分析了不同频率下超声横波成像的响应特征,提出隧洞衬砌内部缺陷定量辨识方法。在超声成像图谱中,钢筋、混凝土及缺陷交界面的色彩区分度明显;当超声发射频率超过25 kHz时,检测图谱中能够有效识别首层钢筋;常规混凝土内部缺陷较佳检测效果的超声发射频率为45 kHz~55 kHz;根据超声成像中异常反射区域可确定衬砌脱空缺陷的位置,根据异常反射出现的深度和正常衬砌厚度,可计算衬砌脱空缺陷的厚度,实现对衬砌内部缺陷的定量辨识。通过在工程中进行应用,并经钻孔内窥镜验证,超声横波成像能够有效定量辨识混凝土衬砌脱空缺陷。 展开更多
关键词 混凝土衬砌 内部缺陷 超声横波 模型试验 工程实践
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新型冠状病毒核酸检测方法 被引量:27
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作者 许金和 王水良 +4 位作者 张胜行 赖国祥 兰小鹏 吴小丽(综述) 余宗阳(审校) 《国际检验医学杂志》 CAS 2020年第17期2138-2142,共5页
从2019年12月开始识别和救治新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染的肺炎至今,新型冠状病毒肺炎的确诊病例数已超过70000例,快速、准确地诊断对于SARS-CoV-2感染的控制至关重要。目前已知的用于人类流感病毒感染的诊断方法主要有:病毒的分离、... 从2019年12月开始识别和救治新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染的肺炎至今,新型冠状病毒肺炎的确诊病例数已超过70000例,快速、准确地诊断对于SARS-CoV-2感染的控制至关重要。目前已知的用于人类流感病毒感染的诊断方法主要有:病毒的分离、特异性抗原检测以及核酸扩增等,核酸扩增所需窗口期短、耗时短,因此在病毒的早期、快速诊断中有一定的优势。SARS-CoV-2为单链RNA病毒,针对RNA病毒的较成熟的核酸诊断技术主要有:实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应、逆转录环介导等温扩增、依赖核酸序列扩增、重组酶聚合酶扩增技术和基因芯片等。本文对这些常用的核酸诊断技术的基本原理和在SARS-CoV-2检测中的应用现状进行了综述,为目前抗击疫情的临床一线提供一些有用参考。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 逆转录环介导等温扩增 等温核酸扩增 CRISPR/Cas 基因芯片
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尿液中miRNA作为常见恶性肿瘤生物标志物研究进展 被引量:2
7
作者 吴亚婷 李卓林 +3 位作者 雷艳 贾如雪(综述) 张胜行 王水良(审校) 《检验医学》 CAS 2023年第1期94-99,共6页
目前,绝大部分中晚期恶性肿瘤患者的综合治疗效果仍然不尽如人意,因此肿瘤的早期诊断至关重要。微小RNA(miRNA)是一类广泛存在且生物学功能多样的非编码小分子RNA,越来越多的研究发现因遗传或表观遗传学改变所致的特定miRNA的表达失调... 目前,绝大部分中晚期恶性肿瘤患者的综合治疗效果仍然不尽如人意,因此肿瘤的早期诊断至关重要。微小RNA(miRNA)是一类广泛存在且生物学功能多样的非编码小分子RNA,越来越多的研究发现因遗传或表观遗传学改变所致的特定miRNA的表达失调在恶性肿瘤进展过程中起着重要的致癌或促癌作用。miRNA可稳定存在于血液、尿液、脑脊液、唾液等生物体液或分泌物中。与血液等样本相比,尿液样本的液体活检具有易于处理和无创取样等优势,尿液miRNA作为潜在的新型肿瘤分子标志物也引起了临床越来越多的关注。文章就近年来尿液miRNA在临床常见恶性肿瘤患者中的研究进展进行综述,并对其未来可能的临床实际应用进行初步展望,提出亟待解决的问题,以期为相关研究提供参考。 展开更多
关键词 微小RNA 恶性肿瘤 生物标志物 尿液
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基于S曲线和分子对接技术对不同香气物质相互作用研究
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作者 安彤 梁德民 +3 位作者 费婷 牛云蔚 张圣航 蒋圆圆 《中国食品添加剂》 CAS 北大核心 2023年第6期119-129,共11页
通过S曲线法测定了9种天然产物中的香气物质的识别阈值,并将这9种香气物质按食品中常见的5种香韵(烤香、木香、甜香、酸香和果香香韵)进行分类,研究香气二元混合物之间的相互作用研究,香韵结构两两组合共得到32组混合物,通过双向协同研... 通过S曲线法测定了9种天然产物中的香气物质的识别阈值,并将这9种香气物质按食品中常见的5种香韵(烤香、木香、甜香、酸香和果香香韵)进行分类,研究香气二元混合物之间的相互作用研究,香韵结构两两组合共得到32组混合物,通过双向协同研究,共计64组数据,不同香韵的香气物质之间呈现的相互作用大部分是掩盖效果和协同效果,小部分呈现出加成作用。利用分子对接技术对4组香气物质(5-甲基糠醛、丁酸、愈创木酚和丙酸)与嗅觉受体OR1D2进行研究,结果显示,香气化合物可以通过氢键和疏水键与嗅觉受体OR1D2上的氨基酸残基发生相互作用,从而激活嗅觉受体,以实现香味的感知。香气化合物之间会通过竞争活性位点来使某种气味被感知到的强度减弱,而有些香气化合物之间可能会相互协作与受体之间的活性位点结合,从而表现出协同作用。 展开更多
关键词 GC-MS S曲线 香气协同 分子对接 作用机制
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Synergy in Rice Immunity:Exploring Strategies of Coordinated Disease Defense Through Receptor-Like Kinases and Receptor-Like Cytoplasmic Kinases
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作者 PEI Mengtian CAO Yingying +6 位作者 XIE Xuze CAO Ying CHEN Jia zhang Xi WANG Zonghua LU Guodong zhang shenghang 《Rice science》 SCIE 2024年第6期643-658,共16页
Receptor-like kinases(RLKs)and receptor-like cytoplasmic kinases(RLCKs)play an indispensable role in the perception and transmission of extracellular signals in plants.In rice,these kinases actively participate in imm... Receptor-like kinases(RLKs)and receptor-like cytoplasmic kinases(RLCKs)play an indispensable role in the perception and transmission of extracellular signals in plants.In rice,these kinases actively participate in immune responses against a variety of pathogens,including fungi,bacteria,and viruses.However,research on the specific response mechanisms and the spectrum of different kinase activities against various pathogens remains insufficient.This review provides an in-depth and comprehensive overview of the types and functions of RLKs and RLCKs involved in disease resistance,emphasizing the central role of certain RLKs and RLCKs in the plant immune system.These kinases can recognize specific molecular patterns of pathogens and rapidly initiate an immune response in rice.Furthermore,the activity and functional regulation of these key kinases are tightly controlled by various post-translational modifications,such as phosphorylation and ubiquitination.This meticulous regulation ensures that the rice immune system's response is both precise and timely,effectively balancing the intensity of the immune response and preventing potential issues caused by either hyperactivity or insufficiency.By synthesizing current research findings,this review not only broadens our understanding of the role of RLKs and RLCKs in plant immunity but also provides new perspectives and strategies for future research on disease resistance breeding in rice.Future studies are expected to delve deeper into the signaling networks and regulatory mechanisms of these kinases,exploring their potential in agricultural production to develop rice varieties with enhanced disease resistance. 展开更多
关键词 receptor-like kinase receptor-like cytoplasmic kinase pathogen-associated molecular pattern genetic breeding
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隧洞衬砌内部缺陷探地雷达正演模拟与应用
10
作者 陶金 张盛行 +2 位作者 官福海 蔡付林 汤雷 《水利与建筑工程学报》 2024年第6期106-112,120,共8页
混凝土衬砌脱空等内部缺陷一直是水工隧洞的“伴生”病害,对工程的安全运行产生不利影响。探地雷达具有高效无损的特点,被广泛用于结构内部缺陷探测。受限于内部缺陷的复杂性,缺陷不同形状及类型与探测雷达图谱特征形成机制仍不明确,易... 混凝土衬砌脱空等内部缺陷一直是水工隧洞的“伴生”病害,对工程的安全运行产生不利影响。探地雷达具有高效无损的特点,被广泛用于结构内部缺陷探测。受限于内部缺陷的复杂性,缺陷不同形状及类型与探测雷达图谱特征形成机制仍不明确,易引起误判。基于时域有限差分法开展规则和不规则脱空含空气、含水缺陷的正演模拟,对雷达图谱、时域、频域响应特征进行分析,并结合雷达波传过程分析其响应机制。结果表明,不规则缺陷使得雷达信号回波形态畸变,出现“多弧状”特征;脱空含水缺陷相较于含空气缺陷雷达回波出现相位反转,上下边界反射信号时间间隔延长,主频向低频偏移。将上述规律应用于某实际隧洞工程探测解译中,准确判别出了缺陷类型和尺寸。 展开更多
关键词 水工隧洞 探地雷达 无损检测 时域有限差分法 正演模拟 时频分析
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肿瘤转移的分子机制及靶向干预研究新进展 被引量:12
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作者 李卓林 贾如雪 +2 位作者 吴亚婷 张胜行 王水良 《中华细胞与干细胞杂志(电子版)》 2022年第1期51-58,共8页
肿瘤转移是一个多阶段的恶性进展过程,涉及肿瘤细胞从原发部位逃逸,侵入脉管系统并在其中存活,随循环系统到达远处靶器官并穿出脉管系统播散定植,最终克隆性生长形成转移瘤。转移过程的每一阶段与肿瘤细胞本身遗传和表观遗传改变以及微... 肿瘤转移是一个多阶段的恶性进展过程,涉及肿瘤细胞从原发部位逃逸,侵入脉管系统并在其中存活,随循环系统到达远处靶器官并穿出脉管系统播散定植,最终克隆性生长形成转移瘤。转移过程的每一阶段与肿瘤细胞本身遗传和表观遗传改变以及微环境中诸多因素的综合调控密切相关。本综述概要介绍了恶性肿瘤转移多步骤过程中所涉的分子调控机制以及肿瘤转移靶向干预新措施等方面的研究进展;同时,就未来肿瘤转移研究相关的新技术和新方向作一简单的展望。 展开更多
关键词 肿瘤转移 分子机制 靶向干预 上皮-间质转化 肿瘤微环境
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丙戊酸通过下调EGFR的表达抑制三阴性乳腺癌细胞生长增殖并诱导凋亡 被引量:1
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作者 付云烽 左伟敏 +10 位作者 李卓林 邓琳 贾如雪 吴亚婷 王萍 唐敏英 林榕 祝玲 董会月 张胜行 王水良 《中华细胞与干细胞杂志(电子版)》 2021年第3期129-136,共8页
目的探讨丙戊酸(VPA)对三阴性乳腺癌可能的治疗作用,并初步探索其可能的分子机理。方法MTS法结合克隆形成实验分析不同浓度VPA(0、0.25、0.5、1、2、4 mmol/L)处理对三阴性乳腺癌MDA-MB-231细胞存活的影响,结晶紫染色法检测不同浓度VPA(... 目的探讨丙戊酸(VPA)对三阴性乳腺癌可能的治疗作用,并初步探索其可能的分子机理。方法MTS法结合克隆形成实验分析不同浓度VPA(0、0.25、0.5、1、2、4 mmol/L)处理对三阴性乳腺癌MDA-MB-231细胞存活的影响,结晶紫染色法检测不同浓度VPA(0、0.125、0.25、0.5 mmol/L)作用后前述细胞克隆形成情况;Western blot法检测凋亡指示蛋白多聚腺苷二磷酸核糖聚合酶(PARP),并结合凋亡特异性ELISA法分析VPA(0.5 mmol/L)处理24、48 h诱导的MDA-MB-231细胞凋亡效应,qRT-PCR法检测其表皮生长因子受体(EGFR)mRNA的表达水平;Western blot法分析VPA(0.25、0.5、1 mmol/L)处理24 h对MDA-MB-231细胞中EGFR的表达及其下游Akt信号通路的影响;miRNAs特异qRT-PCR法分析VPA(0.5 mmol/L)处理24、48 h对MDA-MB-231细胞中miR-133a和miR-133b表达的影响;采用单因素方差分析及Dunnet-t检验进行统计学分析。结果与对照组VPA(0 mmol/L)比较,不同浓度(0.25、0.5、1、2、4 mmol/L)VPA干预组MDA-MB-231细胞的存活率(100﹪±0.46﹪比86.97﹪±0.21﹪、77.66﹪±0.17﹪、66.81﹪±0.59﹪、46.68﹪±0.45﹪、15.89﹪±0.25﹪)及细胞平均克隆数均[(769.33±22.03)个比(599.33±39.00)个、(492.00±52.00)个、(263.33±14.74)个]降低,且呈浓度依赖性(P均<0.05)。0.5 mmol/L VPA处理24 h对体外培养MDA-MB-231细胞凋亡率差异无统计学意义(0.13﹪±0.00﹪比0.14﹪±0.00﹪,P>0.05),但处理48 h后MDA-MB-231凋亡率(0.13﹪±0.00﹪比0.80﹪±0.00﹪)升高,差异有统计学意义(P<0.05)。RT-qPCR结果表明,0.5 mmol/L VPA处理24、48 h对MDA-MB-231细胞中EGFR mRNA的表达水平无明显影响(差异具有统计学意义但无生物学意义,P<0.001)。Western blot结果则显示VPA(0.25、0.5、1 mmol/L)处理24 h可明显下调MDA-MB-231细胞中EGFR的表达,相应的下游Akt信号通路被抑制。此外,miRNA特异RT-qPCR分析结果表明,与对照组(0 h)比较,0.5 mmol/L VPA处理24、48 h上调靶向EGFR mRNA的miR-133b的表达(1±0比6.21±0.89、4.58±0.62)(P<0.001)。结论VPA在体外显示较好的抑制三阴性乳腺癌MDA-MB-231细胞生长增殖并诱导其凋亡效应;初步的机制探讨提示,这可能与VPA处理上调靶向EGFR mRNA的miR-133b的表达特异下调MDA-MB-231细胞中EGFR的表达,进而抑制下游Akt信号通路有关;VPA作为三阴性乳腺癌患者治疗可能的候选药物值得进一步深入研究。 展开更多
关键词 丙戊酸 三阴性乳腺癌 表皮生长因子受体 miR-133a miR-133b
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NRG-1/ErbB4通路与脑缺血再灌注损伤细胞凋亡关系及电针干预作用 被引量:1
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作者 张胜行 张晔智 陈立典 《中华细胞与干细胞杂志(电子版)》 2018年第6期379-383,共5页
神经通路在电针治疗脑缺血再灌注损伤(CIRI)领域研究日渐深入。NRG-1/ErbB4通路是神经调节素(NRG)与其ErbB受体组成的一条在细胞的增殖分化以及神经系统发育等生命过程中起着关键作用的神经信号传导通路,前期研究发现该通路与神经发育... 神经通路在电针治疗脑缺血再灌注损伤(CIRI)领域研究日渐深入。NRG-1/ErbB4通路是神经调节素(NRG)与其ErbB受体组成的一条在细胞的增殖分化以及神经系统发育等生命过程中起着关键作用的神经信号传导通路,前期研究发现该通路与神经发育异常疾病、心力衰竭、心肌梗死以及癌症等疾病密切相关。近年,国内外研究发现CIRI后细胞凋亡与该通路以及Caspase-3、NF-κB、Bcl-2/Bax等因子的调控有关。本文综述NRG-1/ErbB4通路以及相关凋亡因子在CIRI治疗中的研究进展。 展开更多
关键词 神经调节因子1 ERBB4 脑缺血再灌注损伤 细胞凋亡 电针
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RNA m^(6)A甲基化修饰调控异常在乳腺癌转移中作用的研究新进展
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作者 吴亚婷 张胜行 王水良 《中华细胞与干细胞杂志(电子版)》 2023年第1期45-52,共8页
乳腺癌转移是导致患者生存预后差的重要原因,目前对其分子机制的认识仍有限。RNA N^(6)-甲基腺苷(m^(6)A)甲基化修饰是近十余年颇受关注的基因转录后水平表观调控新机制,它在乳腺癌转移等恶性生物学中的重要作用也日益凸显。特定RNA的m^... 乳腺癌转移是导致患者生存预后差的重要原因,目前对其分子机制的认识仍有限。RNA N^(6)-甲基腺苷(m^(6)A)甲基化修饰是近十余年颇受关注的基因转录后水平表观调控新机制,它在乳腺癌转移等恶性生物学中的重要作用也日益凸显。特定RNA的m^(6)A甲基化修饰主要受甲基转移酶复合体(MTC)和RNA去甲基酶影响,如肥胖相关蛋白(FTO)等动态调控;而m^(6)A甲基化修饰后的RNA还需要"解读"蛋白对其的解析才能进一步发挥特定的生物学功能。本综述总结了介导RNA m^(6)A甲基化修饰的"写入蛋白"、"擦除蛋白"和"解读蛋白"等各组分调控异常在乳腺癌转移中的作用及其相关分子机制方面的研究新进展,并就未来乳腺癌转移的RNA m^(6)A甲基化修饰失调控的精准检测和基于新分子机制的靶向治疗新策略开发作一展望。 展开更多
关键词 N^(6)-甲基腺苷(m^(6)A) RNA m^(6)A修饰 乳腺癌 肿瘤转移 表观转录组
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基于外周血转录组定性特征的活动性结核识别标志构建
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作者 马赛君 陈坤 +3 位作者 刘晟 林添钰 张胜行 陈湖星 《中华预防医学杂志》 CAS 2024年第11期1651-1658,共8页
目的基于单个样本内基因表达值的相对高低秩序关系(REOs)构建识别活动性结核的基因对标志。方法以来自4 个数据集的75 例活动性结核及69 例潜伏感染者的外周全血样本为训练集, 分别提取上述两类样本基因表达谱中高度稳定的REOs模式;然... 目的基于单个样本内基因表达值的相对高低秩序关系(REOs)构建识别活动性结核的基因对标志。方法以来自4 个数据集的75 例活动性结核及69 例潜伏感染者的外周全血样本为训练集, 分别提取上述两类样本基因表达谱中高度稳定的REOs模式;然后筛选出二者间REOs模式发生逆转的基因对集合, 并根据每个基因对在两类样本间发生逆转的程度将其降序排列;最后选取分类准确率最高的前k 个基因对作为标志, 进行独立数据集验证。结果在训练集中筛选出一个由7对基因组成的标志, 即7-GPS;该标志应用多数投票规则区分活动性结核与潜伏感染样本的准确率为88.89%, 区分活动性结核与正常样本的准确率为90.09%;在来自不同检测平台的混合验证数据中, 其区分活动性结核与潜伏感染样本的受试者工作特征曲线下面积(AUC)为0.914(95%CI:0.881~0.948), 区分活动性结核与正常样本的AUC为0.934(95%CI:0.904~0.964);另外, 该标志中的4 个基因ETV7、BATF2、ANKRD22与CARD17P倾向于在活动性结核外周血样本中高表达, 且其表达值与临床抗结核治疗时间显著相关。结论 7-GPS标志的分类效能良好, 适合对单个外周血样本进行个体化分析, 具有一定的应用潜力。 展开更多
关键词 活动性结核 潜伏性结核 外周血 基因表达值的相对高低秩序关系 转录组定性特征
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