期刊文献+
共找到7篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
基于多变量光谱数据分析方法的乳腺癌血清拉曼光谱特征研究 被引量:3
1
作者 张宝萍 宁甜 +3 位作者 张富荣 陈一申 张占琴 王爽 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2023年第2期426-434,共9页
相比于细胞、组织等其他病理诊断样品,血液样本更易临床采集,其生化构成变化常表现于医学影像学检测到的临床症状出现之前,更有利于实现恶性疾病的早期筛查与诊断。拉曼光谱(RS)技术,具有快速、无标记、无损、非侵入等检测优势,且可获... 相比于细胞、组织等其他病理诊断样品,血液样本更易临床采集,其生化构成变化常表现于医学影像学检测到的临床症状出现之前,更有利于实现恶性疾病的早期筛查与诊断。拉曼光谱(RS)技术,具有快速、无标记、无损、非侵入等检测优势,且可获得特异性的生物分子结构和物质组成信息,在临床血液样品(血浆、血清)的癌变诊断检测中具有重大的应用前景。本工作采用显微拉曼光谱检测技术,在分析不同病变阶段(健康,早期癌变和晚期癌变)乳腺癌血清样品生化组成信息基础上,结合主成分分析(PCA)与线性判别分析(LDA)、支持向量机(SVM)和偏最小二乘算法(PLS-DA)等多变量光谱分析手段,构建光谱特征归类鉴别模型;并采用留一交叉验证方法(LOOCV)评估、比较这些模型的灵敏度、特异性和准确率,探索基于血清拉曼光谱的乳腺癌诊断方法。研究工作在观察血清类胡罗卜素成分共振拉曼光谱现象基础上,进一步分析了乳腺癌病理演进过程中血清样品蛋白质与脂类光谱特征变化。此外,利用多种光谱数据模型,在提取、识别更具代表性的分子光谱特征信息后,实现了较为准确的血清特征光谱信息鉴别分析。其中,PCA-LDA模型的分类准确率达99%;PCA-SVM(三个内核函数:线性核、多项式核及RBF核)模型中,当线性核函数PCA-SVM模型误差惩罚参数C为0.003时,其在测试集中的分类准确率为92%;当RBF核函数PCA-SVM模型参数C和参数γ分别为0.125和256时,其在测试集中的分类准确率可达到了最高94%;当多项式核函数PCA-SVM参数C为0.003、多项式阶数d=1时,其在测试集中的分类准确率为92%;然而,PLS-DA模型的分类准确率仅为80%。这些实验分析结果,从光谱特征的角度描述了不同病理条件下血清的物质构成信息,更为拓展血清拉曼光谱分析技术在乳腺癌早期筛查与病理分期分级中的应用范畴,奠定了一定实验与理论基础。 展开更多
关键词 拉曼光谱分析技术 多变量数据分类模型 乳腺癌 血清 类胡罗卜素
下载PDF
基于GWAS和WGCNA分析挖掘玉米花期相关候选基因
2
作者 钱甫 张占琴 +3 位作者 陈树宾 丁永福 桑志勤 李卫华 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期3261-3276,共16页
花期是玉米重要性状之一,解析玉米花期的遗传基础,挖掘玉米花期关键基因,对于选育广适玉米品种具有重要意义。在580份玉米自交系构成的自然群体中,3年种植测定散粉期、吐丝期和散粉吐丝间隔期等3个花期性状,利用分布全基因组的31,826个S... 花期是玉米重要性状之一,解析玉米花期的遗传基础,挖掘玉米花期关键基因,对于选育广适玉米品种具有重要意义。在580份玉米自交系构成的自然群体中,3年种植测定散粉期、吐丝期和散粉吐丝间隔期等3个花期性状,利用分布全基因组的31,826个SNPs(single nucleotide polymorphisms)标记进行全基因组关联分析(genome wide association study,GWAS),结合自交系B73的14个不同发育阶段的转录组数据进行权重基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA),挑选与玉米开花相关的组织特异性模块和关键基因。GWAS在多环境(2个环境以上)下共定位标记14个,挖掘到潜在候选基因10个,WGCNA挖掘到花期潜在候选基因17个,2种方法共同挖掘到候选基因3个。Zm00001d052180编码一个MADS-box转录因子19,Zm00001d016814编码NAC转录因子133,Zm00001d048082编码MADS-box转录因子8,这些基因主要参与调节花序生长发育。研究结果为解析玉米花期遗传基础及分子机制提供参考。 展开更多
关键词 玉米 花期性状 GWAS WGCNA 候选基因
下载PDF
不同降解地膜降解性能及棉花应用效果研究 被引量:13
3
作者 张占琴 闫紫薇 +1 位作者 杨相昆 桑志勤 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2018年第6期1185-1189,共5页
【目的】通过对不同诱导期降解地膜降解性能及棉花应用效果的研究,为降解地膜在新疆推广应用和棉田残膜污染治理提供科学依据。【方法】试验包括4个地膜品种:CK(常规PE膜),3种不同诱导期可降解地膜有BXS60、BXS90和BXS120,随机区组,3次... 【目的】通过对不同诱导期降解地膜降解性能及棉花应用效果的研究,为降解地膜在新疆推广应用和棉田残膜污染治理提供科学依据。【方法】试验包括4个地膜品种:CK(常规PE膜),3种不同诱导期可降解地膜有BXS60、BXS90和BXS120,随机区组,3次重复。研究不同诱导期可降解地膜的降解过程及对棉花生长发育的影响。【结果】不同诱导期可降解地膜外观降解性、单位面积破损率、单位面积失重率差异明显,BXS60和BXS90 2个地膜品种基本达到D阶段,单位面积破损率在34%~58.3%之间,失重率在38.19%~46.5%之间。BXS120未到达C阶段,单位面积破损率和失重率均较低。BXS60和BXS90条件下植株较大,LAI持续时间较长,BXS90处理总光合势最高为1.34×106m2d·hm-2,干物质积累量和产量分别为1382.93 g·m-2、5644.1kg·hm-2,均高于CK的1301.9 g·m-2和5334.1 kg·hm-2。BXS60干物质积累量和产量均低于CK,BXS120与CK接近。【结论】合适诱导期的可降解地膜(诱导期在90 d左右),既能满足棉花生长需求,又能及时降解,降低农田残膜污染,对新疆棉田综合防治具有重要意义。 展开更多
关键词 可降解地膜 棉花 降解性 应用效果
下载PDF
基于不同回归模型的玉米秸秆生物量预测
4
作者 桑志勤 张占琴 +4 位作者 段震宇 陈树宾 王友德 郭斌 张小伟 《大麦与谷类科学》 2020年第4期21-24,37,共5页
为了研究利用玉米株高、叶片数快速预测玉米单株秸秆生物量的可行性,采用376个粮饲兼用型玉米杂交组合的大样本量分析玉米植株秸秆生物量与株高、叶片数的相关性,并采用多元回归分析法对蜡熟期玉米秸秆干物质质量进行线性回归分析。研... 为了研究利用玉米株高、叶片数快速预测玉米单株秸秆生物量的可行性,采用376个粮饲兼用型玉米杂交组合的大样本量分析玉米植株秸秆生物量与株高、叶片数的相关性,并采用多元回归分析法对蜡熟期玉米秸秆干物质质量进行线性回归分析。研究结果表明,玉米株高、叶片数与玉米秸秆干物质质量均有极显著相关性,株高的相关性高于叶片数的相关性。采用多元回归模型进行拟合度分析,模型4(DW=493.1-27.7L-1.8H+0.2LH)、模型3(DW=-605.8+1.9H+22.7L)具有较高的拟合精度,其对玉米秸秆干物质质量的决定系数分别为0.40、0.39。说明利用玉米株高、叶片数可实现玉米秸秆干物质质量的估测。 展开更多
关键词 玉米 秸秆生物量 株高 叶片数 模型
下载PDF
Heterosis and heterotic patterns of maize germplasm revealed by a multiple-hybrid population under well-watered and drought-stressed conditions
5
作者 SANG Zhi-qin zhang zhan-qin +4 位作者 YANG Yu-xin LI Zhi-wei LIU Xiao-gang XU Yun-bi LI Wei-hua 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2022年第9期2477-2491,共15页
Understanding the heterosis in multiple environments between different heterotic groups is of fundamental importance in successful maize breeding. A total of 737 hybrids derived from 41 maize inbreds were evaluated ov... Understanding the heterosis in multiple environments between different heterotic groups is of fundamental importance in successful maize breeding. A total of 737 hybrids derived from 41 maize inbreds were evaluated over two years, with the aim of assessing the genetic diversity and their performance between heterotic groups under drought-stressed(DS) and well-watered(WW) treatments. A total of 38 737 SNPs were employed to assess the genetic diversity. The genetic distance(GD) between the parents ranged from 0.05 to 0.74, and the 41 inbreds were classified into five heterotic groups. According to the hybrid performance(high yield and early maturity between heterotic groups), the heterosis and heterotic patterns of Iowa Stiff Stalk Synthetic(BSSS)×Non-Stiff Stalk(NSS), NSS×Sipingtou(SPT) and BSSS×SPT were identified to be useful options in China’s maize breeding. The relative importance of general and specific combining abilities(GCA and SCA) suggests the importance of the additive genetic effects for grain yield traits under the WW treatment, but the non-additive effects under the DS treatment. At least one of the parental lines with drought tolerance and a high GCA effect would be required to achieve the ideal hybrid performance under drought conditions. GD showed a positive correlation with yield and yield heterosis in within-group hybrids over a certain range of GD. The present investigation suggests that the heterosis is due to the combined accumulation of superior genes/alleles in parents and the optimal genetic distance between parents, and that yield heterosis under DS treatment was mainly determined by the non-additive effects. 展开更多
关键词 MAIZE drought stress HETEROSIS heterotic group heterotic pattern genetic distance
下载PDF
Nutrient Accumulation and Distribution in Cotton Promoted by Removal of Mulch Film
6
作者 zhang zhan-qin zhang Li +2 位作者 Tian Hai-yan Niu Yuan Yang Xiang-kun 《Journal of Northeast Agricultural University(English Edition)》 CAS 2022年第1期33-48,共16页
Plastic film mulching affects changes in nutrient contents in soil and absorption and utilization of nutrients in plants were by changing hydrothermal condition of soil.The temporal and spatial variation of the total ... Plastic film mulching affects changes in nutrient contents in soil and absorption and utilization of nutrients in plants were by changing hydrothermal condition of soil.The temporal and spatial variation of the total soil salt and nutrient contents with mulch film removed at three different times during the early cotton growth stage and its effects on nutrient absorption and accumulation in cotton plants were studied over 2015-2017.The film removal treatments reduced salt accumulation in normal rainfall year(2017).Film removal increased contents of soil organic matter,the total phosphorus and available potassium at the end of growth stage,increased contents of soil hydrolyzable nitrogen and the total nitrogen in the surface soil layer(0-10 cm),and increased the total nitrogen contents in the deep soil layer(40-50 cm).Film removal increased accumulation of nitrogen and phosphorus nutrients in cotton plants in 2017 and accumulation of nitrogen,phosphorus and potassium nutrients in cotton plants in heavy rainfall year(2016).These experimental results indicated that removal of mulch film at an appropriate and targeted time in the bud stage of cotton promoted nutrient absorption. 展开更多
关键词 removal of mulch film total soil salt soil nutrient nutrient accumulation nutrient distribution
下载PDF
玉米株高和穗位高的全基因组关联分析
7
作者 钱甫 张占琴 +2 位作者 陈树宾 桑志勤 李卫华 《玉米科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期65-73,81,共10页
以580份遗传多样性丰富的玉米自交系为关联群体,利用分布于全基因组的31826个单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs)分别对株高和穗位高性状3年表型值及BLUE(Best Linear Unbiased Esti⁃mate)值进行全基因组关联分析。... 以580份遗传多样性丰富的玉米自交系为关联群体,利用分布于全基因组的31826个单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs)分别对株高和穗位高性状3年表型值及BLUE(Best Linear Unbiased Esti⁃mate)值进行全基因组关联分析。结果表明,4个环境下共检测到58个显著性SNPs,共定位的SNPs有6个,其中3个与株高显著关联,4个与穗位高显著关联。在共定位显著标记440 kb范围内,共检测到76个关联基因,其中66个有基因描述,53个基因在GO(Gene Ontology)富集分析中得到分类,可归类到20类生物过程、10类分子功能以及8类细胞组成。综合基因功能注释和GO富集分析结果,预测了7个可能与株高和穗位高性状有关的候选基因。 展开更多
关键词 玉米 株高 穗位高 全基因组关联分析
原文传递
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部