目的比较结直肠息肉患者与正常人群的肠道菌群,探索差异菌群与结直肠息肉的关系。方法本研究采用横断面设计方案,收集2021年2月至2022年2月期间,在我国西南地区5家三甲医院消化内科经肠镜检查提示结直肠息肉的75名患者为息肉组,肠镜检...目的比较结直肠息肉患者与正常人群的肠道菌群,探索差异菌群与结直肠息肉的关系。方法本研究采用横断面设计方案,收集2021年2月至2022年2月期间,在我国西南地区5家三甲医院消化内科经肠镜检查提示结直肠息肉的75名患者为息肉组,肠镜检查未见异常的73名患者为对照组。采用16S rRNA测序分析方法,比较2组患者肠镜检查前大便标本的菌群差异;采用京都基因和基因组百科全书数据库比对方法,分析具有显著性差异的代谢通路信息;采用随机森林方法分析菌群显著差异物种及其预测作用。结果2组患者年龄、性别、体质量指数(body mass index,BMI)等基线资料比较差异无统计学意义。息肉组与对照组肠道菌群结构存在明显差异(Bray-curtis,weighted unifrac,P<0.05),息肉组粪杆菌属(Faecalibacterium)(P<0.001)及瘤胃球菌属_2(Ruminococcus_2)(P<0.05)明显减少,而假单胞菌属(Pseudomonas)明显增多(P<0.05)。肠道菌群功能分析结果显示,息肉组氨酰基-tRNA生物合成(P<0.05)、核糖体合成(P<0.01)、错配修复(P<0.05)及同源重组(P<0.01)功能较对照组明显降低。随机森林分析显示肠道菌群对结直肠息肉的发生具有预测作用(AUC=0.756),其中粪杆菌属预测作用最强。结论结直肠息肉患者较正常人群的肠道菌群特征发生改变,其中粪杆菌属差异最显著,其可能与结直肠息肉的形成相关。展开更多
烟草黑胫病在我国烟区分布广泛,严重影响烟草的产量和质量。筛选出对烟草具有防病和促生作用的细菌是有效控制烟草黑胫病危害和提高烟草产量的重要途径。通过稀释涂布平板法、对峙培养法从烟草病株根际土壤中筛选出YBM-4和YJC-4两株细...烟草黑胫病在我国烟区分布广泛,严重影响烟草的产量和质量。筛选出对烟草具有防病和促生作用的细菌是有效控制烟草黑胫病危害和提高烟草产量的重要途径。通过稀释涂布平板法、对峙培养法从烟草病株根际土壤中筛选出YBM-4和YJC-4两株细菌。根据分子形态学、最适生长条件和生理生化及16S r DNA基因序列分析比对结果,鉴定YBM-4是枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis),YJC-4是沙福芽孢杆菌(Bacillus safensis)。在对峙培养中,YBM-4和YJC-4细菌对烟草黑胫病菌丝的相对抑制率分别是85.34%和72.99%。在盆栽试验中,YBM-4和YJC-4对烟株生物量和农艺性状的促生作用明显,YBM-4、YJC-4和YBM-4+YJC-4混剂(比例1:1)对烟草黑胫病的平均防治效果分别是76.37%、80.06%和81.50%,病程进展曲线下面积(AUDPC)分别比对照降低265.01,281.58,287.32。表明细菌YBM-4和YJC-4具有潜在的利用和开发价值。展开更多
文摘目的比较结直肠息肉患者与正常人群的肠道菌群,探索差异菌群与结直肠息肉的关系。方法本研究采用横断面设计方案,收集2021年2月至2022年2月期间,在我国西南地区5家三甲医院消化内科经肠镜检查提示结直肠息肉的75名患者为息肉组,肠镜检查未见异常的73名患者为对照组。采用16S rRNA测序分析方法,比较2组患者肠镜检查前大便标本的菌群差异;采用京都基因和基因组百科全书数据库比对方法,分析具有显著性差异的代谢通路信息;采用随机森林方法分析菌群显著差异物种及其预测作用。结果2组患者年龄、性别、体质量指数(body mass index,BMI)等基线资料比较差异无统计学意义。息肉组与对照组肠道菌群结构存在明显差异(Bray-curtis,weighted unifrac,P<0.05),息肉组粪杆菌属(Faecalibacterium)(P<0.001)及瘤胃球菌属_2(Ruminococcus_2)(P<0.05)明显减少,而假单胞菌属(Pseudomonas)明显增多(P<0.05)。肠道菌群功能分析结果显示,息肉组氨酰基-tRNA生物合成(P<0.05)、核糖体合成(P<0.01)、错配修复(P<0.05)及同源重组(P<0.01)功能较对照组明显降低。随机森林分析显示肠道菌群对结直肠息肉的发生具有预测作用(AUC=0.756),其中粪杆菌属预测作用最强。结论结直肠息肉患者较正常人群的肠道菌群特征发生改变,其中粪杆菌属差异最显著,其可能与结直肠息肉的形成相关。
文摘烟草黑胫病在我国烟区分布广泛,严重影响烟草的产量和质量。筛选出对烟草具有防病和促生作用的细菌是有效控制烟草黑胫病危害和提高烟草产量的重要途径。通过稀释涂布平板法、对峙培养法从烟草病株根际土壤中筛选出YBM-4和YJC-4两株细菌。根据分子形态学、最适生长条件和生理生化及16S r DNA基因序列分析比对结果,鉴定YBM-4是枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis),YJC-4是沙福芽孢杆菌(Bacillus safensis)。在对峙培养中,YBM-4和YJC-4细菌对烟草黑胫病菌丝的相对抑制率分别是85.34%和72.99%。在盆栽试验中,YBM-4和YJC-4对烟株生物量和农艺性状的促生作用明显,YBM-4、YJC-4和YBM-4+YJC-4混剂(比例1:1)对烟草黑胫病的平均防治效果分别是76.37%、80.06%和81.50%,病程进展曲线下面积(AUDPC)分别比对照降低265.01,281.58,287.32。表明细菌YBM-4和YJC-4具有潜在的利用和开发价值。