目的基于网络药理学探讨辛夷治疗过敏性鼻炎的活性成分及作用机制。方法检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取辛夷活性成分,并借助SwissTargetPrediction、PubChem进行辛夷成分的作用靶点预测和筛选,构建成分-靶点网络。通过...目的基于网络药理学探讨辛夷治疗过敏性鼻炎的活性成分及作用机制。方法检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取辛夷活性成分,并借助SwissTargetPrediction、PubChem进行辛夷成分的作用靶点预测和筛选,构建成分-靶点网络。通过TTD、DrugBank、DisGeNET、OMIM数据库获取过敏性鼻炎相关基因靶点。利用Venny2.1软件得到辛夷活性成分作用靶点与过敏性鼻炎的交集靶点信息,利用String数据库和Cytoscape3.7.1制作交集靶点蛋白相互作用网络图。运用R语言对辛夷治疗过敏性鼻炎靶点进行生物过程、KEGG富集分析。运用Discovery Studio 4.0软件进行分子对接,验证其生物活性。结果筛选得到辛夷与过敏性鼻炎相关的17个潜在活性成分和43个潜在有效靶点,主要活性成分为鹅掌楸树脂酚B二甲醚、加尔加拉文、亚油酸乙酯等,与之相关的靶点为PTGS2、ALOX5、PTGER3等。辛夷活性成分可通过参与炎症反应的调节、白细胞迁移、体液水平调节、对外界刺激反应的积极调节、对细菌来源分子的反应等生物学过程,以及刺激神经组织中的交互、胆碱能突触、HIF-1信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、趋化因子信号通路等生物通路发挥作用。结论辛夷活性成分具有良好的抗组胺、抑制炎症反应和促进免疫调节作用,从而达到治疗过敏性鼻炎的效果。展开更多
目的用网络药理学和分子对接方法研究润肺宁神方治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)致失眠的机制。方法在TCMSP、Batman和CTD数据库查找润肺宁神方中药材的化学成分和靶点;在Disgenet、GeneCards、CTD和Malacards数据库中查找COVID-19和失...目的用网络药理学和分子对接方法研究润肺宁神方治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)致失眠的机制。方法在TCMSP、Batman和CTD数据库查找润肺宁神方中药材的化学成分和靶点;在Disgenet、GeneCards、CTD和Malacards数据库中查找COVID-19和失眠的相关靶点;用Cytoscape 3.2.1软件构建成分-靶点-疾病网络;在String数据库构建PPI网络;用R语言软件平台中Cluster Profiler软件包将共同靶点进行通路富集。用Discovery Studio 4.0软件对COVID-19致失眠相关的核心靶点进行分子对接。结果搜集到润肺宁神方药材成分349个,靶点1904个,COVID-19相关靶点1505个,失眠相关靶点1337个;韦恩图取交集得到2个疾病共同靶点404个,药材与2个疾病交集靶点250个,靶点间相互作用网络构建分析筛选出核心靶点33个。通路富集分析显示,润肺宁神方治疗失眠主要作用于AKT1、INS、TP53、IL-6、JUN、CASP3、TNF、CAT、PTGS2和CXCL8等关键靶点,参与人类巨细胞病毒感染、流体剪切应力与动脉粥样硬化和糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路等重要通路过程。分子对接结果表明,核心靶点与β-谷甾醇、1-甲氧基菜豆素、3′-羟基-4′-O-甲基光甘草定与脱水淫羊藿素的亲和力较高。处方治疗COVID-19致失眠可能是通过PTGS2、AR、PPARG、NOS2和HSP90AA1等靶点发挥作用。结论推测润肺宁神方通过抑制IL-6、TNF-α等途径发挥治疗COVID-19致失眠的作用。展开更多
目的 探寻宣肺解热颗粒治疗新型冠状病毒肺炎(Corona Virus Disease 2019,COVID-19)合并发热的作用机制。方法 用中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform, ...目的 探寻宣肺解热颗粒治疗新型冠状病毒肺炎(Corona Virus Disease 2019,COVID-19)合并发热的作用机制。方法 用中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform, TCMSP)筛选宣肺解热颗粒的有效组分,并预测潜在靶基因,并用GeneCards和CTD数据库检索新型冠状病毒肺炎合并发热的相关疾病靶点,得到上述二者共有的靶点,导入Cytoscape中构建“成分-靶点-疾病”网络。将上述二者共有的靶点输入STRING蛋白相互作用在线数据库,将得到的数据结果导入Cytoscape软件获得PPI(protein-protein interaction)网络;用R语言对共同靶点进行GO(Gene Ontology)与KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)富集分析。结果 经筛选得到活性成分84个、靶点82个。通路富集分析显示,宣肺解热颗粒治疗新型冠状病毒肺炎合并发热主要作用于蛋白激酶B(Protein kinase B,AKT1)、肿瘤蛋白P53(Tumor Protein P53,TP53)和白细胞介素-6(Interleukin-6,IL-6)等关键靶点。KEGG通路富集分析显示,主要与影响流体剪切应力与动脉粥样硬化、人巨细胞病毒感染和糖尿病并发症中的AGE-RAGE等信号通路有关。分子对接结果显示,核心靶点与β-谷甾醇、刺芒柄花素及N-反式阿魏酰酪胺等有较强的的亲和力。结论 本研究初步验证宣肺解热颗粒可通过多成分、多靶点和多通路来发挥治疗COVID-19合并发热的作用。展开更多
文摘目的基于网络药理学探讨辛夷治疗过敏性鼻炎的活性成分及作用机制。方法检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取辛夷活性成分,并借助SwissTargetPrediction、PubChem进行辛夷成分的作用靶点预测和筛选,构建成分-靶点网络。通过TTD、DrugBank、DisGeNET、OMIM数据库获取过敏性鼻炎相关基因靶点。利用Venny2.1软件得到辛夷活性成分作用靶点与过敏性鼻炎的交集靶点信息,利用String数据库和Cytoscape3.7.1制作交集靶点蛋白相互作用网络图。运用R语言对辛夷治疗过敏性鼻炎靶点进行生物过程、KEGG富集分析。运用Discovery Studio 4.0软件进行分子对接,验证其生物活性。结果筛选得到辛夷与过敏性鼻炎相关的17个潜在活性成分和43个潜在有效靶点,主要活性成分为鹅掌楸树脂酚B二甲醚、加尔加拉文、亚油酸乙酯等,与之相关的靶点为PTGS2、ALOX5、PTGER3等。辛夷活性成分可通过参与炎症反应的调节、白细胞迁移、体液水平调节、对外界刺激反应的积极调节、对细菌来源分子的反应等生物学过程,以及刺激神经组织中的交互、胆碱能突触、HIF-1信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、趋化因子信号通路等生物通路发挥作用。结论辛夷活性成分具有良好的抗组胺、抑制炎症反应和促进免疫调节作用,从而达到治疗过敏性鼻炎的效果。
文摘目的用网络药理学和分子对接方法研究润肺宁神方治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)致失眠的机制。方法在TCMSP、Batman和CTD数据库查找润肺宁神方中药材的化学成分和靶点;在Disgenet、GeneCards、CTD和Malacards数据库中查找COVID-19和失眠的相关靶点;用Cytoscape 3.2.1软件构建成分-靶点-疾病网络;在String数据库构建PPI网络;用R语言软件平台中Cluster Profiler软件包将共同靶点进行通路富集。用Discovery Studio 4.0软件对COVID-19致失眠相关的核心靶点进行分子对接。结果搜集到润肺宁神方药材成分349个,靶点1904个,COVID-19相关靶点1505个,失眠相关靶点1337个;韦恩图取交集得到2个疾病共同靶点404个,药材与2个疾病交集靶点250个,靶点间相互作用网络构建分析筛选出核心靶点33个。通路富集分析显示,润肺宁神方治疗失眠主要作用于AKT1、INS、TP53、IL-6、JUN、CASP3、TNF、CAT、PTGS2和CXCL8等关键靶点,参与人类巨细胞病毒感染、流体剪切应力与动脉粥样硬化和糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路等重要通路过程。分子对接结果表明,核心靶点与β-谷甾醇、1-甲氧基菜豆素、3′-羟基-4′-O-甲基光甘草定与脱水淫羊藿素的亲和力较高。处方治疗COVID-19致失眠可能是通过PTGS2、AR、PPARG、NOS2和HSP90AA1等靶点发挥作用。结论推测润肺宁神方通过抑制IL-6、TNF-α等途径发挥治疗COVID-19致失眠的作用。
文摘目的 探寻宣肺解热颗粒治疗新型冠状病毒肺炎(Corona Virus Disease 2019,COVID-19)合并发热的作用机制。方法 用中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform, TCMSP)筛选宣肺解热颗粒的有效组分,并预测潜在靶基因,并用GeneCards和CTD数据库检索新型冠状病毒肺炎合并发热的相关疾病靶点,得到上述二者共有的靶点,导入Cytoscape中构建“成分-靶点-疾病”网络。将上述二者共有的靶点输入STRING蛋白相互作用在线数据库,将得到的数据结果导入Cytoscape软件获得PPI(protein-protein interaction)网络;用R语言对共同靶点进行GO(Gene Ontology)与KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)富集分析。结果 经筛选得到活性成分84个、靶点82个。通路富集分析显示,宣肺解热颗粒治疗新型冠状病毒肺炎合并发热主要作用于蛋白激酶B(Protein kinase B,AKT1)、肿瘤蛋白P53(Tumor Protein P53,TP53)和白细胞介素-6(Interleukin-6,IL-6)等关键靶点。KEGG通路富集分析显示,主要与影响流体剪切应力与动脉粥样硬化、人巨细胞病毒感染和糖尿病并发症中的AGE-RAGE等信号通路有关。分子对接结果显示,核心靶点与β-谷甾醇、刺芒柄花素及N-反式阿魏酰酪胺等有较强的的亲和力。结论 本研究初步验证宣肺解热颗粒可通过多成分、多靶点和多通路来发挥治疗COVID-19合并发热的作用。