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某基层医院与三甲儿童医院儿童呼吸道感染病原谱比较
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作者 黄宇轩 贾立平 +2 位作者 德日 赵林清 李晓惠 《分子诊断与治疗杂志》 2024年第7期1200-1203,共4页
目的 比较分级诊疗下某基层医院和三甲儿童医院的儿童急性呼吸道感染病原谱差异。方法 收集2021年11月至2022年3月北京某基层医院及某三甲儿童医院临床诊断为急性呼吸道感染患儿的呼吸道标本,采用多重逆转录-聚合酶联反应(RT-PCR)与毛... 目的 比较分级诊疗下某基层医院和三甲儿童医院的儿童急性呼吸道感染病原谱差异。方法 收集2021年11月至2022年3月北京某基层医院及某三甲儿童医院临床诊断为急性呼吸道感染患儿的呼吸道标本,采用多重逆转录-聚合酶联反应(RT-PCR)与毛细电泳联用技术检测13种呼吸道病原,统计学方法分析两家医院急性呼吸道感染儿童病原谱差异。结果 基层医院纳入患儿112例,男女比例为1∶1,呼吸道病原总阳性检出率为71.43%(80/112),单种病原感染72例(64.29%,72/112),混合感染8例(7.14%,8/112,均为2种病原);三甲儿童医院纳入患儿115例,男女比例1.02∶1,呼吸道病原总阳性检出率为70.43%(81/115),单种病原感染66例(57.39%,66/115),混合感染15例(包括2种病原感染12例,10.43%,12/115;3种病原感染3例,2.61%,3/115)。0~3岁婴幼儿中,基层医院与三甲儿童医院HMPV阳性检出率(52.9%,9/17;5.3%,4/75)差异有统计学意义(χ^(2)=38.10,P<0.05);三甲儿童医院儿童RSV阳性检出率(44.0%,33/75)高于基层医院(23.5%,4/17),但差异无统计学意义(χ^(2)=2.415,P>0.05)。4~15岁儿童中,基层医院Flu B阳性检出率为31.58%(30/95),三甲儿童医院为20.0%(8/40),差异有统计学意义(χ^(2)=6.96,P<0.05);三甲儿童医院MP阳性检出率为37.5%(15/40),基层医院未检出,差异有统计学意义(χ^(2)=40.08,P<0.05)。结论 2021-2022年冬春季节北京某基层医院与三甲儿童医院的儿童呼吸道感染病原谱构成存在差异,各年龄段病原谱分布也不同,提示分级诊疗以及基层医院开展核酸检测的必要性。 展开更多
关键词 儿童 急性呼吸道感染 病原谱 分级诊疗 基层医院 三甲儿童医院
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2009—2023年中国16个省份急性呼吸道感染病例中人呼吸道合胞病毒的流行特征分析 被引量:2
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作者 崔爱利 夏百成 +22 位作者 朱贞 谢智博 孙利伟 徐瑾 许晶 李忠 赵林清 龙晓茹 于德山 朱冰 张凤 穆敏 谢会 蔡亮 朱云 田晓灵 王冰 郜振国 刘晓庆 任斌知 韩光跃 胡孔新 张燕 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期945-951,共7页
目的了解2009—2023年我国16个省份急性呼吸道感染(ARI)病例中人呼吸道合胞病毒(HRSV)的流行特征。方法研究资料来源于2009—2023年我国16个省份ARI病例监测数据,共有28 278例ARI病例纳入研究。监测病例的临床标本进行了HRSV核酸筛查,... 目的了解2009—2023年我国16个省份急性呼吸道感染(ARI)病例中人呼吸道合胞病毒(HRSV)的流行特征。方法研究资料来源于2009—2023年我国16个省份ARI病例监测数据,共有28 278例ARI病例纳入研究。监测病例的临床标本进行了HRSV核酸筛查,并分析不同年龄组、不同地区和不同月份病例的HRSV检出率差异。结果 2009年1月至2023年9月,共纳入28 278例ARI病例。病例年龄范围为<1月龄~112岁,年龄M(Q1,Q3)为3岁(1岁,9岁)。28 278例ARI病例中有3 062例HRSV核酸阳性,总检出率为10.83%。2009—2019年HRSV检出率为9.33%,病毒主要以冬春季流行为主。在新型冠状病毒感染(COVID-19)流行期间,HRSV检出率在6.32%~18.67%之间波动;2022年底至2023年初未出现HRSV传统的冬季流行高峰,在2023年4—5月出现了HRSV反季节流行。87.95%(2 693/3 062)HRSV阳性病例为 5岁以下的儿童,不同年龄组中HRSV检出率的差异具有统计学意义(P<0.001),呈现出随着年龄增加HRSV检出率降低的趋势(P<0.001),其中以<6月龄组患儿的HRSV检出率最高(25.69%)。和2009—2019年相比,2020—2023年期间不同年龄组的HRSV检出率从高到低的排序发生变化,HRSV阳性病例的年龄M(Q1,Q3)从1岁(6月龄,3岁)增加至2岁(11月龄,3岁)。结论通过连续15年的HRSV监测分析发现,5岁以下的儿童,尤其是<6月龄婴幼儿是HRSV感染的主要高发人群。COVID-19流行期间,我国HRSV流行水平和流行模式发生了变化。 展开更多
关键词 人呼吸道合胞病毒 急性呼吸道感染 流行特征 监测
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儿童急性弛缓性脊髓炎4例临床特点分析
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作者 葛绣山 焦辉 +7 位作者 陈倩 张宝元 赵林清 朱汝南 李淑品 马才惠 张媛媛 彭晓音 《中华儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期676-680,共5页
目的总结儿童急性弛缓性脊髓炎(AFM)的临床表现、诊治经验和预后。方法回顾性病例总结,对首都儿科研究所附属儿童医院神经内科2018年9月至2022年11月收治的4例临床诊断AFM患儿的病例资料进行临床特点分析。结果4例AFM患儿年龄分别为7岁... 目的总结儿童急性弛缓性脊髓炎(AFM)的临床表现、诊治经验和预后。方法回顾性病例总结,对首都儿科研究所附属儿童医院神经内科2018年9月至2022年11月收治的4例临床诊断AFM患儿的病例资料进行临床特点分析。结果4例AFM患儿年龄分别为7岁、4岁3月龄、7岁1月龄、6岁5月龄,女2例、男2例。前驱呼吸道感染3例、消化道感染1例。以感染后出现不对称肢体无力为主要表现,受影响肢体范围从单一肢体到四肢。所有患儿均无脑病表现,1例患儿出现周围性面瘫。4例患儿脊髓磁共振成像均提示长节段长T1长T2信号,以灰质受累为主。2例患儿出现脑脊液细胞-蛋白分离现象。1例咽拭子病原体检出肠道病毒D68;1例患儿血液中腺病毒抗体IgM阳性;1例患儿血液中埃可病毒、柯萨奇B组病毒抗体IgG阳性。4例患儿经过糖皮质激素、人免疫球蛋白或单纯对症治疗,同时在后期康复训练下,肌力不同程度恢复,3例遗留有残疾。结论以感染后、急性、不对称肢体无力起病伴有磁共振成像脊髓中央区域异常信号的患儿需考虑AFM,目前有效治疗手段有限且预后不良。 展开更多
关键词 儿童 急性弛缓性脊髓炎 急性弛缓性麻痹 肠道病毒
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CDHR3及其基因单核苷酸多态性与C组鼻病毒致哮喘的相关性研究进展
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作者 傅涵浩钰 德日 赵林清 《国际病毒学杂志》 北大核心 2024年第2期170-173,共4页
支气管哮喘是严重的全球性健康问题。婴幼儿期呼吸道病毒感染是诱发儿童哮喘的主要危险因素之一,也是哮喘加重的最常见原因。近年来的研究表明,人鼻病毒(human rhinovirus,HRV),尤其是C组鼻病毒(HRV-C)在病毒诱导的哮喘发作及加重中发... 支气管哮喘是严重的全球性健康问题。婴幼儿期呼吸道病毒感染是诱发儿童哮喘的主要危险因素之一,也是哮喘加重的最常见原因。近年来的研究表明,人鼻病毒(human rhinovirus,HRV),尤其是C组鼻病毒(HRV-C)在病毒诱导的哮喘发作及加重中发挥重要作用。CDHR3基因是儿童早期严重哮喘的易感基因,其单核苷酸多态性位点rs6967330上的A等位基因是儿童早期哮喘加重的易感基因位点。CDHR3基因编码的CDHR3受体是HRV-C目前唯一的已知受体。本文主要就CDHR3及其基因单核苷酸多态性与HRV-C致哮喘之间的相关性研究进展展开综述,以期为儿童哮喘防治提供理论依据。 展开更多
关键词 支气管哮喘 C组鼻病毒 CDHR3基因 单核苷酸多态性
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团体标准《人呼吸道合胞病毒感染诊断(CT/CPMA028-2023)》解读 被引量:1
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作者 张燕 宋金华 +12 位作者 谢正德 赵林清 张海邻 刘恩梅 任丽丽 孙利伟 徐瑾 于德山 张琪 马庆华 钱渊 申昆玲 许文波 《中国病毒病杂志》 CAS 2023年第3期177-182,共6页
人呼吸道合胞病毒(human respiratory syncytial virus,HRSV)是全球引起5岁以下儿童、老年人及免疫功能低下人群急性下呼吸道感染最重要的病原之一。HRSV感染在全球婴幼儿和老年人中均导致较为严重的疾病负担,病毒引入高危人群聚集场所... 人呼吸道合胞病毒(human respiratory syncytial virus,HRSV)是全球引起5岁以下儿童、老年人及免疫功能低下人群急性下呼吸道感染最重要的病原之一。HRSV感染在全球婴幼儿和老年人中均导致较为严重的疾病负担,病毒引入高危人群聚集场所常引起聚集性暴发疫情。由于我国缺乏HRSV感染诊断标准和检测技术规范,无法早期、准确识别HRSV感染,导致我国不同人群HRSV实际疾病负担可能被低估,还可能会因而出现病毒隐匿传播,疫情播散。因此,中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所联合其他10家单位撰写了《人呼吸道合胞病毒感染诊断(CT/CPMA 028—2023)》团体标准,以“合法性、科学性、时效性、可行性”为原则,对HRSV感染诊断依据、诊断原则、诊断和鉴别诊断进行了规范,为进一步揭示我国HRSV感染实际疾病负担,也为HRSV感染诊疗、监测、防控、疫苗和抗体等的研发及其使用策略的制定提供技术支撑。 展开更多
关键词 人呼吸道合胞病毒 病毒感染 诊断 实验室检测 团体标准
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2004至2017年北京地区儿童流行性感冒样病例中甲型流行性感冒的流行特征 被引量:26
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作者 王芳 钱渊 +4 位作者 邓洁 孙宇 赵林清 田润 朱汝南 《中华儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期429-434,共6页
目的分析2004—2017年连续13个监测年度北京地区儿童中甲型流行性感冒(流感)的流行特征。方法重复横断面研究,2004年9月至2017年8月每周采集首都儿科研究所附属儿童医院门、急诊流感样病例患儿的咽拭子标本,采用传代狗肾细胞(MDCK... 目的分析2004—2017年连续13个监测年度北京地区儿童中甲型流行性感冒(流感)的流行特征。方法重复横断面研究,2004年9月至2017年8月每周采集首都儿科研究所附属儿童医院门、急诊流感样病例患儿的咽拭子标本,采用传代狗肾细胞(MDCK细胞)行流感病毒分离,并用特异性血清对分离到的流感病毒进行血凝抑制试验鉴定型别。组间差异采用t检验或χ2检验,对13个监测年度中不同型别的甲型流感的流行特征及不同年龄组患儿感染特征进行分析,并与同期乙型流感进行比较。结果2004—2017年13个监测年度共采集流感样病例咽拭子标本10 984份,共检测到甲型流感病毒1 052株,总阳性率为9.6%,高于乙型流感(6.7%,741/10 984),包括70株季节性H1N1、302株甲型H1N1和680株H3N2阳性标本。所有甲型流感病毒阳性患儿年龄为(4.2±2.9)岁,男性患儿占55.5%(584/1 052);季节性H1N1、甲型H1N1和H3N2阳性患儿年龄分别为(4.6±2.1)、(4.3±3.1)和(4.2±2.9)岁,各亚型阳性患儿的年龄差异均无统计学意义(季节性H1N1比H3N2:t=1.139,P=0.255;甲型H1N1比H3N2:t=0.631,P=0.528;季节性H1N1比甲型H1N1:t=0.720,P=0.472);而乙型流感阳性患儿平均年龄[(5.2±2.7)岁]大于甲型流感患儿(t=7.120,P=0.000);各年龄组甲型和乙型感染率差异均有统计学意义(P均〈0.05);甲型H1N1(除0~0.5岁年龄组)和H3N2各年龄组患儿的感染率随着年龄增长而升高;〉0.5~12.0岁各年龄组儿童感染H3N2的阳性率均高于季节性H1N1和甲型H1N1(P均〈0.05)。当甲型流感阳性率高于乙型时,其流行高峰均出现在乙型高峰之前,反之亦然;季节性H1N1在2009年后未检出;2009年之后甲型H1N1成为季节性流行株,阳性率高于原季节性H1N1,呈现连续出现两个流行高峰后出现一个流行低谷的规律;H3N2每年均有一个流行峰,多数在冬春季进入流行高峰,在2009年甲型H1N1大流行之前出现H3N2流行峰前移,在夏秋季出现流行高峰,且强度较大。结论2004—2017年连续13个监测年度中北京地区儿童中甲型流感的流行呈现不同的流行特征,2009年后以甲型H1N1和H3N2为优势株。 展开更多
关键词 流感病毒A型 流行病学研究特征(主题) 儿童 病毒分离
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新型冠状病毒肺炎疫情期间北京定点排查医院儿童急性呼吸道感染的病原谱观察 被引量:10
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作者 赵林清 邓莉 +14 位作者 曹玲 陈冬梅 孙宇 朱汝南 王芳 郭琪 周禹彤 贾立平 黄辉 康小会 金凤华 袁艺 张楠 德日 钱渊 《中华儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第8期635-639,共5页
目的探讨新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情期间北京地区儿童中急性呼吸道感染(ARI)的病原谱。方法采用前瞻性研究,自2020年1月20日至2月20日首都儿科研究所附属儿童医院入组3类患儿:有2019新型冠状病毒(2019-nCoV)相关流行病学史的ARI组... 目的探讨新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情期间北京地区儿童中急性呼吸道感染(ARI)的病原谱。方法采用前瞻性研究,自2020年1月20日至2月20日首都儿科研究所附属儿童医院入组3类患儿:有2019新型冠状病毒(2019-nCoV)相关流行病学史的ARI组(疑似病例组),无2019-nCoV相关流行病学史的ARI组(单纯ARI组),既无流行病学史也无呼吸道感染、但因其他疾病需住院治疗的排查组(非ARI组),每组预计纳入至少30例。疑似病例组同时采集咽拭子和鼻咽拭子标本,单纯ARI组及非ARI组仅采集鼻咽拭子标本;所有标本同步应用两个不同厂家的试剂盒进行2019-nCOV核酸检测;鼻咽拭子标本进行ARI多病原核酸检测。单纯ARI组与2019、2018年同期的ARI患儿多病原核酸检测结果比较采用t检验或χ2检验。结果至2020年2月20日总计入组244例患儿,男139例、女105例,年龄(5±4)岁,2019-nCoV核酸检测结果均为阴性。疑似病例组(69.4%,25/36)与单纯ARI组(55.3%,73/132)均有较高的病原检出,以肺炎支原体阳性检出率为最高[19.4%(7/36)、17.4%(23/132)];其次是人偏肺病毒[16.7%(6/36)、9.8%(13/132)];非ARI组病原检出率较低(11.8%,9/76)。2019年同期ARI患儿病原阳性检出率为83.7%(77/92),以呼吸道合胞病毒A(29.3%,27/92)为最高,然后依次为流感病毒H1N1(19.6%,18/92)及腺病毒(14.1%,13/92),与2020年单纯ARI组的3种病毒阳性检出率(分别为7/132,5.3%;0;5/132,3.8%)比较差异均有统计学意义(χ2=27.346、28.083、7.848,P均<0.01);2018年同期ARI患儿病原阳性检出率为61.0%(50/82),以人博卡病毒(13.4%,11/82)及腺病毒(11.0%,9/82)多见,与2020年单纯ARI组人博卡病毒阳性检出率(5/132,3.8%)比较,差异有统计学意义(χ2=6.776,P=0.009)。结论在非高风险地区,即使在有相关的流行病学史前提下,非家庭聚集性发病或非密切接触的儿童感染2019-nCoV的可能性仍很小;与既往同期患儿ARI的病原以病毒为主不同,COVID-19疫情防控期间肺炎支原体占了病原谱的首要位置。 展开更多
关键词 呼吸道感染 病原 儿童 新型冠状病毒肺炎
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2020年北京地区儿童中急性胃肠炎相关诺如病毒的分子流行病学特征 被引量:9
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作者 贾立平 赵林清 +4 位作者 周林 刘立颖 董慧瑾 朱汝南 钱渊 《中华儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第8期645-650,共6页
目的探讨北京地区2020年疫情防控措施下急性胃肠炎患儿诺如病毒的分子流行病学特点。方法采用回顾性重复横断面研究方法,2020年收集首都儿科研究所附属儿童医院就诊急性胃肠炎患儿的粪便标本或呕吐物标本1213份。首先用实时荧光反转录PC... 目的探讨北京地区2020年疫情防控措施下急性胃肠炎患儿诺如病毒的分子流行病学特点。方法采用回顾性重复横断面研究方法,2020年收集首都儿科研究所附属儿童医院就诊急性胃肠炎患儿的粪便标本或呕吐物标本1213份。首先用实时荧光反转录PCR进行标本中诺如病毒筛查,然后用反转录PCR对诺如病毒阳性标本进行病毒VP1基因和RdRp基因扩增,据核苷酸序列进行基因分型。采用χ^(2)检验对不同标本类型、患儿不同性别及不同年龄组间诺如病毒的检出阳性率进行比较。结果在1213份急性胃肠炎患儿标本中,共筛查到诺如病毒阳性标本215份,全年的检出阳性率为17.7%,阳性病例集中在秋冬季节[1、10、11及12月阳性率分别为28.6%(18/63)、26.2%(16/61)、22.8%(77/338)以及17.1%(89/520)]。粪便标本的阳性率明显高于呕吐物标本(χ^(2)=9.692,P<0.01),而男女性别差异无统计学意义(χ^(2)=0.041,P>0.05),各年龄组间诺如病毒检出率差异有统计学意义(χ^(2)=103.112,P<0.01),以6~48月龄诺如病毒的检出率较高。对G基因型分析显示共有3个基因群(GⅠ、GⅡ和GⅨ)诺如病毒流行,以GⅡ基因群为主,占总数的98.5%(196/199)。而GⅡ基因群中以GⅡ.4 Sydney为主要流行株,占GⅡ基因群的55.1%(108/196);其次为GⅡ.2型(29.6%,58/196),以往流行的GⅡ.3型(10.2%,20/196)诺如病毒在本次监测周期中较少。诺如病毒P基因型分析结果显示以GⅡ.P16为主,占61.5%(96/156);其次为GⅡ.P31(19.9%,31/156)。双基因测定结果显示以GⅡ.4 Sydney[P16]为主,占36.4%(56/154),其次为GⅡ.2[P16]占24.7%(38/154)。结论2020年诺如病毒的总阳性率与以往没有大的区别,但流行的基因型别构成有了明显的改变,且呈现多种基因型别诺如病毒的同时流行。 展开更多
关键词 诺罗病毒 胃肠炎 基因型
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北京婴幼儿腹泻中G1、G3型轮状病毒VP7基因分子进化动态分析 被引量:4
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作者 董慧瑾 朱汝南 +5 位作者 张又 赵林清 刘立颖 贾立平 德日 钱渊 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期377-384,共8页
北京儿童腹泻中G1和G3型轮状病毒(Rotavirus,RV)的流行随时间动态变化。鉴于G1和G3型RV在疫苗研发设计中的重要地位,本研究依据前期对2007~2017北京腹泻就诊患儿中RV流行的监测结果,分别选取G1(15例)和G3(18例)型RV标本,应用DNAStar、M... 北京儿童腹泻中G1和G3型轮状病毒(Rotavirus,RV)的流行随时间动态变化。鉴于G1和G3型RV在疫苗研发设计中的重要地位,本研究依据前期对2007~2017北京腹泻就诊患儿中RV流行的监测结果,分别选取G1(15例)和G3(18例)型RV标本,应用DNAStar、MEGA 6.0和BEAST软件包及Datamonkey在线工具,分析和预测11年来其主要中和抗原VP7基因的分子进化动态。结果显示G1和G3型RV同近年世界各地的各自主要流行株之间的进化距离近,相比同一进化树分支内参考株的VP7基因并没有表现出特有的氨基酸变异,提示并未有特别的基因变异直接改变北京G1和G3型RV的流行。本研究中北京G1和G3型RV最近共同祖先株形成时间分别约为2005年和1996年,其VP7基因平均进化速率分别为2.29×10^(-3)和5.11×10^(-4)氨基酸替换·位点^(-1)·年^(-1)。尽管G1型的变异速率大于G3型,但有意思的是它们均无正向选择变异位点。群体流行历史(Bayesian skyline plot,BSP)分析显示人群中G1和G3型RV的感染水平呈现缓慢下降,并均在2010年前后出现了跳跃式下降,随后有所上升并维持在较平稳的感染水平,基本符合北京腹泻儿童中RV流行趋势监测,据此推测群体免疫压力可能是影响G1和G3型RV的流行分布随时间动态变化的原因。分子分析结果还显示本研究中G1和G3型RV和相应型别疫苗株之间的进化距离远,且均在主要抗原区存在变异,这些是否对疫苗应用效果产生影响仍需要对RV的流行进行持续监测。 展开更多
关键词 腹泻 轮状病毒(RV) G1 G3 VP7 分子进化动态
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2014—2019年北京市急性腹泻儿童中诺如病毒感染特征分析
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作者 贾立平 赵林清 +5 位作者 邓莉 刘立颖 董慧瑾 黄辉 金凤华 钱渊 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2022年第5期508-513,共6页
目的了解2014—2019年北京市急性腹泻儿童中诺如病毒(Norovirus,NoV)的感染特征。方法收集2014年4月至2019年12月于首都儿科研究所附属儿童医院以急性腹泻为主要症状的患儿粪便标本,利用逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-poly... 目的了解2014—2019年北京市急性腹泻儿童中诺如病毒(Norovirus,NoV)的感染特征。方法收集2014年4月至2019年12月于首都儿科研究所附属儿童医院以急性腹泻为主要症状的患儿粪便标本,利用逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)筛查NoV;阳性标本进行NoV VP1基因及RdRp基因扩增及序列测定,所测得的序列应用在线分型工具Norovirus Genotyping Tool 2.0进行基因分型。结果本研究共收集2577例急性腹泻儿童粪便标本,NoV核酸检测阳性的484例(18.78%,484/2577);NoV感染全年均可发生,具有明显的季节分布,流行高峰在秋冬季节。NoV的检出无性别差异(χ^(2)=1.77,P=0.183)。其中有399例得到了VP1区分型,结果显示有11个基因型,主要为GII基因群(98.25%,392/399),GII.4 Sydney型为主(52.13%,208/399),其次为GII.3型(19.8%,79/399)、GII.2型(18.5%,74/399)。267例完成了RdRp区分型,结果显示有10个基因型,以GII.P31型为主(57.3%,153/267),其次为GII.P12型(15.36%,41/267)及GII.P16型(14.98%,40/267)。双基因分型结果显示存在16种组合方式,主要为GII.4 Sydney[P31](53.18%,142/267),GII.3[P12]检出率呈下降趋势,而GII.4 Sydney[P16]检出率逐渐增高。结论NoV是北京市2014—2019年儿童急性腹泻的重要病原,流行的基因型别多样。 展开更多
关键词 儿童 诺如病毒 急性腹泻 基因分型
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儿童呼吸道感染病原体核酸检测专家共识 被引量:38
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作者 谢正德 邓继岿 +23 位作者 任丽丽 张燕 陈祥鹏 张海邻 赵林清 徐保平 钟礼立 秦强 卢根 郑跃杰 赵德育 尚云晓 曹玲 陈志敏 殷勇 刘瀚旻 申阿东 应斌武 符州 李昌崇 钱渊 许文波 王健伟 申昆玲 《中华实用儿科临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期321-332,共12页
急性呼吸道感染是儿童最常见的感染性疾病,严重威胁儿童生命健康。快速准确的病原学诊断对于该类疾病的临床诊疗及防控具有重要意义。核酸检测方法因具有较高的灵敏度和特异性,得以快速地在临床推广应用,成为呼吸道感染病原体诊断的主... 急性呼吸道感染是儿童最常见的感染性疾病,严重威胁儿童生命健康。快速准确的病原学诊断对于该类疾病的临床诊疗及防控具有重要意义。核酸检测方法因具有较高的灵敏度和特异性,得以快速地在临床推广应用,成为呼吸道感染病原体诊断的主要方法。为规范儿童呼吸道感染病原体核酸检测的临床应用,提升病原体的诊断水平,特组织相关领域专家,撰写《儿童呼吸道感染病原体核酸检测专家共识》,以指导儿童呼吸道感染病原体的核酸检测,整体提升儿童呼吸道感染病原体的诊断能力。 展开更多
关键词 儿童 急性呼吸道感染 病原体 核酸检测 共识
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我国人副流感病毒3型HN基因的遗传变异及进化特征分析 被引量:2
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作者 江洁 赵林清 +9 位作者 穆敏 王文洋 徐瑾 蔡亮 谢正德 朱贞 张燕 周杉杉 冯意 毛乃颖 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2022年第2期141-149,共9页
目的基于血凝素-神经氨酸酶蛋白(hemagglutinin-neuraminidase,HN)基因分析我国流行人副流感病毒3型(human parainfluenza virus 3,HPIV3)的基因变异规律和进化特征。方法采用多重荧光PCR方法对2007—2020年5个省市(北京、浙江、安徽、... 目的基于血凝素-神经氨酸酶蛋白(hemagglutinin-neuraminidase,HN)基因分析我国流行人副流感病毒3型(human parainfluenza virus 3,HPIV3)的基因变异规律和进化特征。方法采用多重荧光PCR方法对2007—2020年5个省市(北京、浙江、安徽、河南、湖南)急性呼吸道感染病例的咽拭子标本进行常见病原体核酸筛查,对HPIV3阳性标本进行HN基因序列测定,与GenBank数据库的国外和我国10个省的HPIV3流行代表株HN基因序列进行比对,应用多种生物信息学方法开展分子进化分析。结果本研究期间从5个省市共获得49株HPIV3的HN基因序列,核苷酸同源性在96.6%~100%之间,其中48株为C3基因亚型,1株为C5基因亚型。系统进化分析显示,我国12个省市在2003—2020年间存在C1、C3和C5基因亚型的毒株共流行,毒株间核苷酸和氨基酸同源性分别为95.4%~99.8%和97.9%~100%,其中C3是我国的优势流行基因亚型,分属于C3a、C3b、C3c、C3e和C3f进化分支,以C3f的传播范围和流行时间最为广泛。对C3基因亚型的进化分析显示,其最近共同祖先形成时间(tMRCA)可追溯到1990年,有效群体规模在2002—2010年间逐渐扩张而后趋于平稳;C3各进化分支HPIV3的HN基因进化速率在3.69×10^(-4)~5.82×10^(-4)替换/位点/年之间;C3基因亚型毒株HN蛋白共享N308、N351、N485和N523潜在N-糖基化位点,选择压力以负向选择为主。结论C3基因亚型是我国的本土优势HPIV3流行型别,形成了广泛传播和持续流行态势,并在流行过程中形成多个进化分支共同循环。 展开更多
关键词 人副流感病毒3型 血凝素-神经氨酸酶蛋白 基因特征 贝叶斯进化分析
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人腺病毒重组研究进展 被引量:1
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作者 王方明 赵林清 《国际病毒学杂志》 2022年第3期256-259,共4页
人腺病毒(HAdV)是急性呼吸道感染、腹泻、急性眼角结膜炎等多种疾病的常见病原体。许多研究表明HAdV基因组易发生基因重组,进而形成新的基因型别,迄今已报道的104个型别中53~104型为重组形成的新基因型,在全球范围内引起多次疫情,对疾... 人腺病毒(HAdV)是急性呼吸道感染、腹泻、急性眼角结膜炎等多种疾病的常见病原体。许多研究表明HAdV基因组易发生基因重组,进而形成新的基因型别,迄今已报道的104个型别中53~104型为重组形成的新基因型,在全球范围内引起多次疫情,对疾病的防控提出新挑战。目前对其重组研究较少,亟需深入研究以揭示重组机制及临床意义。 展开更多
关键词 人腺病毒 型别 重组
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Effect of human rhinovirus infection in pediatric patients with influenza-like illness on the 2009 pandemic influenza A(H1N1) virus 被引量:1
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作者 Sun Yu Zhu Ru'nan +6 位作者 zhao linqing Deng Jie Wang Fang Ding Yaxin Yuan Yi Qu Dong Qian Yuan 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 2014年第9期1656-1660,共5页
Background Some research groups have hypothesized that human rhinoviruses (HRVs) delayed the circulation of the 2009 pandemic influenza A(H1N1) virus (A(H1N1)pdm09) at the beginning of Autumn 2009 in France.Th... Background Some research groups have hypothesized that human rhinoviruses (HRVs) delayed the circulation of the 2009 pandemic influenza A(H1N1) virus (A(H1N1)pdm09) at the beginning of Autumn 2009 in France.This study aimed to evaluate the relationship between HRV and A(H1N1)pdm09 in pediatric patients with influenza-like illness in Beijing,China.Methods A systematic analysis to detect A(H1N1)pdm09 and seasonal influenza A virus (FLU A) was performed on 4 349 clinical samples from pediatric patients with influenza-like illness during the period June 1,2009 to February 28,2010,while a one-step real-time RT-PCR (rRT-PCR) assay was used to detect HRV in 1 146 clinical specimens selected from those 4 349 specimens.Results During the survey period,only one wave of A(H1N1)pdm09 was observed.The percentage of positive cases for A(H1N1)pdm09 increased sharply in September with a peak in November 2009 and then declined in February 2010.Data on the monthly distribution of HRVs indicated that more HRV-positive samples were detected in September (2.2%) and October (3.3%),revealing that the peak of HRV infection in 2009 was similar to that of other years.Among the 1 146 specimens examined for HRVs,21 (1.8%) were HRV-positive,which was significantly lower than that reported previously in Beijing (15.4% to 19.2%) (P <0.01).Overall,6 samples were positive for both A(H1N1)pdm09 and HRV,which represented a positive relative frequency of 1.60% and 2.08% HRV,considering the A(H1N1)pdm09-positive and-negative specimens,respectively.The odds ratio was 0.87 (95% CI 0.32; 2.44,P=0.80).Conclusions HRVs and A (H1N1)pdm09 co-circulated in this Chinese population during September and October 2009,and the HRV epidemic in 2009 did not affect A(H1N1)pdm09 infection rates in Beijing,China as suggested by other studies.However,the presence of A(H1N1)pdm09 might explain the unexpected reduction in the percentage of HRV positive cases during the period studied. 展开更多
关键词 real-time PCR assay human rhinovirus A(H1N1)pdm09 pediatric patients influenza-like illness
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