目的:通过网络药理学的方法探讨桂枝茯苓丸治疗糖尿病肾病(Diabetic Nephropathy,DN)的信号通路及其可能的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analys...目的:通过网络药理学的方法探讨桂枝茯苓丸治疗糖尿病肾病(Diabetic Nephropathy,DN)的信号通路及其可能的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)检索桂枝茯苓丸中桂枝、茯苓、牡丹、赤芍、桃仁5味中药的有效活性成分,并用Perl软件得出药物作用靶基因,应用Uniprot数据库将药物靶点规范为相应的基因名称;在Genecards数据库、人类孟德尔遗传数据库中输入“diabetic nephropathy”,获取DN的疾病靶点基因。通过R软件获取药物-疾病的交集作用靶点,采用Cytoscape 3.2.1软件绘制成分-靶点-疾病可视化网络图,利用STRING数据库及Cytoscape 3.2.1软件得到靶点蛋白质-蛋白质相互作用(Protein-protein Interaction,PPI)网络图,并进一步对关键靶点进行基因本体论(Gene Ontology,GO)功能富集分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析。结果:桂枝茯苓丸药物组成中活性成分有85个,药物靶点有100个,DN疾病靶点有3496个,通过R软件得到交集靶点68个,PPI网络图核心靶点为白细胞介素-6(Interleukin-6,IL-6)、血管内皮生长因子(Vascular Endothelial Growth Factor A,VEGF)A、丝裂原激活蛋白激酶8(Mitogen-Activated Protein Kinase 8,MAPK8)等。GO功能富集分析主要涉及DNA结合转录因子、RNA聚合酶Ⅱ、血红素结合、泛素样蛋白连接酶结合、转录因子结合、核受体活性等。KEGG通路富集分析显示主要涉及流体剪应力与动脉粥样硬化、晚期糖基化终末产物(Advanced Glycation End Products,AGE)-晚期糖基化终末产物受体(Receptor For Advanced Glycation End Products,RAGE)、细胞凋亡、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、缺氧诱导因子(Hypoxia Inducible Factor,HIF)-1信号通路等。结论:桂枝茯苓丸可能通过多成分、多靶点、多通路实现治疗DN的作用。展开更多
文摘目的:通过网络药理学的方法探讨桂枝茯苓丸治疗糖尿病肾病(Diabetic Nephropathy,DN)的信号通路及其可能的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)检索桂枝茯苓丸中桂枝、茯苓、牡丹、赤芍、桃仁5味中药的有效活性成分,并用Perl软件得出药物作用靶基因,应用Uniprot数据库将药物靶点规范为相应的基因名称;在Genecards数据库、人类孟德尔遗传数据库中输入“diabetic nephropathy”,获取DN的疾病靶点基因。通过R软件获取药物-疾病的交集作用靶点,采用Cytoscape 3.2.1软件绘制成分-靶点-疾病可视化网络图,利用STRING数据库及Cytoscape 3.2.1软件得到靶点蛋白质-蛋白质相互作用(Protein-protein Interaction,PPI)网络图,并进一步对关键靶点进行基因本体论(Gene Ontology,GO)功能富集分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析。结果:桂枝茯苓丸药物组成中活性成分有85个,药物靶点有100个,DN疾病靶点有3496个,通过R软件得到交集靶点68个,PPI网络图核心靶点为白细胞介素-6(Interleukin-6,IL-6)、血管内皮生长因子(Vascular Endothelial Growth Factor A,VEGF)A、丝裂原激活蛋白激酶8(Mitogen-Activated Protein Kinase 8,MAPK8)等。GO功能富集分析主要涉及DNA结合转录因子、RNA聚合酶Ⅱ、血红素结合、泛素样蛋白连接酶结合、转录因子结合、核受体活性等。KEGG通路富集分析显示主要涉及流体剪应力与动脉粥样硬化、晚期糖基化终末产物(Advanced Glycation End Products,AGE)-晚期糖基化终末产物受体(Receptor For Advanced Glycation End Products,RAGE)、细胞凋亡、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、缺氧诱导因子(Hypoxia Inducible Factor,HIF)-1信号通路等。结论:桂枝茯苓丸可能通过多成分、多靶点、多通路实现治疗DN的作用。