子宫内膜癌DNA甲基化谱的全基因组分析预测新甲基化标记物

目的探讨异常的DNA甲基化与子宫内膜癌(UCEC)的临床特征之间的关系。方法本研究对432个UCEC样本和46个正常组织样本的全基因组DNA甲基化谱和基因表达谱进行了整合分析。基于子宫内膜癌组织(UCEC)及其癌旁组织的DNA甲基化芯片数据,识别正常对照样本与子宫内膜癌样本间的差异甲基化区域(DMR),并分析这些差异甲基化区域的基因组分布规律和甲基化分布特征。根据其匹配的基因表达RNA-seq数据,识别癌症异常甲基化对于癌症异常表达的正负转录调控模式,同时结合病人的生存数据评估其作为潜在的临床预后生物学标记潜能。结果基因组分析表明,与低甲基化DMR相比,高甲基化DMR更多分布在TSS附近的CpG岛区。对DMR相关基因的功能分析显示,与肿瘤相关的关键生物学过程和途径(如细胞粘附、细胞分化、失活和cAMP信号通路)中异常甲基化的基因富集。最后,将DMRs甲基化水平与患者生存时间进行了相关性研究,并对130例DMRs进行鉴别,将患者分为高危组和低风险组,总体生存率有显著性差异。结论我们的研究揭示了异常DNA甲基化作为有价值的候选基因标记物和治疗靶点的潜力。并有助于我们对UCEC甲基化调控机制了解。