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各地区人类嗜T细胞病毒Ⅰ型的聚类分析
1
作者
吴艳
谈承杰
朱平
《生物信息学》
2012年第4期264-268,共5页
已有相关文献表明人类嗜T细胞病毒Ⅰ型(Human T-lymphotropic virus 1,记为HTLV-Ⅰ)的分布具有区域性,本文旨在提出不同的分析区域性的方法。首先从GenBank中选取来自亚洲、南美洲、非洲的共20条核苷酸序列,用分子生物学软件Vector NTI ...
已有相关文献表明人类嗜T细胞病毒Ⅰ型(Human T-lymphotropic virus 1,记为HTLV-Ⅰ)的分布具有区域性,本文旨在提出不同的分析区域性的方法。首先从GenBank中选取来自亚洲、南美洲、非洲的共20条核苷酸序列,用分子生物学软件Vector NTI Suite分析各地区序列样本内部的同源性,然后以各序列的氨基酸含量为对象,定义一个全新的公式进行同源性分析,将该结果与其他研究者采用实验的方法的分析结果比较。结果发现不同的分析方法所得的结论均是一致的。这表明:HTLV-Ⅰ病毒的分布有明显的区域性,文章采用的研究方法对其他流行病学的研究是同样可行的。
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关键词
HTLV-Ⅰ
同源性分析
氨基酸
核苷酸序列
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题名
各地区人类嗜T细胞病毒Ⅰ型的聚类分析
1
作者
吴艳
谈承杰
朱平
机构
江南大学理学院
出处
《生物信息学》
2012年第4期264-268,共5页
基金
江南大学创新团队发展计划(PIRTJiangnan2008CXTD02)资助
文摘
已有相关文献表明人类嗜T细胞病毒Ⅰ型(Human T-lymphotropic virus 1,记为HTLV-Ⅰ)的分布具有区域性,本文旨在提出不同的分析区域性的方法。首先从GenBank中选取来自亚洲、南美洲、非洲的共20条核苷酸序列,用分子生物学软件Vector NTI Suite分析各地区序列样本内部的同源性,然后以各序列的氨基酸含量为对象,定义一个全新的公式进行同源性分析,将该结果与其他研究者采用实验的方法的分析结果比较。结果发现不同的分析方法所得的结论均是一致的。这表明:HTLV-Ⅰ病毒的分布有明显的区域性,文章采用的研究方法对其他流行病学的研究是同样可行的。
关键词
HTLV-Ⅰ
同源性分析
氨基酸
核苷酸序列
Keywords
HTLV- I
homology analysis
amino acid
nucleotide sequence
分类号
O012.1 [理学]
Q524 [生物学—生物化学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
各地区人类嗜T细胞病毒Ⅰ型的聚类分析
吴艳
谈承杰
朱平
《生物信息学》
2012
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