中国貉随机扩增多态DNA及其亚种分化关系

对来自陕西、云南、越南、安徽和广西等地的８只中国貉（Ｎｙｃｔｅｒｅｕｔｅｓｐｒｏｃｙｏｎｉｄｅｓ）进行随机扩增多态ＤＮＡ分析。应用２８个１０ｂｐ的随机引物，平均每只貉获得的ＲＡＰＤ标记数约为１３０条。遗传距离计算结果显示，中国貉个体间的平均遗传距离指数值为１１．２０％，最大值为１４．９３％，最小值为２．９４％。以赤狐（Ｖｕｌｐｅｓｖｕｌｐｅｓ）为外群，应用ＰＨＹＬＩＰ３．０计算软件包中的ＵＰＧＭＡ和ＮＪ聚类方法构建分子系统树。结果表明，不同地理群体间的中国貉存在遗传分化；中国貉可分为４组：（１）广西貉，（２）安徽貉，（３）陕西貉，（４）云南貉和越南貉。其中安徽貉和广西貉间的关系稍近，陕西貉则与云南貉－越南貉稍近。对合中国貉的形态分类、地理分布、ｍｔＤＮＡ多态分析以及进化遗传学的观点，认为陕西貉、广西貉和安徽貉可能与云南貉－越南貉具有等同的分类地位。

河南刺猬种群的遗传多样性研究

为正确评价刺猬种群间的遗传关系，利用随机扩增多态DNA（RAPD）技术，对河南刺猬种群的遗传多样性进行研究．共扩增出89个位点，片段大小为200-1650bp，多态位点百分率（P）为89．89％，Nei’s基因多样度（H）为0．3281±0.1720，Shannon’s多样性信息指数（I）为0．4846±0．2298，种群间遗传相似度平均为0．8060，群体间遗传距离平均为0．2228．结果表明，周口种群与信阳种群之间的遗传关系最近，信阳种群与濮阳种群之间的遗传关系最远，说明地理隔离可能是造成河南刺猬种群遗传差异的主要原因．

基于rpl16序列的中国野牡丹属植物分子系统关系初探

针对目前中国原产野牡丹属植物系统关系存在的争议,采用叶绿体基因上的rpl16序列,以野牡丹科野牡丹属之外的3个属4种植物为外类群,对中国野牡丹属植物进行了分子系统关系研究。结果表明,rpl16序列在野牡丹属植物中没有足够的变异位点,最大简约法(Maximum parsimony,MP)构建的分子系统树中,地菍(Melastoma dodecandrum)形成单独的一支,贝叶斯分析(Bayesian Inference,BI)构建的分子系统树中,整个野牡丹属植物形成一支;两种方法构建的分子系统树中,野牡丹科同一个属的植物都可以形成单独的分支。因此,rpl16序列并不适合野牡丹属植物的分子系统关系研究,可能比较适合野牡丹科植物属间的分子系统关系研究。

蒺藜苜蓿SBP-box转录因子基因家族全基因组分析

从全基因组水平研究蒺藜苜蓿SBP-box转录因子基因家族,系统地鉴定出22个SBP-box家族基因,根据基因结构分析、结构域的差异和系统发育分析将这些SBP-box基因分成5个亚家族.基因比较分析表明SBPbox基因家族扩张主要是通过部分复制及串联重复事件来实现的.基因表达模式分析表明蒺藜苜蓿SBP-box基因具有器官特异性并且参与干旱胁迫反应.这些结果为进一步研究蒺藜苜蓿SBP-box家族基因的功能与进化提供理论参考.

依据ITS rDNA序列探讨我国盾腹虫属种类的系统发育关系(英文)

盾腹吸虫为寄生扁形动物中一小的类群。我国已报道7种盾腹吸虫,其中5种隶属于盾腹虫属(Aspidogastridae,Aspidogastrinae)。研究测定了在我国采集到的4种盾腹虫属吸虫的核糖体DNA转录内间隔区(ITSrDNA)序列,并分别采用邻接法和最大似然法构建分子系统发育树。结果显示,这4种盾腹吸虫的ITS-1和ITS-2序列的长度分别在728—877bp和518—645bp之间,其G+C含量分别在50.1%—52.3%和49.2%—52.2%范围内。4种盾腹吸虫的种间遗传距离在0.2%—26.9%之间,其中重庆盾腹吸虫(Aspidogaster chongqingensis)和似螺盾腹吸虫(A.limacoides)间仅为0.2%。所构建的最大似然树和邻接树具有相同的拓扑结构,均支持重庆盾腹吸虫和似螺盾腹吸虫亲缘关系最近,它们与饭岛盾腹吸虫(A.ijimai)亲缘关系较近,而与位于系统树基部的贝居盾腹吸虫(A.conchicola)关系较远。此外,对我国盾腹属种类的宿主特异性进行了讨论。

云南省Seo型汉坦病毒基因差异研究

为揭示云南省啮齿类动物携带的汉坦病毒的基因型及亚型,从来自云南的7个免疫荧光检测阳性的鼠肺标本中提取出病毒RNA,通过逆转录和巢式PCR获得了M片段G2区.序列分析表明,云南省内啮齿类动物携带病毒多为SEO型,且SEO型病毒间较为保守,相似性为93.7%～99.7%,且多在97%以上,系统发生树分析表明,云南省内SEO型病毒在构建的种系发生树上处于两个分支,分属于S1及S3亚型.

基于转录组的池蝶蚌系统发育及其遗传分析

池蝶蚌(Hyriopsis schlegelii)和三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)的亲缘关系一直存在争议,为了更深入地对淡水珠蚌进行系统发育分析,研究对池蝶蚌及其3个近缘物种三角帆蚌、褶纹冠蚌(Cristaria plicata)和背角无齿蚌(Anodonta woodiana)的转录组进行了比较分析。对它们共有单拷贝同源基因进行多序列联配后计算这4种淡水珠蚌之间的遗传距离,结果表明池蝶蚌和三角帆蚌的遗传距离只有0.00746(小于1%),而其他淡水珠蚌之间的遗传距离几乎是它的10倍(平均大于6%)。系统发育分析表明,小方蚌亚科与无齿蚌亚科大约在5144万年前发生分歧,而池蝶蚌和三角帆蚌发生分化的时间大约在424万年前。进一步的遗传差异分析鉴定了池蝶蚌转录组中的特有基因,其中KEGG通路富集的结果表明这些基因主要富集在免疫细胞膜分子和蛋白消化吸收等通路上。同时, GO注释结果表明有很多特有基因与池蝶蚌的优良性状相关,如与发育相关的生长发育、系统发育和动物器官发育等生物学过程,及与免疫相关的免疫系统过程、抗原处理和呈递等生物学过程。以上结果表明,池蝶蚌和三角帆蚌具有更近的亲缘关系,它们可能是同一物种的不同亚种或不同种群,这对淡水珠蚌种质资源的保护和遗传育种具有重要参考意义。此外,相比于三角帆蚌,池蝶蚌可能具有一些与生长发育及免疫相关的特有基因,这为探究相关的分子机制提供了线索。

分子标记及其在植物线虫分子系统发育研究中的应用

综述了基于DNA分子标记的类型、特点与功能。展望了分子标记技术在植物线虫分子系统发育研究中的应用前景。

遗传系谱题的分析和解法

一、解题思路 （一）判断遗传系谱类型： 遗传系谱类型共有五种：常染色体显性遗传，常染色体隐性遗传，伴x显性遗传，伴X隐性遗传，伴Y遗传。