降钙素受体基因多态性与上海地区妇女骨密度的关系

目的探讨降钙素受体(calcitoninreceptor,CTR)基因多态性与绝经前和绝经后妇女骨密度(bonemineraldensity,BMD)之间的关系。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(polymerasechainreaction-restrictionfragmentlengthpolymorphism,PCR-RFLP)方法,对上海地区184名绝经前和199名绝经后妇女进行CTR基因型的检测。应用双能X线骨密度仪(dual-energyX-rayabsorptiometry,DEXA)测定腰椎和股骨颈BMD。结果383名上海地区妇女CTR基因型频率分布依次为CC型占83.8%,TC型14.6%,TT型1.6%。在绝经后妇女组,CC型的股骨颈BMD明显高于TC和TT型(P<0.01),而在绝经前组不同基因型的各部位BMD无差别。多元逐步回归分析提示,CTR基因型与绝经后妇女股骨颈BMD相关(P<0.05)。结论CTR基因多态性与绝经后妇女BMD存在一定的关联。

A-FABP基因5′侧翼区多态性及其与秦川牛肉用性状的关联分析

本研究通过对牛脂肪型脂肪酸结合蛋白(A-FABP)基因5′侧翼区的1441bp序列进行SNPs检测,结果在转录起始位点上游-389bp处发现T→C突变,进而利用PCR-SSCP的方法在秦川牛、南阳牛、鲁西牛、夏南牛和郏县红牛共5个牛群体中进行个体基因型分析,结果发现3种基因型,分别命名为AA、AB和BB。χ2检验表明,除秦川牛外其它各品种在该基因座均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。基因型与秦川牛肉用性状的关联分析发现,AB基因型个体的宰前活体质量、胴体质量、含水率均显著低于AA和BB基因型个体(P<0.05),AA和BB基因型个体之间差异不显著;BB基因型个体大理石花纹等级极显著优于AB基因型个体(P<0.01),显著优于AA基因型个体(P<0.05)。推测这一位点可能是影响牛肉大理石花纹及含水率的主效QTL或与之紧密连锁,可尝试做为肉牛肉质性状的候选分子标记。

猪TLR6基因MspⅠ多态性与生长性状相关性研究

为了阐明猪TLR6基因片段多态性及其与生长性状之间的关系,采用PCR-RFLPs技术检测了405头猪TLR6基因片段MspⅠ酶切位点的多态性,结果表明:该位点具有两种等位基因T/C,在大围子猪、沙子岭猪、宁乡猪和黔邵花猪各群体中的频率分别为0.136/0.864、0.189/0.811、0.186/0.814、0.281/0.719。C等位基因是群体中的优势等位基因,该基因座处于Hardy-Weinberg平衡状态。利用最小二乘分析研究了该多态位点对初生体质量、45日龄体质量、60日龄体质量、4月龄体质量、6月龄体质量、6月龄体高、6月龄体长、6月龄胸围等生长性状的影响。结果显示:TT基因型个体对4月龄体质量性状影响达极显著水平(P<0.01);TT基因型4月龄体质量比CC型高25.92%;对45日龄体质量、6月龄体质量、体长和胸围性状影响达显著水平(P<0.05),TT基因型45日龄体质量比CC型高12.46%、6月龄体质量高7.20%、6月龄体长高7.62%、6月龄胸围高7.24%。由此可知,猪TLR6基因不同基因型对生长性状有着重要的影响,是猪育种应用中的一个潜在遗传标记。

京海黄鸡IGF-Ⅱ基因SNPs及其与生产性能关系研究

以京海黄鸡为材料,采用PCR-SSCP技术测定IGF-Ⅱ基因3个SNPs位点,同时分析它们对不同周龄体重及产蛋性状的遗传效应。结果显示,3个位点分别发生C→G、G→C、G→A的单碱基突变,各检测到3种基因型,P1位点偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05)。最小二乘方差分析表明,AA与BB基因型个体300日龄产蛋数存在显著差异(P<0.05),A为增效等位基因,B为减效等位基因;CD基因型个体12周龄体质量显著高于CC型(P<0.05);EE、EF基因型个体300日龄平均蛋质量显著高于FF型(P<0.05),E为增效等位基因,F为减效等位基因。联合基因型AA/CC/EF平均蛋质量显著高于AB/CD/EE与AB/CD/EF(P<0.05);AB/CD/EF基因型个体300日龄体质量显著高于AA/CC/EF、BB/DD/EE型(P<0.05)。

利用RAPD标记对不同秋眠级苜蓿种质的聚类和评价

利用RAPD标记对25份不同秋眠等级的苜蓿材料进行分析,构建了25份苜蓿材料的DNA指纹图谱,用两种方法(特异的谱带类型和不同引物谱带类型的组合)可以有效的鉴别苜蓿单株,说明RAPD标记是鉴定苜蓿的一种有效方法。通过计算25份苜蓿材料的遗传距离,进行聚类分析,探讨它们之间的亲缘关系。结果如下:25份苜蓿材料间的遗传距离介于4.69-8.14之间,说明材料间的遗传距离较大,亲缘关系较远,遗传基础较宽;从50条RAPD引物中筛选出19条引物,总共扩增出144条带,其中134条呈多态性,占93.05%,10条为单态性带,占6.94%;遗传距离为7.39时,试验材料可以分为差异明显的4类,苜蓿材料间有较大的遗传差异,这为苜蓿引种、亲本选配,分子标记辅助选择育种提供良好的理论基础和科学依据。

组蛋白H2A去泛素化酶MYSM1缺陷小鼠造血干细胞增殖加快且凋亡增加

目的研究组蛋白H2A去泛素化酶MYSM1缺陷(MYSM1-/-)小鼠骨髓造血干细胞(HSC)的静息状态、增殖与凋亡情况。方法分离MYSM1-/-小鼠和野生对照(MYSM1+/+)小鼠的骨髓细胞,利用免疫磁珠和流式细胞仪分选获得表面标志为lin-Sca-1+c-kit+的HSC。采用腹腔注射溴脱氧尿嘧啶核苷(Brd U)的方法检测HSC增殖与细胞周期、采用Hoechst 33342-派若宁(pyronin)Y双染色法检测静息态HSC的比例、采用异硫氰酸荧光素标记膜联素Ⅴ/7-氨基放线菌素D(annexinⅤ-FITC/7-AAD)双染色法检测HSC凋亡。比较MYSM1-/-小鼠和MYSM1+/+对照小鼠HSC数目、细胞周期、细胞增殖和细胞凋亡的变化情况。结果 MYSM1-/-小鼠的骨髓细胞、HSC总数与野生型小鼠相比明显降低;HSC的S期比例增加、增殖加快、静息期细胞减少但功能有缺陷的MYSM1-/-HSC凋亡率显著上升。结论 MYSM1对维持HSC的静息状态有非常重要的作用,其缺陷可引起静息态的HSC大量进入S期,异常增殖的HSC凋亡增加并最终引起HSC和骨髓细胞总数减少。

白芨胶对大鼠皮肤成纤维细胞VEGFmRNA表达的影响

目的:研究白芨胶对体外培养的大鼠皮肤成纤维细胞VEGFmRNA表达的影响,探讨白芨胶促进伤口愈合的分子机制。方法:体外培养大鼠皮肤成纤维细胞,分别给予不同浓度的白芨胶进行干预,然后用RT-PCR技术分别检测各组细胞的VEGFmRNA表达,并进行定量分析。结果:白芨胶在不同浓度时连续干预至第3d,以0.5mg/ml浓度条件下,VEGFmRNA表达最强。结论:白芨胶对体外培养的大鼠皮肤成纤维细胞VEGFmRNA表达有明显促进作用,其作用强度随浓度而改变。

磷脂转移蛋白(PLTP)基因HaeⅢ多态性与猪生长性能相关性研究

应用PCR-RFLP技术检测猪磷脂转移蛋白(PLTP)基因内含子4多态性。结果表明:凉伞猪、龙潭猪群体中PLTP基因内含子4经HaeⅢ酶切后均有A和B 2个等位基因存在。利用最小二乘分析研究该多态位点对初生质量、45日龄质量、60日龄质量、4月龄质量、6月龄体质量、6月龄体高、6月龄体长、6月龄胸围等生长性状的影响。结果显示:aa与AA基因型个体间在4月龄体质量上存在极显著差异(P<0.01),同样在6月龄体高上存在显著差异(P<0.05),Aa基因型个体在初生质量上显著高于AA基因型个体(P<0.05)。由此可知,猪PLTP基因不同基因型对生长性状有着重要的影响,是猪育种应用中的一个潜在的遗传标记。

一种改良的CTAB法提取马尾松基因组DNA

以马尾松针叶为试验材料,利用改良的CTAB法抽提基因组DNA,其浓度和纯度符合PCR实验的要求,经凝胶电泳检测,DNA纯化效果好。

糖皮质激素受体基因内含子7长度多态性与猪脂肪性状相关研究

应用特异PCR技术检测了猪糖皮质激素受体（GR）基因内含子7长度多态性,并分析其与脂肪性状的相关性。结果表明：凉伞猪、龙潭猪群体中,GR基因内含子7长度多态性发现有A和B2个等位基因存在,该2种等位基因A/B频率在2个群体中分别为0.2286/0.7714和0.2008/0.7992。B等位基因是群体中的优势等位基因,该基因座在2个群体中处于Hardy-Weinberg平衡状态。建立混合模型方程组分析该长度多态对猪脂肪性状的效应,结果显示,猪GR基因内含子7长度多态的不同基因型与肌内脂肪、肩部膘厚、腰部膘厚、6~7肋膘厚、板油质量等性状显著相关（P〈0.05）。表明猪GR基因内含子7长度多态对猪脂肪沉积有一定的影响。

褶纹冠蚌肝脏线粒体DNA的初步研究

对褶纹冠蚌肝脏线粒体ｍｔＤＮＡ进行了提取，纯化，内切酶分析和电镜观察，ＢａｍＨＩ和ＢｇｌＩ单酶切结果分别产生两个和三个片段，测得其分子大小为１５．４９ｋｂ，分子量为９．５７×１０＾６，电镜观察显示ｍｔＤＮＡ呈环形，大小为１５．４０ｋｂ。褶纹冠蚌肝脏ＤＮＡ与其它动物的ｍｔＤＮＡ在形状和大小上相似。

DNA芯片的制作与应用

介绍了ＤＮＡ芯片的制作方法：支持物表面经活性处理后，采用原位合成法在支持物表面合成寡核苷酸探针，或用芯片外合成法制得探针后将探针通过喷墨打印法或化学方法固定到支持物上．探针与经过ＰＣＲ扩增、标记的生物样品杂交，检测杂交信号并进行分析以获得生物样品的遗传信息．讨论了该技术在诸如基因组研究、遗传分析、基因诊断等多方面的应用，并估计了今后的发展方向及前景．

浙江省桃花水母18S rRNA基因序列分析及物种鉴定

采用PCR和DNA测序技术扩增和测序了2003-2008年间采自浙江省宁波、杭州、温州和金华4个地区7个地点桃花水母（Craspedacusta）核糖体小亚基rRNA（18S rRNA）基因,并与已知索氏桃花水母（Craspedacusta sow-erbyi）和中华桃花水母（Craspedacusta sinensis）18S rRNA基因序列进行了比对。结果显示：这7个地点的桃花水母与索氏桃花水母序列极为相似,相似度达99.67%-100%,遗传距离为0-0.002,而与同属中华桃花水母的遗传距离为0.013-0.015。分子系统学分析显示这7个地点桃花水母与索氏桃花水母分支的置信度高达100%。结果确定分析样品均为索氏桃花水母。

广东汉族人HLA－DQA基因多态性检测

广东汉族人ＨＬＡ－ＤＱＡ基因多态性检测周俊宜，罗超权，杨英浩，刘熙文（中山医科大学生物化学教研室；广州，５１００８９）关键词ＰＣＲ－ＳＳＯ，ＨＬＡ－ＤＱＡ，基因分型，基因多态性中图号０５２７．３；Ｄ９１９国外大量资料表明，ＨＬＡ各组等位基因的数量及其...

乙醛脱氢酶-2基因及其rs671多态性与相关疾病

乙醛脱氢酶-2(ALDH2)是酒精代谢过程中的关键酶,在酒精代谢产生的高毒性物质乙醛的催化过程中起着重要作用,其基因多态性(尤其是rs671位点多态性)与肝脏疾病、心血管疾病、呼吸道疾病、癌症、阿尔茨海默病(AD)等的发生或发展关系密切,成为近年关注和研究的主要课题。

非编码RNA与骨骼肌发育研究进展

骨骼肌作为脊椎动物机体的重要组织,其胚胎期发育起始于生皮肌节的肌源性祖细胞增殖、分化成的成肌细胞,进一步发育形成肌管,最终形成肌纤维。整个发育过程受到复杂严密的调控,任何调控异常都可能影响骨骼肌正常的发育过程。近年来研究表明,除了生肌调控因子、肌细胞增强因子、配对盒因子外,非编码RNA包括微小RNA(microRNA,miRNA)、长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)和环形RNA(circular RNA,circRNA)都可作为重要的调节因子广泛参与调控骨骼肌发育过程。其中miRNA主要作用于靶mRNA,通过诱发靶mRNA的去稳定性和/或抑制翻译,在转录后水平调控相关基因表达;lncRNA长度较长,具有高级结构,可以在转录前和转录后水平,通过多种作用方式调控相关基因表达;circRNA主要作为miRNA“海绵”,竞争性结合miRNA,进而参与骨骼肌发育调控网络。作者将从骨骼肌发育、miRNA作用机制、miRNA与骨骼肌发育、lncRNA作用机制、lncRNA与骨骼肌发育、circRNA作用机制、circRNA与骨骼肌发育7个方面进行综述,以期为研究非编码RNA调控骨骼肌发育提供参考。

精子sncRNAs在环境暴露相关跨代遗传中的作用

哺乳动物胚胎发育受遗传和表观遗传的共同调控。精子作为重要的雄性生殖细胞,通过受精过程,将这些信息传递给卵子,进而影响子代的发育。精子中携带有丰富的表观遗传信息,其中小非编码RNAs(small noncoding RNAs,sncRNAs)在精子发育不同阶段发挥重要的作用,包括调控基因表达、介导蛋白质翻译,以及参与精子的表观遗传信息传递等。环境暴露包括饮食变化、毒性物质暴露和心理压力等。现有的研究表明,环境因素不仅影响机体健康,还可能导致生殖系统配子(精子与/或卵子)表观遗传信息的改变。越来越多的证据表明,亲本在环境暴露后发生的获得性性状变化,可通过配子的表观遗传信息传递给后代,即产生跨代遗传。本综述主要讨论因环境因素引起的获得性性状,可通过精子sncRNAs变化,产生跨代遗传,并影响胚胎发育及子代健康。本综述的讨论主要集中在tRNA来源的小RNAs(transfer RNA-derived small RNAs,tsRNAs)、微RNA(microRNAs,miRNAs)和PIWI相互作用RNAs(PIWI-interacting RNAs,piRNAs),并涉及到最近在精子中发现有大量表达的rRNA来源的小RNAs(risbosome-RNA derived small RNAs,rsRNAs)。此外,本文还进一步探讨了环境因素影响精子sncRNAs表达变化的可能机制。通过对上述内容的综述,将更好地理解精子sncRNAs在跨代遗传中的作用,促进表观遗传学领域的新研究,加深对基本生命过程的理解。

用信息论方法研究几类核酸序列的密码子使用与基因表达水平的关系

研究了Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａｃｏｌｉ，Ｂａｃｉｌｌｕｓｓｕｂｔｉｌｉｓ和ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓＹｅａｓｔ三类核酸序列的密码子使用频率与基因表达水平的关系，依照每一基因中最适密码子、非最适密码子和稀有密码子出现的概率，计算其信息熵Ｅ。首先，发现Ｅ与ＣＡＩ值保持了很好的线性关系，且三类序列的线性拟合方程非常接近，因此，用信息熵Ｅ作为描述基因表达水平的物理量是合适的；其次，三类序列的Ｅ─Ｐ（Ｒ）（稀有密码子概率）曲线都接近对数关系，说明稀有密码子在抑制基因表达水平方面，起着很重要的作用；第三，由各种关系曲线的相似性，可以推测，Ｅ．ｃｏｌｉ等原核生物与真核生物Ｙｅａｓｔ在密码子使用与基因表达水平的关系方面，其机理是相似的。

错配修复系统的生物学效应和机理

在ＤＮＡ正常代谢中，碱基错配、插入或缺失可导致基因组ＤＮＡ复制错误。已证明在细菌、酵母及高等真核细胞中，都存在错配修复系统。这方面的研究已取得了一些进展，包括Ｅ．ｃｏｌｉ中的ＭｕｔＨＬＳ修复系统，酵母中的错配修复基因及其蛋白以及真核细胞中的错配修复基因及蛋白。这对消除ＤＮＡ生物合成错误，增加染色体复制的可信性，防止自由突变以及肿瘤的发生发展、诊断和治疗有着重要意义。