结构生物学实验技能课中应用可视化软件Pymol的教学体会

人们关于蛋白质结构预测的研究取得了突破性进展。从海量结构信息中对兴趣蛋白质进行功能分析及推断是生物学家未来需要探索的重点问题,但前提是需要对已有蛋白质结构的模型具有充分的认识和理解。Pymol是蛋白质三维结构可视化最常用的软件之一,其功能多样且强大,深受广大结构生物学工作者的青睐。该文旨在分享作者在本科生结构生物学实验技能课教学中使用Pymol软件的经验,深入浅出地讲解该软件的初步使用方法,从而使初学者能够达到查看、展示并进行一般性结构绘图的目的。开设该课程对提高学生对于蛋白质结构信息的理解、激发其科研兴趣等方面均具有较大益处,并且取得了良好的教学效果。