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复合编码支持向量机预测蛋白质二级结构
1
作者
郑欣亚
马文丽
+1 位作者
陈启龙
郑文岭
《微计算机信息》
2009年第13期276-278,共3页
蛋白质结构与功能一直是生命科学的研究重点。尽管蛋白质二级结构的预测已得到广泛的应用,但其预测的精度一直受到算法的制约。在本文中,采用复合编码代替传统的氨基酸编码方式,结合氨基酸疏水性对蛋白质结构的影响,提出一种新的支持向...
蛋白质结构与功能一直是生命科学的研究重点。尽管蛋白质二级结构的预测已得到广泛的应用,但其预测的精度一直受到算法的制约。在本文中,采用复合编码代替传统的氨基酸编码方式,结合氨基酸疏水性对蛋白质结构的影响,提出一种新的支持向量机算法。使用7倍交叉验证表明,本算法提高了二级蛋白质结构预测的准确性,并节约了计算资源。
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关键词
复合编码
二级结构
三元支持向量机
交叉验证
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职称材料
题名
复合编码支持向量机预测蛋白质二级结构
1
作者
郑欣亚
马文丽
陈启龙
郑文岭
机构
上海大学电子生物技术研究中心
南方医科大学基因工程研究所
黄山学院生命与环境科学学院
出处
《微计算机信息》
2009年第13期276-278,共3页
基金
基金申请人:马文丽
项目名称:基因组研究与基因分离中DNA阵列技术
基金颁发部门:国家自然科学基金委(39880032)
文摘
蛋白质结构与功能一直是生命科学的研究重点。尽管蛋白质二级结构的预测已得到广泛的应用,但其预测的精度一直受到算法的制约。在本文中,采用复合编码代替传统的氨基酸编码方式,结合氨基酸疏水性对蛋白质结构的影响,提出一种新的支持向量机算法。使用7倍交叉验证表明,本算法提高了二级蛋白质结构预测的准确性,并节约了计算资源。
关键词
复合编码
二级结构
三元支持向量机
交叉验证
Keywords
complex coding
secondary structure
TSVM
cross-validation
分类号
Q617.6 [生物学—生物物理学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
复合编码支持向量机预测蛋白质二级结构
郑欣亚
马文丽
陈启龙
郑文岭
《微计算机信息》
2009
0
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