支持向量机法对活血化瘀类药物的分类研究

以密度、基于分子表面的弱电场参数、投影参数及氢键供体数等11个结构描述符为输入,通过支持向量机(SVM)方法对99个活血化瘀类药物活性建立了构效关系的分类模型。全部化合物被随机分为包含85个化合物的训练集和包含14个化合物的测试集,使用十重交互检验方法选择最优的惩罚函数及核函数参数值,研究表明这个模型对活血化瘀类药物的活性有很好的预测效果(训练集中准确率为100%,测试集中准确率为92.9%),显示出了支持向量机算法在研究中药构效关系方面有很好的应用前景。

辣椒RWP-RK转录因子分析

RWP-RK基因家族是植物特有的转录因子家族。该家族在植物氮元素信号传导和配子体发育过程中起核心的调控作用。使用公开的中国重要栽培品种遵辣1号及其野生亲本墨西哥辣椒种"Chiltepin"的基因组序列,鉴定出辣椒基因组中含有RWP-RK结构域的基因,并进行系统进化、染色体定位、保守序列和可能功能等分析。遵辣一号基因组中与拟南芥氮代谢重要调控因子AtNLP7同源的是CaZunla01g000097、CaZunla01g004485和CaZunla00g000405。遵辣1号的2个基因Capana03g001990和Capana03g000787与拟南芥卵细胞形成相关转录因子AtRKD1、AtRKD2和AtRKD4同源。这些基因在栽培品种遵辣1号和其野生祖先品种基因组中保持了高度的保守性。此外,辣椒基因组中存在特有的RWP-RK转录因子亚家族。这一亚家族的蛋白质氨基酸序列中含有独特的保守序列。这些序列在拟南芥RWP-RK转录因子中并不存在。辣椒栽培品种遵辣1号中有在其野生祖先"Chiltepin"中不存在的RWP-RK转录因子基因。鉴定出了分别与拟南芥RWP-RK转录因子高度相似、存在重大差异以及辣椒野生种和栽培种之间存在差异的RWP-RK转录因子成员,为后期辣椒RWP-RK转录因子家族的克隆和功能研究提供了重要的信息。对这些基因进行功能研究,会极大的促进辣椒对氮元素匮乏环境响应以及辣椒配子体发育的分子机制研究。

端粒G-四链体结合酞菁分子的分子模拟研究

为揭示负电性稳定剂与人端粒G-四链体的作用机制,采用分子对接和分子动力学方法对新型负电性四磺酸酞菁分子(anionic phthalocyanine 3,4′,4″,4^(■)-tetrasulfonic acid)和人端粒平行构象G-四链体进行了系统研究。构象分析发现,酞菁分子能够单独或同时稳定结合于G-四链体的顶层和底层G-四分体平面并有效提高G-四链体的稳定性;结合自由能分析表明,酞菁分子堆叠于顶层G-四分体的结合模式在能量上更为有利,同时第二个酞菁分子的引入能够进一步提升结合强度。这些发现对新型端粒G-四链体稳定剂的开发具有重要的指导意义。

紫外线吸收剂分子印迹聚合物的制备及其性能评价

采用分子印迹技术,以UV-0作为模板分子,2-乙烯基吡啶作为功能单体,偶氮二异丁腈作为引发剂,乙二醇二甲基丙烯酸酯作为交联剂,在乙腈溶液中制备了UV-0分子印迹聚合物。用其为液相色谱固定相,将其与结构类似物UV-9基线分离,并对其吸附性进行了研究及评价。