软枣猕猴桃栽培品种DNA指纹图谱的构建及遗传多样性分析

为了对软枣猕猴桃栽培品种进行分子鉴别及分析不同品种间的亲缘关系,采用对叶片直接进行PCR扩增的方法,利用EST-SSR分子标记技术构建了常见的42个软枣猕猴桃品种的数字指纹图谱和模式指纹图谱数据库(cluster project),并进行了遗传多样性分析.结果表明:利用21对软枣猕猴桃核心引物扩增所有品种的基因组,共检测到132个等位位点,包括122个多态性位点,多态性比率为92.4%.每对引物扩增出的等位位点数为3~8个,平均每对引物扩增6.28个基因型,扩增条带大小100~300bp,多态信息含量(polymorphism information content,CPIC)为0.721,基因流为1.454,平均杂合率为0.691.其中,7对引物,即ACAR2,ACAR13,ACAR53,ACAR75,ACAR92,ACAR112和ACAR120可作为指纹图谱构建的首选引物,利用其中的ACAR2,ACAR13,ACAR53和ACAR75以引物组合方式构建指纹图谱可区分42个品种.聚类分析表明在遗传距离0.64处42个品种被分为一类,在遗传距离0.81处分为4类.聚类结果与品种的特性及来源具有较高的一致性.

石柱参人参皂苷合成酶基因的克隆及表达量测定

以人参为对照组,采用HPLC法测定5a生石柱参样品中6种人参皂苷(Rb1、Rb2、Rc、Re、Rg1、Rg2)的质量分数,采用实时荧光定量PCR技术对不同生长期人参皂苷合成酶基因(SS、CYP82D47、CYP716A42)的表达量进行比较,以探究石柱参人参皂苷质量分数较低的原因;并对石柱参CYP82D47基因进行克隆、测序及生物信息学分析,获得石柱参系统发育树。结果表明:石柱参人参皂苷合成酶基因的表达量在根、茎、叶组织中具有高度相似性,却也具有高度组织差异性,比如SS基因在石柱参根、叶中表达活跃,在茎中表达量有限;CYP82D47基因在石柱参中的表达部位主要是茎、叶组织;而CYP82D47基因在在根、茎、叶组织中表达较活跃,尤其是根、叶中;此外,人参皂苷合成酶基因CYP82D47的表达量相对较低是造成石柱参人参皂苷质量分数较低的原因之一;由系统进化树可见,石柱参与竹节参、西洋参、三七及刺五加的亲缘关系较近,结果与物种进化程度相符合。

软枣猕猴桃EST-PCR体系建立及品种遗传关系

以25份软枣猕猴桃健康幼嫩叶片为材料,改良传统CTAB法提取高质量的基因组DNA,建立适合软枣猕猴桃的EST-SSR反应体系,即20μL反应体系:d NTPs(2.5 mmol·L^(-1))2μL,引物(10μmol·L^(-1))各1.5μL,DNA(50~100 ng·μL^(-1))1μL,Taq DNA聚合酶(5 U·μL^(-1))0.2μL,Mg Cl2(1.5 mmol·L^(-1))1.5μL,10×缓冲液2.5μL,加dd H2O至20μL;采用该体系对25份软枣猕猴桃进行遗传关系分析。结果可见:21对引物共扩增133条带,多态性位点百分率为96.2%;在遗传相似系数0.69处,25份种质资源分为2支,基本上是红肉和绿肉软枣猕猴桃各分1支,在遗传相似系数0.78处分为4支,遗传相似性最高的为LD133和LD241,珍玉2号和珍玉3号,佳绿和LD237。

红光熊蜂触角感受器扫描电镜观察及气味受体基因BiOr119的克隆与表达分析

旨在克隆红光熊蜂气味受体基因、分析蛋白质结构特性与理化性质,确定其在工蜂不同组织、不同发育阶段表达量的差异。以红光熊蜂工蜂为材料,采用扫描电镜观察其触角感受器,RT-PCR技术扩增获得气味受体基因cDNA序列,采用生物信息学软件分析编码蛋白质的结构特性,MEGA7.0软件邻接法构建氨基酸同源性系统进化树;采用实时定量PCR技术分析红光熊蜂气味受体基因BiOr119在工蜂不同组织(触角、头、胸、腹、足和翅)、不同发育阶段的差异表达情况。结果表明,工蜂触角具4种感受器,即板型感受器、锥状感受器、毛型感受器和腔型感受器;BiOr119基因开放阅读框(ORF)长1077 bp,编码358个氨基酸,分子质量为41.48 ku,理论等电点(pI)7.04,是一种稳定的碱性疏水蛋白;含有6个跨膜结构(7tm-6),蛋白氨基端位于膜内;氨基酸同源性分析,BiOr119与地熊蜂BtOr9a一致性高达96.2%;BiOr119基因在同日龄下触角的基因表达量极显著高于其他组织(P<0.01),腹部表达量最低。综上所述,BiOr119具有昆虫气味受体的典型特征。

蓝莓种质资源遗传多样性的EST-SSR分析

文章采用EST-SSR分子标记对6个蓝莓品种进行遗传多样性分析。结果表明:利用13对多态性引物共扩增出65条条带,其中多态性条带53条,多态性比率为81.5%,多态性信息量(PIC)范围为0.513~0.887,平均每对引物的PIC值为0.698,遗传分化系数F_(st)平均值为0.137,基因流N_m的平均值为1.567,说明6种供试材料种群之间交流较大,遗传多样性较低,遗传基础相对狭窄,物种之间亲缘关系较近。

红枣分子标记技术应用研究进展

红枣是山西等众多地区的主要经济作物,但传统的分类、命名及育种限制了其发展。随着分子标记技术的发展,其在枣的分类育种的应用方面显示出了良好的优越性。本文简要综述了分子标记技术在红枣种质资源和遗传育种研究中的应用,如在遗传图谱构建、亲缘关系及分类研究、遗传多样性、枣种鉴定及育种方面的应用,并分析了其在红枣研究中存在的问题和应用前景,以期为开展红枣分子遗传育种提供参考。