一种基于多路纳米孔测序技术的多种血清型沙门菌快速分型方法

目的构建基于多路纳米孔测序技术的本地化沙门菌血清型分型方法,评估血清型数量和测序时间对分型结果的影响,为多种血清型沙门菌的同时快速分型提供方法。方法首先,利用纳米孔测序技术建立多菌株测序方法。其次,基于沙门菌核心基因组数据库构建本地化沙门菌血清型分型流程。最后评估血清型数量和测序时间对分型结果的影响。结果建立的多种血清型沙门菌分型方法准确率和特异性均可达到100%,且在2 h测序时间内可完成6株以上不同血清型的沙门菌快速准确分型。结论该方法能够同时对多株血清型沙门菌快速分型,有效提高沙门菌血清型的鉴定效率,为环境水体中沙门菌血清型的快速鉴定提供有力支持。