盐单胞菌属一新种——黄海盐单胞菌

以《伯杰氏系统细菌学手册》第1卷(1984年)等为主要依据,对从江苏省黄海盐场晒盐池分离到的H_5菌株进行了鉴定。结果表明,H_5菌株符合盐单胞菌属(Halomonas)的特征。但该菌株的形态、生理生化特性及DNA中G十C mol％等又不同于该属中的已知种。同时,H_5菌株与该属中的相关种——伸长盐单胞菌(Halomonas elongata ATCC 33173)的DNA杂交率为44.7％。因而将H_5菌株鉴定为盐单胞菌属的一个新种,命名为黄海盐单胞菌(Halomonas huanghaiensis sP. nov.),且H_5菌株作为模式株。

ERIC-PCR:一种快速鉴别环境细菌菌株的方法

以 Ｅ Ｒ Ｉ Ｃ（ 肠杆菌基因间共有重多序列） 序列设计的特异引物对３ 株大肠杆菌、３ 株软腐欧氏杆菌、２ 株草生欧氏杆菌、１ 株梨火疫欧氏杆菌、１ 株催娩克氏菌、１ 株阴沟肠杆菌和９ 株具有降酚能力的细菌等２０ 种细菌的基因组 Ｄ Ｎ Ａ 进行 Ｐ Ｃ Ｒ 分析．每种菌株均存在数目不等的各自独特的带型，能够区分同一种类中极为相近的菌株．经多次重复，各特异性扩增的主要带型能重复稳定出现．聚类分析的结果表明，供试菌株多数按照分类地位归到相应的组中．９ 种具有降酚能力的细菌中，２ 种分离自处理焦化废水池活性污泥，７ 种来自土壤样品． Ｅ Ｒ Ｉ Ｃ Ｐ Ｃ Ｒ 指纹图显示，前２ 种属于一类，都有一条大小约１ ．１ ｋｂ 的主带，其它７ 种土壤中分离出来的细菌除其中１ 种有１ 条约１ ．２ ｋｂ 大小的主带外，其余６ 种都有１ 条大小约１ ．４ ｋｂ 的带．聚类分析将从土壤中分离出来的细菌归为３ 种不同的类型． Ｅ Ｒ Ｉ Ｃ Ｐ Ｃ Ｒ 可以从分子水平对细菌基因组进行快速指纹图分析。

生防细菌BRF-1和BRF-2鉴定及生物学特征

BRF-1和BRF-2是从大豆根际土壤中筛选得到的两株革兰氏阳性生防细菌,平板对峙培养表明它们对7种植物病原真菌具有拮抗作用。BRF-1芽孢球型中生,无鞭毛;而BRF-2芽孢球型端生,周生鞭毛。部分生物学特征研究表明,两菌株之间存在较大的差异。采用Biolog微生物自动鉴定仪鉴定和对两菌株的16S rDNA基因序列分析表明,菌株BRF-1和BRF-2分别与多粘类芽孢杆菌和枯草芽孢杆菌亲缘关系最近,故把菌株BRF-1和BRF-2分别定为多粘类芽孢杆菌和枯草芽孢杆菌。

Phoma和Phyllosticta两属分类的研究进展

Ｐｈｏｍａ和Ｐｈｙｌｌｏｓｔｉｃｔａ是两个非常重要的属，引起多种植物的病害。本文就其两属的建立及演变、分类研究、分类依据和两属的个体发育进展加以综述。

土壤杆菌属的数值分类

对我国不同寄主植物上分离的77株土壤杆菌,5个标准菌株和4个根瘤菌菌株进行了102项表型特征测定,并用计算机进行数值分析。结果表明,这些菌株可归为5个群,其中4个群分别相当于《伯杰系统细菌学手册》第一卷中所记述的生物变型(biovar)1,2,3和悬钩子土壤杆菌(A.rubi)。另外一个群与它们均不相同,是该属的一个新生物变型。本研究获得的A.rubi 菌株是近50年来全世界重新发现这类菌株的唯一报道。

气单胞菌生物学特性研究进展

气单胞菌属(Aeromonas)是近年来不断引起医学界注意的革兰氏阴性发酵细菌之一,原隶于弧菌科,现已单独成立为气单胞菌科。该菌普遍存在于水生环境,经常从土壤、食物和多种动物中分离到。某些种是鱼类、两栖类、爬行类、鸟类等动物的重要病原菌、近来的大量材料证明气单胞菌属的许多种可引起人的急性胃肠炎、败血症及伤口感染等多种疾病,是免疫抑制病人和肝功能疾病患者的条件致病菌,临床病例呈上升趋势。气单胞菌属已成为引人注目的人兽共患病的新病原。

弗兰克氏菌的G+C含量和DNA杂交

对一些弗兰克氏菌的遗传和生理特性进行了研究。结果表明,7株菌可以分为3个基因群。从木麻黄(casuarina equisetifolia)分离的菌株可以划为一个基因群(与菌株 S-103的DNA 同源性在74%以上),这是国外尚未报道的新基因群。其他两株弗兰克氏菌菌株 Arl4(从赤杨根瘤分离)和 PtI1(从 Purshia 根瘤分离)分别形成另外两个基因群,这与 An 的报道一致。7株弗兰克氏菌 DNA 的 G+c mol%在69—73。S-103基因群菌株不利用糖类,仅利用简单的有机酸盐。而菌株 Arl4和 PtI1则利用一些糖和有机酸盐作为碳源。

杀线虫活性菌的筛选、分离与初步鉴定

从河南南阳宝天曼森林土壤样品中分离纯化细菌,以对线虫Caenorhabditis elegans的杀灭作用为筛选模型,从128株细菌中共筛选到3株杀线虫活性较高的细菌,编号分别为B、C、D。当作用于线虫24 h后,它们对线虫的致死率分别为20%、25%、97%。然而发现当B和C共同作用于线虫时,致死率大为提高(约为90%),说明二者在杀线虫方面有协同作用。通过培养观察菌落形态,革兰氏染色;提取各菌种基因组,扩增16S rDNA测序,系统发育分析,确定这三株菌的鉴定结果为:菌株B与Bacillus subtilis strain xfchu2的同源性较高,为96.46%,菌株C与Stenotrophomonas maltophilia strain QT24的同源性较高,为92.75%。菌株D与荧光假单胞菌属的同源性较高。

利用氢和二氧化碳生长的一个泥杆菌新种——嗜氢泥杆菌

从降解有机物产生甲烷的富集培养物中分离到一株利用巴豆酸的严格厌氧革兰氏阴性杆菌.此菌利用氢和二氧化碳或甲酸合成乙酸,发酵巴豆酸产生丁酸和乙酸,发酵葡萄糖、果糖、麦芽糖和半乳糖产生乙酸、乙醇和氢或甲酸,不利用延胡索酸、酒石酸和柠檬酸生长.该菌不产生芽孢,不还原硫酸盐,触酶反应阴性,DNA的G+C含量为30.7±1mol%,是泥杆菌属中的一个新种,定名为嗜氢泥杆菌(Ilyobacter hydrogenotrophicus nov.sp.).

类杆菌分类的脱氢酶系列

国外已建立了4h水解酶色原底物系列,成功地用于厌氧菌的分类与鉴定,鉴于国内的无系列水解底物,我们对厌氧菌系列脱氢酶进行了研究,以便建立一种快速鉴定系列。为此选择类杆菌的参考株作为分类单位,以不同的糖、氨基酸和有机酸的天然底物纸片与细菌完整细胞进行酶学反应,并以四唑盐受氢后以变色效应来指示酶的存在。筛选了18项脱氢底物与色氨酸、尿素一起,组成20项以检测细菌脱氢酶为主的系列,研究发现完整的菌细胞可以较好地表现底物的脱氢酶活性,酶的分布具有菌种特征,这个系列在有氧条件下,30～60min出现明显的可见反应。以4株脆类杆菌参考株进行24次重复试验,其中9项的阳性概率为0.99,7项为0.01,其它4项分别是0.03,0.125,0.5和0.66。尤其胆酸脱氢酶与常规胆汁抑制试验有较好的相关性,有可能取代厌氧菌分类中有要意义的20％胆汁抑制实验。