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绿豆GPX基因家族鉴定及其对非生物胁迫的响应
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作者 邱涛涛 苏鸿飞 +5 位作者 王瑜 张禾佳 胡慧欣 阮诗婷 袁星星 谢彦杰 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期453-461,共9页
[目的]本文利用生物信息学方法从绿豆基因组中筛选谷胱甘肽过氧化物酶(glutathione peroxidase,GPX)基因家族成员,并探究其组织表达模式及其对若干胁迫的响应。[方法]利用生物信息学的方法对绿豆GPX家族的等电点、相对分子质量、共线性... [目的]本文利用生物信息学方法从绿豆基因组中筛选谷胱甘肽过氧化物酶(glutathione peroxidase,GPX)基因家族成员,并探究其组织表达模式及其对若干胁迫的响应。[方法]利用生物信息学的方法对绿豆GPX家族的等电点、相对分子质量、共线性、上游顺式作用元件等进行分析,通过转录组测序和RT-qPCR进一步分析绿豆GPX基因家族的组织表达模式以及在不同逆境胁迫和激素作用下的表达水平。[结果]从绿豆基因组中筛选出8个GPX基因,其不均匀分布于1/2/3/5/10号染色体上。基因结构及基序分析结果显示,8个GPX的基因结构类似,均含有6个内含子区域,并且大部分GPX成员都具有UTR区。转录组以及RT-qPCR分析结果表明,多个GPX家族成员均能响应多种逆境胁迫。组织表达分析结果显示,不同GPX家族成员在不同组织中呈特异性表达;GPX家族整体在绿豆中表达丰度较低,但表达量能被各种胁迫强烈诱导。[结论]绿豆GPX基因家族响应多种非生物胁迫,不同GPX成员响应的胁迫类型不同。 展开更多
关键词 绿豆 GPX基因家族 非生物胁迫 基因表达
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香鳞毛蕨DfDXR基因克隆和表达模式分析
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作者 马骞 袁强 +2 位作者 邱晓杰 宋春华 常缨 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2023年第1期102-109,共8页
为探索1-去氧-D-木酮糖-5-磷酸还原异构酶(DXR)是否参与香鳞毛蕨对环境的抗逆功能,用PCR克隆并鉴定了香鳞毛蕨DfDXR基因,并通过在线预测网站对其蛋白序列进行生物信息学分析,利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术研究了DfDXR基因在不同化... 为探索1-去氧-D-木酮糖-5-磷酸还原异构酶(DXR)是否参与香鳞毛蕨对环境的抗逆功能,用PCR克隆并鉴定了香鳞毛蕨DfDXR基因,并通过在线预测网站对其蛋白序列进行生物信息学分析,利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术研究了DfDXR基因在不同化学物质和逆境胁迫处理下相对表达量的变化。结果表明,成功克隆出DfDXR基因的CDS序列全长1434 bp,编码477个氨基酸,DXR蛋白二级结构为alpha-beta型。蛋白质多序列比对以及进化树分析表明,DfDXR与铁线蕨AcDXR亲缘关系较近,与苹果和桃等植物的DXR蛋白亲缘关系较远,Motif分析表明,该蛋白含有PLN02696结构域,该结构域为DXR蛋白的保守结构域,亚细胞定位预测DXR蛋白定位于叶绿体上,与其他物种一致。对qRT-PCR数据进行分析显示,DfDXR的相对表达量在茉莉酸甲酯(MeJA)和聚乙二醇(PEG)处理后总体都呈现上调的趋势,并分别在1,12 h达到最高;NaCl处理下呈“降—升—降”的趋势,但各处理时间下的表达量均低于对照组;水杨酸(SA)、脱落酸(ABA)、乙烯利(ETH)、高温(HT)以及低温(LT)处理下,DfDXR的相对表达量也发生明显变化。在香鳞毛蕨响应不同非生物胁迫过程中,DfDXR均发挥调控作用,且DfDXR对不同化学物质和逆境胁迫的响应时间不同。 展开更多
关键词 香鳞毛蕨 DfDXR基因 非生物胁迫 萜类物质 功能验证
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AM真菌DNA的提取与PCR-DGGE分析 被引量:50
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作者 龙良鲲 羊宋贞 +1 位作者 姚青 朱红惠 《菌物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期564-569,共6页
分别从丛枝菌根(AM)真菌的单孢、宿主植物根系及土壤样品中提取DNA,对AM真菌的18SrDNA中NS31/Glol区进行Nested PCR特异性扩增,表明Nested PCR能很好地以微量DNA为模板扩增出目标产物;对扩增产物进行DGGE电泳,3种样品表现出不同的DGGE... 分别从丛枝菌根(AM)真菌的单孢、宿主植物根系及土壤样品中提取DNA,对AM真菌的18SrDNA中NS31/Glol区进行Nested PCR特异性扩增,表明Nested PCR能很好地以微量DNA为模板扩增出目标产物;对扩增产物进行DGGE电泳,3种样品表现出不同的DGGE指纹图谱特征。本文认为,将Nested PCR与DGGE技术相结合,可以成为AM真菌分子生态学研究的有效途径。 展开更多
关键词 GLOMUS 巢式PCR 宿主植物的根 土壤
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几种中药DNA提取方法的比较研究 被引量:22
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作者 陈莉 魏莉 +3 位作者 周童 李敏瑜 覃玉斌 吴耀生 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期137-139,136,共4页
以丹参、绞股蓝、三七为材料,分别采取CTAB法和SDS法提取基因组DNA,并通过紫外分光光度法和琼脂糖凝胶电泳对所提取的DNA样品进行检测,将它们在DNA产量、质量等方面的优缺点进行总结。结果表明,CTAB法能从丹参、绞股蓝中提取高质量的DNA... 以丹参、绞股蓝、三七为材料,分别采取CTAB法和SDS法提取基因组DNA,并通过紫外分光光度法和琼脂糖凝胶电泳对所提取的DNA样品进行检测,将它们在DNA产量、质量等方面的优缺点进行总结。结果表明,CTAB法能从丹参、绞股蓝中提取高质量的DNA,而三七的DNA更适合用SDS法提取。 展开更多
关键词 丹参 绞股蓝 三七 基因组DNA DNA提取
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非洲菊花瓣总RNA提取方法的改进 被引量:46
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作者 张玉进 孟祥春 +1 位作者 潘瑞炽 王小菁 《植物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第6期722-726,共5页
利用异硫氰酸胍一步法和植物总RNA提取试剂盒 (RNeasyPlantMiniKit)提取非洲菊 (Gerberahy brida)花瓣中总RNA时存在多糖的干扰。实验中利用异硫氰酸胍一步法提取总RNA ,在RNA沉淀后 ,再次加入适量变性液 ,冻融 2次 ,再加热至 45℃使RN... 利用异硫氰酸胍一步法和植物总RNA提取试剂盒 (RNeasyPlantMiniKit)提取非洲菊 (Gerberahy brida)花瓣中总RNA时存在多糖的干扰。实验中利用异硫氰酸胍一步法提取总RNA ,在RNA沉淀后 ,再次加入适量变性液 ,冻融 2次 ,再加热至 45℃使RNA完全溶解 ;试剂盒提取时 ,适当延长各提取步骤的离心时间 ,并增加DEPCH2 O溶解RNA的时间。通过以上操作方法的改进可排除多糖的干扰 ,得到高质量的总RNA。为进一步利用Northern杂交技术研究非洲菊中花色素苷基因的表达 ,进行花色改良提供了方便、有效的实验手段。 展开更多
关键词 非洲菊花瓣 异硫氰酸胍一步法 RNA提取试剂盒 总RNA 提取方法 改进
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水稻颖果总RNA提取方法的研究 被引量:12
6
作者 陈星 汪琦 +2 位作者 黄迎春 王欣生 王英典 《北京师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期79-81,共3页
利用TRIZOL试剂快速提取法、异硫氰酸胍法和改良的SDS法提取不同发育时期水稻颖果的总RNA,并通 过凝胶电泳、紫外分光光度法检测提取获得的RNA样品的品质.研究结果表明,改良的SDS法提取的RNA具有28S rRNA和18SrRNA2条清晰的条带,且... 利用TRIZOL试剂快速提取法、异硫氰酸胍法和改良的SDS法提取不同发育时期水稻颖果的总RNA,并通 过凝胶电泳、紫外分光光度法检测提取获得的RNA样品的品质.研究结果表明,改良的SDS法提取的RNA具有28S rRNA和18SrRNA2条清晰的条带,且无降解.其D260/D280为1.84~1.97,具有较高的纯度.其他2种方法获得的RNA 品质较差,有降解和弥散现象.将改良的SDS法提取的RNA逆转录成cDNA,作为PCR扩增的模板,可获得清晰的约 1.7kb的目的条带.该法提取的RNA用于Northern杂交,可产生特异的杂交信号.这些结果进一步证明了改良的SDS 法提取的RNA具有很高的品质与纯度,可以满足下一步分子生物学研究的需要. 展开更多
关键词 水稻 颖果 总RNA 提取
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一种简便实用的玉米干种子基因组DNA提取方法 被引量:14
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作者 魏琦超 畅丽萍 +2 位作者 周岩 宫俊丽 王慧娟 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期165-167,共3页
利用改良的CTAB法提取玉米干种子基因组DNA,DNA样品经紫外光谱吸收、琼脂糖凝胶电泳、PCR和酶切检测,表明获得的DNA样品纯度较好、无明显降解,DNA质量可满足下游分子生物学实验要求,证实该方法是提取玉米基因组DNA的一种有效方法。
关键词 玉米 干种子 基因组DNA 提取
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核糖体DNA ITS区序列在植物分子系统学研究中的价值 被引量:34
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作者 赵志礼 徐珞珊 +1 位作者 董辉 王峥涛 《植物资源与环境学报》 CAS CSCD 2000年第2期50-54,共5页
本文就近年来国内外有关被子植物核糖体DNA中的内转录间隔区 (ITS)序列在植物属内、近缘属间乃至科内系统发育研究中的应用 ,结合作者在中国姜科山姜属 (AlpiniaRoxb .)上的研究 ,对ITS区序列在植物分子系统学研究中的价值作一简要综述 。
关键词 分子系统学 核糖体DNA ITS区序列 植物
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坛紫菜叶状体的细菌性红烂病研究 被引量:11
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作者 严兴洪 黄林彬 +1 位作者 周晓 李琳 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期313-322,共10页
本实验对发生在福建省平墰岛自然海区的野生坛紫菜(Porphyra haitanensis)叶状体上的红烂病进行了研究。患病叶状体上存在大小不等、肉眼可见的圆形或亚圆形病斑,镜检发现病斑内存在大量铁锈红色的死细胞和少量已解离的发绿或发白死细... 本实验对发生在福建省平墰岛自然海区的野生坛紫菜(Porphyra haitanensis)叶状体上的红烂病进行了研究。患病叶状体上存在大小不等、肉眼可见的圆形或亚圆形病斑,镜检发现病斑内存在大量铁锈红色的死细胞和少量已解离的发绿或发白死细胞。将患病叶状体与健康坛紫菜叶状体共培养3d后,后者也出现了相同的红烂病,表明该病是由传染性病原侵入引起的。从患病叶状体中分离到一种病原菌,能感染健康叶状体使其出现相同的病症。该病原菌具有分泌毒素和微弱的消化琼胶能力,经高压灭菌或煮沸后的病原菌液,其杀死紫菜细胞的能力比未处理的病原菌液增加了数倍,这说明该菌可能通过释放内毒素来杀死叶状体细胞。鉴于此病是由于病原菌侵入叶状体并释放内毒素杀死紫菜细胞,且死亡细胞呈铁锈红色,故将其命名为"坛紫菜细菌性红烂病"。 展开更多
关键词 坛紫菜 叶状体 红烂病 病原菌 内毒素
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响应曲面法优化女贞子总黄酮的超声波提取工艺 被引量:12
10
作者 江明珠 陈星 +1 位作者 颜辉 张久成 《江苏科技大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2010年第6期604-608,共5页
采用超声波提取法提取女贞子总黄酮,在单因素试验的基础上,利用响应面分析法考察乙醇的浓度、超声提取功率及超声提取时间对总黄酮得率的影响.结果表明,最佳提取条件为:乙醇体积分数为49.12%,超声提取功率为116.94 W,超声提取时间为1.31... 采用超声波提取法提取女贞子总黄酮,在单因素试验的基础上,利用响应面分析法考察乙醇的浓度、超声提取功率及超声提取时间对总黄酮得率的影响.结果表明,最佳提取条件为:乙醇体积分数为49.12%,超声提取功率为116.94 W,超声提取时间为1.31 h;响应面分析法可以优化女贞子总黄酮的提取工艺,在各影响因素合理取值范围内找到最佳得率及其对应的最佳提取条件. 展开更多
关键词 女贞子 总黄酮 超声波提取 响应曲面
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一种简易的植物核酸提取方法─—从干叶和新鲜叶中快速提取RNA和DNA 被引量:23
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作者 施苏华 章群 +2 位作者 陈月琴 唐绍清 屈良鹄 《中山大学学报(自然科学版)》 CSCD 1996年第2期103-105,共3页
本文介绍了一种植物核酸提取的简易方法.该法只需在常温下按常规的分子生物学操作条件从已干燥的和新鲜的植物叶中快速提取总RNA和DNA.所获得的RNA和DNA能顺利用于下一步的PCR、测序及小分子RNA研究等分子生物学实验.
关键词 植物 核酸 提取 RNA DNA
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Trizol法提取厚皮甜瓜果实RNA条件的筛选 被引量:10
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作者 赵继荣 毕阳 +1 位作者 刘红霞 高雄杰 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期56-59,共4页
采用改良的Trizol法提取厚皮甜瓜‘银帝’果实中的RNA.利用琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度法和RT-PCR法进行纯度、浓度和RNA完整性检测.结果表明:1 mL Trizol用于提取200 mg甜瓜果实量时,得到的RNA产量最大,氯仿抽提2次时提取到的RNA的A... 采用改良的Trizol法提取厚皮甜瓜‘银帝’果实中的RNA.利用琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度法和RT-PCR法进行纯度、浓度和RNA完整性检测.结果表明:1 mL Trizol用于提取200 mg甜瓜果实量时,得到的RNA产量最大,氯仿抽提2次时提取到的RNA的A260/A280在1.9-2.0之间,所提取的RNA无蛋白质和DNA污染,室温沉淀和低温沉淀对RNA的产量无明显影响.将提取的RNA反转录后扩增β-actin基因片段,扩增的条带与设计大小一致,验证了该方法提取的RNA可用于RT-PCR. 展开更多
关键词 TRIZOL法 甜瓜 RNA 提取
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从苹果属腊叶标本中提取DNA的改良CTAB法研究 被引量:10
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作者 丁芳兵 刘连芬 +2 位作者 汤庚国 吴瑞姣 钱关泽 《中国农学通报》 CSCD 2012年第16期176-179,共4页
为了探求从保存年代较长,并富含多糖多酚的苹果属植物腊叶标本中提取基因组DNA的方法,在传统CTAB法的基础上加以改良,无液氮研磨材料后加入预冷CTAB free缓冲液和提高沉淀时盐浓度,所得模板直接用于扩增nrITS区和cpDNA matK基因。经紫... 为了探求从保存年代较长,并富含多糖多酚的苹果属植物腊叶标本中提取基因组DNA的方法,在传统CTAB法的基础上加以改良,无液氮研磨材料后加入预冷CTAB free缓冲液和提高沉淀时盐浓度,所得模板直接用于扩增nrITS区和cpDNA matK基因。经紫外分光光度和琼脂糖凝胶电泳检测,结果表明用改良方法提取的DNA在质量和产量上优于常规方法并能满足后续扩增反应的要求。该方法不需要液氮研磨,节省了人力和成本,提前加入除杂缓冲液对去除多酚的效果良好,增加沉淀时盐的浓度能有效去除多糖,表明改良CTAB法适合苹果属腊叶标本叶片总DNA的提取。 展开更多
关键词 DNA提取 多酚 多糖 苹果属 腊叶标本
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枸杞LbMYB1基因的克隆与表达分析 被引量:7
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作者 郑蕊 岳思君 王丽娟 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期174-179,共6页
在前期的枸杞花药蛋白质组学研究鉴定差异表达蛋白的基础上,采用RT-PCR技术,从宁夏枸杞"宁杞1号"花药中克隆了一个花药发育差异表达MYB类蛋白基因。生物信息学分析表明,该基因编码R2R3类MYB转录因子的典型结构域,与其他物种MY... 在前期的枸杞花药蛋白质组学研究鉴定差异表达蛋白的基础上,采用RT-PCR技术,从宁夏枸杞"宁杞1号"花药中克隆了一个花药发育差异表达MYB类蛋白基因。生物信息学分析表明,该基因编码R2R3类MYB转录因子的典型结构域,与其他物种MYB蛋白的氨基酸的相似性达72%以上,属于R2R3类MYB蛋白基因家族。将该基因命名为Lb MYB1,Lb MYB1包含一个975 bp的开放阅读框,编码324个氨基酸残基,分子量79.2 kv,等电点为4.95。实时定量RT-PCR检测表明,Lb MYB1基因在花药四分体形成时期高丰度表达,在花中的表达量也较高,果实中表达量较低,在根、茎及叶中未检测到表达,推测Lb MYB1基因可能与花药发育中有关。本研究为后继进一步探讨Lb MYB1蛋白在枸杞花药发育过程中可能发挥的调控功能及其分子机理提供参考。 展开更多
关键词 枸杞 LB MYB1 基因克隆 表达分析
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濒危植物岩黄连叶片中基因组DNA的提取及分析 被引量:6
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作者 程华 周蓬蓬 +4 位作者 余龙江 胡琼月 朱路 刘智 敖明章 《时珍国医国药》 CAS CSCD 北大核心 2006年第9期1699-1700,共2页
目的获取高质量的岩黄连基因组DNA。方法用改进的SDS-CTAB法从岩黄连叶片中提取基因组DNA,通过琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度法、PCR检测其质量,并与传统的CTAB法比较。结果通过改进的SDS-CTAB法提取的DNA优于CTAB法提取的DNA,电泳条带... 目的获取高质量的岩黄连基因组DNA。方法用改进的SDS-CTAB法从岩黄连叶片中提取基因组DNA,通过琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度法、PCR检测其质量,并与传统的CTAB法比较。结果通过改进的SDS-CTAB法提取的DNA优于CTAB法提取的DNA,电泳条带清晰,纯度高,能较好的进行PCR。结论改进的SDS-CTAB法适合岩黄连基因组DNA的提取。 展开更多
关键词 岩黄连 基因组DNA SDS-CTAB法
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一种适用于盐生植物的RNA提取方法 被引量:13
16
作者 方孝东 吴多桂 +1 位作者 林栖凤 李冠一 《海南大学学报(自然科学版)》 CAS 1998年第4期311-313,共3页
介绍了一种红树RNA提取方法,此法无需特殊试剂和贵重仪器设备,可有效地排除红树细胞中大量存在的胶质和多糖类物质的干扰,所得RNA样品经紫外分光光度计检测和1%琼脂糖凝胶电泳分析证明具有较高的纯度和完整性,可满足多数分... 介绍了一种红树RNA提取方法,此法无需特殊试剂和贵重仪器设备,可有效地排除红树细胞中大量存在的胶质和多糖类物质的干扰,所得RNA样品经紫外分光光度计检测和1%琼脂糖凝胶电泳分析证明具有较高的纯度和完整性,可满足多数分子生物学实验的需要,尤其适用于提取多糖含量较高的植物细胞的RNA. 展开更多
关键词 提取 红树 盐生植物 RNA提取
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神农香菊花的化学成分研究(Ⅱ) 被引量:10
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作者 龚复俊 王国亮 王有为 《武汉植物学研究》 CSCD 北大核心 2005年第6期610-612,共3页
对采自湖北神农架的神农香菊(D end ranthem a ind icum(L.)D es M on l.var.arom a ticum Q.H.L iu et S.F.Zhang var.nov.)的化学成分进行研究,从中分离到5个化合物,利用波谱分析技术和文献对照确定了其结构,分别鉴定为木犀草素(lu te... 对采自湖北神农架的神农香菊(D end ranthem a ind icum(L.)D es M on l.var.arom a ticum Q.H.L iu et S.F.Zhang var.nov.)的化学成分进行研究,从中分离到5个化合物,利用波谱分析技术和文献对照确定了其结构,分别鉴定为木犀草素(lu teo lin),木犀黄酮甙(lu teo lin-7-O--βg lucopyranos ide),刺槐素甙(acacetin-7-rham nos idg luos ide),1-单山艹俞酸甘油酯(g lycery l-1-m onobehenate),山艹俞酸(behen ic ac id)。 展开更多
关键词 木犀黄酮甙 1-单山萮酸甘油酯 刺槐素甙 黄酮
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SSR标记技术在杂交水稻和杂交玉米种子质量鉴定中的应用研究 被引量:6
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作者 蒋晓英 杨春文 +4 位作者 林清 吴红 杨勋毅 刘捷 雷开荣 《中国农学通报》 CSCD 2013年第21期41-46,共6页
SSR标记具有快速、稳定、准确的技术优势,已经在品种鉴定等方面得到广泛的应用。为了鉴定生产用"两杂"种子样品的遗传多样性及纯度,利用36对SSR引物对39份杂交水稻样品进行了遗传多样性鉴定,其中2个样品为"同名异种&quo... SSR标记具有快速、稳定、准确的技术优势,已经在品种鉴定等方面得到广泛的应用。为了鉴定生产用"两杂"种子样品的遗传多样性及纯度,利用36对SSR引物对39份杂交水稻样品进行了遗传多样性鉴定,其中2个样品为"同名异种"(遗传距离为0.11),有2个样品疑似"异名同种";利用33对SSR引物对36份杂交玉米样品进行了遗传多样性鉴定,同样存在"同名异种"和"异名同种"现象。在人为混杂的杂交水稻样本中,SSR标记检测值与实际混杂率u测验没有显著性差异;同时利用SSR标记和田间鉴定方法比较种子公司提供的10个杂交水稻样品纯度,尽管有3个样品SSR标记检测结果低于田间鉴定,但由于田间纯度鉴定以农艺性状为标准,遗传背景相似的单株难以区分,因此从加强种子质量监管角度考虑,SSR分子标记鉴定技术更为有利。 展开更多
关键词 SSR标记 杂交水稻 杂交玉米 种子质量鉴定
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一种改进的珙桐(Davidia involucrata)干种子总RNA的提取方法 被引量:8
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作者 黎云祥 陈放 《四川大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期968-970,共3页
After many unsuccessful attempts to obtain biologically active mRNAs from dry seeds of Davidia involucrata using available protocols,an effective procedure modified from Vicient and Delseny (1999) is developed.This me... After many unsuccessful attempts to obtain biologically active mRNAs from dry seeds of Davidia involucrata using available protocols,an effective procedure modified from Vicient and Delseny (1999) is developed.This method is based on the use of 8mol/L LiCl in the extraction buffer followed by phenol extractions.The differences with respect to the original method are the inclusions of 2% soluble PVP (10000Da) and 10 mmol/L cysteine in the extraction buffer to avoid oxidation of polyphenolics,the reduction in the number of phenol extractions,freezing the seeds for 10 minutes instead of using quarts.The author modifications conquer the perishing oxidation of polyphenolics,in their oxidized forms,polyphenols can covalently bind to proteins and nucleic acids; and permit the recovery of and an average of 240 μg total RNA per g of the seeds that is suitable for translation in vitro,northern hybridizations,and the construction of cDNA libraries. 展开更多
关键词 抽提缓冲液 多酚类物质 核酸 珙桐 干种子 总RAN 提取方法
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浙江丽水16个柑橘特色品种的RAPD分析 被引量:8
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作者 曾燕如 胡瑛 +1 位作者 斯金平 徐象华 《浙江林学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期481-485,共5页
以浙江省丽水市生产的16个柑橘品种为试验材料,利用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对其亲缘关系进行研究.用21个引物扩增出了216个RAPD位点,平均每个引物10.29个位点,其中多态性位点达96.76%.每个引物不同的品种能扩增出0~10个条带.引物S1... 以浙江省丽水市生产的16个柑橘品种为试验材料,利用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对其亲缘关系进行研究.用21个引物扩增出了216个RAPD位点,平均每个引物10.29个位点,其中多态性位点达96.76%.每个引物不同的品种能扩增出0~10个条带.引物S13信息量最少,扩增出了48个条带,而引物S317信息量最大,扩增出了143个条带.文旦Citrus grandis var.wentanyu是最特殊的品种,21个PCR扩增引物中有8个引物未扩增出任何条带.UPGMA聚类结果是瓯柑类、椪柑类、温州蜜柑类及柚类基本上能聚在一起;南香Citrus unshiu × Citrus clementina与天草Citrus hybrid在遗传上与温州蜜柑类接近;属于杂柑的胡柚Citrus paradisi‘Changshanhuyou’与红肉脐橙Citrus sinensis var.brasiliensis在遗传上接近.另外,用引物S304可以区分无籽瓯柑Citrus suavissima ‘Seedless'与普通瓯柑C.suavissima,用S356可以区分无籽柑Citrus poonensis‘Seedless’与普通椪柑C.poonensis.研究结果表明,这些柑橘不仅在DNA水平上是有差异的,而且RAPD标记技术可用于柑橘DNA水平的鉴别. 展开更多
关键词 随机扩增多态DNA 柑橘品种 亲缘关系 无籽瓯柑 无籽桠柑
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