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基于网络药理学和分子对接探讨清热散结胶囊治疗慢性前列腺炎的潜在机制
1
作者
张家楷
刘宏岳
+2 位作者
张苏阳
唐志广
金珊
《中医临床研究》
2024年第5期33-41,共9页
目的:基于网络药理学及分子对接技术探讨清热散结胶囊治疗慢性前列腺炎的潜在机制。方法:查阅文献及数据库筛选清热散结胶囊的活性成分,利用Swiss Target Prediction获取有效成分的相应蛋白靶标,并利用Uni Prot数据库确定基因靶点标准...
目的:基于网络药理学及分子对接技术探讨清热散结胶囊治疗慢性前列腺炎的潜在机制。方法:查阅文献及数据库筛选清热散结胶囊的活性成分,利用Swiss Target Prediction获取有效成分的相应蛋白靶标,并利用Uni Prot数据库确定基因靶点标准化名称,通过Cyto Scape 3.7.2软件构建“中药-有效成分-靶点”作用网络。借助Gene Cards、Drug Bank和Pharm GKB数据库筛选慢性前列腺炎的疾病靶点,与药物有效成分靶点取交集后得到清热散结胶囊与慢性前列腺炎的共同靶点,利用STRING数据库构建清热散结胶囊治疗慢性前列腺炎的蛋白质-蛋白质相互作用并利用Cytoscape过滤查找蛋白质-蛋白质相互作用网络核心。通过Metascape数据库对共同靶点进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,利用Py MOL及Vina软件进行分子对接验证,最后根据预测结果绘制清热散结胶囊治疗慢性前列腺炎的作用机制图。结果:筛选得到清热散结胶囊有效成分12个,去重对应靶点237个,慢性前列腺炎疾病靶点4770个,共同靶点基因154个,蛋白质-蛋白质相互作用网络分析表明清热散结胶囊治疗慢性前列腺炎的关键靶点基因包括丝裂原活化蛋白激酶1(Mitogen-Activated Protein Kinase 1,MAPK1)、Janus激酶1(Janus Kinase 1,JAK1)、FYN癌基因相关SRC,FGR,YES(Oncogene Related to SRC,FGR,YES,FYN)、磷脂酰肌醇-3激酶调节亚基1(phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1,PIK3R1)、肉瘤基因(Sarcoma,SRC)、MAPK14、PTK2蛋白酪氨酸激酶2(PTK2 Protein Tyrosine Kinase 2,PTK2)、JAK2、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase1,AKT1)、信号转导因子和转录激活因子3(Signal Transducer and Activator of Transcription 3,STAT3)、磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸3-激酶催化亚基α(Phosphatidylinositol-4,5-Bisphosphate 3-Kinase Catalytic Subunit Alpha,PIK3CA)等。GO分析和KEGG分析表明核心靶点参与影响细胞代谢、炎症、免疫和氧化应激等多种生物过程,作用于癌症、细胞凋亡、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、磷脂酰肌醇3激酶(Phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)-蛋白激酶B(Akt)、缺氧诱导因子-1(Hypoxia Inducible Factor-1,HIF-1)、叉头框O(Forkhead Box,Fox O)等多种信号通路。分子对接显示核心化合物与靶点具有良好的结合活性。结论:本研究初步揭示了清热散结胶囊治疗慢性前列腺炎的潜在机制,为临床用药及后续研究提供理论依据。
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关键词
清热散结胶囊
网络药理学
分子对接
慢性前列腺炎
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职称材料
题名
基于网络药理学和分子对接探讨清热散结胶囊治疗慢性前列腺炎的潜在机制
1
作者
张家楷
刘宏岳
张苏阳
唐志广
金珊
机构
天津中医药大学
天津中医药大学第一附属医院
出处
《中医临床研究》
2024年第5期33-41,共9页
文摘
目的:基于网络药理学及分子对接技术探讨清热散结胶囊治疗慢性前列腺炎的潜在机制。方法:查阅文献及数据库筛选清热散结胶囊的活性成分,利用Swiss Target Prediction获取有效成分的相应蛋白靶标,并利用Uni Prot数据库确定基因靶点标准化名称,通过Cyto Scape 3.7.2软件构建“中药-有效成分-靶点”作用网络。借助Gene Cards、Drug Bank和Pharm GKB数据库筛选慢性前列腺炎的疾病靶点,与药物有效成分靶点取交集后得到清热散结胶囊与慢性前列腺炎的共同靶点,利用STRING数据库构建清热散结胶囊治疗慢性前列腺炎的蛋白质-蛋白质相互作用并利用Cytoscape过滤查找蛋白质-蛋白质相互作用网络核心。通过Metascape数据库对共同靶点进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,利用Py MOL及Vina软件进行分子对接验证,最后根据预测结果绘制清热散结胶囊治疗慢性前列腺炎的作用机制图。结果:筛选得到清热散结胶囊有效成分12个,去重对应靶点237个,慢性前列腺炎疾病靶点4770个,共同靶点基因154个,蛋白质-蛋白质相互作用网络分析表明清热散结胶囊治疗慢性前列腺炎的关键靶点基因包括丝裂原活化蛋白激酶1(Mitogen-Activated Protein Kinase 1,MAPK1)、Janus激酶1(Janus Kinase 1,JAK1)、FYN癌基因相关SRC,FGR,YES(Oncogene Related to SRC,FGR,YES,FYN)、磷脂酰肌醇-3激酶调节亚基1(phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1,PIK3R1)、肉瘤基因(Sarcoma,SRC)、MAPK14、PTK2蛋白酪氨酸激酶2(PTK2 Protein Tyrosine Kinase 2,PTK2)、JAK2、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase1,AKT1)、信号转导因子和转录激活因子3(Signal Transducer and Activator of Transcription 3,STAT3)、磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸3-激酶催化亚基α(Phosphatidylinositol-4,5-Bisphosphate 3-Kinase Catalytic Subunit Alpha,PIK3CA)等。GO分析和KEGG分析表明核心靶点参与影响细胞代谢、炎症、免疫和氧化应激等多种生物过程,作用于癌症、细胞凋亡、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、磷脂酰肌醇3激酶(Phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)-蛋白激酶B(Akt)、缺氧诱导因子-1(Hypoxia Inducible Factor-1,HIF-1)、叉头框O(Forkhead Box,Fox O)等多种信号通路。分子对接显示核心化合物与靶点具有良好的结合活性。结论:本研究初步揭示了清热散结胶囊治疗慢性前列腺炎的潜在机制,为临床用药及后续研究提供理论依据。
关键词
清热散结胶囊
网络药理学
分子对接
慢性前列腺炎
Keywords
The Qingre Sanjie capsules
Network pharmacology
Molecular docking
Chronic prostatitis
分类号
R697..33 [医药卫生—泌尿科学]
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作者
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被引量
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1
基于网络药理学和分子对接探讨清热散结胶囊治疗慢性前列腺炎的潜在机制
张家楷
刘宏岳
张苏阳
唐志广
金珊
《中医临床研究》
2024
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