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中国汉族人群MAPT基因SNPs等位基因及单体型频率与阿尔茨海默病相关性研究 被引量:1
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作者 徐向红 郭天康 +3 位作者 苏海翔 魏丽 李永红 徐辉 《现代检验医学杂志》 CAS 2014年第2期34-37,共4页
目的 用生物信息学方法挑选中国汉族人群中的MAPT基因标签单核苷酸多态性(tag-SNPs)位点,考察中国汉族人群MAPT基因与老年痴呆症的关系.方法 通过Hapmap数据库获取中国汉族人群的MAPT基因SNPs数据;应用Haploview4.2对MAPT基因进行连... 目的 用生物信息学方法挑选中国汉族人群中的MAPT基因标签单核苷酸多态性(tag-SNPs)位点,考察中国汉族人群MAPT基因与老年痴呆症的关系.方法 通过Hapmap数据库获取中国汉族人群的MAPT基因SNPs数据;应用Haploview4.2对MAPT基因进行连锁不平衡分析;在D'值95%可信区间内构建单体域;根据单体域内SNPs之间的r2值和LOD值,挑选标签SNP.结果 MAPT基因70个SNPs中,15个(21.43%) SNPs为纯合基因型,MAF高于10%的SNPs为44个,占62.86%.利用55个合格SNPs确定了26个标签SNPs,构建了8个单体域,各单体域以其前两种单体型为主,累计频率在61.9%-100.0%之间.结论 中国汉族人群MAPT基因的26个SNPs位点是较具代表性的标志性位点,可被选为标签SNPs,并作为中国汉族人群MAPT基因与老年痴呆症的关联研究. 展开更多
关键词 MAPT基因 SNPs等位基因 多态性 基因频率 阿尔茨海默病
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