芸薹根肿菌SSR标记的开发及遗传多样性研究

芸薹根肿菌(Plasmodiophora brassicae)专性寄生于十字花科作物根部引起根肿病,且变异迅速。本研究利用Williams鉴别寄主系统鉴定了32株根肿菌,根据根肿菌基因组序列分析了根肿菌基因组中简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)的分布特性,并结合SSR标记开发研究了根肿菌遗传多样性。主要结果:从收集自8个省市31个地区的32株根肿菌中,鉴定出2、4、7和11号生理小种;根肿菌基因组存在3 164个SSR,即每7. 6 kb存在1个SSR。核苷酸重复类型以2和3为主,分布频率分别为45. 92%和53. 04%。从62对SSR引物中,筛选出31个多态性标记,多态率50%,平均PIC值为0. 407;聚类分析表明,同一地区的根肿菌大多聚类到一起,但同时存在变异。