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20份新疆紫花苜蓿种质SSR遗传多样性分析
被引量:
4
1
作者
马金星
剡转转
+2 位作者
张吉宇
王铁梅
卢欣石
《云南农业大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2018年第3期397-404,共8页
【目的】本研究旨在为紫花苜蓿分子育种提供基础。【方法】基于SSR分子标记,对20份新疆紫花苜蓿种质资源进行遗传多样性分析,用梯度PCR仪对50对SSR引物进行扩增筛选,筛选出多态性好的引物用于20份种质材料的研究。【结果】从50对SSR引...
【目的】本研究旨在为紫花苜蓿分子育种提供基础。【方法】基于SSR分子标记,对20份新疆紫花苜蓿种质资源进行遗传多样性分析,用梯度PCR仪对50对SSR引物进行扩增筛选,筛选出多态性好的引物用于20份种质材料的研究。【结果】从50对SSR引物中筛选得到9对多态性引物,共扩增出199个条带,多态性条带179个,多态带百分率89.95%。20份种质的遗传距离在0.010 4~0.086 0之间,Nei’s基因多样性指数和Shannon信息指数的平均值分别为0.164 0和0.254 4。UPGMA聚类分析显示:20份苜蓿材料在遗传相似系数为0.957 1时可分为5个类群。【结论】来自新疆的紫花苜蓿种质资源具有丰富的遗传多样性,种群间发生了较高的遗传分化。
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关键词
紫花苜蓿
SSR标记
多态性
遗传多样性
遗传分化
下载PDF
职称材料
紫花苜蓿线粒体和叶绿体DNA高效提取体系的建立
被引量:
2
2
作者
姜少俊
周海辰
+4 位作者
金樑
宋瑜
杨阳
张晓强
王晓娟
《云南农业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第5期747-754,共8页
细胞质雄性不育系是作物杂种优势利用的有效途径,分离其不育系线粒体和叶绿体基因组是深入探究细胞质雄性不育分子机制的重要环节,本研究以紫花苜蓿细胞质雄性不育系CMS1和野生对照植株WT为研究材料,选取新鲜叶片经冷冻匀浆、差速离心...
细胞质雄性不育系是作物杂种优势利用的有效途径,分离其不育系线粒体和叶绿体基因组是深入探究细胞质雄性不育分子机制的重要环节,本研究以紫花苜蓿细胞质雄性不育系CMS1和野生对照植株WT为研究材料,选取新鲜叶片经冷冻匀浆、差速离心分离叶绿体和线粒体、DNase I降解核DNA、蛋白酶K裂解线粒体和叶绿体、酚—氯仿—异戊醇去除蛋白质和用乙醇沉淀叶绿体DNA(cpDNA)和线粒体DNA(mtDNA),结果如下:(1)叶绿体提取液中叶绿体数量的平均值为1 500个/m L,而詹纳斯绿B染色观察发现提取液中线粒体结构完整、含量较多;(2)叶片取材量为4 g时,CMS1(WT)的cpDNA平均产率为0.41(0.47)μg/g,而mtDNA的平均产率为1.15(0.83)μg/g;改进叶片取材量为10 g时,两种苜蓿材料的cpDNA和mtDNA的平均产率升高至2.17μg/g和2.22μg/g,并且纯度好(cpDNA和mtDNA的OD260/OD280均保持在2.0左右);延长蛋白酶K消化处理时间(2 h,4 h和6 h)可以提高紫花苜蓿cpDNA和mtDNA的产率,其中消化4 h的mtDNA质量浓度最高(59.9 ng/μL),而cpDNA浓度则在孵育6 h后达到最高值24.3 ng/μL;(3)紫花苜蓿CMS1和WT的mtDNA和cpDNA琼脂糖凝胶电泳检测发现,细胞质基因组条带清晰,无拖尾现象,进一步表明采用以上方法提取的紫花苜蓿mtDNA和cpDNA符合分子遗传学研究的标准和要求。
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关键词
紫花苜蓿
线粒体DNA
叶绿体DNA
差速离心法
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职称材料
题名
20份新疆紫花苜蓿种质SSR遗传多样性分析
被引量:
4
1
作者
马金星
剡转转
张吉宇
王铁梅
卢欣石
机构
北京林业大学林学院
全国畜牧总站
兰州大学草地农业科技学院
出处
《云南农业大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2018年第3期397-404,共8页
基金
国家自然科学基金项目(31201843,31572453)。
文摘
【目的】本研究旨在为紫花苜蓿分子育种提供基础。【方法】基于SSR分子标记,对20份新疆紫花苜蓿种质资源进行遗传多样性分析,用梯度PCR仪对50对SSR引物进行扩增筛选,筛选出多态性好的引物用于20份种质材料的研究。【结果】从50对SSR引物中筛选得到9对多态性引物,共扩增出199个条带,多态性条带179个,多态带百分率89.95%。20份种质的遗传距离在0.010 4~0.086 0之间,Nei’s基因多样性指数和Shannon信息指数的平均值分别为0.164 0和0.254 4。UPGMA聚类分析显示:20份苜蓿材料在遗传相似系数为0.957 1时可分为5个类群。【结论】来自新疆的紫花苜蓿种质资源具有丰富的遗传多样性,种群间发生了较高的遗传分化。
关键词
紫花苜蓿
SSR标记
多态性
遗传多样性
遗传分化
Keywords
alfalfa
SSR markers
polymorphism
genetic diversity
genetic differentiation
分类号
S541.103.2 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
紫花苜蓿线粒体和叶绿体DNA高效提取体系的建立
被引量:
2
2
作者
姜少俊
周海辰
金樑
宋瑜
杨阳
张晓强
王晓娟
机构
兰州大学草地农业生态系统国家重点实验室草地农业科技学院
上海科技馆
上海自然博物馆自然史研究中心
中国环境管理干部学院
出处
《云南农业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第5期747-754,共8页
基金
国家自然科学基金项目(31270558)
文摘
细胞质雄性不育系是作物杂种优势利用的有效途径,分离其不育系线粒体和叶绿体基因组是深入探究细胞质雄性不育分子机制的重要环节,本研究以紫花苜蓿细胞质雄性不育系CMS1和野生对照植株WT为研究材料,选取新鲜叶片经冷冻匀浆、差速离心分离叶绿体和线粒体、DNase I降解核DNA、蛋白酶K裂解线粒体和叶绿体、酚—氯仿—异戊醇去除蛋白质和用乙醇沉淀叶绿体DNA(cpDNA)和线粒体DNA(mtDNA),结果如下:(1)叶绿体提取液中叶绿体数量的平均值为1 500个/m L,而詹纳斯绿B染色观察发现提取液中线粒体结构完整、含量较多;(2)叶片取材量为4 g时,CMS1(WT)的cpDNA平均产率为0.41(0.47)μg/g,而mtDNA的平均产率为1.15(0.83)μg/g;改进叶片取材量为10 g时,两种苜蓿材料的cpDNA和mtDNA的平均产率升高至2.17μg/g和2.22μg/g,并且纯度好(cpDNA和mtDNA的OD260/OD280均保持在2.0左右);延长蛋白酶K消化处理时间(2 h,4 h和6 h)可以提高紫花苜蓿cpDNA和mtDNA的产率,其中消化4 h的mtDNA质量浓度最高(59.9 ng/μL),而cpDNA浓度则在孵育6 h后达到最高值24.3 ng/μL;(3)紫花苜蓿CMS1和WT的mtDNA和cpDNA琼脂糖凝胶电泳检测发现,细胞质基因组条带清晰,无拖尾现象,进一步表明采用以上方法提取的紫花苜蓿mtDNA和cpDNA符合分子遗传学研究的标准和要求。
关键词
紫花苜蓿
线粒体DNA
叶绿体DNA
差速离心法
Keywords
Medicago sativa L.
mitochondrion DNA
chloroplast DNA
differential centrifugation method
分类号
S541.103.2 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
20份新疆紫花苜蓿种质SSR遗传多样性分析
马金星
剡转转
张吉宇
王铁梅
卢欣石
《云南农业大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2018
4
下载PDF
职称材料
2
紫花苜蓿线粒体和叶绿体DNA高效提取体系的建立
姜少俊
周海辰
金樑
宋瑜
杨阳
张晓强
王晓娟
《云南农业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2015
2
下载PDF
职称材料
已选择
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