不同寄主植物上芜菁花叶病毒外壳蛋白基因克隆及分析

为研究芜菁花叶病毒在不同寄主植物上的变异,从江苏省徐州市感病的油菜、萝卜及菠菜上分离到3个芜菁花叶病毒分离物,分别命名为XZYC、XZLB、XZBOC.经单斑分离,利用RT-PCR克隆了这3个分离物的cp基因序列,并进行了序列分析.结果表明,3个分离物的cp基因大小均为867 bp,一致率较高,为99.8％ ～ 99.9％,氨基酸一致率为100.0％.所分析的分离物cp基因未发现明显重组.山东分离物之间、江苏分离物之间及江苏和山东分离物之间基因交流频繁,两地区遗传分化显著.将中国和日本的部分分离物构建系统进化树,分为4个组,日本和中国分离物Basal-BR组分离物单独成簇,本研究的3个分离物都位于Basal-BR组.