石榴果皮DAHPS基因的克隆与生物信息学分析

以‘泰山红’石榴果实为试材,利用RT-PCR技术克隆石榴果皮DAHPS部分基因并对其进行了生物信息学分析。结果表明:获得1 373bp的DAHPS基因cDNA片段编码393个氨基酸,其氨基酸序列与甜橙(XP_006472576.1)、白梨(XP_009372963.1)、葡萄(NP_001268096.1)、苹果(XP_008386115.1)的相似性分别为94%、93%、92%、92%;预测蛋白质理论分子量约为44kDa,等电点为9.00,具有Cys-Ser-Ala-His保守区和典型的DAHP_synthe_2超家族保守结构域,为亲水性和跨膜蛋白,不是分泌蛋白;蛋白质二级结构主要由无规则卷曲(40.97%)、α?螺旋(38.17%)、伸展链(12.47%)和β?转角(8.40%)组成。GenBank登录号为KU198932。该研究结果为揭示石榴果实中没食子酸的代谢机理奠定了理论基础。

果用石榴品种的ISSR遗传多样性分析

果用石榴果实营养丰富,具有鲜食和加工价值。以65个果用石榴品种为试材,采用ISSR标记分析果用石榴类群品种的亲缘关系和遗传多样性。结果表明：10条ISSR引物对65个石榴品种进行PCR扩增,共扩增出186个位点,其中161个是多态性位点,多态性位点比率为（PPB）86.56%,等位基因数（Na）为1.865 6,有效等位基因数（Ne）为1.311 9,Nei′s的基因多样性指数（He）为0.209 2,Shannon信息指数（I）为0.338 9,品种间遗传相似系数（Gs）介于0.478-0.995,65个果用石榴品种的遗传多样性丰富。UPGMA聚类在GS为0.78时,65个石榴品种分为三大类。聚类结果表明,果用品种间遗传关系与地理环境、籽粒硬度性状有相关性,与果皮颜色、果实风味无相关性。

不同保存方法对石榴成熟叶片基因组DNA提取效果的影响

以石榴(Punica granatum L.)成熟叶片为试材,设置6种保存方法,采用改良的CTAB法提取石榴基因组DNA,研究了不同保存方法对石榴叶片基因组DNA提取效果的影响。结果表明:采用改良的CTAB法,新鲜叶片、-70℃保存6个月、4℃保存5d的样品均能得到浓度较高的DNA;-20℃保存7d和14d的样品均能得到完整DNA,但浓度略低;硅胶干燥常温保存5个月的样品用同样的方法未能提取到DNA,在对提取方法进行优化后,可提取纯度较高的基因组DNA,但其浓度仅约为鲜叶的50%。上述方法保存的样品提取的基因组DNA均能得到清晰、稳定的SRAP-PCR扩增图谱。

枣庄石榴种质资源遗传多样性的ISSR分析

以39份枣庄石榴品种为试材,采用ISSR标记方法,研究了石榴品种间的遗传多样性及遗传关系,以期为枣庄石榴种质资源保存、杂交育种奠定基础。结果表明:9条ISSR引物对39个品种进行扩增,共检测到168个DNA位点,平均每条引物扩增出18.67个DNA位点,其中多态性位点156个,多态性位点比率(PPB)为92.86%。供试样品平均观察等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei′s基因多样性指数(He)及Shannon信息指数(I)分别为1.928 6、1.690 9、0.384 7、0.557 3;品种的遗传相似系数(GS)在0.410 7～0.958 3,采用UPGMA构建遗传关系聚类图,以遗传相似性系数(GS)0.656为阈值,供试的39份石榴品种可分为5类,根据ISSR标记的品种分类结果与根据形态性状分类结果不一致。