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紫花苜蓿R2R3-MYB亚家族鉴定与干旱胁迫下的表达分析
被引量:
8
1
作者
任明辉
张雨蓬
+2 位作者
许涛
朱慧森
岑慧芳
《草地学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期972-983,共12页
MYB(v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog)家族是最大的转录因子家族之一,R2R3-MYB亚家族在植物胁迫响应、次级代谢、生长和发育等过程发挥重要作用。本研究利用紫花苜蓿(Medicago sativa‘Zhongmu No.1’)基因组和转录...
MYB(v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog)家族是最大的转录因子家族之一,R2R3-MYB亚家族在植物胁迫响应、次级代谢、生长和发育等过程发挥重要作用。本研究利用紫花苜蓿(Medicago sativa‘Zhongmu No.1’)基因组和转录组数据,通过生物信息学方法鉴定了R2R3-MYB转录因子,并对其序列特征、系统进化、染色体分布、基因结构、顺式作用元件及干旱胁迫下的表达模式进行分析。结果显示,紫花苜蓿中有121个R2R3-MYB亚家族成员,各成员均具有两个典型的MYB结构域,理化性质变化较大。系统进化分析将121个成员分为33个组,各成员无规律地定位在8条染色体上。基因结构和顺式作用元件分析发现,同一分组具有相同或相似的外显子数和顺式作用元件。响应干旱胁迫表达模式分析和实时荧光定量PCR(qRT-PCR)结果表明干旱胁迫下MsMYB12,MsMYB45,MsMYB52,MsMYB73,MsMYB88,MsMYB124,MsMYB149,MsMYB189,MsMYB268基因的表达量显著上调,可作为后期紫花苜蓿响应干旱胁迫机制研究的潜在靶点。
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关键词
紫花苜蓿
R2R3-MYB
生物信息学分析
干旱胁迫
表达模式
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职称材料
盐胁迫下TheIF1A基因启动子表达特性分析
2
作者
郭宇聪
杨桂燕
+2 位作者
赵玉琳
张凤娇
高彩球
《西南林业大学学报(自然科学)》
CAS
北大核心
2015年第6期1-5,共5页
为探讨刚毛柽柳真核翻译起始因子1A(The IF1A)基因对植物逆境胁迫响应的调控作用,对The IF1A基因启动子盐胁迫下的应答表达情况进行分析,比较转The IF1A基因启动子拟南芥在不同浓度盐胁迫及不同时间后GUS染色和酶活差异。结果显示:The I...
为探讨刚毛柽柳真核翻译起始因子1A(The IF1A)基因对植物逆境胁迫响应的调控作用,对The IF1A基因启动子盐胁迫下的应答表达情况进行分析,比较转The IF1A基因启动子拟南芥在不同浓度盐胁迫及不同时间后GUS染色和酶活差异。结果显示:The IF1A启动子在短时间内即对400 mmol/L Na Cl胁迫做出应答,主要表现为表达受抑制,各组织中老叶的GUS酶活性最高;100mmol/L Na Cl胁迫下,The IF1A启动子活性也被明显抑制,胁迫20 h后,GUS酶活性恢复到较高水平,各组织中,根中的活性最低。研究表明,The IF1A启动子的表达能对盐胁迫作出应答,但在低盐和高盐胁迫下的应答方式存在一定的差异性。
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关键词
刚毛柽柳
盐胁迫
表达模式
TheIF1A启动子
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职称材料
林木对干旱胁迫的全基因组应答(一)
3
作者
田郎
张霖
《陕西林业科技》
2015年第6期68-75,共8页
干旱对于森林健康及人工生产林的建立均是一种严重威胁。因此,人们对于林木对干旱胁迫的应答机制一直怀有极大的兴趣。本文综述一般植物,特别是林木对于水分亏缺的感受及响应模式,并着重介绍林木对干旱刺激的分子应答机制,尤其是胁迫所...
干旱对于森林健康及人工生产林的建立均是一种严重威胁。因此,人们对于林木对干旱胁迫的应答机制一直怀有极大的兴趣。本文综述一般植物,特别是林木对于水分亏缺的感受及响应模式,并着重介绍林木对干旱刺激的分子应答机制,尤其是胁迫所引发的整个基因组范围内转录本丰度及蛋白质表达谱的改变。纵观林木此方面的研究历程可以看出,人们对于干旱分子应答的认识已由单个应答基因的分离鉴定逐渐深入到了对协同参与和调控应答反应的一系列相关基因或蛋白质的分析探讨。此外,本文也关注到了如何有效地利用这些研究成果才能最终达到保护森林健康和提高人工林生产力的目的。我们的综合分析结果显示,作为一种新的研究工具和手段,林木干旱应答的全基因组分析可有效地用于其适应性变异的保持及新品种的选育和基因型的定向修饰,从而使其能更好地应对未来可能的干旱胁迫。
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关键词
林木
干旱胁迫
全基因组应答
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职称材料
正交试验下提高胡杨幼苗水分利用效率途径研究
4
作者
吴伟
李建贵
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期92-97,共6页
【目的】提高胡杨幼苗水分利用效率途径。【方法】试验在单因子试验的基础上,根据胡杨生长特点和种植中存在的实际问题,采用密度、灌水周期、施肥浓度和黄腐酸喷施浓度的4因素5水平正交试验。【结果】灌水量是影响胡杨水分利用效率的主...
【目的】提高胡杨幼苗水分利用效率途径。【方法】试验在单因子试验的基础上,根据胡杨生长特点和种植中存在的实际问题,采用密度、灌水周期、施肥浓度和黄腐酸喷施浓度的4因素5水平正交试验。【结果】灌水量是影响胡杨水分利用效率的主要因素;各因素对胡杨水分利用效率影响强度大小的顺序是:灌水频率>黄腐酸喷施量>密度>施肥量。【结论】提高胡杨水分利用效率的最佳组合为灌水周期为13 d,密度25株/盆,施肥浓度1 mg/mL、黄腐酸喷施浓度1.6 mg/mL。
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关键词
正交优化设计
胡杨
水分利用效率
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职称材料
中国荒漠化地区植物选育研究的展望
5
作者
江泽平
马文元
《林业科技管理》
1998年第2期18-19,共2页
植物遗传资源的保护与利用是防治荒漠化最关键的因素之一。一方面,它们是提供木材、粮食、油料、纤维和医药等生活生产资料的重要资源;另一方面,它们在为野生动物提供栖息地、保护生物多样性、地理景观美化、退化生态系统恢复与重建等...
植物遗传资源的保护与利用是防治荒漠化最关键的因素之一。一方面,它们是提供木材、粮食、油料、纤维和医药等生活生产资料的重要资源;另一方面,它们在为野生动物提供栖息地、保护生物多样性、地理景观美化、退化生态系统恢复与重建等生态环境维护方面具有重要功能。荒漠化地区优良植物选繁和定向培育技术的研究一直是我国的薄弱环节。
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关键词
植物选育
研究现状
展望
荒漠化地区
中国
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职称材料
题名
紫花苜蓿R2R3-MYB亚家族鉴定与干旱胁迫下的表达分析
被引量:
8
1
作者
任明辉
张雨蓬
许涛
朱慧森
岑慧芳
机构
山西农业大学草业学院
出处
《草地学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期972-983,共12页
基金
国家自然科学基金(32071872,31402131)
山西省中央引导地方科技发展资金项目(YDZJSX2022B006)
+1 种基金
山西省基础研究计划青年科学研究项目(20210302124607)
山西省高等学校科技创新项目(2021L106)资助。
文摘
MYB(v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog)家族是最大的转录因子家族之一,R2R3-MYB亚家族在植物胁迫响应、次级代谢、生长和发育等过程发挥重要作用。本研究利用紫花苜蓿(Medicago sativa‘Zhongmu No.1’)基因组和转录组数据,通过生物信息学方法鉴定了R2R3-MYB转录因子,并对其序列特征、系统进化、染色体分布、基因结构、顺式作用元件及干旱胁迫下的表达模式进行分析。结果显示,紫花苜蓿中有121个R2R3-MYB亚家族成员,各成员均具有两个典型的MYB结构域,理化性质变化较大。系统进化分析将121个成员分为33个组,各成员无规律地定位在8条染色体上。基因结构和顺式作用元件分析发现,同一分组具有相同或相似的外显子数和顺式作用元件。响应干旱胁迫表达模式分析和实时荧光定量PCR(qRT-PCR)结果表明干旱胁迫下MsMYB12,MsMYB45,MsMYB52,MsMYB73,MsMYB88,MsMYB124,MsMYB149,MsMYB189,MsMYB268基因的表达量显著上调,可作为后期紫花苜蓿响应干旱胁迫机制研究的潜在靶点。
关键词
紫花苜蓿
R2R3-MYB
生物信息学分析
干旱胁迫
表达模式
Keywords
Alfalfa
R2R3-MYB
Bioinformatic analysis
Drought stress
Expression patterns
分类号
S772.36 [农业科学—森林工程]
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职称材料
题名
盐胁迫下TheIF1A基因启动子表达特性分析
2
作者
郭宇聪
杨桂燕
赵玉琳
张凤娇
高彩球
机构
林木遗传育种国家重点实验室(东北林业大学)
出处
《西南林业大学学报(自然科学)》
CAS
北大核心
2015年第6期1-5,共5页
基金
国家自然科学基金项目(31370676)资助
中央高校基本科研业务费专项资金项目(2572014DA03)资助
文摘
为探讨刚毛柽柳真核翻译起始因子1A(The IF1A)基因对植物逆境胁迫响应的调控作用,对The IF1A基因启动子盐胁迫下的应答表达情况进行分析,比较转The IF1A基因启动子拟南芥在不同浓度盐胁迫及不同时间后GUS染色和酶活差异。结果显示:The IF1A启动子在短时间内即对400 mmol/L Na Cl胁迫做出应答,主要表现为表达受抑制,各组织中老叶的GUS酶活性最高;100mmol/L Na Cl胁迫下,The IF1A启动子活性也被明显抑制,胁迫20 h后,GUS酶活性恢复到较高水平,各组织中,根中的活性最低。研究表明,The IF1A启动子的表达能对盐胁迫作出应答,但在低盐和高盐胁迫下的应答方式存在一定的差异性。
关键词
刚毛柽柳
盐胁迫
表达模式
TheIF1A启动子
Keywords
Tamarix hispida
salt stress
expression pattern
ThelF1A promoter
分类号
S772.36 [农业科学—森林工程]
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职称材料
题名
林木对干旱胁迫的全基因组应答(一)
3
作者
田郎
张霖
机构
中国热带农业科学院橡胶研究所
河南大学生命科学学院
出处
《陕西林业科技》
2015年第6期68-75,共8页
文摘
干旱对于森林健康及人工生产林的建立均是一种严重威胁。因此,人们对于林木对干旱胁迫的应答机制一直怀有极大的兴趣。本文综述一般植物,特别是林木对于水分亏缺的感受及响应模式,并着重介绍林木对干旱刺激的分子应答机制,尤其是胁迫所引发的整个基因组范围内转录本丰度及蛋白质表达谱的改变。纵观林木此方面的研究历程可以看出,人们对于干旱分子应答的认识已由单个应答基因的分离鉴定逐渐深入到了对协同参与和调控应答反应的一系列相关基因或蛋白质的分析探讨。此外,本文也关注到了如何有效地利用这些研究成果才能最终达到保护森林健康和提高人工林生产力的目的。我们的综合分析结果显示,作为一种新的研究工具和手段,林木干旱应答的全基因组分析可有效地用于其适应性变异的保持及新品种的选育和基因型的定向修饰,从而使其能更好地应对未来可能的干旱胁迫。
关键词
林木
干旱胁迫
全基因组应答
Keywords
Forest tree
drought stress
Genome-wide responses
分类号
S772.36 [农业科学—森林工程]
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职称材料
题名
正交试验下提高胡杨幼苗水分利用效率途径研究
4
作者
吴伟
李建贵
机构
新疆农业大学林学与园艺学院
新疆农业大学科研管理处
出处
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期92-97,共6页
基金
中国科学院"西部之光"人才培养计划
文摘
【目的】提高胡杨幼苗水分利用效率途径。【方法】试验在单因子试验的基础上,根据胡杨生长特点和种植中存在的实际问题,采用密度、灌水周期、施肥浓度和黄腐酸喷施浓度的4因素5水平正交试验。【结果】灌水量是影响胡杨水分利用效率的主要因素;各因素对胡杨水分利用效率影响强度大小的顺序是:灌水频率>黄腐酸喷施量>密度>施肥量。【结论】提高胡杨水分利用效率的最佳组合为灌水周期为13 d,密度25株/盆,施肥浓度1 mg/mL、黄腐酸喷施浓度1.6 mg/mL。
关键词
正交优化设计
胡杨
水分利用效率
Keywords
orthogonal optimal design
Populus euphratica
water use efficiency
分类号
S772.36 [农业科学—森林工程]
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职称材料
题名
中国荒漠化地区植物选育研究的展望
5
作者
江泽平
马文元
机构
中国林科院林业所
出处
《林业科技管理》
1998年第2期18-19,共2页
文摘
植物遗传资源的保护与利用是防治荒漠化最关键的因素之一。一方面,它们是提供木材、粮食、油料、纤维和医药等生活生产资料的重要资源;另一方面,它们在为野生动物提供栖息地、保护生物多样性、地理景观美化、退化生态系统恢复与重建等生态环境维护方面具有重要功能。荒漠化地区优良植物选繁和定向培育技术的研究一直是我国的薄弱环节。
关键词
植物选育
研究现状
展望
荒漠化地区
中国
分类号
S332 [农业科学—作物遗传育种]
S772.36 [农业科学—森林工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
紫花苜蓿R2R3-MYB亚家族鉴定与干旱胁迫下的表达分析
任明辉
张雨蓬
许涛
朱慧森
岑慧芳
《草地学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
8
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职称材料
2
盐胁迫下TheIF1A基因启动子表达特性分析
郭宇聪
杨桂燕
赵玉琳
张凤娇
高彩球
《西南林业大学学报(自然科学)》
CAS
北大核心
2015
0
下载PDF
职称材料
3
林木对干旱胁迫的全基因组应答(一)
田郎
张霖
《陕西林业科技》
2015
0
下载PDF
职称材料
4
正交试验下提高胡杨幼苗水分利用效率途径研究
吴伟
李建贵
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2010
0
下载PDF
职称材料
5
中国荒漠化地区植物选育研究的展望
江泽平
马文元
《林业科技管理》
1998
0
下载PDF
职称材料
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