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杭州市规模化养殖场湖羊芽囊原虫的PCR检测与基因亚型鉴定
1
作者
邓朴明
赵慧钢
+6 位作者
余复昌
石团员
孙洪超
周炜
周芷锦
赵爱云
齐萌
《畜牧与饲料科学》
2024年第2期103-108,共6页
[目的]掌握杭州市规模化养殖场中湖羊芽囊原虫的感染情况和基因亚型分布。[方法]从杭州市4个规模化养殖场采集167份湖羊的新鲜粪便样本,提取粪便全基因组DNA;基于小亚基核糖体RNA(SSU rRNA)基因,对粪便DNA样本进行PCR扩增,对阳性产物进...
[目的]掌握杭州市规模化养殖场中湖羊芽囊原虫的感染情况和基因亚型分布。[方法]从杭州市4个规模化养殖场采集167份湖羊的新鲜粪便样本,提取粪便全基因组DNA;基于小亚基核糖体RNA(SSU rRNA)基因,对粪便DNA样本进行PCR扩增,对阳性产物进行测序;经序列比对鉴定芽囊原虫基因亚型,构建系统进化树解析其遗传进化关系。[结果]167份样本中,检测出芽囊原虫阳性样本18份,感染率为10.78%(18/167);3个养殖场呈芽囊原虫阳性,感染率依次为21.43%(3/14)、21.21%(14/66)和2.13%(1/47),1个养殖场未检测出芽囊原虫;不同养殖场之间湖羊芽囊原虫的感染率存在极显著(P<0.01)差异。鉴定出7个芽囊原虫基因亚型,分别为ST7(n=1)、ST10(n=9)、ST21(n=3)、ST23(n=1)、ST24(n=2)、ST26(n=1)、ST30(n=1),以ST10亚型为优势感染亚型(9/18,50.00%);基于芽囊原虫SSU rRNA基因的系统进化树分析发现,6种基因亚型序列聚类形成1个大群,其中ST10和ST23聚类形成亚群,ST21、ST26和ST30聚类形成亚群,ST24聚类形成亚群;而ST7聚类形成另外1个群。[结论]杭州市湖羊芽囊原虫感染较常见,其基因亚型存在遗传多样性。研究结果为我国绵羊芽囊原虫的感染情况调查提供了基础数据。
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关键词
芽囊原虫
检测
鉴定
基因亚型
湖羊
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题名
杭州市规模化养殖场湖羊芽囊原虫的PCR检测与基因亚型鉴定
1
作者
邓朴明
赵慧钢
余复昌
石团员
孙洪超
周炜
周芷锦
赵爱云
齐萌
机构
塔里木大学动物科学与技术学院
浙江省农业科学院畜牧兽医研究所
浙江省动物疫病预防控制中心
出处
《畜牧与饲料科学》
2024年第2期103-108,共6页
基金
浙江省“三农九方”农业科技协作计划项目(2023SNJF058)
杭州市农业与社会发展项目(202203B19)。
文摘
[目的]掌握杭州市规模化养殖场中湖羊芽囊原虫的感染情况和基因亚型分布。[方法]从杭州市4个规模化养殖场采集167份湖羊的新鲜粪便样本,提取粪便全基因组DNA;基于小亚基核糖体RNA(SSU rRNA)基因,对粪便DNA样本进行PCR扩增,对阳性产物进行测序;经序列比对鉴定芽囊原虫基因亚型,构建系统进化树解析其遗传进化关系。[结果]167份样本中,检测出芽囊原虫阳性样本18份,感染率为10.78%(18/167);3个养殖场呈芽囊原虫阳性,感染率依次为21.43%(3/14)、21.21%(14/66)和2.13%(1/47),1个养殖场未检测出芽囊原虫;不同养殖场之间湖羊芽囊原虫的感染率存在极显著(P<0.01)差异。鉴定出7个芽囊原虫基因亚型,分别为ST7(n=1)、ST10(n=9)、ST21(n=3)、ST23(n=1)、ST24(n=2)、ST26(n=1)、ST30(n=1),以ST10亚型为优势感染亚型(9/18,50.00%);基于芽囊原虫SSU rRNA基因的系统进化树分析发现,6种基因亚型序列聚类形成1个大群,其中ST10和ST23聚类形成亚群,ST21、ST26和ST30聚类形成亚群,ST24聚类形成亚群;而ST7聚类形成另外1个群。[结论]杭州市湖羊芽囊原虫感染较常见,其基因亚型存在遗传多样性。研究结果为我国绵羊芽囊原虫的感染情况调查提供了基础数据。
关键词
芽囊原虫
检测
鉴定
基因亚型
湖羊
Keywords
Blastocystis
detection
identify
subgenotype
Hu sheep
分类号
S858.265.72 [农业科学—临床兽医学]
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作者
出处
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被引量
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1
杭州市规模化养殖场湖羊芽囊原虫的PCR检测与基因亚型鉴定
邓朴明
赵慧钢
余复昌
石团员
孙洪超
周炜
周芷锦
赵爱云
齐萌
《畜牧与饲料科学》
2024
0
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引证文献
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